EuRBPDB

  • Home
  • Cancer
  • Family
  • Species
  • RBPredictor
  • Search
  • Download
  • Submit
  • Help
  • Contact

  • Description
  • RBDs
  • Transcripts
  • Gene Model
  • PPI
  • Orthologs
Description
Ensembl ID
ENSTNIG00000015549 (Gene tree)
Gene ID
-
Gene Symbol
ftsj3
Alias
cb410|ftsj|sb:cb410|wu:fa08a09
Full Name
FtsJ RNA methyltransferase homolog 3
Gene Type
protein_coding
Species
Tetraodon_nigroviridis
Status
putative
Strand
Plus strand
Length
5062 bases
Position
chr1:16580460-16585521
Accession
ZDB-GENE-030131-9828
RBP type
canonical RBP
Summary
-
RNA binding domains(RBDs)
Protein IDDomain Pfam IDE-value Domain number Total number
ENSTNIP00000018621FtsJPF01728.197.6e-5811
Transcripts
Transcript IDNameLengthRefSeq ID Protein IDLengthRefSeq IDUniportKB ID
ENSTNIT00000018848-2478-ENSTNIP00000018621826 (aa)-H3DDM8
Gene Model
Click here to download ENSTNIG00000015549's gene model file
Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSTNIG00000015549's network
Orthologs
Ensembl IDGene SymbolCoverageIdentiy OrthologGene SymbolCoverageIdentiy Species
ENSTNIG00000015549ftsj39859.264ENSG00000108592FTSJ310090.909Homo_sapiens
ENSTNIG00000015549ftsj37879.452ENSAPOG00000005543ftsj39078.341Acanthochromis_polyacanthus
ENSTNIG00000015549ftsj39960.526ENSAMEG00000003148FTSJ39961.814Ailuropoda_melanoleuca
ENSTNIG00000015549ftsj38787.895ENSACIG00000012880ftsj39966.825Amphilophus_citrinellus
ENSTNIG00000015549ftsj310077.224ENSAOCG00000023196ftsj39879.363Amphiprion_ocellaris
ENSTNIG00000015549ftsj310076.868ENSAPEG00000004250ftsj39979.009Amphiprion_percula
ENSTNIG00000015549ftsj39278.599ENSATEG00000010069ftsj39780.103Anabas_testudineus
ENSTNIG00000015549ftsj38372.193ENSAPLG00000010362-9955.398Anas_platyrhynchos
ENSTNIG00000015549ftsj38857.718ENSACAG00000017930FTSJ39957.600Anolis_carolinensis
ENSTNIG00000015549ftsj39859.689ENSANAG00000033774FTSJ39960.468Aotus_nancymaae
ENSTNIG00000015549ftsj38584.615ENSACLG00000019137ftsj39884.615Astatotilapia_calliptera
ENSTNIG00000015549ftsj39971.816ENSAMXG00000021571ftsj39672.378Astyanax_mexicanus
ENSTNIG00000015549ftsj39860.984ENSBTAG00000021060FTSJ39961.045Bos_taurus
ENSTNIG00000015549ftsj35349.436WBGene00019168H06I04.36049.436Caenorhabditis_elegans
ENSTNIG00000015549ftsj39859.524ENSCJAG00000019631FTSJ39958.851Callithrix_jacchus
ENSTNIG00000015549ftsj39960.331ENSCAFG00000012770FTSJ39960.689Canis_familiaris
ENSTNIG00000015549ftsj39961.210ENSCAFG00020026630FTSJ39960.906Canis_lupus_dingo
ENSTNIG00000015549ftsj39861.715ENSCHIG00000025676FTSJ39961.740Capra_hircus
ENSTNIG00000015549ftsj39556.211ENSTSYG00000001393FTSJ39956.730Carlito_syrichta
ENSTNIG00000015549ftsj36467.179ENSCAPG00000016654FTSJ39166.667Cavia_aperea
ENSTNIG00000015549ftsj39861.418ENSCPOG00000011384FTSJ39960.999Cavia_porcellus
ENSTNIG00000015549ftsj39859.904ENSCCAG00000023533-9766.853Cebus_capucinus
ENSTNIG00000015549ftsj39859.952ENSCATG00000018510FTSJ39959.766Cercocebus_atys
ENSTNIG00000015549ftsj39861.011ENSCLAG00000003222FTSJ39960.284Chinchilla_lanigera
ENSTNIG00000015549ftsj39960.000ENSCSAG00000003921FTSJ39959.883Chlorocebus_sabaeus
ENSTNIG00000015549ftsj39960.409ENSCPBG00000010032FTSJ39373.333Chrysemys_picta_bellii
ENSTNIG00000015549ftsj37352.844ENSCING00000025069-5950.324Ciona_intestinalis
ENSTNIG00000015549ftsj35859.150ENSCSAVG00000003607-8350.794Ciona_savignyi
ENSTNIG00000015549ftsj39859.857ENSCANG00000042921FTSJ39959.883Colobus_angolensis_palliatus
ENSTNIG00000015549ftsj39860.870ENSCGRG00001018068FTSJ39960.284Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSTNIG00000015549ftsj39860.870ENSCGRG00000010648FTSJ39960.284Cricetulus_griseus_crigri
ENSTNIG00000015549ftsj39971.412ENSCSEG00000013468ftsj39773.641Cynoglossus_semilaevis
ENSTNIG00000015549ftsj310075.891ENSCVAG00000007484ftsj39976.366Cyprinodon_variegatus
ENSTNIG00000015549ftsj39970.203ENSDARG00000104938ftsj39971.209Danio_rerio
ENSTNIG00000015549ftsj39959.507ENSDNOG00000002392FTSJ39959.203Dasypus_novemcinctus
ENSTNIG00000015549ftsj39860.843ENSDORG00000004200Ftsj39960.952Dipodomys_ordii
ENSTNIG00000015549ftsj39960.443ENSETEG00000019228FTSJ39960.047Echinops_telfairi
ENSTNIG00000015549ftsj39954.676ENSEBUG00000007828ftsj39853.929Eptatretus_burgeri
ENSTNIG00000015549ftsj39961.151ENSEASG00005013565FTSJ39668.421Equus_asinus_asinus
ENSTNIG00000015549ftsj39860.958ENSECAG00000011995FTSJ39959.977Equus_caballus
ENSTNIG00000015549ftsj39971.006ENSELUG00000013501ftsj39670.671Esox_lucius
ENSTNIG00000015549ftsj39960.143ENSFCAG00000013983FTSJ39960.642Felis_catus
ENSTNIG00000015549ftsj39861.916ENSFALG00000013635FTSJ310062.220Ficedula_albicollis
ENSTNIG00000015549ftsj39860.361ENSFDAG00000010274FTSJ39960.854Fukomys_damarensis
ENSTNIG00000015549ftsj310077.197ENSFHEG00000007639ftsj39877.098Fundulus_heteroclitus
ENSTNIG00000015549ftsj35077.221ENSGMOG00000017184ftsj39977.221Gadus_morhua
ENSTNIG00000015549ftsj39863.101ENSGALG00000032993FTSJ39963.636Gallus_gallus
ENSTNIG00000015549ftsj35078.873ENSGACG00000009841ftsj39978.422Gasterosteus_aculeatus
ENSTNIG00000015549ftsj39962.048ENSGAGG00000006236FTSJ39961.520Gopherus_agassizii
ENSTNIG00000015549ftsj39859.785ENSGGOG00000006794FTSJ39960.828Gorilla_gorilla
ENSTNIG00000015549ftsj39977.605ENSHBUG00000022331ftsj39778.199Haplochromis_burtoni
ENSTNIG00000015549ftsj39861.037ENSHGLG00000012282FTSJ39960.646Heterocephalus_glaber_female
ENSTNIG00000015549ftsj39861.037ENSHGLG00100003578FTSJ39960.646Heterocephalus_glaber_male
ENSTNIG00000015549ftsj39976.822ENSHCOG00000018770ftsj39877.305Hippocampus_comes
ENSTNIG00000015549ftsj39969.845ENSIPUG00000024942ftsj39670.651Ictalurus_punctatus
ENSTNIG00000015549ftsj39860.409ENSSTOG00000021265FTSJ39960.714Ictidomys_tridecemlineatus
ENSTNIG00000015549ftsj39861.463ENSJJAG00000012822Ftsj39961.391Jaculus_jaculus
ENSTNIG00000015549ftsj39977.804ENSKMAG00000021997ftsj39877.224Kryptolebias_marmoratus
ENSTNIG00000015549ftsj39977.338ENSLBEG00000027142ftsj39877.381Labrus_bergylta
ENSTNIG00000015549ftsj38246.884ENSLACG00000005523FTSJ39846.857Latimeria_chalumnae
ENSTNIG00000015549ftsj39965.967ENSLOCG00000008979ftsj39968.047Lepisosteus_oculatus
ENSTNIG00000015549ftsj39960.355ENSLAFG00000003252FTSJ39960.635Loxodonta_africana
ENSTNIG00000015549ftsj39860.096ENSMFAG00000003764FTSJ39959.930Macaca_fascicularis
ENSTNIG00000015549ftsj39859.196ENSMMUG00000016768FTSJ39959.014Macaca_mulatta
ENSTNIG00000015549ftsj39860.024ENSMNEG00000029254FTSJ39959.743Macaca_nemestrina
ENSTNIG00000015549ftsj39860.382ENSMLEG00000029091FTSJ39960.256Mandrillus_leucophaeus
ENSTNIG00000015549ftsj39972.826ENSMAMG00000006408ftsj39873.576Mastacembelus_armatus
ENSTNIG00000015549ftsj39977.061ENSMZEG00005001992ftsj39778.741Maylandia_zebra
ENSTNIG00000015549ftsj39065.554ENSMGAG00000000953FTSJ310059.727Meleagris_gallopavo
ENSTNIG00000015549ftsj39860.706ENSMAUG00000015688Ftsj39960.744Mesocricetus_auratus
ENSTNIG00000015549ftsj39860.501ENSMICG00000045996FTSJ39961.065Microcebus_murinus
ENSTNIG00000015549ftsj39962.335ENSMOCG00000017809Ftsj39961.071Microtus_ochrogaster
ENSTNIG00000015549ftsj39977.470ENSMMOG00000019522ftsj39179.976Mola_mola
ENSTNIG00000015549ftsj310062.057ENSMODG00000009901FTSJ39961.712Monodelphis_domestica
ENSTNIG00000015549ftsj39860.744MGP_CAROLIEiJ_G0017315Ftsj39960.329Mus_caroli
ENSTNIG00000015549ftsj39861.345ENSMUSG00000020706Ftsj39961.019Mus_musculus
ENSTNIG00000015549ftsj39861.124MGP_PahariEiJ_G0018445Ftsj39960.592Mus_pahari
ENSTNIG00000015549ftsj39861.271MGP_SPRETEiJ_G0018159Ftsj39960.900Mus_spretus
ENSTNIG00000015549ftsj39960.906ENSMPUG00000014911FTSJ39961.045Mustela_putorius_furo
ENSTNIG00000015549ftsj39959.242ENSMLUG00000011667FTSJ39959.788Myotis_lucifugus
ENSTNIG00000015549ftsj39961.957ENSNGAG00000005899Ftsj39961.548Nannospalax_galili
ENSTNIG00000015549ftsj38684.737ENSNBRG00000017453ftsj39984.737Neolamprologus_brichardi
ENSTNIG00000015549ftsj39860.312ENSNLEG00000004188FTSJ39959.836Nomascus_leucogenys
ENSTNIG00000015549ftsj39958.353ENSMEUG00000013252FTSJ39958.234Notamacropus_eugenii
ENSTNIG00000015549ftsj39860.552ENSOPRG00000014985FTSJ39960.166Ochotona_princeps
ENSTNIG00000015549ftsj39960.642ENSODEG00000008167FTSJ39960.380Octodon_degus
ENSTNIG00000015549ftsj39977.566ENSONIG00000001654ftsj39778.648Oreochromis_niloticus
ENSTNIG00000015549ftsj39961.603ENSOCUG00000004319FTSJ36564.144Oryctolagus_cuniculus
ENSTNIG00000015549ftsj310077.619ENSORLG00000005910ftsj39877.450Oryzias_latipes
ENSTNIG00000015549ftsj310076.813ENSORLG00020021255ftsj39184.375Oryzias_latipes_hni
ENSTNIG00000015549ftsj310077.857ENSORLG00015018416ftsj39877.686Oryzias_latipes_hsok
ENSTNIG00000015549ftsj39977.738ENSOMEG00000014432ftsj39876.950Oryzias_melastigma
ENSTNIG00000015549ftsj39959.312ENSOGAG00000032479FTSJ39959.622Otolemur_garnettii
ENSTNIG00000015549ftsj39860.095ENSOARG00000013637FTSJ36665.187Ovis_aries
ENSTNIG00000015549ftsj39859.360ENSPPAG00000027297FTSJ39959.765Pan_paniscus
ENSTNIG00000015549ftsj39960.143ENSPPRG00000003042FTSJ39960.642Panthera_pardus
ENSTNIG00000015549ftsj39958.304ENSPTIG00000012576FTSJ39960.380Panthera_tigris_altaica
ENSTNIG00000015549ftsj39859.501ENSPTRG00000009524FTSJ39959.812Pan_troglodytes
ENSTNIG00000015549ftsj39860.335ENSPANG00000020978FTSJ39960.047Papio_anubis
ENSTNIG00000015549ftsj39871.826ENSPKIG00000012838ftsj39872.052Paramormyrops_kingsleyae
ENSTNIG00000015549ftsj35079.545ENSPSIG00000004632FTSJ35779.208Pelodiscus_sinensis
ENSTNIG00000015549ftsj39965.042ENSPMGG00000012959ftsj39964.447Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSTNIG00000015549ftsj39862.271ENSPEMG00000000248Ftsj39961.751Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSTNIG00000015549ftsj39962.440ENSPCIG00000009088FTSJ39962.143Phascolarctos_cinereus
ENSTNIG00000015549ftsj310076.028ENSPFOG00000023101ftsj39875.323Poecilia_formosa
ENSTNIG00000015549ftsj310075.822ENSPLAG00000003846ftsj39975.117Poecilia_latipinna
ENSTNIG00000015549ftsj310076.263ENSPMEG00000012692ftsj39875.558Poecilia_mexicana
ENSTNIG00000015549ftsj310075.029ENSPREG00000014874ftsj39874.679Poecilia_reticulata
ENSTNIG00000015549ftsj39860.701ENSPPYG00000008532FTSJ39961.124Pongo_abelii
ENSTNIG00000015549ftsj39958.760ENSPCAG00000002560FTSJ39958.999Procavia_capensis
ENSTNIG00000015549ftsj39859.784ENSPCOG00000023921FTSJ39960.664Propithecus_coquereli
ENSTNIG00000015549ftsj39958.207ENSPVAG00000000162FTSJ36663.588Pteropus_vampyrus
ENSTNIG00000015549ftsj38684.574ENSPNYG00000005108ftsj39884.574Pundamilia_nyererei
ENSTNIG00000015549ftsj39571.287ENSPNAG00000022474ftsj39671.068Pygocentrus_nattereri
ENSTNIG00000015549ftsj39961.871ENSRNOG00000009857Ftsj39961.198Rattus_norvegicus
ENSTNIG00000015549ftsj39859.928ENSRBIG00000039259FTSJ39959.532Rhinopithecus_bieti
ENSTNIG00000015549ftsj39859.809ENSRROG00000045002FTSJ39959.415Rhinopithecus_roxellana
ENSTNIG00000015549ftsj39936.054YCL054W-5643.121Saccharomyces_cerevisiae
ENSTNIG00000015549ftsj39959.739ENSSBOG00000031794FTSJ39360.710Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSTNIG00000015549ftsj39961.995ENSSHAG00000013062FTSJ39961.484Sarcophilus_harrisii
ENSTNIG00000015549ftsj39970.609ENSSFOG00015018053ftsj39969.504Scleropages_formosus
ENSTNIG00000015549ftsj39975.812ENSSMAG00000002863ftsj39779.286Scophthalmus_maximus
ENSTNIG00000015549ftsj39980.167ENSSDUG00000003385ftsj39780.404Seriola_dumerili
ENSTNIG00000015549ftsj39980.024ENSSLDG00000017970ftsj39780.499Seriola_lalandi_dorsalis
ENSTNIG00000015549ftsj39261.032ENSSPUG00000012959FTSJ39960.492Sphenodon_punctatus
ENSTNIG00000015549ftsj310078.538ENSSPAG00000002390ftsj39878.774Stegastes_partitus
ENSTNIG00000015549ftsj39859.881ENSSSCG00000017288FTSJ39960.952Sus_scrofa
ENSTNIG00000015549ftsj39988.688ENSTRUG00000017550ftsj39888.517Takifugu_rubripes
ENSTNIG00000015549ftsj39856.763ENSTBEG00000010295FTSJ39957.788Tupaia_belangeri
ENSTNIG00000015549ftsj39860.457ENSTTRG00000006973FTSJ39961.831Tursiops_truncatus
ENSTNIG00000015549ftsj38189.552ENSUAMG00000007332FTSJ39589.552Ursus_americanus
ENSTNIG00000015549ftsj39960.735ENSUMAG00000017450FTSJ39961.888Ursus_maritimus
ENSTNIG00000015549ftsj39961.474ENSVVUG00000006106FTSJ39961.144Vulpes_vulpes
ENSTNIG00000015549ftsj39655.910ENSXETG00000006939ftsj39955.437Xenopus_tropicalis
ENSTNIG00000015549ftsj39970.190ENSXCOG00000002999ftsj39869.834Xiphophorus_couchianus
ENSTNIG00000015549ftsj39974.733ENSXMAG00000018139ftsj39874.853Xiphophorus_maculatus

Copyright © , Bioinformatics Center, Sun Yat-sen Memorial Hospital, Sun Yat-sen University, China. All Rights Reserved.

Any comment and suggestion, please contact us