EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSTNIG00000016140 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: htatsf1
Alias: zgc:66252
Full Name: HIV-1 Tat specific factor 1
Gene Type: protein_coding
Species: Tetraodon_nigroviridis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 2476 bases
Position: chr7:8226057-8228532
Accession: ZDB-GENE-040426-1578
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSTNIP00000019231	RRM_1	PF00076.22	1e-14	1	2
ENSTNIP00000019231	RRM_1	PF00076.22	1e-14	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSTNIT00000019460	-	1514	-	ENSTNIP00000019231	442 (aa)	-	H3DFD7

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSTNIG00000016140	htatsf1	83	62.169	ENSG00000102241	HTATSF1	100	56.098	Homo_sapiens
ENSTNIG00000016140	htatsf1	99	76.770	ENSAPOG00000009823	htatsf1	100	76.770	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTNIG00000016140	htatsf1	87	63.520	ENSAMEG00000002921	HTATSF1	50	63.000	Ailuropoda_melanoleuca
ENSTNIG00000016140	htatsf1	99	76.549	ENSACIG00000020459	htatsf1	100	77.212	Amphilophus_citrinellus
ENSTNIG00000016140	htatsf1	99	75.817	ENSAOCG00000020994	htatsf1	100	76.253	Amphiprion_ocellaris
ENSTNIG00000016140	htatsf1	99	77.193	ENSAPEG00000016432	htatsf1	100	77.193	Amphiprion_percula
ENSTNIG00000016140	htatsf1	94	77.698	ENSATEG00000008903	htatsf1	94	77.698	Anabas_testudineus
ENSTNIG00000016140	htatsf1	90	62.911	ENSAPLG00000012401	HTATSF1	99	63.033	Anas_platyrhynchos
ENSTNIG00000016140	htatsf1	87	61.299	ENSACAG00000009346	HTATSF1	99	60.448	Anolis_carolinensis
ENSTNIG00000016140	htatsf1	99	77.655	ENSACLG00000008096	htatsf1	100	77.655	Astatotilapia_calliptera
ENSTNIG00000016140	htatsf1	99	64.655	ENSAMXG00000008387	htatsf1	99	65.870	Astyanax_mexicanus
ENSTNIG00000016140	htatsf1	88	62.935	ENSBTAG00000054942	HTATSF1	50	64.428	Bos_taurus
ENSTNIG00000016140	htatsf1	88	62.935	ENSBTAG00000055212	HTATSF1	50	64.428	Bos_taurus
ENSTNIG00000016140	htatsf1	88	61.940	ENSBTAG00000032711	HTATSF1	52	61.940	Bos_taurus
ENSTNIG00000016140	htatsf1	78	38.068	WBGene00022025	Y65B4A.1	76	37.500	Caenorhabditis_elegans
ENSTNIG00000016140	htatsf1	87	64.213	ENSCAFG00000023294	HTATSF1	50	64.213	Canis_familiaris
ENSTNIG00000016140	htatsf1	88	63.184	ENSCHIG00000000312	HTATSF1	51	64.677	Capra_hircus
ENSTNIG00000016140	htatsf1	83	63.032	ENSTSYG00000028876	HTATSF1	51	63.184	Carlito_syrichta
ENSTNIG00000016140	htatsf1	83	60.533	ENSCCAG00000025329	-	55	61.069	Cebus_capucinus
ENSTNIG00000016140	htatsf1	83	62.434	ENSCATG00000029963	HTATSF1	53	60.520	Cercocebus_atys
ENSTNIG00000016140	htatsf1	90	61.205	ENSCLAG00000002718	HTATSF1	53	60.570	Chinchilla_lanigera
ENSTNIG00000016140	htatsf1	83	62.834	ENSCSAG00000007505	HTATSF1	53	60.520	Chlorocebus_sabaeus
ENSTNIG00000016140	htatsf1	98	62.198	ENSCPBG00000026092	HTATSF1	98	62.198	Chrysemys_picta_bellii
ENSTNIG00000016140	htatsf1	90	39.873	ENSCING00000005914	-	91	40.351	Ciona_intestinalis
ENSTNIG00000016140	htatsf1	88	43.836	ENSCSAVG00000000371	-	92	43.014	Ciona_savignyi
ENSTNIG00000016140	htatsf1	83	63.102	ENSCANG00000028495	HTATSF1	53	60.757	Colobus_angolensis_palliatus
ENSTNIG00000016140	htatsf1	99	75.450	ENSCVAG00000014070	htatsf1	99	75.056	Cyprinodon_variegatus
ENSTNIG00000016140	htatsf1	99	65.502	ENSDARG00000056649	htatsf1	100	65.939	Danio_rerio
ENSTNIG00000016140	htatsf1	88	62.687	ENSDNOG00000002254	HTATSF1	50	62.687	Dasypus_novemcinctus
ENSTNIG00000016140	htatsf1	81	45.682	FBgn0037081	barc	64	45.682	Drosophila_melanogaster
ENSTNIG00000016140	htatsf1	86	55.471	ENSEBUG00000001534	htatsf1	78	53.980	Eptatretus_burgeri
ENSTNIG00000016140	htatsf1	99	62.500	ENSELUG00000005486	htatsf1	90	64.946	Esox_lucius
ENSTNIG00000016140	htatsf1	88	61.905	ENSFCAG00000031924	HTATSF1	51	61.905	Felis_catus
ENSTNIG00000016140	htatsf1	86	66.839	ENSFALG00000003728	HTATSF1	99	60.262	Ficedula_albicollis
ENSTNIG00000016140	htatsf1	88	62.871	ENSFDAG00000008617	HTATSF1	51	63.119	Fukomys_damarensis
ENSTNIG00000016140	htatsf1	99	76.975	ENSFHEG00000020286	htatsf1	100	76.975	Fundulus_heteroclitus
ENSTNIG00000016140	htatsf1	82	73.901	ENSGMOG00000016444	htatsf1	100	73.901	Gadus_morhua
ENSTNIG00000016140	htatsf1	98	60.784	ENSGALG00000006410	HTATSF1	99	60.394	Gallus_gallus
ENSTNIG00000016140	htatsf1	99	75.730	ENSGAFG00000003041	htatsf1	98	75.730	Gambusia_affinis
ENSTNIG00000016140	htatsf1	99	74.215	ENSGACG00000020459	htatsf1	100	74.215	Gasterosteus_aculeatus
ENSTNIG00000016140	htatsf1	83	62.169	ENSGGOG00000026072	HTATSF1	53	60.284	Gorilla_gorilla
ENSTNIG00000016140	htatsf1	99	78.097	ENSHBUG00000004392	htatsf1	100	78.097	Haplochromis_burtoni
ENSTNIG00000016140	htatsf1	94	59.302	ENSHGLG00000005328	HTATSF1	54	59.302	Heterocephalus_glaber_female
ENSTNIG00000016140	htatsf1	99	68.807	ENSHCOG00000009056	htatsf1	99	69.161	Hippocampus_comes
ENSTNIG00000016140	htatsf1	99	63.002	ENSIPUG00000017828	htatsf1	99	64.407	Ictalurus_punctatus
ENSTNIG00000016140	htatsf1	83	62.834	ENSSTOG00000012505	HTATSF1	52	62.935	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSTNIG00000016140	htatsf1	99	76.169	ENSKMAG00000007622	htatsf1	100	76.169	Kryptolebias_marmoratus
ENSTNIG00000016140	htatsf1	99	75.991	ENSLBEG00000001154	htatsf1	100	75.991	Labrus_bergylta
ENSTNIG00000016140	htatsf1	99	61.778	ENSLACG00000015989	HTATSF1	99	61.778	Latimeria_chalumnae
ENSTNIG00000016140	htatsf1	98	45.860	ENSLOCG00000015118	htatsf1	99	46.008	Lepisosteus_oculatus
ENSTNIG00000016140	htatsf1	87	64.885	ENSLAFG00000014307	HTATSF1	55	64.377	Loxodonta_africana
ENSTNIG00000016140	htatsf1	83	62.834	ENSMFAG00000044705	HTATSF1	53	60.520	Macaca_fascicularis
ENSTNIG00000016140	htatsf1	83	62.434	ENSMMUG00000006450	HTATSF1	53	60.520	Macaca_mulatta
ENSTNIG00000016140	htatsf1	83	62.834	ENSMNEG00000024084	HTATSF1	59	60.520	Macaca_nemestrina
ENSTNIG00000016140	htatsf1	83	62.834	ENSMLEG00000035511	HTATSF1	53	60.520	Mandrillus_leucophaeus
ENSTNIG00000016140	htatsf1	99	77.727	ENSMAMG00000021225	htatsf1	99	77.727	Mastacembelus_armatus
ENSTNIG00000016140	htatsf1	99	77.655	ENSMZEG00005000485	htatsf1	100	77.876	Maylandia_zebra
ENSTNIG00000016140	htatsf1	93	62.356	ENSMGAG00000003558	HTATSF1	98	62.356	Meleagris_gallopavo
ENSTNIG00000016140	htatsf1	88	63.457	ENSMAUG00000007235	Htatsf1	51	63.457	Mesocricetus_auratus
ENSTNIG00000016140	htatsf1	83	61.111	ENSMICG00000009348	HTATSF1	50	62.121	Microcebus_murinus
ENSTNIG00000016140	htatsf1	83	62.466	ENSMOCG00000023007	-	51	62.594	Microtus_ochrogaster
ENSTNIG00000016140	htatsf1	83	60.950	ENSMOCG00000022370	-	51	61.179	Microtus_ochrogaster
ENSTNIG00000016140	htatsf1	99	80.225	ENSMMOG00000011013	htatsf1	100	80.225	Mola_mola
ENSTNIG00000016140	htatsf1	57	58.427	ENSMODG00000000199	-	91	57.600	Monodelphis_domestica
ENSTNIG00000016140	htatsf1	99	60.349	ENSMODG00000014087	-	98	60.349	Monodelphis_domestica
ENSTNIG00000016140	htatsf1	99	75.501	ENSMALG00000019977	htatsf1	100	75.501	Monopterus_albus
ENSTNIG00000016140	htatsf1	83	61.968	MGP_CAROLIEiJ_G0033094	Htatsf1	50	62.690	Mus_caroli
ENSTNIG00000016140	htatsf1	87	62.087	ENSMLUG00000009234	-	52	62.437	Myotis_lucifugus
ENSTNIG00000016140	htatsf1	83	62.466	ENSNGAG00000017831	Htatsf1	51	63.171	Nannospalax_galili
ENSTNIG00000016140	htatsf1	99	77.212	ENSNBRG00000003818	htatsf1	100	77.434	Neolamprologus_brichardi
ENSTNIG00000016140	htatsf1	83	62.698	ENSNLEG00000002746	HTATSF1	53	60.757	Nomascus_leucogenys
ENSTNIG00000016140	htatsf1	90	63.861	ENSMEUG00000004133	-	93	64.109	Notamacropus_eugenii
ENSTNIG00000016140	htatsf1	99	77.655	ENSONIG00000008638	htatsf1	100	77.655	Oreochromis_niloticus
ENSTNIG00000016140	htatsf1	90	60.526	ENSOANG00000011674	-	98	60.238	Ornithorhynchus_anatinus
ENSTNIG00000016140	htatsf1	83	61.930	ENSOCUG00000012570	HTATSF1	51	62.095	Oryctolagus_cuniculus
ENSTNIG00000016140	htatsf1	99	72.308	ENSORLG00000002356	htatsf1	100	72.527	Oryzias_latipes
ENSTNIG00000016140	htatsf1	99	71.834	ENSORLG00020017818	htatsf1	97	71.895	Oryzias_latipes_hni
ENSTNIG00000016140	htatsf1	99	72.429	ENSORLG00015002268	htatsf1	100	72.627	Oryzias_latipes_hsok
ENSTNIG00000016140	htatsf1	100	73.362	ENSOMEG00000007564	htatsf1	100	73.568	Oryzias_melastigma
ENSTNIG00000016140	htatsf1	88	62.189	ENSOARG00000000481	-	50	62.189	Ovis_aries
ENSTNIG00000016140	htatsf1	83	62.169	ENSPPAG00000024268	HTATSF1	53	60.284	Pan_paniscus
ENSTNIG00000016140	htatsf1	88	62.155	ENSPPRG00000014209	HTATSF1	51	62.155	Panthera_pardus
ENSTNIG00000016140	htatsf1	83	62.169	ENSPTRG00000044591	HTATSF1	53	60.284	Pan_troglodytes
ENSTNIG00000016140	htatsf1	99	65.351	ENSPKIG00000024852	htatsf1	99	65.351	Paramormyrops_kingsleyae
ENSTNIG00000016140	htatsf1	71	67.568	ENSPSIG00000010192	HTATSF1	94	67.568	Pelodiscus_sinensis
ENSTNIG00000016140	htatsf1	99	72.000	ENSPMGG00000006172	htatsf1	99	72.000	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSTNIG00000016140	htatsf1	86	66.071	ENSPCIG00000030173	-	87	65.657	Phascolarctos_cinereus
ENSTNIG00000016140	htatsf1	98	57.333	ENSPCIG00000018896	-	98	57.494	Phascolarctos_cinereus
ENSTNIG00000016140	htatsf1	99	75.506	ENSPFOG00000007871	htatsf1	97	75.506	Poecilia_formosa
ENSTNIG00000016140	htatsf1	99	75.450	ENSPLAG00000007532	htatsf1	100	75.450	Poecilia_latipinna
ENSTNIG00000016140	htatsf1	99	75.785	ENSPMEG00000000352	htatsf1	100	75.225	Poecilia_mexicana
ENSTNIG00000016140	htatsf1	99	76.009	ENSPREG00000007811	htatsf1	100	75.450	Poecilia_reticulata
ENSTNIG00000016140	htatsf1	83	62.698	ENSPPYG00000020765	HTATSF1	53	60.993	Pongo_abelii
ENSTNIG00000016140	htatsf1	87	57.761	ENSPCAG00000010576	HTATSF1	52	57.545	Procavia_capensis
ENSTNIG00000016140	htatsf1	83	62.834	ENSPCOG00000021823	HTATSF1	50	63.520	Propithecus_coquereli
ENSTNIG00000016140	htatsf1	88	63.000	ENSPVAG00000010281	HTATSF1	55	63.000	Pteropus_vampyrus
ENSTNIG00000016140	htatsf1	99	77.434	ENSPNYG00000016693	htatsf1	100	77.655	Pundamilia_nyererei
ENSTNIG00000016140	htatsf1	99	66.239	ENSPNAG00000006166	htatsf1	99	66.880	Pygocentrus_nattereri
ENSTNIG00000016140	htatsf1	83	62.834	ENSRROG00000021939	HTATSF1	53	60.520	Rhinopithecus_roxellana
ENSTNIG00000016140	htatsf1	81	62.097	ENSSBOG00000027186	-	53	60.192	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSTNIG00000016140	htatsf1	88	66.582	ENSSHAG00000006440	-	98	66.837	Sarcophilus_harrisii
ENSTNIG00000016140	htatsf1	98	61.135	ENSSHAG00000018908	-	97	61.135	Sarcophilus_harrisii
ENSTNIG00000016140	htatsf1	99	60.504	ENSSFOG00015012002	htatsf1	99	60.638	Scleropages_formosus
ENSTNIG00000016140	htatsf1	99	72.926	ENSSMAG00000002970	htatsf1	100	72.926	Scophthalmus_maximus
ENSTNIG00000016140	htatsf1	99	76.027	ENSSDUG00000020002	htatsf1	99	75.799	Seriola_dumerili
ENSTNIG00000016140	htatsf1	99	76.837	ENSSLDG00000016880	htatsf1	100	76.837	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSTNIG00000016140	htatsf1	88	60.401	ENSSARG00000005193	HTATSF1	53	60.401	Sorex_araneus
ENSTNIG00000016140	htatsf1	99	62.745	ENSSPUG00000014767	HTATSF1	98	62.582	Sphenodon_punctatus
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ENSTNIG00000016140	htatsf1	83	63.636	ENSSSCG00000023062	HTATSF1	57	62.379	Sus_scrofa
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