EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSTNIG00000016912 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: syf2
Alias: hm:zeh0031|zeh0031|zgc:113871|zgc:92835
Full Name: SYF2 pre-mRNA-splicing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Tetraodon_nigroviridis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 2552 bases
Position: chr10:3734703-3737254
Accession: ZDB-GENE-040801-170
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSTNIP00000020031	SYF2	PF08231.12	2.8e-52	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSTNIT00000020262	-	672	-	ENSTNIP00000020031	223 (aa)	-	H3DHN7

Gene Model

Click here to download ENSTNIG00000016912's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSTNIG00000016912's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSTNIG00000016912	syf2	97	80.556	ENSG00000117614	SYF2	90	80.275	Homo_sapiens
ENSTNIG00000016912	syf2	99	87.838	ENSAPOG00000001174	syf2	93	87.838	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTNIG00000016912	syf2	87	78.462	ENSAMEG00000010134	-	100	78.462	Ailuropoda_melanoleuca
ENSTNIG00000016912	syf2	98	79.358	ENSAMEG00000010115	-	90	79.358	Ailuropoda_melanoleuca
ENSTNIG00000016912	syf2	99	88.288	ENSACIG00000023688	syf2	89	88.288	Amphilophus_citrinellus
ENSTNIG00000016912	syf2	99	87.727	ENSAOCG00000022046	syf2	94	87.387	Amphiprion_ocellaris
ENSTNIG00000016912	syf2	92	87.317	ENSAOCG00000010912	syf2	64	87.317	Amphiprion_ocellaris
ENSTNIG00000016912	syf2	99	87.387	ENSAPEG00000018858	syf2	86	87.387	Amphiprion_percula
ENSTNIG00000016912	syf2	97	89.401	ENSATEG00000007745	syf2	93	89.189	Anabas_testudineus
ENSTNIG00000016912	syf2	90	80.500	ENSAPLG00000016435	SYF2	99	80.500	Anas_platyrhynchos
ENSTNIG00000016912	syf2	74	67.066	ENSACAG00000026777	-	100	67.066	Anolis_carolinensis
ENSTNIG00000016912	syf2	91	78.922	ENSACAG00000013653	-	100	78.922	Anolis_carolinensis
ENSTNIG00000016912	syf2	97	81.019	ENSANAG00000032473	SYF2	90	80.734	Aotus_nancymaae
ENSTNIG00000016912	syf2	99	90.090	ENSACLG00000019916	syf2	93	90.090	Astatotilapia_calliptera
ENSTNIG00000016912	syf2	99	82.883	ENSAMXG00000004051	syf2	93	82.883	Astyanax_mexicanus
ENSTNIG00000016912	syf2	100	79.372	ENSBTAG00000001651	SYF2	94	79.372	Bos_taurus
ENSTNIG00000016912	syf2	93	51.185	WBGene00019402	syf-2	90	50.472	Caenorhabditis_elegans
ENSTNIG00000016912	syf2	97	81.019	ENSCJAG00000046570	SYF2	90	80.734	Callithrix_jacchus
ENSTNIG00000016912	syf2	99	72.398	ENSCAFG00000030331	-	97	72.398	Canis_familiaris
ENSTNIG00000016912	syf2	97	79.630	ENSCAFG00000012895	-	89	79.358	Canis_familiaris
ENSTNIG00000016912	syf2	97	79.630	ENSCAFG00020021091	-	89	79.358	Canis_lupus_dingo
ENSTNIG00000016912	syf2	83	70.588	ENSCAFG00020021094	-	97	70.588	Canis_lupus_dingo
ENSTNIG00000016912	syf2	100	78.924	ENSCHIG00000020874	SYF2	93	78.924	Capra_hircus
ENSTNIG00000016912	syf2	100	78.475	ENSTSYG00000005114	SYF2	92	78.475	Carlito_syrichta
ENSTNIG00000016912	syf2	89	79.293	ENSCAPG00000010006	SYF2	100	79.293	Cavia_aperea
ENSTNIG00000016912	syf2	98	80.734	ENSCPOG00000005326	SYF2	89	80.734	Cavia_porcellus
ENSTNIG00000016912	syf2	97	81.019	ENSCCAG00000022459	SYF2	90	80.734	Cebus_capucinus
ENSTNIG00000016912	syf2	98	79.358	ENSCATG00000026917	SYF2	90	79.358	Cercocebus_atys
ENSTNIG00000016912	syf2	100	79.372	ENSCLAG00000008474	SYF2	91	79.372	Chinchilla_lanigera
ENSTNIG00000016912	syf2	98	79.358	ENSCSAG00000000948	SYF2	90	79.358	Chlorocebus_sabaeus
ENSTNIG00000016912	syf2	73	64.417	ENSCHOG00000005273	-	89	64.417	Choloepus_hoffmanni
ENSTNIG00000016912	syf2	100	79.821	ENSCPBG00000025073	SYF2	90	79.821	Chrysemys_picta_bellii
ENSTNIG00000016912	syf2	99	53.571	ENSCING00000003017	-	89	55.869	Ciona_intestinalis
ENSTNIG00000016912	syf2	95	49.765	ENSCSAVG00000006627	-	97	49.765	Ciona_savignyi
ENSTNIG00000016912	syf2	98	69.266	ENSCANG00000037322	SYF2	88	69.266	Colobus_angolensis_palliatus
ENSTNIG00000016912	syf2	100	79.372	ENSCGRG00001020733	Syf2	92	79.372	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSTNIG00000016912	syf2	88	80.102	ENSCGRG00000005095	Syf2	96	79.899	Cricetulus_griseus_crigri
ENSTNIG00000016912	syf2	98	85.845	ENSCSEG00000000117	syf2	93	85.586	Cynoglossus_semilaevis
ENSTNIG00000016912	syf2	99	87.783	ENSCVAG00000019543	syf2	92	87.783	Cyprinodon_variegatus
ENSTNIG00000016912	syf2	99	84.234	ENSDARG00000004706	syf2	93	84.234	Danio_rerio
ENSTNIG00000016912	syf2	100	78.924	ENSDNOG00000047605	SYF2	91	78.924	Dasypus_novemcinctus
ENSTNIG00000016912	syf2	100	79.372	ENSDORG00000001274	Syf2	91	79.372	Dipodomys_ordii
ENSTNIG00000016912	syf2	98	53.182	FBgn0033556	CG12343	97	53.182	Drosophila_melanogaster
ENSTNIG00000016912	syf2	93	67.633	ENSETEG00000015729	SYF2	90	67.633	Echinops_telfairi
ENSTNIG00000016912	syf2	88	58.376	ENSEBUG00000015402	syf2	95	58.376	Eptatretus_burgeri
ENSTNIG00000016912	syf2	98	80.734	ENSEASG00005004224	-	89	80.734	Equus_asinus_asinus
ENSTNIG00000016912	syf2	100	69.507	ENSEASG00005004232	-	92	69.507	Equus_asinus_asinus
ENSTNIG00000016912	syf2	98	80.734	ENSECAG00000010440	-	91	80.734	Equus_caballus
ENSTNIG00000016912	syf2	100	79.372	ENSECAG00000012023	-	91	79.372	Equus_caballus
ENSTNIG00000016912	syf2	70	69.427	ENSEEUG00000015084	SYF2	86	69.427	Erinaceus_europaeus
ENSTNIG00000016912	syf2	99	85.135	ENSELUG00000003465	syf2	93	85.135	Esox_lucius
ENSTNIG00000016912	syf2	98	79.817	ENSFCAG00000043095	-	89	79.817	Felis_catus
ENSTNIG00000016912	syf2	98	80.734	ENSFCAG00000010324	-	75	80.734	Felis_catus
ENSTNIG00000016912	syf2	91	78.431	ENSFALG00000000460	SYF2	89	77.982	Ficedula_albicollis
ENSTNIG00000016912	syf2	98	80.275	ENSFDAG00000008310	SYF2	90	80.275	Fukomys_damarensis
ENSTNIG00000016912	syf2	100	73.214	ENSFHEG00000007238	syf2	99	73.214	Fundulus_heteroclitus
ENSTNIG00000016912	syf2	96	85.581	ENSGMOG00000019138	syf2	96	85.581	Gadus_morhua
ENSTNIG00000016912	syf2	100	79.821	ENSGALG00000013639	SYF2	88	79.821	Gallus_gallus
ENSTNIG00000016912	syf2	99	87.387	ENSGAFG00000019435	syf2	93	87.387	Gambusia_affinis
ENSTNIG00000016912	syf2	99	86.036	ENSGACG00000007305	syf2	93	86.036	Gasterosteus_aculeatus
ENSTNIG00000016912	syf2	100	80.269	ENSGAGG00000010670	SYF2	90	80.269	Gopherus_agassizii
ENSTNIG00000016912	syf2	97	80.556	ENSGGOG00000012796	SYF2	90	80.275	Gorilla_gorilla
ENSTNIG00000016912	syf2	99	90.090	ENSHBUG00000020477	syf2	95	90.090	Haplochromis_burtoni
ENSTNIG00000016912	syf2	99	68.919	ENSHGLG00000004304	-	93	69.369	Heterocephalus_glaber_female
ENSTNIG00000016912	syf2	99	79.730	ENSHGLG00000014393	SYF2	91	79.730	Heterocephalus_glaber_female
ENSTNIG00000016912	syf2	99	79.730	ENSHGLG00100014722	SYF2	91	79.730	Heterocephalus_glaber_male
ENSTNIG00000016912	syf2	99	89.640	ENSHCOG00000012904	syf2	73	89.640	Hippocampus_comes
ENSTNIG00000016912	syf2	98	84.862	ENSIPUG00000019859	syf2	92	84.862	Ictalurus_punctatus
ENSTNIG00000016912	syf2	65	74.658	ENSSTOG00000023984	SYF2	100	74.658	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSTNIG00000016912	syf2	96	75.234	ENSJJAG00000013301	Syf2	94	79.899	Jaculus_jaculus
ENSTNIG00000016912	syf2	99	88.288	ENSKMAG00000013856	syf2	94	88.288	Kryptolebias_marmoratus
ENSTNIG00000016912	syf2	97	89.862	ENSLBEG00000014425	syf2	94	88.341	Labrus_bergylta
ENSTNIG00000016912	syf2	99	79.279	ENSLACG00000012064	SYF2	93	79.279	Latimeria_chalumnae
ENSTNIG00000016912	syf2	100	83.857	ENSLOCG00000002728	syf2	89	83.857	Lepisosteus_oculatus
ENSTNIG00000016912	syf2	82	53.804	ENSLAFG00000030814	-	100	53.804	Loxodonta_africana
ENSTNIG00000016912	syf2	100	79.372	ENSLAFG00000023150	-	91	79.372	Loxodonta_africana
ENSTNIG00000016912	syf2	98	79.358	ENSMFAG00000041831	SYF2	90	79.358	Macaca_fascicularis
ENSTNIG00000016912	syf2	97	79.630	ENSMMUG00000002968	SYF2	90	79.358	Macaca_mulatta
ENSTNIG00000016912	syf2	98	79.358	ENSMNEG00000030180	SYF2	90	79.358	Macaca_nemestrina
ENSTNIG00000016912	syf2	98	79.358	ENSMLEG00000030248	SYF2	90	79.358	Mandrillus_leucophaeus
ENSTNIG00000016912	syf2	97	88.940	ENSMAMG00000010403	syf2	92	88.288	Mastacembelus_armatus
ENSTNIG00000016912	syf2	99	90.090	ENSMZEG00005006429	syf2	93	90.090	Maylandia_zebra
ENSTNIG00000016912	syf2	89	80.402	ENSMGAG00000002019	SYF2	100	80.402	Meleagris_gallopavo
ENSTNIG00000016912	syf2	100	79.372	ENSMAUG00000018974	Syf2	92	79.372	Mesocricetus_auratus
ENSTNIG00000016912	syf2	89	79.899	ENSMICG00000016191	SYF2	100	79.899	Microcebus_murinus
ENSTNIG00000016912	syf2	100	79.821	ENSMOCG00000022938	Syf2	92	79.821	Microtus_ochrogaster
ENSTNIG00000016912	syf2	99	87.838	ENSMMOG00000002396	syf2	93	87.838	Mola_mola
ENSTNIG00000016912	syf2	100	75.111	ENSMODG00000013951	-	98	75.111	Monodelphis_domestica
ENSTNIG00000016912	syf2	99	87.444	ENSMALG00000010706	syf2	93	87.892	Monopterus_albus
ENSTNIG00000016912	syf2	100	80.269	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	92	80.269	Mus_caroli
ENSTNIG00000016912	syf2	100	80.269	ENSMUSG00000028821	Syf2	92	80.269	Mus_musculus
ENSTNIG00000016912	syf2	100	80.269	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	92	80.269	Mus_pahari
ENSTNIG00000016912	syf2	100	80.269	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	92	80.269	Mus_spretus
ENSTNIG00000016912	syf2	97	79.630	ENSMPUG00000015802	-	89	79.358	Mustela_putorius_furo
ENSTNIG00000016912	syf2	100	78.475	ENSMPUG00000015801	-	91	78.475	Mustela_putorius_furo
ENSTNIG00000016912	syf2	100	78.475	ENSMLUG00000001885	SYF2	91	78.475	Myotis_lucifugus
ENSTNIG00000016912	syf2	100	78.924	ENSNGAG00000007912	Syf2	91	78.924	Nannospalax_galili
ENSTNIG00000016912	syf2	99	80.180	ENSNBRG00000010720	syf2	93	79.646	Neolamprologus_brichardi
ENSTNIG00000016912	syf2	97	80.556	ENSNLEG00000035185	SYF2	90	80.275	Nomascus_leucogenys
ENSTNIG00000016912	syf2	100	78.924	ENSOPRG00000012870	SYF2	92	78.924	Ochotona_princeps
ENSTNIG00000016912	syf2	100	69.955	ENSODEG00000014338	-	93	69.955	Octodon_degus
ENSTNIG00000016912	syf2	100	78.475	ENSODEG00000017664	-	94	78.475	Octodon_degus
ENSTNIG00000016912	syf2	99	90.090	ENSONIG00000008213	syf2	93	90.090	Oreochromis_niloticus
ENSTNIG00000016912	syf2	91	79.208	ENSOANG00000009552	SYF2	100	79.208	Ornithorhynchus_anatinus
ENSTNIG00000016912	syf2	97	81.019	ENSOCUG00000013050	SYF2	91	79.372	Oryctolagus_cuniculus
ENSTNIG00000016912	syf2	99	86.486	ENSORLG00000028820	syf2	95	86.486	Oryzias_latipes
ENSTNIG00000016912	syf2	99	86.486	ENSORLG00020018333	syf2	94	86.486	Oryzias_latipes_hni
ENSTNIG00000016912	syf2	99	86.486	ENSORLG00015014665	syf2	93	86.486	Oryzias_latipes_hsok
ENSTNIG00000016912	syf2	99	87.838	ENSOMEG00000013911	syf2	93	87.838	Oryzias_melastigma
ENSTNIG00000016912	syf2	99	80.180	ENSOGAG00000009962	SYF2	91	80.180	Otolemur_garnettii
ENSTNIG00000016912	syf2	100	78.222	ENSOARG00000006348	-	91	78.222	Ovis_aries
ENSTNIG00000016912	syf2	87	52.821	ENSOARG00000006269	-	100	52.821	Ovis_aries
ENSTNIG00000016912	syf2	97	80.556	ENSPPAG00000036579	SYF2	90	80.275	Pan_paniscus
ENSTNIG00000016912	syf2	98	79.817	ENSPPRG00000001651	-	89	79.817	Panthera_pardus
ENSTNIG00000016912	syf2	98	80.734	ENSPPRG00000001638	-	89	80.734	Panthera_pardus
ENSTNIG00000016912	syf2	98	79.817	ENSPTIG00000007036	-	89	79.817	Panthera_tigris_altaica
ENSTNIG00000016912	syf2	97	81.019	ENSPTIG00000005711	-	81	79.372	Panthera_tigris_altaica
ENSTNIG00000016912	syf2	97	80.556	ENSPTRG00000000352	SYF2	90	80.275	Pan_troglodytes
ENSTNIG00000016912	syf2	98	79.358	ENSPANG00000008139	SYF2	90	79.358	Papio_anubis
ENSTNIG00000016912	syf2	99	84.615	ENSPKIG00000008130	syf2	94	84.615	Paramormyrops_kingsleyae
ENSTNIG00000016912	syf2	100	78.924	ENSPSIG00000011816	SYF2	87	78.924	Pelodiscus_sinensis
ENSTNIG00000016912	syf2	100	88.341	ENSPMGG00000008755	syf2	87	88.341	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSTNIG00000016912	syf2	100	79.372	ENSPEMG00000008283	Syf2	92	79.372	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSTNIG00000016912	syf2	100	78.924	ENSPCIG00000014235	SYF2	89	78.924	Phascolarctos_cinereus
ENSTNIG00000016912	syf2	99	87.387	ENSPFOG00000004116	syf2	92	87.387	Poecilia_formosa
ENSTNIG00000016912	syf2	99	86.937	ENSPLAG00000006691	syf2	95	86.937	Poecilia_latipinna
ENSTNIG00000016912	syf2	99	85.455	ENSPMEG00000011684	syf2	95	85.135	Poecilia_mexicana
ENSTNIG00000016912	syf2	97	88.426	ENSPREG00000003009	syf2	94	87.444	Poecilia_reticulata
ENSTNIG00000016912	syf2	98	80.275	ENSPPYG00000001713	SYF2	90	80.275	Pongo_abelii
ENSTNIG00000016912	syf2	100	54.709	ENSPCOG00000027011	SYF2	88	54.709	Propithecus_coquereli
ENSTNIG00000016912	syf2	100	69.507	ENSPVAG00000005841	SYF2	91	69.507	Pteropus_vampyrus
ENSTNIG00000016912	syf2	99	90.090	ENSPNYG00000004979	syf2	93	90.090	Pundamilia_nyererei
ENSTNIG00000016912	syf2	99	84.234	ENSPNAG00000015570	syf2	93	84.234	Pygocentrus_nattereri
ENSTNIG00000016912	syf2	100	80.269	ENSRNOG00000060597	Syf2	92	80.269	Rattus_norvegicus
ENSTNIG00000016912	syf2	98	77.064	ENSRBIG00000042970	SYF2	90	77.064	Rhinopithecus_bieti
ENSTNIG00000016912	syf2	98	79.358	ENSRROG00000001347	SYF2	90	79.358	Rhinopithecus_roxellana
ENSTNIG00000016912	syf2	97	80.556	ENSSBOG00000020184	SYF2	90	80.275	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSTNIG00000016912	syf2	100	77.578	ENSSHAG00000015630	-	90	77.578	Sarcophilus_harrisii
ENSTNIG00000016912	syf2	92	78.641	ENSSHAG00000007152	-	100	78.641	Sarcophilus_harrisii
ENSTNIG00000016912	syf2	99	84.615	ENSSFOG00015023647	syf2	93	84.615	Scleropages_formosus
ENSTNIG00000016912	syf2	99	86.878	ENSSMAG00000009867	syf2	93	86.878	Scophthalmus_maximus
ENSTNIG00000016912	syf2	98	89.498	ENSSDUG00000013072	syf2	94	88.341	Seriola_dumerili
ENSTNIG00000016912	syf2	98	89.498	ENSSLDG00000012677	syf2	94	88.341	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSTNIG00000016912	syf2	100	61.435	ENSSARG00000012889	SYF2	91	61.435	Sorex_araneus
ENSTNIG00000016912	syf2	100	78.475	ENSSPUG00000005251	SYF2	88	78.475	Sphenodon_punctatus
ENSTNIG00000016912	syf2	99	87.387	ENSSPAG00000009626	syf2	93	87.387	Stegastes_partitus
ENSTNIG00000016912	syf2	98	80.275	ENSSSCG00000037481	SYF2	89	80.275	Sus_scrofa
ENSTNIG00000016912	syf2	67	51.656	ENSTGUG00000001126	SYF2	81	53.333	Taeniopygia_guttata
ENSTNIG00000016912	syf2	99	93.243	ENSTRUG00000001499	syf2	89	93.243	Takifugu_rubripes
ENSTNIG00000016912	syf2	100	57.848	ENSTBEG00000017370	SYF2	90	57.848	Tupaia_belangeri
ENSTNIG00000016912	syf2	97	80.093	ENSTTRG00000003550	SYF2	91	78.475	Tursiops_truncatus
ENSTNIG00000016912	syf2	98	79.817	ENSUAMG00000002897	SYF2	89	79.817	Ursus_americanus
ENSTNIG00000016912	syf2	97	79.630	ENSUMAG00000013108	SYF2	89	79.358	Ursus_maritimus
ENSTNIG00000016912	syf2	99	78.829	ENSVPAG00000005705	SYF2	91	78.829	Vicugna_pacos
ENSTNIG00000016912	syf2	97	79.630	ENSVVUG00000027175	-	89	79.358	Vulpes_vulpes
ENSTNIG00000016912	syf2	92	79.024	ENSVVUG00000027181	-	88	78.899	Vulpes_vulpes
ENSTNIG00000016912	syf2	100	77.578	ENSXETG00000022797	syf2	90	77.578	Xenopus_tropicalis
ENSTNIG00000016912	syf2	96	87.907	ENSXMAG00000022698	syf2	93	86.486	Xiphophorus_maculatus