EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSTNIG00000017106 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: papolg
Alias: zgc:63762
Full Name: poly(A) polymerase gamma
Gene Type: protein_coding
Species: Tetraodon_nigroviridis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 11475 bases
Position: chrUn_random:95669113-95680587
Accession: ZDB-GENE-040426-1256
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSTNIP00000020241	PAP_RNA-bind	PF04926.15	1.6e-28	1	2
ENSTNIP00000020241	PAP_RNA-bind	PF04926.15	1.6e-28	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSTNIT00000020472	-	2190	-	ENSTNIP00000020241	730 (aa)	-	H3DI97

Gene Model

Click here to download ENSTNIG00000017106's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSTNIG00000017106's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSTNIG00000017106	papolg	100	66.491	ENSG00000115421	PAPOLG	100	71.548	Homo_sapiens
ENSTNIG00000017106	papolg	100	82.337	ENSAPOG00000004798	papolg	99	76.747	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTNIG00000017106	papolg	99	66.799	ENSAMEG00000018227	PAPOLG	99	66.799	Ailuropoda_melanoleuca
ENSTNIG00000017106	papolg	100	75.439	ENSACIG00000010546	papolg	99	75.234	Amphilophus_citrinellus
ENSTNIG00000017106	papolg	100	82.205	ENSAOCG00000010254	papolg	89	82.470	Amphiprion_ocellaris
ENSTNIG00000017106	papolg	100	82.337	ENSAPEG00000006944	papolg	89	82.603	Amphiprion_percula
ENSTNIG00000017106	papolg	100	83.178	ENSATEG00000009007	papolg	89	83.112	Anabas_testudineus
ENSTNIG00000017106	papolg	99	60.343	ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	60.211	Anas_platyrhynchos
ENSTNIG00000017106	papolg	81	59.869	ENSACAG00000015048	-	99	59.869	Anolis_carolinensis
ENSTNIG00000017106	papolg	100	66.048	ENSANAG00000024627	PAPOLG	100	66.048	Aotus_nancymaae
ENSTNIG00000017106	papolg	100	79.739	ENSACLG00000015592	papolg	89	80.364	Astatotilapia_calliptera
ENSTNIG00000017106	papolg	100	71.713	ENSAMXG00000004611	papolg	100	71.713	Astyanax_mexicanus
ENSTNIG00000017106	papolg	100	66.447	ENSBTAG00000007414	PAPOLG	100	66.447	Bos_taurus
ENSTNIG00000017106	papolg	100	66.534	ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	66.534	Callithrix_jacchus
ENSTNIG00000017106	papolg	100	66.535	ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	58.057	Canis_familiaris
ENSTNIG00000017106	papolg	100	66.144	ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	66.144	Canis_lupus_dingo
ENSTNIG00000017106	papolg	100	66.316	ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	66.316	Capra_hircus
ENSTNIG00000017106	papolg	100	66.053	ENSTSYG00000004947	PAPOLG	100	66.053	Carlito_syrichta
ENSTNIG00000017106	papolg	52	70.876	ENSCAPG00000014901	-	100	70.876	Cavia_aperea
ENSTNIG00000017106	papolg	100	66.008	ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	66.008	Cavia_porcellus
ENSTNIG00000017106	papolg	100	66.667	ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	66.667	Cebus_capucinus
ENSTNIG00000017106	papolg	90	66.102	ENSCATG00000044395	PAPOLG	100	66.102	Cercocebus_atys
ENSTNIG00000017106	papolg	100	66.316	ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	66.316	Chinchilla_lanigera
ENSTNIG00000017106	papolg	100	66.402	ENSCSAG00000014408	PAPOLG	100	66.402	Chlorocebus_sabaeus
ENSTNIG00000017106	papolg	90	65.390	ENSCHOG00000014028	PAPOLG	99	65.390	Choloepus_hoffmanni
ENSTNIG00000017106	papolg	69	58.366	ENSCING00000024664	-	94	58.366	Ciona_intestinalis
ENSTNIG00000017106	papolg	66	59.756	ENSCSAVG00000009085	-	97	59.756	Ciona_savignyi
ENSTNIG00000017106	papolg	100	66.402	ENSCANG00000038120	PAPOLG	100	66.402	Colobus_angolensis_palliatus
ENSTNIG00000017106	papolg	99	65.646	ENSCGRG00001014951	Papolg	100	65.646	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSTNIG00000017106	papolg	99	65.646	ENSCGRG00000005552	-	100	65.646	Cricetulus_griseus_crigri
ENSTNIG00000017106	papolg	100	78.121	ENSCSEG00000000771	papolg	99	78.389	Cynoglossus_semilaevis
ENSTNIG00000017106	papolg	100	77.314	ENSCVAG00000016602	papolg	90	86.640	Cyprinodon_variegatus
ENSTNIG00000017106	papolg	100	73.168	ENSDARG00000012141	papolg	100	73.168	Danio_rerio
ENSTNIG00000017106	papolg	100	64.042	ENSDNOG00000011326	PAPOLG	100	64.042	Dasypus_novemcinctus
ENSTNIG00000017106	papolg	58	77.064	ENSDORG00000016228	Papolg	100	77.064	Dipodomys_ordii
ENSTNIG00000017106	papolg	88	68.966	ENSETEG00000011815	PAPOLG	88	68.966	Echinops_telfairi
ENSTNIG00000017106	papolg	62	71.059	ENSEBUG00000004020	papolg	96	59.369	Eptatretus_burgeri
ENSTNIG00000017106	papolg	100	66.230	ENSEASG00005002038	PAPOLG	100	66.055	Equus_asinus_asinus
ENSTNIG00000017106	papolg	100	66.230	ENSECAG00000009859	PAPOLG	98	66.095	Equus_caballus
ENSTNIG00000017106	papolg	100	58.026	ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	58.026	Erinaceus_europaeus
ENSTNIG00000017106	papolg	100	71.208	ENSELUG00000014497	papolg	99	72.380	Esox_lucius
ENSTNIG00000017106	papolg	100	66.447	ENSFCAG00000026126	PAPOLG	100	66.447	Felis_catus
ENSTNIG00000017106	papolg	98	55.689	ENSFALG00000011079	PAPOLG	96	55.689	Ficedula_albicollis
ENSTNIG00000017106	papolg	100	66.184	ENSFDAG00000010662	PAPOLG	97	66.184	Fukomys_damarensis
ENSTNIG00000017106	papolg	66	78.752	ENSFHEG00000019080	papolg	90	80.517	Fundulus_heteroclitus
ENSTNIG00000017106	papolg	90	85.284	ENSGMOG00000018772	papolg	94	85.284	Gadus_morhua
ENSTNIG00000017106	papolg	100	57.106	ENSGALG00000007853	PAPOLG	100	56.845	Gallus_gallus
ENSTNIG00000017106	papolg	100	77.575	ENSGAFG00000003263	papolg	89	77.690	Gambusia_affinis
ENSTNIG00000017106	papolg	100	81.060	ENSGACG00000002718	papolg	100	81.242	Gasterosteus_aculeatus
ENSTNIG00000017106	papolg	100	66.534	ENSGGOG00000006083	PAPOLG	100	66.534	Gorilla_gorilla
ENSTNIG00000017106	papolg	100	79.739	ENSHBUG00000004882	papolg	89	80.234	Haplochromis_burtoni
ENSTNIG00000017106	papolg	99	66.270	ENSHGLG00000019610	PAPOLG	99	66.270	Heterocephalus_glaber_female
ENSTNIG00000017106	papolg	100	66.404	ENSHGLG00100010429	PAPOLG	99	66.404	Heterocephalus_glaber_male
ENSTNIG00000017106	papolg	100	82.249	ENSHCOG00000006782	papolg	89	82.249	Hippocampus_comes
ENSTNIG00000017106	papolg	100	70.997	ENSIPUG00000021642	papolg	100	71.410	Ictalurus_punctatus
ENSTNIG00000017106	papolg	100	65.969	ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	65.969	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSTNIG00000017106	papolg	58	77.294	ENSJJAG00000015601	Papolg	100	77.294	Jaculus_jaculus
ENSTNIG00000017106	papolg	100	78.912	ENSKMAG00000016439	papolg	97	74.665	Kryptolebias_marmoratus
ENSTNIG00000017106	papolg	100	77.001	ENSLBEG00000023218	papolg	89	77.313	Labrus_bergylta
ENSTNIG00000017106	papolg	98	59.973	ENSLACG00000009543	PAPOLG	98	59.973	Latimeria_chalumnae
ENSTNIG00000017106	papolg	100	71.039	ENSLOCG00000016130	papolg	100	71.039	Lepisosteus_oculatus
ENSTNIG00000017106	papolg	100	65.879	ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	76.606	Loxodonta_africana
ENSTNIG00000017106	papolg	100	66.667	ENSMFAG00000042450	PAPOLG	100	66.667	Macaca_fascicularis
ENSTNIG00000017106	papolg	100	66.667	ENSMMUG00000000498	PAPOLG	100	66.667	Macaca_mulatta
ENSTNIG00000017106	papolg	100	59.816	ENSMNEG00000035939	PAPOLG	100	59.816	Macaca_nemestrina
ENSTNIG00000017106	papolg	100	66.579	ENSMLEG00000039462	PAPOLG	100	66.579	Mandrillus_leucophaeus
ENSTNIG00000017106	papolg	100	81.442	ENSMAMG00000010667	papolg	99	76.653	Mastacembelus_armatus
ENSTNIG00000017106	papolg	100	79.739	ENSMZEG00005018140	papolg	99	77.568	Maylandia_zebra
ENSTNIG00000017106	papolg	100	57.687	ENSMGAG00000001741	PAPOLG	100	57.424	Meleagris_gallopavo
ENSTNIG00000017106	papolg	99	66.045	ENSMAUG00000009088	Papolg	99	66.045	Mesocricetus_auratus
ENSTNIG00000017106	papolg	100	66.359	ENSMICG00000010042	PAPOLG	100	66.623	Microcebus_murinus
ENSTNIG00000017106	papolg	100	66.229	ENSMOCG00000006857	Papolg	100	66.229	Microtus_ochrogaster
ENSTNIG00000017106	papolg	100	82.048	ENSMMOG00000008020	papolg	99	82.048	Mola_mola
ENSTNIG00000017106	papolg	98	65.119	ENSMODG00000002160	PAPOLG	99	65.119	Monodelphis_domestica
ENSTNIG00000017106	papolg	100	81.709	ENSMALG00000007012	papolg	89	81.541	Monopterus_albus
ENSTNIG00000017106	papolg	100	66.008	MGP_CAROLIEiJ_G0016144	Papolg	99	77.598	Mus_caroli
ENSTNIG00000017106	papolg	100	65.876	ENSMUSG00000020273	Papolg	99	77.598	Mus_musculus
ENSTNIG00000017106	papolg	100	65.744	MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	65.744	Mus_pahari
ENSTNIG00000017106	papolg	100	65.744	MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	77.598	Mus_spretus
ENSTNIG00000017106	papolg	100	66.798	ENSMPUG00000005165	PAPOLG	90	66.798	Mustela_putorius_furo
ENSTNIG00000017106	papolg	99	66.000	ENSMLUG00000009853	PAPOLG	99	65.824	Myotis_lucifugus
ENSTNIG00000017106	papolg	100	66.140	ENSNGAG00000001120	Papolg	100	66.140	Nannospalax_galili
ENSTNIG00000017106	papolg	100	70.410	ENSNBRG00000011943	papolg	99	71.091	Neolamprologus_brichardi
ENSTNIG00000017106	papolg	58	76.835	ENSNLEG00000009507	-	100	76.835	Nomascus_leucogenys
ENSTNIG00000017106	papolg	63	68.196	ENSMEUG00000013605	-	68	68.196	Notamacropus_eugenii
ENSTNIG00000017106	papolg	100	65.481	ENSOPRG00000009630	PAPOLG	100	65.481	Ochotona_princeps
ENSTNIG00000017106	papolg	58	73.843	ENSODEG00000012424	PAPOLG	99	73.843	Octodon_degus
ENSTNIG00000017106	papolg	100	74.565	ENSONIG00000002985	papolg	100	74.700	Oreochromis_niloticus
ENSTNIG00000017106	papolg	98	65.695	ENSOANG00000012403	PAPOLG	99	65.695	Ornithorhynchus_anatinus
ENSTNIG00000017106	papolg	100	66.099	ENSOCUG00000004962	PAPOLG	100	66.099	Oryctolagus_cuniculus
ENSTNIG00000017106	papolg	100	77.660	ENSORLG00000001577	papolg	99	78.191	Oryzias_latipes
ENSTNIG00000017106	papolg	100	77.896	ENSORLG00020002482	papolg	89	78.429	Oryzias_latipes_hni
ENSTNIG00000017106	papolg	100	77.660	ENSORLG00015008836	papolg	99	78.191	Oryzias_latipes_hsok
ENSTNIG00000017106	papolg	100	78.571	ENSOMEG00000001406	papolg	89	78.856	Oryzias_melastigma
ENSTNIG00000017106	papolg	58	59.152	ENSOGAG00000003145	PAPOLG	100	59.152	Otolemur_garnettii
ENSTNIG00000017106	papolg	100	66.184	ENSOARG00000001563	PAPOLG	91	66.184	Ovis_aries
ENSTNIG00000017106	papolg	100	66.491	ENSPPAG00000019917	PAPOLG	100	66.491	Pan_paniscus
ENSTNIG00000017106	papolg	100	66.447	ENSPPRG00000023250	PAPOLG	100	66.447	Panthera_pardus
ENSTNIG00000017106	papolg	100	66.316	ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	66.316	Panthera_tigris_altaica
ENSTNIG00000017106	papolg	100	66.491	ENSPTRG00000011948	PAPOLG	100	66.491	Pan_troglodytes
ENSTNIG00000017106	papolg	100	63.456	ENSPANG00000014543	PAPOLG	100	63.456	Papio_anubis
ENSTNIG00000017106	papolg	100	70.696	ENSPKIG00000003313	papolg	100	70.696	Paramormyrops_kingsleyae
ENSTNIG00000017106	papolg	91	72.595	ENSPKIG00000006027	PAPOLG	97	72.595	Paramormyrops_kingsleyae
ENSTNIG00000017106	papolg	98	62.685	ENSPSIG00000013663	PAPOLG	98	62.685	Pelodiscus_sinensis
ENSTNIG00000017106	papolg	99	66.000	ENSPEMG00000008960	-	100	66.000	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSTNIG00000017106	papolg	99	49.229	ENSPMAG00000002961	papolg	99	48.969	Petromyzon_marinus
ENSTNIG00000017106	papolg	68	58.431	ENSPMAG00000004864	-	99	58.431	Petromyzon_marinus
ENSTNIG00000017106	papolg	100	65.450	ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	65.450	Phascolarctos_cinereus
ENSTNIG00000017106	papolg	100	77.604	ENSPFOG00000012909	papolg	99	77.326	Poecilia_formosa
ENSTNIG00000017106	papolg	100	77.575	ENSPLAG00000018445	papolg	89	77.575	Poecilia_latipinna
ENSTNIG00000017106	papolg	100	77.633	ENSPMEG00000003961	papolg	89	77.633	Poecilia_mexicana
ENSTNIG00000017106	papolg	100	76.005	ENSPREG00000010358	papolg	89	77.588	Poecilia_reticulata
ENSTNIG00000017106	papolg	100	66.446	ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	66.446	Pongo_abelii
ENSTNIG00000017106	papolg	99	58.675	ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	58.699	Procavia_capensis
ENSTNIG00000017106	papolg	100	60.805	ENSPCOG00000027306	PAPOLG	100	61.074	Propithecus_coquereli
ENSTNIG00000017106	papolg	89	74.733	ENSPVAG00000013541	PAPOLG	88	74.733	Pteropus_vampyrus
ENSTNIG00000017106	papolg	100	79.739	ENSPNYG00000006729	papolg	99	77.957	Pundamilia_nyererei
ENSTNIG00000017106	papolg	100	71.751	ENSPNAG00000015521	papolg	100	71.751	Pygocentrus_nattereri
ENSTNIG00000017106	papolg	100	66.008	ENSRNOG00000006261	Papolg	100	66.008	Rattus_norvegicus
ENSTNIG00000017106	papolg	100	61.886	ENSRBIG00000040086	PAPOLG	100	61.886	Rhinopithecus_bieti
ENSTNIG00000017106	papolg	100	66.268	ENSRROG00000035954	PAPOLG	100	66.268	Rhinopithecus_roxellana
ENSTNIG00000017106	papolg	100	66.844	ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	66.844	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSTNIG00000017106	papolg	94	65.284	ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	65.284	Sarcophilus_harrisii
ENSTNIG00000017106	papolg	100	69.774	ENSSFOG00015002383	papolg	100	69.774	Scleropages_formosus
ENSTNIG00000017106	papolg	100	60.829	ENSSFOG00015011874	papolg	100	60.829	Scleropages_formosus
ENSTNIG00000017106	papolg	78	86.575	ENSSMAG00000015598	papolg	95	78.239	Scophthalmus_maximus
ENSTNIG00000017106	papolg	100	83.762	ENSSDUG00000000912	papolg	99	76.685	Seriola_dumerili
ENSTNIG00000017106	papolg	100	84.168	ENSSLDG00000001217	papolg	89	84.168	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSTNIG00000017106	papolg	100	64.133	ENSSPUG00000007491	PAPOLG	100	64.133	Sphenodon_punctatus
ENSTNIG00000017106	papolg	100	80.754	ENSSPAG00000009004	papolg	99	76.622	Stegastes_partitus
ENSTNIG00000017106	papolg	100	65.793	ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	65.793	Sus_scrofa
ENSTNIG00000017106	papolg	73	65.872	ENSTGUG00000006762	PAPOLG	99	65.872	Taeniopygia_guttata
ENSTNIG00000017106	papolg	100	80.295	ENSTRUG00000006410	papolg	99	80.295	Takifugu_rubripes
ENSTNIG00000017106	papolg	99	59.470	ENSTBEG00000002609	PAPOLG	100	59.470	Tupaia_belangeri
ENSTNIG00000017106	papolg	100	61.337	ENSTTRG00000006237	PAPOLG	100	61.337	Tursiops_truncatus
ENSTNIG00000017106	papolg	100	66.140	ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	66.977	Ursus_americanus
ENSTNIG00000017106	papolg	99	66.977	ENSUMAG00000019081	PAPOLG	90	66.977	Ursus_maritimus
ENSTNIG00000017106	papolg	99	63.081	ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	63.081	Vicugna_pacos
ENSTNIG00000017106	papolg	100	66.667	ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	66.667	Vulpes_vulpes
ENSTNIG00000017106	papolg	100	62.958	ENSXETG00000002208	papolg	100	62.958	Xenopus_tropicalis
ENSTNIG00000017106	papolg	68	86.759	ENSXCOG00000006611	papolg	73	86.759	Xiphophorus_couchianus
ENSTNIG00000017106	papolg	75	84.221	ENSXMAG00000007383	papolg	95	84.221	Xiphophorus_maculatus