EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSTNIG00000017511 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: polg2
Alias: im:7158733|si:ch211-157f15.3
Full Name: polymerase (DNA directed)%2C gamma 2%2C accessory subunit
Gene Type: protein_coding
Species: Tetraodon_nigroviridis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 2045 bases
Position: chrUn_random:26924941-26926985
Accession: ZDB-GENE-060810-116
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSTNIP00000020655	HGTP_anticodon	PF03129.20	5.8e-11	1	1
ENSTNIP00000002685	HGTP_anticodon	PF03129.20	6.2e-11	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSTNIT00000020888	-	1236	-	ENSTNIP00000020655	411 (aa)	-	Q4RLF8
ENSTNIT00000003432	-	1275	-	ENSTNIP00000002685	424 (aa)	-	H3C366

Gene Model

Click here to download ENSTNIG00000017511's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSTNIG00000017511's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSTNIG00000017511	polg2	100	47.743	ENSG00000256525	POLG2	100	51.613	Homo_sapiens
ENSTNIG00000017511	polg2	99	70.098	ENSAPOG00000018161	polg2	91	70.098	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTNIG00000017511	polg2	100	47.268	ENSAMEG00000002728	POLG2	91	47.156	Ailuropoda_melanoleuca
ENSTNIG00000017511	polg2	100	69.586	ENSACIG00000006899	polg2	93	69.586	Amphilophus_citrinellus
ENSTNIG00000017511	polg2	99	70.833	ENSAPEG00000002866	polg2	91	70.833	Amphiprion_percula
ENSTNIG00000017511	polg2	100	69.343	ENSATEG00000005834	polg2	92	67.133	Anabas_testudineus
ENSTNIG00000017511	polg2	72	53.115	ENSAPLG00000009056	POLG2	98	53.115	Anas_platyrhynchos
ENSTNIG00000017511	polg2	100	44.286	ENSACAG00000001118	POLG2	88	44.286	Anolis_carolinensis
ENSTNIG00000017511	polg2	100	46.556	ENSANAG00000034136	POLG2	86	46.556	Aotus_nancymaae
ENSTNIG00000017511	polg2	100	69.157	ENSACLG00000003123	polg2	91	69.157	Astatotilapia_calliptera
ENSTNIG00000017511	polg2	95	56.313	ENSAMXG00000030889	polg2	89	56.313	Astyanax_mexicanus
ENSTNIG00000017511	polg2	100	47.031	ENSBTAG00000018420	POLG2	86	47.031	Bos_taurus
ENSTNIG00000017511	polg2	100	47.031	ENSCJAG00000019350	POLG2	86	47.031	Callithrix_jacchus
ENSTNIG00000017511	polg2	100	46.793	ENSCAFG00000011721	POLG2	86	46.793	Canis_familiaris
ENSTNIG00000017511	polg2	100	46.793	ENSCAFG00020026568	POLG2	86	46.793	Canis_lupus_dingo
ENSTNIG00000017511	polg2	100	47.506	ENSCHIG00000017524	POLG2	86	47.506	Capra_hircus
ENSTNIG00000017511	polg2	71	53.020	ENSTSYG00000005984	POLG2	93	53.020	Carlito_syrichta
ENSTNIG00000017511	polg2	71	48.837	ENSCAPG00000007228	POLG2	100	48.837	Cavia_aperea
ENSTNIG00000017511	polg2	100	47.619	ENSCPOG00000007124	POLG2	86	47.619	Cavia_porcellus
ENSTNIG00000017511	polg2	100	46.793	ENSCCAG00000025697	POLG2	86	46.793	Cebus_capucinus
ENSTNIG00000017511	polg2	100	47.506	ENSCATG00000029013	POLG2	86	47.506	Cercocebus_atys
ENSTNIG00000017511	polg2	80	52.239	ENSCLAG00000007162	POLG2	98	53.354	Chinchilla_lanigera
ENSTNIG00000017511	polg2	100	47.506	ENSCSAG00000004013	POLG2	86	47.506	Chlorocebus_sabaeus
ENSTNIG00000017511	polg2	50	53.704	ENSCHOG00000012147	-	78	53.704	Choloepus_hoffmanni
ENSTNIG00000017511	polg2	100	47.268	ENSCANG00000040254	POLG2	86	47.268	Colobus_angolensis_palliatus
ENSTNIG00000017511	polg2	100	45.735	ENSCGRG00001013686	Polg2	91	45.755	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSTNIG00000017511	polg2	100	45.735	ENSCGRG00000014208	Polg2	95	45.755	Cricetulus_griseus_crigri
ENSTNIG00000017511	polg2	100	64.734	ENSCSEG00000008112	polg2	92	64.734	Cynoglossus_semilaevis
ENSTNIG00000017511	polg2	75	72.611	ENSCVAG00000015342	polg2	89	72.611	Cyprinodon_variegatus
ENSTNIG00000017511	polg2	99	52.289	ENSDARG00000074933	polg2	91	52.289	Danio_rerio
ENSTNIG00000017511	polg2	100	48.219	ENSDNOG00000006906	POLG2	86	48.219	Dasypus_novemcinctus
ENSTNIG00000017511	polg2	100	48.694	ENSDORG00000001592	Polg2	92	48.122	Dipodomys_ordii
ENSTNIG00000017511	polg2	71	45.847	ENSETEG00000002345	-	100	45.847	Echinops_telfairi
ENSTNIG00000017511	polg2	80	40.104	ENSEBUG00000004824	polg2	87	40.104	Eptatretus_burgeri
ENSTNIG00000017511	polg2	100	46.793	ENSECAG00000023052	POLG2	78	46.370	Equus_caballus
ENSTNIG00000017511	polg2	100	62.379	ENSELUG00000007591	polg2	91	60.698	Esox_lucius
ENSTNIG00000017511	polg2	100	48.219	ENSFCAG00000003511	POLG2	86	48.219	Felis_catus
ENSTNIG00000017511	polg2	93	47.328	ENSFALG00000002313	POLG2	100	47.328	Ficedula_albicollis
ENSTNIG00000017511	polg2	98	48.426	ENSFDAG00000015094	POLG2	80	47.733	Fukomys_damarensis
ENSTNIG00000017511	polg2	99	65.281	ENSFHEG00000013523	polg2	91	65.281	Fundulus_heteroclitus
ENSTNIG00000017511	polg2	100	46.744	ENSGALG00000003520	POLG2	92	46.744	Gallus_gallus
ENSTNIG00000017511	polg2	100	48.122	ENSGAGG00000020792	POLG2	80	48.122	Gopherus_agassizii
ENSTNIG00000017511	polg2	100	47.506	ENSGGOG00000015412	POLG2	86	47.506	Gorilla_gorilla
ENSTNIG00000017511	polg2	100	68.916	ENSHBUG00000002868	polg2	91	68.916	Haplochromis_burtoni
ENSTNIG00000017511	polg2	100	47.031	ENSHGLG00000001726	POLG2	88	47.073	Heterocephalus_glaber_female
ENSTNIG00000017511	polg2	100	47.031	ENSHGLG00100001156	POLG2	88	47.073	Heterocephalus_glaber_male
ENSTNIG00000017511	polg2	99	63.747	ENSHCOG00000019138	polg2	91	63.747	Hippocampus_comes
ENSTNIG00000017511	polg2	100	55.529	ENSIPUG00000014424	polg2	90	55.529	Ictalurus_punctatus
ENSTNIG00000017511	polg2	100	47.268	ENSSTOG00000012523	POLG2	87	47.073	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSTNIG00000017511	polg2	100	46.556	ENSJJAG00000018108	Polg2	92	46.495	Jaculus_jaculus
ENSTNIG00000017511	polg2	99	66.098	ENSKMAG00000011330	polg2	91	66.098	Kryptolebias_marmoratus
ENSTNIG00000017511	polg2	100	64.593	ENSLBEG00000012319	-	90	64.593	Labrus_bergylta
ENSTNIG00000017511	polg2	100	67.718	ENSLBEG00000010722	polg2	90	67.718	Labrus_bergylta
ENSTNIG00000017511	polg2	100	47.268	ENSLACG00000015134	POLG2	90	46.868	Latimeria_chalumnae
ENSTNIG00000017511	polg2	99	42.043	ENSLOCG00000013528	polg2	98	41.995	Lepisosteus_oculatus
ENSTNIG00000017511	polg2	100	44.893	ENSLAFG00000011216	POLG2	86	44.893	Loxodonta_africana
ENSTNIG00000017511	polg2	100	47.506	ENSMMUG00000009464	POLG2	86	47.506	Macaca_mulatta
ENSTNIG00000017511	polg2	100	47.981	ENSMNEG00000041525	POLG2	86	47.981	Macaca_nemestrina
ENSTNIG00000017511	polg2	100	47.506	ENSMLEG00000039506	POLG2	86	47.506	Mandrillus_leucophaeus
ENSTNIG00000017511	polg2	100	69.157	ENSMZEG00005001234	polg2	91	69.157	Maylandia_zebra
ENSTNIG00000017511	polg2	72	52.459	ENSMGAG00000007713	POLG2	100	52.459	Meleagris_gallopavo
ENSTNIG00000017511	polg2	100	47.981	ENSMICG00000046718	POLG2	86	47.981	Microcebus_murinus
ENSTNIG00000017511	polg2	100	46.793	ENSMOCG00000022506	Polg2	93	46.838	Microtus_ochrogaster
ENSTNIG00000017511	polg2	100	66.990	ENSMMOG00000015739	polg2	91	66.990	Mola_mola
ENSTNIG00000017511	polg2	100	46.556	ENSMODG00000003701	POLG2	91	46.556	Monodelphis_domestica
ENSTNIG00000017511	polg2	100	67.883	ENSMALG00000022551	polg2	91	67.883	Monopterus_albus
ENSTNIG00000017511	polg2	85	52.444	MGP_CAROLIEiJ_G0017328	Polg2	91	52.444	Mus_caroli
ENSTNIG00000017511	polg2	100	47.564	ENSMUSG00000020718	Polg2	92	47.564	Mus_musculus
ENSTNIG00000017511	polg2	100	46.556	MGP_PahariEiJ_G0018458	Polg2	92	46.824	Mus_pahari
ENSTNIG00000017511	polg2	100	47.307	MGP_SPRETEiJ_G0018172	Polg2	92	47.307	Mus_spretus
ENSTNIG00000017511	polg2	100	47.743	ENSMPUG00000014747	POLG2	87	47.307	Mustela_putorius_furo
ENSTNIG00000017511	polg2	100	46.793	ENSMLUG00000009469	POLG2	86	46.793	Myotis_lucifugus
ENSTNIG00000017511	polg2	99	46.445	ENSNGAG00000016032	Polg2	88	46.445	Nannospalax_galili
ENSTNIG00000017511	polg2	100	69.175	ENSNBRG00000002880	polg2	91	69.175	Neolamprologus_brichardi
ENSTNIG00000017511	polg2	100	44.893	ENSNLEG00000014951	POLG2	86	44.893	Nomascus_leucogenys
ENSTNIG00000017511	polg2	83	44.196	ENSMEUG00000003840	-	72	44.196	Notamacropus_eugenii
ENSTNIG00000017511	polg2	100	48.456	ENSOPRG00000008195	POLG2	90	47.806	Ochotona_princeps
ENSTNIG00000017511	polg2	72	54.785	ENSODEG00000008546	POLG2	92	55.776	Octodon_degus
ENSTNIG00000017511	polg2	93	46.923	ENSOANG00000008042	POLG2	99	46.923	Ornithorhynchus_anatinus
ENSTNIG00000017511	polg2	100	65.860	ENSORLG00000000860	polg2	92	65.860	Oryzias_latipes
ENSTNIG00000017511	polg2	100	66.344	ENSORLG00020017813	polg2	92	66.344	Oryzias_latipes_hni
ENSTNIG00000017511	polg2	100	66.586	ENSORLG00015017452	polg2	92	66.586	Oryzias_latipes_hsok
ENSTNIG00000017511	polg2	100	63.680	ENSOMEG00000009019	polg2	93	63.680	Oryzias_melastigma
ENSTNIG00000017511	polg2	100	48.219	ENSOGAG00000015348	POLG2	87	47.887	Otolemur_garnettii
ENSTNIG00000017511	polg2	100	47.045	ENSOARG00000014976	POLG2	86	47.045	Ovis_aries
ENSTNIG00000017511	polg2	100	47.506	ENSPPAG00000033268	POLG2	86	47.506	Pan_paniscus
ENSTNIG00000017511	polg2	100	48.219	ENSPPRG00000011997	POLG2	86	48.219	Panthera_pardus
ENSTNIG00000017511	polg2	100	48.219	ENSPTIG00000009776	POLG2	86	48.219	Panthera_tigris_altaica
ENSTNIG00000017511	polg2	100	47.268	ENSPTRG00000009541	POLG2	86	47.268	Pan_troglodytes
ENSTNIG00000017511	polg2	100	47.506	ENSPANG00000020707	POLG2	86	47.506	Papio_anubis
ENSTNIG00000017511	polg2	100	53.957	ENSPKIG00000006859	polg2	92	53.412	Paramormyrops_kingsleyae
ENSTNIG00000017511	polg2	100	59.611	ENSPMGG00000004567	polg2	89	59.611	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSTNIG00000017511	polg2	100	46.793	ENSPEMG00000016654	Polg2	92	47.073	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSTNIG00000017511	polg2	100	48.463	ENSPCIG00000014426	POLG2	88	48.260	Phascolarctos_cinereus
ENSTNIG00000017511	polg2	100	63.747	ENSPFOG00000011791	polg2	91	63.747	Poecilia_formosa
ENSTNIG00000017511	polg2	99	63.725	ENSPLAG00000013015	polg2	91	63.725	Poecilia_latipinna
ENSTNIG00000017511	polg2	100	63.747	ENSPMEG00000011690	polg2	91	63.747	Poecilia_mexicana
ENSTNIG00000017511	polg2	100	62.774	ENSPREG00000018945	polg2	91	62.774	Poecilia_reticulata
ENSTNIG00000017511	polg2	100	47.981	ENSPPYG00000008546	POLG2	86	47.981	Pongo_abelii
ENSTNIG00000017511	polg2	68	45.517	ENSPCAG00000005549	-	100	45.517	Procavia_capensis
ENSTNIG00000017511	polg2	100	45.952	ENSPCOG00000024674	POLG2	86	45.755	Propithecus_coquereli
ENSTNIG00000017511	polg2	85	56.790	ENSPVAG00000001931	POLG2	74	56.790	Pteropus_vampyrus
ENSTNIG00000017511	polg2	94	56.997	ENSPNAG00000029339	polg2	89	56.997	Pygocentrus_nattereri
ENSTNIG00000017511	polg2	99	46.682	ENSRNOG00000013728	Polg2	91	46.682	Rattus_norvegicus
ENSTNIG00000017511	polg2	100	47.981	ENSRBIG00000036171	POLG2	86	47.981	Rhinopithecus_bieti
ENSTNIG00000017511	polg2	100	47.981	ENSRROG00000028560	POLG2	86	47.981	Rhinopithecus_roxellana
ENSTNIG00000017511	polg2	100	47.268	ENSSBOG00000028048	POLG2	86	47.268	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSTNIG00000017511	polg2	100	47.743	ENSSHAG00000012812	POLG2	91	47.981	Sarcophilus_harrisii
ENSTNIG00000017511	polg2	100	51.442	ENSSFOG00015004948	polg2	92	50.583	Scleropages_formosus
ENSTNIG00000017511	polg2	100	65.617	ENSSMAG00000017857	polg2	92	65.860	Scophthalmus_maximus
ENSTNIG00000017511	polg2	100	68.856	ENSSDUG00000019446	polg2	91	68.856	Seriola_dumerili
ENSTNIG00000017511	polg2	100	68.613	ENSSLDG00000003723	polg2	91	68.613	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSTNIG00000017511	polg2	100	46.919	ENSSARG00000007760	POLG2	89	46.838	Sorex_araneus
ENSTNIG00000017511	polg2	95	43.890	ENSSPUG00000004613	POLG2	97	51.938	Sphenodon_punctatus
ENSTNIG00000017511	polg2	100	68.765	ENSSPAG00000014932	polg2	91	69.007	Stegastes_partitus
ENSTNIG00000017511	polg2	92	47.927	ENSSSCG00000036057	POLG2	81	47.927	Sus_scrofa
ENSTNIG00000017511	polg2	100	45.972	ENSTGUG00000004666	POLG2	100	45.972	Taeniopygia_guttata
ENSTNIG00000017511	polg2	100	47.268	ENSTTRG00000008785	POLG2	87	47.268	Tursiops_truncatus
ENSTNIG00000017511	polg2	100	47.506	ENSUAMG00000023386	POLG2	86	47.506	Ursus_americanus
ENSTNIG00000017511	polg2	100	47.506	ENSUMAG00000017776	POLG2	86	47.506	Ursus_maritimus
ENSTNIG00000017511	polg2	100	47.268	ENSVPAG00000010757	POLG2	86	47.268	Vicugna_pacos
ENSTNIG00000017511	polg2	100	46.556	ENSVVUG00000006258	POLG2	86	46.556	Vulpes_vulpes
ENSTNIG00000017511	polg2	100	47.381	ENSXETG00000012579	polg2	89	47.381	Xenopus_tropicalis
ENSTNIG00000017511	polg2	99	63.855	ENSXCOG00000012260	polg2	91	63.855	Xiphophorus_couchianus
ENSTNIG00000017511	polg2	99	65.441	ENSXMAG00000006121	polg2	91	65.441	Xiphophorus_maculatus