EuRBPDB

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSTNIG00000017678 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: cpeb2
Alias: zmp:0000000636
Full Name: cytoplasmic polyadenylation element binding protein 2
Gene Type: protein_coding
Species: Tetraodon_nigroviridis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 10855 bases
Position: chr1:11422757-11433611
Accession: ZDB-GENE-130530-639
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSTNIP00000020828	RRM_1	PF00076.22	4.6e-11	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSTNIT00000021061	-	1701	-	ENSTNIP00000020828	566 (aa)	-	H3DJY2

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSTNIG00000017678	cpeb2	93	64.706	ENSTNIG00000017077	cpeb4a	78	65.193
ENSTNIG00000017678	cpeb2	53	88.742	ENSTNIG00000004021	-	95	88.926

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSTNIG00000017678	cpeb2	99	75.251	ENSG00000137449	CPEB2	100	97.006	Homo_sapiens
ENSTNIG00000017678	cpeb2	100	90.300	ENSAPOG00000023124	cpeb2	70	90.300	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTNIG00000017678	cpeb2	85	80.825	ENSAMEG00000001477	-	100	80.206	Ailuropoda_melanoleuca
ENSTNIG00000017678	cpeb2	100	89.947	ENSACIG00000000358	cpeb2	71	89.947	Amphilophus_citrinellus
ENSTNIG00000017678	cpeb2	100	89.594	ENSAOCG00000014750	cpeb2	71	89.065	Amphiprion_ocellaris
ENSTNIG00000017678	cpeb2	100	89.437	ENSAPEG00000016778	cpeb2	100	88.935	Amphiprion_percula
ENSTNIG00000017678	cpeb2	100	88.889	ENSATEG00000013906	cpeb2	70	88.889	Anabas_testudineus
ENSTNIG00000017678	cpeb2	86	79.226	ENSAPLG00000005039	CPEB2	100	77.959	Anas_platyrhynchos
ENSTNIG00000017678	cpeb2	99	77.622	ENSANAG00000004909	CPEB2	99	74.415	Aotus_nancymaae
ENSTNIG00000017678	cpeb2	100	90.123	ENSACLG00000017893	cpeb2	70	90.123	Astatotilapia_calliptera
ENSTNIG00000017678	cpeb2	99	80.783	ENSAMXG00000030819	cpeb2	68	81.449	Astyanax_mexicanus
ENSTNIG00000017678	cpeb2	99	75.000	ENSBTAG00000019847	CPEB2	99	76.342	Bos_taurus
ENSTNIG00000017678	cpeb2	99	74.333	ENSCJAG00000038767	CPEB2	99	74.167	Callithrix_jacchus
ENSTNIG00000017678	cpeb2	85	82.474	ENSCAFG00000015372	CPEB2	99	81.856	Canis_familiaris
ENSTNIG00000017678	cpeb2	99	74.917	ENSCAFG00020011244	CPEB2	98	94.118	Canis_lupus_dingo
ENSTNIG00000017678	cpeb2	99	73.658	ENSCHIG00000022582	CPEB2	99	75.000	Capra_hircus
ENSTNIG00000017678	cpeb2	85	82.231	ENSTSYG00000003779	-	100	81.612	Carlito_syrichta
ENSTNIG00000017678	cpeb2	85	78.689	ENSCAPG00000003843	-	99	78.074	Cavia_aperea
ENSTNIG00000017678	cpeb2	88	80.080	ENSCPOG00000001180	-	91	77.609	Cavia_porcellus
ENSTNIG00000017678	cpeb2	99	73.256	ENSCCAG00000032725	CPEB2	99	73.920	Cebus_capucinus
ENSTNIG00000017678	cpeb2	99	74.833	ENSCATG00000040126	CPEB2	99	74.000	Cercocebus_atys
ENSTNIG00000017678	cpeb2	53	66.557	ENSCLAG00000000949	-	99	65.574	Chinchilla_lanigera
ENSTNIG00000017678	cpeb2	99	74.751	ENSCSAG00000016370	CPEB2	57	75.249	Chlorocebus_sabaeus
ENSTNIG00000017678	cpeb2	63	91.036	ENSCHOG00000003058	-	100	91.036	Choloepus_hoffmanni
ENSTNIG00000017678	cpeb2	99	76.207	ENSCPBG00000005454	CPEB2	65	76.724	Chrysemys_picta_bellii
ENSTNIG00000017678	cpeb2	85	82.268	ENSCANG00000040670	CPEB2	99	78.013	Colobus_angolensis_palliatus
ENSTNIG00000017678	cpeb2	99	74.874	ENSCGRG00001011001	Cpeb2	58	76.047	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSTNIG00000017678	cpeb2	85	80.412	ENSCGRG00000007200	-	95	79.794	Cricetulus_griseus_crigri
ENSTNIG00000017678	cpeb2	99	88.693	ENSCVAG00000013200	cpeb2	100	86.929	Cyprinodon_variegatus
ENSTNIG00000017678	cpeb2	79	84.667	ENSDARG00000052604	cpeb2	100	83.929	Danio_rerio
ENSTNIG00000017678	cpeb2	84	68.098	ENSDARG00000100499	cpeb4b	74	61.864	Danio_rerio
ENSTNIG00000017678	cpeb2	99	76.265	ENSDNOG00000047761	CPEB2	98	80.268	Dasypus_novemcinctus
ENSTNIG00000017678	cpeb2	86	79.716	ENSDORG00000015311	-	99	79.108	Dipodomys_ordii
ENSTNIG00000017678	cpeb2	85	69.835	ENSETEG00000018238	-	100	69.215	Echinops_telfairi
ENSTNIG00000017678	cpeb2	99	75.000	ENSEASG00005005397	CPEB2	99	75.667	Equus_asinus_asinus
ENSTNIG00000017678	cpeb2	99	75.000	ENSECAG00000008722	CPEB2	98	91.150	Equus_caballus
ENSTNIG00000017678	cpeb2	100	82.897	ENSELUG00000005824	cpeb2	69	83.072	Esox_lucius
ENSTNIG00000017678	cpeb2	99	74.875	ENSFCAG00000027193	CPEB2	57	75.707	Felis_catus
ENSTNIG00000017678	cpeb2	81	81.838	ENSFALG00000009331	CPEB2	99	81.798	Ficedula_albicollis
ENSTNIG00000017678	cpeb2	84	81.002	ENSFDAG00000015407	-	99	81.607	Fukomys_damarensis
ENSTNIG00000017678	cpeb2	100	86.934	ENSFHEG00000013134	cpeb2	72	86.934	Fundulus_heteroclitus
ENSTNIG00000017678	cpeb2	99	73.254	ENSGALG00000014516	CPEB2	96	94.118	Gallus_gallus
ENSTNIG00000017678	cpeb2	100	85.614	ENSGAFG00000019240	cpeb2	100	85.477	Gambusia_affinis
ENSTNIG00000017678	cpeb2	99	86.292	ENSGACG00000013966	cpeb2	100	86.292	Gasterosteus_aculeatus
ENSTNIG00000017678	cpeb2	99	75.086	ENSGAGG00000010321	CPEB2	65	76.460	Gopherus_agassizii
ENSTNIG00000017678	cpeb2	99	74.296	ENSGGOG00000004449	CPEB2	99	79.915	Gorilla_gorilla
ENSTNIG00000017678	cpeb2	100	90.123	ENSHBUG00000023297	cpeb2	70	90.123	Haplochromis_burtoni
ENSTNIG00000017678	cpeb2	86	80.285	ENSHGLG00000018058	-	99	77.778	Heterocephalus_glaber_female
ENSTNIG00000017678	cpeb2	53	66.447	ENSHGLG00100000538	-	100	65.461	Heterocephalus_glaber_male
ENSTNIG00000017678	cpeb2	97	79.676	ENSHCOG00000012069	cpeb2	73	80.000	Hippocampus_comes
ENSTNIG00000017678	cpeb2	99	76.626	ENSIPUG00000001181	CPEB2	68	75.923	Ictalurus_punctatus
ENSTNIG00000017678	cpeb2	53	66.447	ENSSTOG00000002388	-	100	65.461	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSTNIG00000017678	cpeb2	86	80.081	ENSJJAG00000013747	-	100	78.711	Jaculus_jaculus
ENSTNIG00000017678	cpeb2	100	88.732	ENSKMAG00000013593	cpeb2	87	86.552	Kryptolebias_marmoratus
ENSTNIG00000017678	cpeb2	84	85.177	ENSLBEG00000022680	cpeb2	100	85.177	Labrus_bergylta
ENSTNIG00000017678	cpeb2	100	80.454	ENSLOCG00000009876	cpeb2	62	80.454	Lepisosteus_oculatus
ENSTNIG00000017678	cpeb2	86	79.435	ENSLAFG00000007142	-	100	75.340	Loxodonta_africana
ENSTNIG00000017678	cpeb2	99	75.251	ENSMFAG00000006541	CPEB2	99	74.415	Macaca_fascicularis
ENSTNIG00000017678	cpeb2	99	75.251	ENSMMUG00000001384	CPEB2	99	74.415	Macaca_mulatta
ENSTNIG00000017678	cpeb2	99	74.472	ENSMNEG00000041798	CPEB2	99	74.648	Macaca_nemestrina
ENSTNIG00000017678	cpeb2	85	82.231	ENSMLEG00000026496	-	100	81.612	Mandrillus_leucophaeus
ENSTNIG00000017678	cpeb2	100	89.771	ENSMAMG00000013478	cpeb2	70	89.771	Mastacembelus_armatus
ENSTNIG00000017678	cpeb2	100	90.123	ENSMZEG00005020634	cpeb2	70	90.123	Maylandia_zebra
ENSTNIG00000017678	cpeb2	87	78.990	ENSMGAG00000005200	CPEB2	100	77.733	Meleagris_gallopavo
ENSTNIG00000017678	cpeb2	99	73.869	ENSMAUG00000012556	Cpeb2	99	74.707	Mesocricetus_auratus
ENSTNIG00000017678	cpeb2	99	74.707	ENSMICG00000032133	CPEB2	99	73.199	Microcebus_murinus
ENSTNIG00000017678	cpeb2	99	75.336	ENSMOCG00000004212	Cpeb2	99	74.832	Microtus_ochrogaster
ENSTNIG00000017678	cpeb2	99	87.063	ENSMMOG00000006038	cpeb2	98	87.063	Mola_mola
ENSTNIG00000017678	cpeb2	86	81.911	ENSMODG00000001149	CPEB2	99	74.220	Monodelphis_domestica
ENSTNIG00000017678	cpeb2	99	75.168	MGP_CAROLIEiJ_G0027191	-	99	65.723	Mus_caroli
ENSTNIG00000017678	cpeb2	99	75.336	ENSMUSG00000039782	Cpeb2	99	66.038	Mus_musculus
ENSTNIG00000017678	cpeb2	99	75.503	MGP_PahariEiJ_G0016973	Cpeb2	99	66.352	Mus_pahari
ENSTNIG00000017678	cpeb2	99	75.336	MGP_SPRETEiJ_G0028187	-	99	66.038	Mus_spretus
ENSTNIG00000017678	cpeb2	81	83.621	ENSMPUG00000002117	-	99	81.818	Mustela_putorius_furo
ENSTNIG00000017678	cpeb2	99	75.127	ENSMLUG00000000894	CPEB2	99	74.958	Myotis_lucifugus
ENSTNIG00000017678	cpeb2	90	78.835	ENSNGAG00000010275	-	99	78.220	Nannospalax_galili
ENSTNIG00000017678	cpeb2	100	90.123	ENSNBRG00000004949	cpeb2	70	90.123	Neolamprologus_brichardi
ENSTNIG00000017678	cpeb2	85	82.231	ENSNLEG00000016275	-	100	81.612	Nomascus_leucogenys
ENSTNIG00000017678	cpeb2	85	81.031	ENSODEG00000009313	-	96	80.206	Octodon_degus
ENSTNIG00000017678	cpeb2	79	86.830	ENSONIG00000003107	cpeb2	100	86.830	Oreochromis_niloticus
ENSTNIG00000017678	cpeb2	81	82.974	ENSOANG00000003552	-	98	83.553	Ornithorhynchus_anatinus
ENSTNIG00000017678	cpeb2	85	80.247	ENSOCUG00000007950	-	99	79.630	Oryctolagus_cuniculus
ENSTNIG00000017678	cpeb2	100	87.895	ENSORLG00000016222	cpeb2	73	87.368	Oryzias_latipes
ENSTNIG00000017678	cpeb2	100	88.007	ENSORLG00020018105	cpeb2	73	88.360	Oryzias_latipes_hni
ENSTNIG00000017678	cpeb2	100	87.719	ENSORLG00015013801	cpeb2	73	88.070	Oryzias_latipes_hsok
ENSTNIG00000017678	cpeb2	100	87.958	ENSOMEG00000005079	cpeb2	100	87.683	Oryzias_melastigma
ENSTNIG00000017678	cpeb2	90	78.723	ENSOGAG00000011237	CPEB2	87	78.776	Otolemur_garnettii
ENSTNIG00000017678	cpeb2	87	79.596	ENSOARG00000008716	-	99	78.990	Ovis_aries
ENSTNIG00000017678	cpeb2	90	80.426	ENSPPAG00000009844	-	100	77.677	Pan_paniscus
ENSTNIG00000017678	cpeb2	99	74.875	ENSPPRG00000008207	CPEB2	99	74.376	Panthera_pardus
ENSTNIG00000017678	cpeb2	85	82.231	ENSPTIG00000015956	-	80	81.818	Panthera_tigris_altaica
ENSTNIG00000017678	cpeb2	99	75.000	ENSPTRG00000015924	CPEB2	82	74.167	Pan_troglodytes
ENSTNIG00000017678	cpeb2	99	75.000	ENSPANG00000017542	CPEB2	82	75.500	Papio_anubis
ENSTNIG00000017678	cpeb2	100	82.639	ENSPKIG00000006396	cpeb2	61	82.465	Paramormyrops_kingsleyae
ENSTNIG00000017678	cpeb2	92	75.758	ENSPSIG00000009111	CPEB2	98	81.798	Pelodiscus_sinensis
ENSTNIG00000017678	cpeb2	99	87.302	ENSPMGG00000023340	cpeb2	99	87.302	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSTNIG00000017678	cpeb2	90	78.682	ENSPEMG00000024159	-	98	78.736	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSTNIG00000017678	cpeb2	90	80.388	ENSPCIG00000024549	CPEB2	55	74.836	Phascolarctos_cinereus
ENSTNIG00000017678	cpeb2	100	86.842	ENSPFOG00000018603	cpeb2	72	86.842	Poecilia_formosa
ENSTNIG00000017678	cpeb2	100	86.038	ENSPMEG00000001535	cpeb2	73	86.038	Poecilia_mexicana
ENSTNIG00000017678	cpeb2	99	86.491	ENSPREG00000018393	cpeb2	100	86.491	Poecilia_reticulata
ENSTNIG00000017678	cpeb2	99	74.958	ENSPPYG00000014613	-	99	75.459	Pongo_abelii
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ENSTNIG00000017678	cpeb2	100	90.123	ENSPNYG00000012125	cpeb2	70	90.123	Pundamilia_nyererei
ENSTNIG00000017678	cpeb2	99	80.392	ENSPNAG00000006826	cpeb2	69	80.810	Pygocentrus_nattereri
ENSTNIG00000017678	cpeb2	99	75.168	ENSRNOG00000005043	Cpeb2	83	76.007	Rattus_norvegicus
ENSTNIG00000017678	cpeb2	98	71.624	ENSRBIG00000028478	CPEB2	98	71.966	Rhinopithecus_bieti
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