EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSTNIG00000017689 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: urb2
Alias: fc13e02|si:dkey-162b3.2|wu:fc13e02
Full Name: URB2 ribosome biogenesis homolog
Gene Type: protein_coding
Species: Tetraodon_nigroviridis
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 8367 bases
Position: chr5:3617752-3626118
Accession: ZDB-GENE-030131-2621
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSTNIP00000020839	Urb2	PF10441.9	1.1e-18	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSTNIT00000021072	-	4476	-	ENSTNIP00000020839	1491 (aa)	-	H3DJZ3

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSTNIG00000017689	urb2	99	36.446	ENSG00000135763	URB2	99	60.714	Homo_sapiens
ENSTNIG00000017689	urb2	89	58.717	ENSAPOG00000000608	urb2	88	65.948	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTNIG00000017689	urb2	100	36.206	ENSAMEG00000009206	URB2	100	36.013	Ailuropoda_melanoleuca
ENSTNIG00000017689	urb2	96	62.446	ENSAOCG00000019961	urb2	100	58.548	Amphiprion_ocellaris
ENSTNIG00000017689	urb2	96	62.158	ENSAPEG00000005263	urb2	100	58.548	Amphiprion_percula
ENSTNIG00000017689	urb2	99	58.105	ENSATEG00000020930	urb2	95	58.562	Anabas_testudineus
ENSTNIG00000017689	urb2	97	36.464	ENSAPLG00000002998	URB2	99	36.405	Anas_platyrhynchos
ENSTNIG00000017689	urb2	99	38.613	ENSACAG00000001285	URB2	92	47.182	Anolis_carolinensis
ENSTNIG00000017689	urb2	99	36.852	ENSANAG00000033963	URB2	99	36.596	Aotus_nancymaae
ENSTNIG00000017689	urb2	87	61.715	ENSACLG00000009254	urb2	89	61.715	Astatotilapia_calliptera
ENSTNIG00000017689	urb2	99	41.779	ENSAMXG00000003474	urb2	99	41.736	Astyanax_mexicanus
ENSTNIG00000017689	urb2	100	35.911	ENSBTAG00000010180	URB2	100	36.102	Bos_taurus
ENSTNIG00000017689	urb2	95	60.993	ENSCJAG00000010968	URB2	99	60.993	Callithrix_jacchus
ENSTNIG00000017689	urb2	99	35.302	ENSCAFG00000012118	URB2	99	35.203	Canis_familiaris
ENSTNIG00000017689	urb2	94	33.902	ENSCAFG00020027217	URB2	99	33.788	Canis_lupus_dingo
ENSTNIG00000017689	urb2	100	35.687	ENSCHIG00000014513	URB2	100	35.494	Capra_hircus
ENSTNIG00000017689	urb2	95	45.051	ENSTSYG00000006924	URB2	92	44.816	Carlito_syrichta
ENSTNIG00000017689	urb2	63	45.706	ENSCPOG00000020777	-	99	45.706	Cavia_porcellus
ENSTNIG00000017689	urb2	99	36.883	ENSCCAG00000023932	URB2	99	36.626	Cebus_capucinus
ENSTNIG00000017689	urb2	99	36.832	ENSCATG00000043366	URB2	99	36.703	Cercocebus_atys
ENSTNIG00000017689	urb2	99	36.581	ENSCLAG00000006268	URB2	99	36.815	Chinchilla_lanigera
ENSTNIG00000017689	urb2	99	36.551	ENSCSAG00000010599	URB2	99	36.252	Chlorocebus_sabaeus
ENSTNIG00000017689	urb2	61	54.091	ENSCHOG00000010163	URB2	64	54.091	Choloepus_hoffmanni
ENSTNIG00000017689	urb2	96	46.823	ENSCPBG00000006191	URB2	92	46.823	Chrysemys_picta_bellii
ENSTNIG00000017689	urb2	99	36.504	ENSCANG00000023711	URB2	99	36.118	Colobus_angolensis_palliatus
ENSTNIG00000017689	urb2	99	36.445	ENSCGRG00001009591	Urb2	94	45.631	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSTNIG00000017689	urb2	99	36.445	ENSCGRG00000011259	Urb2	94	45.631	Cricetulus_griseus_crigri
ENSTNIG00000017689	urb2	100	48.675	ENSCSEG00000000299	urb2	94	55.731	Cynoglossus_semilaevis
ENSTNIG00000017689	urb2	96	59.351	ENSCVAG00000011011	urb2	93	59.351	Cyprinodon_variegatus
ENSTNIG00000017689	urb2	100	44.097	ENSDARG00000003217	urb2	100	67.890	Danio_rerio
ENSTNIG00000017689	urb2	97	34.572	ENSDNOG00000043064	URB2	99	34.722	Dasypus_novemcinctus
ENSTNIG00000017689	urb2	99	35.847	ENSDORG00000014975	Urb2	99	35.787	Dipodomys_ordii
ENSTNIG00000017689	urb2	95	38.732	ENSETEG00000002869	URB2	95	38.732	Echinops_telfairi
ENSTNIG00000017689	urb2	100	36.271	ENSEASG00005012060	URB2	100	36.498	Equus_asinus_asinus
ENSTNIG00000017689	urb2	91	61.538	ENSECAG00000012338	URB2	90	61.538	Equus_caballus
ENSTNIG00000017689	urb2	87	57.447	ENSEEUG00000002669	URB2	90	57.447	Erinaceus_europaeus
ENSTNIG00000017689	urb2	100	49.457	ENSELUG00000014647	urb2	100	49.521	Esox_lucius
ENSTNIG00000017689	urb2	99	36.049	ENSFCAG00000007662	URB2	99	35.874	Felis_catus
ENSTNIG00000017689	urb2	99	36.480	ENSFALG00000003385	URB2	92	44.839	Ficedula_albicollis
ENSTNIG00000017689	urb2	99	36.761	ENSFDAG00000021079	URB2	99	36.954	Fukomys_damarensis
ENSTNIG00000017689	urb2	97	57.421	ENSFHEG00000010357	urb2	94	56.889	Fundulus_heteroclitus
ENSTNIG00000017689	urb2	99	52.252	ENSGMOG00000012459	urb2	93	61.214	Gadus_morhua
ENSTNIG00000017689	urb2	99	37.349	ENSGALG00000011101	URB2	92	46.024	Gallus_gallus
ENSTNIG00000017689	urb2	96	68.562	ENSGACG00000016179	urb2	94	69.565	Gasterosteus_aculeatus
ENSTNIG00000017689	urb2	99	38.413	ENSGAGG00000021879	URB2	92	47.000	Gopherus_agassizii
ENSTNIG00000017689	urb2	99	36.873	ENSGGOG00000025643	URB2	99	36.317	Gorilla_gorilla
ENSTNIG00000017689	urb2	98	72.727	ENSHBUG00000018469	urb2	91	72.727	Haplochromis_burtoni
ENSTNIG00000017689	urb2	97	36.291	ENSHGLG00000016561	URB2	99	36.412	Heterocephalus_glaber_female
ENSTNIG00000017689	urb2	92	39.694	ENSHGLG00100001838	URB2	99	36.358	Heterocephalus_glaber_male
ENSTNIG00000017689	urb2	100	42.638	ENSIPUG00000020315	urb2	92	48.929	Ictalurus_punctatus
ENSTNIG00000017689	urb2	99	36.143	ENSSTOG00000025323	URB2	99	36.276	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSTNIG00000017689	urb2	99	36.282	ENSJJAG00000011998	Urb2	99	36.463	Jaculus_jaculus
ENSTNIG00000017689	urb2	98	58.333	ENSKMAG00000020129	urb2	94	58.333	Kryptolebias_marmoratus
ENSTNIG00000017689	urb2	99	38.882	ENSLACG00000002038	URB2	99	38.765	Latimeria_chalumnae
ENSTNIG00000017689	urb2	94	51.661	ENSLOCG00000015462	urb2	92	51.661	Lepisosteus_oculatus
ENSTNIG00000017689	urb2	99	35.756	ENSLAFG00000012484	URB2	100	35.829	Loxodonta_africana
ENSTNIG00000017689	urb2	99	36.761	ENSMFAG00000039905	URB2	99	36.768	Macaca_fascicularis
ENSTNIG00000017689	urb2	99	37.025	ENSMMUG00000009509	URB2	99	36.896	Macaca_mulatta
ENSTNIG00000017689	urb2	99	36.832	ENSMNEG00000038762	URB2	99	36.703	Macaca_nemestrina
ENSTNIG00000017689	urb2	99	36.896	ENSMLEG00000043252	URB2	99	36.768	Mandrillus_leucophaeus
ENSTNIG00000017689	urb2	97	57.580	ENSMAMG00000020365	urb2	92	57.580	Mastacembelus_armatus
ENSTNIG00000017689	urb2	98	71.257	ENSMZEG00005011027	urb2	91	71.257	Maylandia_zebra
ENSTNIG00000017689	urb2	90	42.885	ENSMGAG00000012073	URB2	91	42.857	Meleagris_gallopavo
ENSTNIG00000017689	urb2	95	60.993	ENSMAUG00000017980	Urb2	99	60.993	Mesocricetus_auratus
ENSTNIG00000017689	urb2	100	37.092	ENSMICG00000033302	URB2	100	36.667	Microcebus_murinus
ENSTNIG00000017689	urb2	94	47.059	ENSMOCG00000020369	Urb2	91	47.059	Microtus_ochrogaster
ENSTNIG00000017689	urb2	100	56.999	ENSMALG00000006529	urb2	93	62.693	Monopterus_albus
ENSTNIG00000017689	urb2	95	45.904	ENSMUSG00000031976	Urb2	95	45.336	Mus_musculus
ENSTNIG00000017689	urb2	99	36.252	ENSMPUG00000012438	URB2	99	36.311	Mustela_putorius_furo
ENSTNIG00000017689	urb2	99	36.312	ENSNGAG00000016524	Urb2	99	36.084	Nannospalax_galili
ENSTNIG00000017689	urb2	99	36.656	ENSNLEG00000014450	URB2	99	36.293	Nomascus_leucogenys
ENSTNIG00000017689	urb2	91	43.318	ENSMEUG00000016434	URB2	93	43.318	Notamacropus_eugenii
ENSTNIG00000017689	urb2	87	76.190	ENSOPRG00000009906	URB2	87	76.190	Ochotona_princeps
ENSTNIG00000017689	urb2	99	36.122	ENSODEG00000005593	URB2	99	36.701	Octodon_degus
ENSTNIG00000017689	urb2	100	57.521	ENSONIG00000017078	urb2	95	66.066	Oreochromis_niloticus
ENSTNIG00000017689	urb2	99	33.441	ENSOANG00000013732	URB2	92	39.836	Ornithorhynchus_anatinus
ENSTNIG00000017689	urb2	100	36.311	ENSOCUG00000010700	URB2	100	36.334	Oryctolagus_cuniculus
ENSTNIG00000017689	urb2	98	55.233	ENSORLG00000010915	urb2	95	55.233	Oryzias_latipes
ENSTNIG00000017689	urb2	98	55.378	ENSORLG00020003361	urb2	95	55.378	Oryzias_latipes_hni
ENSTNIG00000017689	urb2	99	55.233	ENSORLG00015001534	urb2	95	55.233	Oryzias_latipes_hsok
ENSTNIG00000017689	urb2	95	57.315	ENSOMEG00000010076	urb2	91	57.399	Oryzias_melastigma
ENSTNIG00000017689	urb2	100	35.641	ENSOGAG00000003021	URB2	100	35.581	Otolemur_garnettii
ENSTNIG00000017689	urb2	100	36.095	ENSOARG00000003102	URB2	100	35.962	Ovis_aries
ENSTNIG00000017689	urb2	99	36.832	ENSPPAG00000040629	URB2	99	36.276	Pan_paniscus
ENSTNIG00000017689	urb2	99	35.985	ENSPPRG00000012767	URB2	99	35.810	Panthera_pardus
ENSTNIG00000017689	urb2	96	56.250	ENSPTIG00000012577	URB2	99	56.250	Panthera_tigris_altaica
ENSTNIG00000017689	urb2	99	36.832	ENSPTRG00000002092	URB2	99	36.276	Pan_troglodytes
ENSTNIG00000017689	urb2	99	35.544	ENSPANG00000002245	URB2	99	35.480	Papio_anubis
ENSTNIG00000017689	urb2	99	42.622	ENSPKIG00000005787	urb2	93	49.186	Paramormyrops_kingsleyae
ENSTNIG00000017689	urb2	99	37.429	ENSPSIG00000002690	URB2	92	45.833	Pelodiscus_sinensis
ENSTNIG00000017689	urb2	96	35.790	ENSPEMG00000019551	Urb2	100	35.643	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSTNIG00000017689	urb2	99	35.792	ENSPCIG00000030071	URB2	99	35.568	Phascolarctos_cinereus
ENSTNIG00000017689	urb2	100	54.324	ENSPFOG00000014330	urb2	100	54.042	Poecilia_formosa
ENSTNIG00000017689	urb2	96	58.230	ENSPLAG00000014654	urb2	100	53.284	Poecilia_latipinna
ENSTNIG00000017689	urb2	100	53.143	ENSPMEG00000012356	urb2	100	52.999	Poecilia_mexicana
ENSTNIG00000017689	urb2	100	53.047	ENSPREG00000010268	urb2	100	52.905	Poecilia_reticulata
ENSTNIG00000017689	urb2	100	36.707	ENSPPYG00000000123	URB2	100	36.159	Pongo_abelii
ENSTNIG00000017689	urb2	100	36.785	ENSPCOG00000023537	URB2	100	36.697	Propithecus_coquereli
ENSTNIG00000017689	urb2	99	34.936	ENSPVAG00000002108	URB2	93	43.780	Pteropus_vampyrus
ENSTNIG00000017689	urb2	87	61.925	ENSPNYG00000016840	urb2	89	61.925	Pundamilia_nyererei
ENSTNIG00000017689	urb2	99	44.286	ENSPNAG00000013684	urb2	99	43.912	Pygocentrus_nattereri
ENSTNIG00000017689	urb2	96	45.623	ENSRNOG00000026853	Urb2	97	35.769	Rattus_norvegicus
ENSTNIG00000017689	urb2	99	36.510	ENSRBIG00000037937	URB2	99	36.317	Rhinopithecus_bieti
ENSTNIG00000017689	urb2	99	36.446	ENSRROG00000039854	URB2	99	36.252	Rhinopithecus_roxellana
ENSTNIG00000017689	urb2	99	36.410	ENSSBOG00000023055	URB2	99	36.090	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSTNIG00000017689	urb2	99	35.403	ENSSHAG00000014735	URB2	99	35.723	Sarcophilus_harrisii
ENSTNIG00000017689	urb2	97	43.898	ENSSFOG00015015432	urb2	89	48.208	Scleropages_formosus
ENSTNIG00000017689	urb2	85	65.702	ENSSMAG00000004984	urb2	88	65.702	Scophthalmus_maximus
ENSTNIG00000017689	urb2	96	79.394	ENSSDUG00000000902	urb2	89	79.394	Seriola_dumerili
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ENSTNIG00000017689	urb2	96	76.970	ENSSPAG00000013632	urb2	91	76.970	Stegastes_partitus
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ENSTNIG00000017689	urb2	96	76.190	ENSTTRG00000014864	URB2	96	76.190	Tursiops_truncatus
ENSTNIG00000017689	urb2	100	36.003	ENSUAMG00000015022	URB2	100	36.067	Ursus_americanus
ENSTNIG00000017689	urb2	100	35.879	ENSUMAG00000004728	URB2	100	35.944	Ursus_maritimus
ENSTNIG00000017689	urb2	99	35.287	ENSVVUG00000006747	URB2	99	35.419	Vulpes_vulpes
ENSTNIG00000017689	urb2	99	33.270	ENSXETG00000023331	urb2	91	38.499	Xenopus_tropicalis
ENSTNIG00000017689	urb2	100	53.520	ENSXMAG00000015059	urb2	100	53.193	Xiphophorus_maculatus