EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSTNIG00000017778 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: twistnb
Alias: -
Full Name: TWIST neighbor
Gene Type: protein_coding
Species: Tetraodon_nigroviridis
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 2686 bases
Position: chr21_random:1545131-1547816
Accession: ZDB-GENE-041007-3
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSTNIP00000020930	SHS2_Rpb7-N	PF03876.17	8.4e-08	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSTNIT00000021163	-	987	-	ENSTNIP00000020930	329 (aa)	-	H3DK84
ENSTNIT00000000638	-	1038	-	ENSTNIP00000000612	345 (aa)	-	H3BX99

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSTNIG00000017778	twistnb	89	43.131	ENSG00000105849	TWISTNB	91	42.857	Homo_sapiens
ENSTNIG00000017778	twistnb	99	61.960	ENSAPOG00000011796	twistnb	91	61.960	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTNIG00000017778	twistnb	96	59.091	ENSACIG00000020400	twistnb	87	61.162	Amphilophus_citrinellus
ENSTNIG00000017778	twistnb	99	62.139	ENSAOCG00000024200	twistnb	91	62.069	Amphiprion_ocellaris
ENSTNIG00000017778	twistnb	99	62.139	ENSAPEG00000016750	twistnb	91	62.178	Amphiprion_percula
ENSTNIG00000017778	twistnb	93	61.755	ENSATEG00000017956	twistnb	88	60.472	Anabas_testudineus
ENSTNIG00000017778	twistnb	56	53.552	ENSACAG00000011817	TWISTNB	91	53.552	Anolis_carolinensis
ENSTNIG00000017778	twistnb	84	43.986	ENSANAG00000026418	TWISTNB	85	42.953	Aotus_nancymaae
ENSTNIG00000017778	twistnb	96	58.055	ENSACLG00000022280	twistnb	84	58.631	Astatotilapia_calliptera
ENSTNIG00000017778	twistnb	60	55.779	ENSAMXG00000035868	twistnb	67	53.540	Astyanax_mexicanus
ENSTNIG00000017778	twistnb	89	44.654	ENSBTAG00000006721	TWISTNB	92	44.795	Bos_taurus
ENSTNIG00000017778	twistnb	84	44.863	ENSCJAG00000001148	TWISTNB	85	43.813	Callithrix_jacchus
ENSTNIG00000017778	twistnb	89	42.038	ENSCAFG00000002511	TWISTNB	91	44.304	Canis_familiaris
ENSTNIG00000017778	twistnb	89	42.581	ENSCAFG00020002140	TWISTNB	85	43.653	Canis_lupus_dingo
ENSTNIG00000017778	twistnb	89	46.885	ENSCHIG00000024078	TWISTNB	97	45.104	Capra_hircus
ENSTNIG00000017778	twistnb	89	42.453	ENSTSYG00000001471	TWISTNB	91	43.168	Carlito_syrichta
ENSTNIG00000017778	twistnb	92	43.533	ENSCPOG00000031651	TWISTNB	93	42.025	Cavia_porcellus
ENSTNIG00000017778	twistnb	84	42.160	ENSCCAG00000026416	TWISTNB	84	43.434	Cebus_capucinus
ENSTNIG00000017778	twistnb	89	43.131	ENSCATG00000035621	TWISTNB	91	42.857	Cercocebus_atys
ENSTNIG00000017778	twistnb	84	46.996	ENSCLAG00000012696	TWISTNB	85	46.575	Chinchilla_lanigera
ENSTNIG00000017778	twistnb	89	42.812	ENSCSAG00000013544	TWISTNB	91	42.547	Chlorocebus_sabaeus
ENSTNIG00000017778	twistnb	89	44.068	ENSCPBG00000000367	TWISTNB	88	44.746	Chrysemys_picta_bellii
ENSTNIG00000017778	twistnb	89	42.812	ENSCANG00000038759	TWISTNB	91	42.547	Colobus_angolensis_palliatus
ENSTNIG00000017778	twistnb	62	52.451	ENSCGRG00001000499	Twistnb	93	42.188	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSTNIG00000017778	twistnb	60	72.362	ENSCVAG00000014324	twistnb	89	54.360	Cyprinodon_variegatus
ENSTNIG00000017778	twistnb	60	55.769	ENSDARG00000024416	twistnb	53	55.769	Danio_rerio
ENSTNIG00000017778	twistnb	91	41.935	ENSDNOG00000006438	-	92	45.283	Dasypus_novemcinctus
ENSTNIG00000017778	twistnb	89	44.262	ENSDORG00000007795	Twistnb	95	43.312	Dipodomys_ordii
ENSTNIG00000017778	twistnb	89	44.156	ENSEASG00005021702	TWISTNB	89	43.252	Equus_asinus_asinus
ENSTNIG00000017778	twistnb	89	43.871	ENSECAG00000014563	TWISTNB	89	43.558	Equus_caballus
ENSTNIG00000017778	twistnb	91	54.019	ENSELUG00000000098	TWISTNB	85	54.019	Esox_lucius
ENSTNIG00000017778	twistnb	91	45.098	ENSFCAG00000025987	TWISTNB	92	43.218	Felis_catus
ENSTNIG00000017778	twistnb	79	41.818	ENSFALG00000009761	TWISTNB	93	42.414	Ficedula_albicollis
ENSTNIG00000017778	twistnb	61	51.961	ENSFDAG00000017368	TWISTNB	86	43.689	Fukomys_damarensis
ENSTNIG00000017778	twistnb	64	72.146	ENSFHEG00000013318	twistnb	92	57.061	Fundulus_heteroclitus
ENSTNIG00000017778	twistnb	84	46.429	ENSGALG00000010863	TWISTNB	70	46.552	Gallus_gallus
ENSTNIG00000017778	twistnb	60	74.372	ENSGAFG00000018309	twistnb	92	54.179	Gambusia_affinis
ENSTNIG00000017778	twistnb	74	59.127	ENSGACG00000006425	twistnb	100	58.052	Gasterosteus_aculeatus
ENSTNIG00000017778	twistnb	89	43.131	ENSGGOG00000026888	TWISTNB	91	42.857	Gorilla_gorilla
ENSTNIG00000017778	twistnb	96	58.359	ENSHBUG00000020155	twistnb	84	58.333	Haplochromis_burtoni
ENSTNIG00000017778	twistnb	84	44.330	ENSHGLG00000010976	TWISTNB	85	44.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSTNIG00000017778	twistnb	84	44.330	ENSHGLG00100005410	TWISTNB	85	44.000	Heterocephalus_glaber_male
ENSTNIG00000017778	twistnb	63	68.519	ENSHCOG00000010590	twistnb	86	52.793	Hippocampus_comes
ENSTNIG00000017778	twistnb	89	47.619	ENSIPUG00000004117	twistnb	87	47.619	Ictalurus_punctatus
ENSTNIG00000017778	twistnb	58	53.299	ENSSTOG00000022702	TWISTNB	84	42.236	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSTNIG00000017778	twistnb	88	43.299	ENSJJAG00000015887	Twistnb	88	42.715	Jaculus_jaculus
ENSTNIG00000017778	twistnb	91	56.452	ENSKMAG00000001591	twistnb	88	55.917	Kryptolebias_marmoratus
ENSTNIG00000017778	twistnb	98	56.305	ENSLBEG00000024225	twistnb	91	58.430	Labrus_bergylta
ENSTNIG00000017778	twistnb	87	47.945	ENSLACG00000010508	TWISTNB	82	47.945	Latimeria_chalumnae
ENSTNIG00000017778	twistnb	53	60.571	ENSLOCG00000011399	twistnb	59	57.436	Lepisosteus_oculatus
ENSTNIG00000017778	twistnb	89	46.689	ENSLAFG00000008755	TWISTNB	92	47.452	Loxodonta_africana
ENSTNIG00000017778	twistnb	89	42.812	ENSMFAG00000045328	TWISTNB	91	42.547	Macaca_fascicularis
ENSTNIG00000017778	twistnb	89	42.812	ENSMMUG00000009609	TWISTNB	90	42.547	Macaca_mulatta
ENSTNIG00000017778	twistnb	89	42.812	ENSMNEG00000041159	TWISTNB	91	42.547	Macaca_nemestrina
ENSTNIG00000017778	twistnb	89	43.131	ENSMLEG00000042783	TWISTNB	91	42.857	Mandrillus_leucophaeus
ENSTNIG00000017778	twistnb	96	58.055	ENSMZEG00005007561	twistnb	84	58.631	Maylandia_zebra
ENSTNIG00000017778	twistnb	64	51.887	ENSMICG00000036489	TWISTNB	90	44.805	Microcebus_murinus
ENSTNIG00000017778	twistnb	58	54.974	ENSMOCG00000003458	Twistnb	98	43.505	Microtus_ochrogaster
ENSTNIG00000017778	twistnb	93	58.036	ENSMMOG00000020085	twistnb	86	59.226	Mola_mola
ENSTNIG00000017778	twistnb	84	45.329	ENSMODG00000001402	-	67	42.722	Monodelphis_domestica
ENSTNIG00000017778	twistnb	56	74.595	ENSMALG00000016407	twistnb	88	54.885	Monopterus_albus
ENSTNIG00000017778	twistnb	65	50.935	MGP_CAROLIEiJ_G0017692	Twistnb	93	41.745	Mus_caroli
ENSTNIG00000017778	twistnb	62	51.471	ENSMUSG00000020561	Twistnb	92	42.991	Mus_musculus
ENSTNIG00000017778	twistnb	92	43.218	MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	95	43.082	Mus_pahari
ENSTNIG00000017778	twistnb	65	50.467	MGP_SPRETEiJ_G0018534	Twistnb	93	42.724	Mus_spretus
ENSTNIG00000017778	twistnb	89	44.839	ENSMPUG00000013948	TWISTNB	86	44.828	Mustela_putorius_furo
ENSTNIG00000017778	twistnb	53	54.857	ENSMLUG00000008848	TWISTNB	92	43.750	Myotis_lucifugus
ENSTNIG00000017778	twistnb	59	53.535	ENSNGAG00000022455	Twistnb	99	53.535	Nannospalax_galili
ENSTNIG00000017778	twistnb	97	58.788	ENSNBRG00000008652	twistnb	90	58.160	Neolamprologus_brichardi
ENSTNIG00000017778	twistnb	84	44.674	ENSNLEG00000035755	TWISTNB	84	44.333	Nomascus_leucogenys
ENSTNIG00000017778	twistnb	89	45.277	ENSOPRG00000016109	TWISTNB	96	43.844	Ochotona_princeps
ENSTNIG00000017778	twistnb	57	55.102	ENSODEG00000007222	TWISTNB	91	45.171	Octodon_degus
ENSTNIG00000017778	twistnb	90	57.729	ENSORLG00000004005	twistnb	80	57.015	Oryzias_latipes
ENSTNIG00000017778	twistnb	90	58.013	ENSORLG00020002579	twistnb	89	57.015	Oryzias_latipes_hni
ENSTNIG00000017778	twistnb	90	56.563	ENSORLG00015013403	twistnb	79	57.313	Oryzias_latipes_hsok
ENSTNIG00000017778	twistnb	63	50.704	ENSOGAG00000009189	TWISTNB	93	42.553	Otolemur_garnettii
ENSTNIG00000017778	twistnb	89	45.724	ENSOARG00000009803	TWISTNB	96	44.411	Ovis_aries
ENSTNIG00000017778	twistnb	89	43.131	ENSPPAG00000034623	TWISTNB	93	42.857	Pan_paniscus
ENSTNIG00000017778	twistnb	91	44.518	ENSPPRG00000005877	TWISTNB	92	43.871	Panthera_pardus
ENSTNIG00000017778	twistnb	82	46.097	ENSPTIG00000021539	TWISTNB	93	43.599	Panthera_tigris_altaica
ENSTNIG00000017778	twistnb	89	43.131	ENSPTRG00000018962	TWISTNB	91	42.857	Pan_troglodytes
ENSTNIG00000017778	twistnb	89	42.812	ENSPANG00000015736	TWISTNB	91	42.547	Papio_anubis
ENSTNIG00000017778	twistnb	53	62.428	ENSPKIG00000025635	twistnb	87	44.237	Paramormyrops_kingsleyae
ENSTNIG00000017778	twistnb	92	60.188	ENSPMGG00000019023	twistnb	84	60.188	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSTNIG00000017778	twistnb	84	45.520	ENSPCIG00000017456	TWISTNB	90	44.408	Phascolarctos_cinereus
ENSTNIG00000017778	twistnb	91	43.871	ENSPPYG00000017752	TWISTNB	84	44.781	Pongo_abelii
ENSTNIG00000017778	twistnb	55	55.801	ENSPCOG00000017601	TWISTNB	89	45.541	Propithecus_coquereli
ENSTNIG00000017778	twistnb	89	44.771	ENSPVAG00000015574	TWISTNB	91	45.253	Pteropus_vampyrus
ENSTNIG00000017778	twistnb	96	57.751	ENSPNYG00000002674	twistnb	89	58.333	Pundamilia_nyererei
ENSTNIG00000017778	twistnb	96	43.529	ENSPNAG00000011956	twistnb	92	45.994	Pygocentrus_nattereri
ENSTNIG00000017778	twistnb	53	58.046	ENSRNOG00000010750	Twistnb	89	46.179	Rattus_norvegicus
ENSTNIG00000017778	twistnb	88	42.765	ENSRBIG00000043007	TWISTNB	89	42.500	Rhinopithecus_bieti
ENSTNIG00000017778	twistnb	88	42.765	ENSRROG00000040155	TWISTNB	90	42.500	Rhinopithecus_roxellana
ENSTNIG00000017778	twistnb	84	43.986	ENSSBOG00000023188	TWISTNB	85	43.289	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSTNIG00000017778	twistnb	51	61.677	ENSSFOG00015012788	twistnb	96	42.405	Scleropages_formosus
ENSTNIG00000017778	twistnb	99	61.696	ENSSMAG00000012792	twistnb	90	61.404	Scophthalmus_maximus
ENSTNIG00000017778	twistnb	95	60.180	ENSSDUG00000007038	twistnb	89	62.209	Seriola_dumerili
ENSTNIG00000017778	twistnb	93	38.978	ENSSPUG00000007595	TWISTNB	97	41.042	Sphenodon_punctatus
ENSTNIG00000017778	twistnb	97	61.212	ENSSPAG00000005871	twistnb	91	62.899	Stegastes_partitus
ENSTNIG00000017778	twistnb	96	43.963	ENSSSCG00000025298	TWISTNB	94	44.272	Sus_scrofa
ENSTNIG00000017778	twistnb	60	52.261	ENSTBEG00000003554	TWISTNB	88	42.812	Tupaia_belangeri
ENSTNIG00000017778	twistnb	92	44.304	ENSUAMG00000017593	TWISTNB	93	43.731	Ursus_americanus
ENSTNIG00000017778	twistnb	92	43.987	ENSUMAG00000022203	TWISTNB	93	43.425	Ursus_maritimus
ENSTNIG00000017778	twistnb	59	55.556	ENSVVUG00000008386	TWISTNB	91	45.367	Vulpes_vulpes
ENSTNIG00000017778	twistnb	60	76.382	ENSXCOG00000020199	twistnb	90	56.587	Xiphophorus_couchianus