EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSTNIG00000017812 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: polr1e
Alias: zgc:112501
Full Name: RNA polymerase I subunit E
Gene Type: protein_coding
Species: Tetraodon_nigroviridis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 2887 bases
Position: chr18:566264-569150
Accession: ZDB-GENE-050522-251
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSTNIP00000020968	RNA_pol_I_A49	PF06870.12	1.1e-111	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSTNIT00000021201	-	1343	-	ENSTNIP00000020968	417 (aa)	-	H3DKC2

Gene Model

Click here to download ENSTNIG00000017812's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSTNIG00000017812's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSTNIG00000017812	polr1e	98	44.634	ENSG00000137054	POLR1E	97	44.634	Homo_sapiens
ENSTNIG00000017812	polr1e	99	67.788	ENSAPOG00000012452	polr1e	99	67.788	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTNIG00000017812	polr1e	98	40.220	ENSAMEG00000010193	POLR1E	94	40.220	Ailuropoda_melanoleuca
ENSTNIG00000017812	polr1e	99	64.029	ENSACIG00000009884	polr1e	99	68.448	Amphilophus_citrinellus
ENSTNIG00000017812	polr1e	99	73.798	ENSAOCG00000005665	polr1e	99	73.798	Amphiprion_ocellaris
ENSTNIG00000017812	polr1e	99	74.279	ENSAPEG00000020581	polr1e	99	74.279	Amphiprion_percula
ENSTNIG00000017812	polr1e	99	76.442	ENSATEG00000020609	polr1e	99	76.442	Anabas_testudineus
ENSTNIG00000017812	polr1e	81	38.701	ENSAPLG00000010340	POLR1E	99	38.701	Anas_platyrhynchos
ENSTNIG00000017812	polr1e	99	43.720	ENSANAG00000038046	POLR1E	98	43.720	Aotus_nancymaae
ENSTNIG00000017812	polr1e	99	71.394	ENSACLG00000013685	polr1e	99	71.394	Astatotilapia_calliptera
ENSTNIG00000017812	polr1e	100	54.916	ENSAMXG00000018181	polr1e	100	54.916	Astyanax_mexicanus
ENSTNIG00000017812	polr1e	98	45.721	ENSBTAG00000012243	POLR1E	97	45.721	Bos_taurus
ENSTNIG00000017812	polr1e	95	42.462	ENSCJAG00000010512	POLR1E	93	44.236	Callithrix_jacchus
ENSTNIG00000017812	polr1e	99	43.133	ENSCAFG00000002377	POLR1E	98	43.133	Canis_familiaris
ENSTNIG00000017812	polr1e	99	43.373	ENSCAFG00020017851	POLR1E	98	43.373	Canis_lupus_dingo
ENSTNIG00000017812	polr1e	98	45.477	ENSCHIG00000019479	POLR1E	97	45.477	Capra_hircus
ENSTNIG00000017812	polr1e	99	42.892	ENSTSYG00000002075	POLR1E	98	42.892	Carlito_syrichta
ENSTNIG00000017812	polr1e	70	42.612	ENSCAPG00000015653	POLR1E	99	42.612	Cavia_aperea
ENSTNIG00000017812	polr1e	98	44.254	ENSCPOG00000009965	POLR1E	97	44.254	Cavia_porcellus
ENSTNIG00000017812	polr1e	99	40.338	ENSCCAG00000029460	POLR1E	98	40.338	Cebus_capucinus
ENSTNIG00000017812	polr1e	98	44.878	ENSCATG00000031732	POLR1E	97	44.878	Cercocebus_atys
ENSTNIG00000017812	polr1e	87	45.730	ENSCLAG00000012701	POLR1E	95	45.730	Chinchilla_lanigera
ENSTNIG00000017812	polr1e	98	44.878	ENSCSAG00000010782	POLR1E	97	44.878	Chlorocebus_sabaeus
ENSTNIG00000017812	polr1e	95	38.287	ENSCHOG00000013024	POLR1E	82	38.287	Choloepus_hoffmanni
ENSTNIG00000017812	polr1e	100	47.255	ENSCPBG00000006923	POLR1E	100	47.754	Chrysemys_picta_bellii
ENSTNIG00000017812	polr1e	98	44.634	ENSCANG00000036112	POLR1E	96	51.429	Colobus_angolensis_palliatus
ENSTNIG00000017812	polr1e	99	42.410	ENSCGRG00001006197	Polr1e	95	42.482	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSTNIG00000017812	polr1e	99	41.928	ENSCGRG00000006430	Polr1e	95	42.005	Cricetulus_griseus_crigri
ENSTNIG00000017812	polr1e	100	67.146	ENSCSEG00000005121	polr1e	100	67.146	Cynoglossus_semilaevis
ENSTNIG00000017812	polr1e	99	70.433	ENSCVAG00000019759	polr1e	99	70.433	Cyprinodon_variegatus
ENSTNIG00000017812	polr1e	97	56.158	ENSDARG00000006434	polr1e	99	55.635	Danio_rerio
ENSTNIG00000017812	polr1e	99	40.426	ENSDNOG00000010257	POLR1E	99	37.660	Dasypus_novemcinctus
ENSTNIG00000017812	polr1e	86	41.322	ENSETEG00000018204	POLR1E	99	41.598	Echinops_telfairi
ENSTNIG00000017812	polr1e	99	43.855	ENSEASG00005000675	POLR1E	98	43.855	Equus_asinus_asinus
ENSTNIG00000017812	polr1e	99	43.855	ENSECAG00000014669	POLR1E	98	43.855	Equus_caballus
ENSTNIG00000017812	polr1e	95	38.791	ENSEEUG00000011928	POLR1E	84	38.791	Erinaceus_europaeus
ENSTNIG00000017812	polr1e	99	64.183	ENSELUG00000008150	polr1e	99	64.183	Esox_lucius
ENSTNIG00000017812	polr1e	99	44.231	ENSFCAG00000013081	POLR1E	98	44.231	Felis_catus
ENSTNIG00000017812	polr1e	95	45.113	ENSFALG00000012950	POLR1E	99	45.113	Ficedula_albicollis
ENSTNIG00000017812	polr1e	98	44.743	ENSFDAG00000016917	POLR1E	97	44.743	Fukomys_damarensis
ENSTNIG00000017812	polr1e	99	68.269	ENSFHEG00000009801	polr1e	99	68.269	Fundulus_heteroclitus
ENSTNIG00000017812	polr1e	99	53.477	ENSGMOG00000003336	POLR1E	98	53.477	Gadus_morhua
ENSTNIG00000017812	polr1e	99	43.269	ENSGALG00000005395	POLR1E	99	43.269	Gallus_gallus
ENSTNIG00000017812	polr1e	99	69.231	ENSGAFG00000004850	polr1e	99	69.231	Gambusia_affinis
ENSTNIG00000017812	polr1e	99	66.826	ENSGACG00000016087	polr1e	99	66.826	Gasterosteus_aculeatus
ENSTNIG00000017812	polr1e	97	42.298	ENSGAGG00000001659	POLR1E	99	42.005	Gopherus_agassizii
ENSTNIG00000017812	polr1e	99	44.153	ENSGGOG00000001882	POLR1E	99	48.246	Gorilla_gorilla
ENSTNIG00000017812	polr1e	99	71.394	ENSHBUG00000002559	polr1e	99	71.394	Haplochromis_burtoni
ENSTNIG00000017812	polr1e	98	44.499	ENSHGLG00000002036	POLR1E	97	44.499	Heterocephalus_glaber_female
ENSTNIG00000017812	polr1e	98	44.499	ENSHGLG00100012784	POLR1E	97	44.499	Heterocephalus_glaber_male
ENSTNIG00000017812	polr1e	99	69.231	ENSHCOG00000002774	polr1e	99	69.231	Hippocampus_comes
ENSTNIG00000017812	polr1e	100	53.477	ENSIPUG00000003019	polr1e	100	53.477	Ictalurus_punctatus
ENSTNIG00000017812	polr1e	99	43.614	ENSSTOG00000009810	POLR1E	99	43.614	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSTNIG00000017812	polr1e	98	43.032	ENSJJAG00000020731	Polr1e	93	43.032	Jaculus_jaculus
ENSTNIG00000017812	polr1e	99	70.673	ENSKMAG00000000046	polr1e	99	70.673	Kryptolebias_marmoratus
ENSTNIG00000017812	polr1e	100	71.223	ENSLBEG00000003104	polr1e	99	71.223	Labrus_bergylta
ENSTNIG00000017812	polr1e	86	49.863	ENSLACG00000003416	POLR1E	99	49.863	Latimeria_chalumnae
ENSTNIG00000017812	polr1e	99	53.110	ENSLOCG00000012859	polr1e	99	53.110	Lepisosteus_oculatus
ENSTNIG00000017812	polr1e	99	44.819	ENSLAFG00000012831	POLR1E	98	44.819	Loxodonta_africana
ENSTNIG00000017812	polr1e	98	44.878	ENSMFAG00000045465	POLR1E	96	50.476	Macaca_fascicularis
ENSTNIG00000017812	polr1e	98	44.878	ENSMMUG00000017892	POLR1E	96	50.476	Macaca_mulatta
ENSTNIG00000017812	polr1e	98	41.527	ENSMNEG00000040283	POLR1E	89	52.632	Macaca_nemestrina
ENSTNIG00000017812	polr1e	98	44.878	ENSMLEG00000031135	POLR1E	96	50.476	Mandrillus_leucophaeus
ENSTNIG00000017812	polr1e	100	72.902	ENSMAMG00000001260	polr1e	99	72.902	Mastacembelus_armatus
ENSTNIG00000017812	polr1e	99	71.635	ENSMZEG00005021536	polr1e	99	71.635	Maylandia_zebra
ENSTNIG00000017812	polr1e	98	43.341	ENSMAUG00000021044	Polr1e	93	43.341	Mesocricetus_auratus
ENSTNIG00000017812	polr1e	99	43.373	ENSMICG00000003673	POLR1E	98	43.373	Microcebus_murinus
ENSTNIG00000017812	polr1e	98	42.233	ENSMOCG00000012920	Polr1e	94	41.928	Microtus_ochrogaster
ENSTNIG00000017812	polr1e	99	75.481	ENSMMOG00000007391	polr1e	99	75.481	Mola_mola
ENSTNIG00000017812	polr1e	96	44.169	ENSMODG00000002884	POLR1E	98	44.169	Monodelphis_domestica
ENSTNIG00000017812	polr1e	99	74.279	ENSMALG00000002665	polr1e	99	74.279	Monopterus_albus
ENSTNIG00000017812	polr1e	99	42.271	MGP_CAROLIEiJ_G0025967	Polr1e	97	42.677	Mus_caroli
ENSTNIG00000017812	polr1e	99	42.651	ENSMUSG00000028318	Polr1e	97	43.073	Mus_musculus
ENSTNIG00000017812	polr1e	99	44.365	MGP_PahariEiJ_G0024114	Polr1e	97	44.862	Mus_pahari
ENSTNIG00000017812	polr1e	99	42.651	MGP_SPRETEiJ_G0026930	Polr1e	97	43.073	Mus_spretus
ENSTNIG00000017812	polr1e	99	39.785	ENSMPUG00000006040	POLR1E	98	38.710	Mustela_putorius_furo
ENSTNIG00000017812	polr1e	99	45.060	ENSMLUG00000012688	POLR1E	95	45.060	Myotis_lucifugus
ENSTNIG00000017812	polr1e	98	43.447	ENSNGAG00000002520	Polr1e	94	43.447	Nannospalax_galili
ENSTNIG00000017812	polr1e	99	71.635	ENSNBRG00000016822	polr1e	99	71.635	Neolamprologus_brichardi
ENSTNIG00000017812	polr1e	98	44.634	ENSNLEG00000003616	POLR1E	96	50.476	Nomascus_leucogenys
ENSTNIG00000017812	polr1e	74	48.230	ENSMEUG00000015372	-	80	48.230	Notamacropus_eugenii
ENSTNIG00000017812	polr1e	86	39.118	ENSOPRG00000014206	POLR1E	99	39.118	Ochotona_princeps
ENSTNIG00000017812	polr1e	98	44.988	ENSODEG00000014565	POLR1E	94	44.988	Octodon_degus
ENSTNIG00000017812	polr1e	99	71.875	ENSONIG00000008921	polr1e	99	71.875	Oreochromis_niloticus
ENSTNIG00000017812	polr1e	99	43.373	ENSOCUG00000024773	POLR1E	98	43.614	Oryctolagus_cuniculus
ENSTNIG00000017812	polr1e	99	67.788	ENSORLG00000005143	polr1e	99	67.788	Oryzias_latipes
ENSTNIG00000017812	polr1e	92	65.625	ENSORLG00020007271	polr1e	98	65.625	Oryzias_latipes_hni
ENSTNIG00000017812	polr1e	99	67.788	ENSORLG00015000137	polr1e	99	67.788	Oryzias_latipes_hsok
ENSTNIG00000017812	polr1e	99	66.106	ENSOMEG00000013264	polr1e	98	66.106	Oryzias_melastigma
ENSTNIG00000017812	polr1e	99	43.373	ENSOGAG00000012981	POLR1E	96	43.373	Otolemur_garnettii
ENSTNIG00000017812	polr1e	98	45.721	ENSOARG00000011465	POLR1E	93	45.721	Ovis_aries
ENSTNIG00000017812	polr1e	98	44.634	ENSPPAG00000034566	POLR1E	96	50.476	Pan_paniscus
ENSTNIG00000017812	polr1e	99	44.712	ENSPPRG00000005649	POLR1E	98	44.712	Panthera_pardus
ENSTNIG00000017812	polr1e	99	44.712	ENSPTIG00000009774	POLR1E	98	44.712	Panthera_tigris_altaica
ENSTNIG00000017812	polr1e	98	44.634	ENSPTRG00000020944	POLR1E	96	50.476	Pan_troglodytes
ENSTNIG00000017812	polr1e	98	44.878	ENSPANG00000025563	POLR1E	96	50.476	Papio_anubis
ENSTNIG00000017812	polr1e	99	55.582	ENSPKIG00000003562	polr1e	99	55.582	Paramormyrops_kingsleyae
ENSTNIG00000017812	polr1e	99	45.192	ENSPSIG00000003274	POLR1E	95	45.673	Pelodiscus_sinensis
ENSTNIG00000017812	polr1e	95	65.743	ENSPMGG00000024169	polr1e	96	65.743	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSTNIG00000017812	polr1e	99	36.562	ENSPEMG00000022300	-	94	36.562	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSTNIG00000017812	polr1e	99	43.373	ENSPEMG00000019151	-	95	43.373	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSTNIG00000017812	polr1e	96	44.913	ENSPCIG00000014798	POLR1E	98	44.913	Phascolarctos_cinereus
ENSTNIG00000017812	polr1e	99	65.760	ENSPFOG00000019627	polr1e	99	65.760	Poecilia_formosa
ENSTNIG00000017812	polr1e	99	69.952	ENSPLAG00000022679	polr1e	99	69.952	Poecilia_latipinna
ENSTNIG00000017812	polr1e	86	71.111	ENSPMEG00000022123	polr1e	93	71.111	Poecilia_mexicana
ENSTNIG00000017812	polr1e	99	68.269	ENSPREG00000009470	polr1e	99	68.269	Poecilia_reticulata
ENSTNIG00000017812	polr1e	98	45.122	ENSPPYG00000019061	POLR1E	97	45.122	Pongo_abelii
ENSTNIG00000017812	polr1e	54	40.889	ENSPCAG00000004891	POLR1E	68	42.381	Procavia_capensis
ENSTNIG00000017812	polr1e	99	43.855	ENSPCOG00000027448	POLR1E	98	43.855	Propithecus_coquereli
ENSTNIG00000017812	polr1e	95	45.340	ENSPVAG00000007940	POLR1E	83	45.340	Pteropus_vampyrus
ENSTNIG00000017812	polr1e	99	71.635	ENSPNYG00000001032	polr1e	99	71.635	Pundamilia_nyererei
ENSTNIG00000017812	polr1e	99	54.436	ENSPNAG00000006987	polr1e	99	54.436	Pygocentrus_nattereri
ENSTNIG00000017812	polr1e	98	42.787	ENSRNOG00000012664	Polr1e	93	42.787	Rattus_norvegicus
ENSTNIG00000017812	polr1e	95	45.477	ENSRBIG00000034214	POLR1E	99	45.692	Rhinopithecus_bieti
ENSTNIG00000017812	polr1e	98	44.878	ENSRROG00000031986	POLR1E	96	50.476	Rhinopithecus_roxellana
ENSTNIG00000017812	polr1e	98	44.878	ENSSBOG00000021415	POLR1E	97	44.878	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSTNIG00000017812	polr1e	82	45.087	ENSSHAG00000016084	POLR1E	95	45.087	Sarcophilus_harrisii
ENSTNIG00000017812	polr1e	100	56.563	ENSSFOG00015002293	polr1e	100	56.563	Scleropages_formosus
ENSTNIG00000017812	polr1e	99	72.837	ENSSMAG00000011672	polr1e	93	72.837	Scophthalmus_maximus
ENSTNIG00000017812	polr1e	99	75.481	ENSSDUG00000022279	polr1e	99	75.481	Seriola_dumerili
ENSTNIG00000017812	polr1e	99	75.481	ENSSLDG00000024918	polr1e	99	75.481	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSTNIG00000017812	polr1e	56	39.914	ENSSARG00000009810	-	58	39.914	Sorex_araneus
ENSTNIG00000017812	polr1e	99	45.714	ENSSPUG00000009499	POLR1E	99	45.714	Sphenodon_punctatus
ENSTNIG00000017812	polr1e	99	75.962	ENSSPAG00000021240	polr1e	99	75.962	Stegastes_partitus
ENSTNIG00000017812	polr1e	99	44.203	ENSSSCG00000005347	POLR1E	98	44.203	Sus_scrofa
ENSTNIG00000017812	polr1e	95	38.170	ENSTGUG00000007169	POLR1E	99	38.170	Taeniopygia_guttata
ENSTNIG00000017812	polr1e	100	83.771	ENSTRUG00000020779	polr1e	100	84.777	Takifugu_rubripes
ENSTNIG00000017812	polr1e	95	45.614	ENSTBEG00000013786	POLR1E	84	45.614	Tupaia_belangeri
ENSTNIG00000017812	polr1e	95	43.860	ENSTTRG00000008294	POLR1E	84	43.860	Tursiops_truncatus
ENSTNIG00000017812	polr1e	99	44.337	ENSUAMG00000012474	POLR1E	98	45.580	Ursus_americanus
ENSTNIG00000017812	polr1e	99	44.337	ENSUMAG00000011496	POLR1E	98	44.337	Ursus_maritimus
ENSTNIG00000017812	polr1e	82	41.520	ENSVPAG00000009048	POLR1E	81	41.520	Vicugna_pacos
ENSTNIG00000017812	polr1e	98	43.765	ENSVVUG00000019954	POLR1E	97	43.765	Vulpes_vulpes
ENSTNIG00000017812	polr1e	99	40.952	ENSXETG00000006533	polr1e	99	40.952	Xenopus_tropicalis
ENSTNIG00000017812	polr1e	99	66.587	ENSXCOG00000013706	polr1e	99	66.587	Xiphophorus_couchianus
ENSTNIG00000017812	polr1e	99	71.154	ENSXMAG00000012484	polr1e	99	71.154	Xiphophorus_maculatus