EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSTNIG00000018880 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: srp19
Alias: zgc:63961
Full Name: signal recognition particle 19
Gene Type: protein_coding
Species: Tetraodon_nigroviridis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 2045 bases
Position: chr12:12311746-12313790
Accession: ZDB-GENE-040426-2657
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSTNIP00000022065	SRP19	PF01922.17	2.6e-29	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSTNIT00000022301	-	759	-	ENSTNIP00000022065	141 (aa)	-	Q4RG91

Gene Model

Click here to download ENSTNIG00000018880's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSTNIG00000018880's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSTNIG00000018880	srp19	91	69.767	ENSG00000153037	SRP19	95	67.708	Homo_sapiens
ENSTNIG00000018880	srp19	94	88.722	ENSAPOG00000002199	srp19	94	88.722	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTNIG00000018880	srp19	91	71.318	ENSAMEG00000012623	SRP19	88	71.318	Ailuropoda_melanoleuca
ENSTNIG00000018880	srp19	94	87.970	ENSACIG00000005082	srp19	94	87.970	Amphilophus_citrinellus
ENSTNIG00000018880	srp19	94	89.474	ENSAOCG00000002718	srp19	94	89.474	Amphiprion_ocellaris
ENSTNIG00000018880	srp19	94	88.722	ENSAPEG00000022170	srp19	94	88.722	Amphiprion_percula
ENSTNIG00000018880	srp19	94	91.729	ENSATEG00000012472	srp19	94	91.729	Anabas_testudineus
ENSTNIG00000018880	srp19	79	67.857	ENSAPLG00000002624	SRP19	93	67.826	Anas_platyrhynchos
ENSTNIG00000018880	srp19	88	69.600	ENSACAG00000007550	SRP19	87	70.079	Anolis_carolinensis
ENSTNIG00000018880	srp19	90	53.906	ENSANAG00000030287	-	89	53.659	Aotus_nancymaae
ENSTNIG00000018880	srp19	89	55.906	ENSANAG00000029862	-	88	64.583	Aotus_nancymaae
ENSTNIG00000018880	srp19	91	70.543	ENSANAG00000032576	-	90	70.543	Aotus_nancymaae
ENSTNIG00000018880	srp19	94	83.459	ENSACLG00000006259	srp19	94	83.459	Astatotilapia_calliptera
ENSTNIG00000018880	srp19	93	80.153	ENSAMXG00000043011	srp19	94	80.451	Astyanax_mexicanus
ENSTNIG00000018880	srp19	91	69.767	ENSBTAG00000012803	SRP19	90	69.767	Bos_taurus
ENSTNIG00000018880	srp19	82	48.305	WBGene00018159	F37F2.2	82	48.305	Caenorhabditis_elegans
ENSTNIG00000018880	srp19	91	70.543	ENSCJAG00000038676	-	86	67.368	Callithrix_jacchus
ENSTNIG00000018880	srp19	86	52.459	ENSCJAG00000045531	-	80	52.381	Callithrix_jacchus
ENSTNIG00000018880	srp19	91	69.767	ENSCAFG00000031549	SRP19	90	69.767	Canis_familiaris
ENSTNIG00000018880	srp19	65	68.478	ENSCAFG00020004285	-	85	69.474	Canis_lupus_dingo
ENSTNIG00000018880	srp19	84	70.833	ENSCAFG00020022437	-	92	71.545	Canis_lupus_dingo
ENSTNIG00000018880	srp19	91	69.767	ENSCAFG00020014267	-	90	69.767	Canis_lupus_dingo
ENSTNIG00000018880	srp19	91	69.767	ENSCHIG00000017551	SRP19	90	69.767	Capra_hircus
ENSTNIG00000018880	srp19	91	70.543	ENSTSYG00000007875	SRP19	90	70.543	Carlito_syrichta
ENSTNIG00000018880	srp19	82	58.824	ENSCPOG00000036806	SRP19	89	58.824	Cavia_porcellus
ENSTNIG00000018880	srp19	91	70.543	ENSCCAG00000035651	-	90	70.543	Cebus_capucinus
ENSTNIG00000018880	srp19	87	53.659	ENSCCAG00000029821	-	61	53.659	Cebus_capucinus
ENSTNIG00000018880	srp19	87	54.032	ENSCCAG00000023426	-	80	54.032	Cebus_capucinus
ENSTNIG00000018880	srp19	91	64.341	ENSCATG00000039250	-	89	64.341	Cercocebus_atys
ENSTNIG00000018880	srp19	87	60.976	ENSCATG00000040513	-	77	61.600	Cercocebus_atys
ENSTNIG00000018880	srp19	90	70.312	ENSCLAG00000004791	-	90	69.767	Chinchilla_lanigera
ENSTNIG00000018880	srp19	89	66.667	ENSCLAG00000016055	-	89	65.116	Chinchilla_lanigera
ENSTNIG00000018880	srp19	91	70.543	ENSCHOG00000013452	SRP19	90	70.543	Choloepus_hoffmanni
ENSTNIG00000018880	srp19	93	65.909	ENSCPBG00000013903	SRP19	94	66.418	Chrysemys_picta_bellii
ENSTNIG00000018880	srp19	91	68.217	ENSCGRG00001020510	Srp19	90	68.217	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSTNIG00000018880	srp19	69	66.667	ENSCGRG00000010716	-	89	65.686	Cricetulus_griseus_crigri
ENSTNIG00000018880	srp19	84	63.866	ENSCGRG00000008542	-	91	63.866	Cricetulus_griseus_crigri
ENSTNIG00000018880	srp19	94	84.211	ENSCSEG00000010039	srp19	94	84.211	Cynoglossus_semilaevis
ENSTNIG00000018880	srp19	94	89.474	ENSCVAG00000017621	srp19	94	89.474	Cyprinodon_variegatus
ENSTNIG00000018880	srp19	93	82.443	ENSDARG00000035699	srp19	94	82.707	Danio_rerio
ENSTNIG00000018880	srp19	91	70.543	ENSDNOG00000013856	SRP19	90	70.543	Dasypus_novemcinctus
ENSTNIG00000018880	srp19	67	70.833	ENSDORG00000004746	Srp19	76	70.833	Dipodomys_ordii
ENSTNIG00000018880	srp19	87	50.820	FBgn0015298	Srp19	70	52.679	Drosophila_melanogaster
ENSTNIG00000018880	srp19	91	70.543	ENSETEG00000017132	SRP19	90	70.543	Echinops_telfairi
ENSTNIG00000018880	srp19	88	68.548	ENSEBUG00000006613	srp19	94	66.917	Eptatretus_burgeri
ENSTNIG00000018880	srp19	91	70.543	ENSEASG00005015182	SRP19	90	70.543	Equus_asinus_asinus
ENSTNIG00000018880	srp19	91	68.992	ENSEEUG00000007298	SRP19	90	68.992	Erinaceus_europaeus
ENSTNIG00000018880	srp19	94	75.188	ENSELUG00000004594	srp19	94	75.188	Esox_lucius
ENSTNIG00000018880	srp19	93	83.969	ENSELUG00000007958	srp19	94	84.211	Esox_lucius
ENSTNIG00000018880	srp19	91	70.543	ENSFCAG00000025895	SRP19	90	70.543	Felis_catus
ENSTNIG00000018880	srp19	91	68.992	ENSFDAG00000013543	SRP19	90	68.992	Fukomys_damarensis
ENSTNIG00000018880	srp19	94	87.970	ENSFHEG00000000493	srp19	94	87.970	Fundulus_heteroclitus
ENSTNIG00000018880	srp19	85	85.833	ENSGMOG00000003264	srp19	94	85.833	Gadus_morhua
ENSTNIG00000018880	srp19	89	69.841	ENSGALG00000000218	SRP19	92	68.421	Gallus_gallus
ENSTNIG00000018880	srp19	94	83.333	ENSGAFG00000015815	srp19	64	83.333	Gambusia_affinis
ENSTNIG00000018880	srp19	94	86.466	ENSGACG00000001093	srp19	90	86.466	Gasterosteus_aculeatus
ENSTNIG00000018880	srp19	93	65.909	ENSGAGG00000025305	SRP19	94	66.418	Gopherus_agassizii
ENSTNIG00000018880	srp19	91	78.295	ENSHBUG00000006131	srp19	90	78.295	Haplochromis_burtoni
ENSTNIG00000018880	srp19	91	68.217	ENSHGLG00000006075	SRP19	90	68.217	Heterocephalus_glaber_female
ENSTNIG00000018880	srp19	91	68.217	ENSHGLG00100015859	SRP19	90	68.217	Heterocephalus_glaber_male
ENSTNIG00000018880	srp19	94	82.707	ENSHCOG00000013231	srp19	94	82.707	Hippocampus_comes
ENSTNIG00000018880	srp19	93	79.389	ENSIPUG00000025084	srp19	94	79.699	Ictalurus_punctatus
ENSTNIG00000018880	srp19	91	70.543	ENSSTOG00000000348	SRP19	90	70.543	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSTNIG00000018880	srp19	91	69.767	ENSJJAG00000017185	Srp19	90	69.767	Jaculus_jaculus
ENSTNIG00000018880	srp19	94	92.481	ENSKMAG00000011155	srp19	94	92.481	Kryptolebias_marmoratus
ENSTNIG00000018880	srp19	94	89.474	ENSLBEG00000026727	srp19	94	89.474	Labrus_bergylta
ENSTNIG00000018880	srp19	93	72.727	ENSLACG00000004459	SRP19	87	73.134	Latimeria_chalumnae
ENSTNIG00000018880	srp19	93	79.389	ENSLOCG00000010302	srp19	94	79.699	Lepisosteus_oculatus
ENSTNIG00000018880	srp19	91	68.992	ENSLAFG00000002564	SRP19	90	68.992	Loxodonta_africana
ENSTNIG00000018880	srp19	84	54.622	ENSMFAG00000040055	-	90	55.372	Macaca_fascicularis
ENSTNIG00000018880	srp19	85	64.463	ENSMFAG00000000554	-	93	61.832	Macaca_fascicularis
ENSTNIG00000018880	srp19	87	60.163	ENSMMUG00000032515	-	92	60.800	Macaca_mulatta
ENSTNIG00000018880	srp19	85	65.289	ENSMMUG00000049186	-	93	62.595	Macaca_mulatta
ENSTNIG00000018880	srp19	91	69.767	ENSMNEG00000038714	SRP19	90	69.767	Macaca_nemestrina
ENSTNIG00000018880	srp19	84	53.782	ENSMNEG00000040117	-	90	54.545	Macaca_nemestrina
ENSTNIG00000018880	srp19	94	93.233	ENSMAMG00000018346	srp19	94	93.233	Mastacembelus_armatus
ENSTNIG00000018880	srp19	94	83.459	ENSMZEG00005001765	srp19	94	83.459	Maylandia_zebra
ENSTNIG00000018880	srp19	84	69.167	ENSMGAG00000006762	SRP19	93	69.672	Meleagris_gallopavo
ENSTNIG00000018880	srp19	91	68.217	ENSMICG00000000399	SRP19	90	68.217	Microcebus_murinus
ENSTNIG00000018880	srp19	65	64.516	ENSMICG00000049202	-	86	65.625	Microcebus_murinus
ENSTNIG00000018880	srp19	67	69.792	ENSMOCG00000010532	-	88	69.792	Microtus_ochrogaster
ENSTNIG00000018880	srp19	90	70.312	ENSMOCG00000006534	Srp19	90	69.767	Microtus_ochrogaster
ENSTNIG00000018880	srp19	89	89.600	ENSMMOG00000010417	srp19	81	89.600	Mola_mola
ENSTNIG00000018880	srp19	93	70.455	ENSMODG00000013278	SRP19	94	70.896	Monodelphis_domestica
ENSTNIG00000018880	srp19	94	90.226	ENSMALG00000003858	srp19	94	90.226	Monopterus_albus
ENSTNIG00000018880	srp19	91	71.318	MGP_CAROLIEiJ_G0022086	Srp19	90	71.318	Mus_caroli
ENSTNIG00000018880	srp19	91	71.318	ENSMUSG00000014504	Srp19	90	71.318	Mus_musculus
ENSTNIG00000018880	srp19	91	70.543	MGP_PahariEiJ_G0018820	Srp19	90	70.543	Mus_pahari
ENSTNIG00000018880	srp19	91	71.318	MGP_SPRETEiJ_G0022998	Srp19	90	71.318	Mus_spretus
ENSTNIG00000018880	srp19	91	71.318	ENSMPUG00000012695	SRP19	88	71.318	Mustela_putorius_furo
ENSTNIG00000018880	srp19	87	64.516	ENSMLUG00000024549	-	91	65.079	Myotis_lucifugus
ENSTNIG00000018880	srp19	91	67.442	ENSMLUG00000014793	-	90	67.442	Myotis_lucifugus
ENSTNIG00000018880	srp19	90	69.531	ENSNGAG00000003440	-	89	69.531	Nannospalax_galili
ENSTNIG00000018880	srp19	87	64.516	ENSNGAG00000014524	-	95	64.516	Nannospalax_galili
ENSTNIG00000018880	srp19	90	63.281	ENSNLEG00000035364	-	88	66.667	Nomascus_leucogenys
ENSTNIG00000018880	srp19	84	71.429	ENSMEUG00000012529	SRP19	93	71.901	Notamacropus_eugenii
ENSTNIG00000018880	srp19	82	70.940	ENSOPRG00000010549	SRP19	93	71.074	Ochotona_princeps
ENSTNIG00000018880	srp19	87	57.724	ENSODEG00000013862	-	87	58.730	Octodon_degus
ENSTNIG00000018880	srp19	89	65.079	ENSODEG00000019119	-	90	65.116	Octodon_degus
ENSTNIG00000018880	srp19	67	69.792	ENSODEG00000005538	-	84	69.792	Octodon_degus
ENSTNIG00000018880	srp19	94	84.962	ENSONIG00000000542	srp19	94	84.962	Oreochromis_niloticus
ENSTNIG00000018880	srp19	93	68.182	ENSOANG00000011139	SRP19	77	68.657	Ornithorhynchus_anatinus
ENSTNIG00000018880	srp19	91	70.000	ENSOCUG00000015639	SRP19	90	70.000	Oryctolagus_cuniculus
ENSTNIG00000018880	srp19	94	87.970	ENSORLG00000028267	srp19	95	87.970	Oryzias_latipes
ENSTNIG00000018880	srp19	94	87.970	ENSORLG00020015201	srp19	95	87.970	Oryzias_latipes_hni
ENSTNIG00000018880	srp19	94	87.970	ENSORLG00015007525	srp19	95	87.970	Oryzias_latipes_hsok
ENSTNIG00000018880	srp19	94	86.466	ENSOMEG00000009178	srp19	95	86.466	Oryzias_melastigma
ENSTNIG00000018880	srp19	91	69.767	ENSOGAG00000008579	SRP19	90	69.767	Otolemur_garnettii
ENSTNIG00000018880	srp19	91	68.992	ENSOARG00000016066	SRP19	90	68.992	Ovis_aries
ENSTNIG00000018880	srp19	91	69.767	ENSPPAG00000037062	SRP19	90	69.767	Pan_paniscus
ENSTNIG00000018880	srp19	91	70.543	ENSPPRG00000015591	SRP19	90	70.543	Panthera_pardus
ENSTNIG00000018880	srp19	91	70.543	ENSPTIG00000021474	SRP19	90	70.543	Panthera_tigris_altaica
ENSTNIG00000018880	srp19	91	69.767	ENSPTRG00000017136	SRP19	90	69.767	Pan_troglodytes
ENSTNIG00000018880	srp19	90	64.844	ENSPANG00000034740	-	88	64.844	Papio_anubis
ENSTNIG00000018880	srp19	91	69.767	ENSPANG00000004370	-	90	69.767	Papio_anubis
ENSTNIG00000018880	srp19	94	76.692	ENSPKIG00000018671	srp19	94	76.692	Paramormyrops_kingsleyae
ENSTNIG00000018880	srp19	84	65.833	ENSPSIG00000013811	SRP19	93	66.393	Pelodiscus_sinensis
ENSTNIG00000018880	srp19	94	87.218	ENSPMGG00000015313	srp19	94	87.218	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSTNIG00000018880	srp19	85	71.901	ENSPEMG00000004412	-	88	71.901	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSTNIG00000018880	srp19	95	64.179	ENSPMAG00000002685	srp19	93	65.649	Petromyzon_marinus
ENSTNIG00000018880	srp19	93	69.697	ENSPCIG00000010250	SRP19	93	70.149	Phascolarctos_cinereus
ENSTNIG00000018880	srp19	94	89.474	ENSPFOG00000015887	srp19	94	89.474	Poecilia_formosa
ENSTNIG00000018880	srp19	94	89.474	ENSPLAG00000007784	srp19	94	89.474	Poecilia_latipinna
ENSTNIG00000018880	srp19	94	88.722	ENSPMEG00000003056	srp19	94	88.722	Poecilia_mexicana
ENSTNIG00000018880	srp19	94	89.474	ENSPREG00000017307	srp19	94	89.474	Poecilia_reticulata
ENSTNIG00000018880	srp19	91	69.767	ENSPPYG00000029584	SRP19	88	69.767	Pongo_abelii
ENSTNIG00000018880	srp19	67	69.474	ENSPCAG00000000228	SRP19	66	69.474	Procavia_capensis
ENSTNIG00000018880	srp19	91	69.767	ENSPCOG00000023239	SRP19	90	69.767	Propithecus_coquereli
ENSTNIG00000018880	srp19	91	69.767	ENSPVAG00000004895	SRP19	90	69.767	Pteropus_vampyrus
ENSTNIG00000018880	srp19	93	81.818	ENSPNAG00000009392	srp19	94	82.090	Pygocentrus_nattereri
ENSTNIG00000018880	srp19	91	70.543	ENSRNOG00000020204	Srp19	90	70.543	Rattus_norvegicus
ENSTNIG00000018880	srp19	52	65.333	ENSRBIG00000031651	-	83	65.333	Rhinopithecus_bieti
ENSTNIG00000018880	srp19	91	69.767	ENSRBIG00000015627	-	90	69.767	Rhinopithecus_bieti
ENSTNIG00000018880	srp19	89	63.200	ENSRBIG00000040440	-	89	63.281	Rhinopithecus_bieti
ENSTNIG00000018880	srp19	87	57.258	ENSRROG00000037316	-	91	58.197	Rhinopithecus_roxellana
ENSTNIG00000018880	srp19	89	63.200	ENSRROG00000037054	-	89	63.281	Rhinopithecus_roxellana
ENSTNIG00000018880	srp19	91	52.713	ENSSBOG00000032685	-	85	60.000	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSTNIG00000018880	srp19	91	70.543	ENSSBOG00000028071	-	90	70.543	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSTNIG00000018880	srp19	94	81.203	ENSSFOG00015022139	srp19	94	81.203	Scleropages_formosus
ENSTNIG00000018880	srp19	94	86.466	ENSSMAG00000016803	srp19	94	86.466	Scophthalmus_maximus
ENSTNIG00000018880	srp19	94	79.861	ENSSDUG00000012930	srp19	94	79.861	Seriola_dumerili
ENSTNIG00000018880	srp19	65	65.217	ENSSLDG00000021916	-	57	66.667	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSTNIG00000018880	srp19	90	69.531	ENSSARG00000000615	SRP19	90	68.992	Sorex_araneus
ENSTNIG00000018880	srp19	87	71.545	ENSSPUG00000015769	SRP19	92	69.925	Sphenodon_punctatus
ENSTNIG00000018880	srp19	91	69.767	ENSSSCG00000026230	SRP19	90	69.767	Sus_scrofa
ENSTNIG00000018880	srp19	87	69.919	ENSTGUG00000001019	SRP19	88	70.312	Taeniopygia_guttata
ENSTNIG00000018880	srp19	94	91.971	ENSTRUG00000023119	srp19	94	91.971	Takifugu_rubripes
ENSTNIG00000018880	srp19	91	68.992	ENSTTRG00000001690	SRP19	89	68.992	Tursiops_truncatus
ENSTNIG00000018880	srp19	89	70.635	ENSUAMG00000000111	SRP19	90	71.318	Ursus_americanus
ENSTNIG00000018880	srp19	91	71.318	ENSUMAG00000016997	SRP19	90	71.318	Ursus_maritimus
ENSTNIG00000018880	srp19	91	70.543	ENSVPAG00000006001	SRP19	90	70.543	Vicugna_pacos
ENSTNIG00000018880	srp19	67	70.833	ENSVVUG00000012423	SRP19	87	76.471	Vulpes_vulpes
ENSTNIG00000018880	srp19	86	72.131	ENSXETG00000011993	srp19	86	72.131	Xenopus_tropicalis
ENSTNIG00000018880	srp19	96	71.324	ENSXCOG00000012530	srp19	93	72.932	Xiphophorus_couchianus
ENSTNIG00000018880	srp19	94	89.474	ENSXMAG00000029788	srp19	94	89.474	Xiphophorus_maculatus