EuRBPDB

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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSTNIG00000018937 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: pelo
Alias: wu:fa12c12|wu:fb97f07|zgc:56550
Full Name: pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor
Gene Type: protein_coding
Species: Tetraodon_nigroviridis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 4388 bases
Position: chr2:7813155-7817542
Accession: ZDB-GENE-040426-1074
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSTNIP00000022124	eRF1_2	PF03464.15	6.5e-33	1	1
ENSTNIP00000022124	eRF1_3	PF03465.15	3.5e-26	1	1
ENSTNIP00000022124	eRF1_1	PF03463.15	4e-53	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSTNIT00000022361	-	1583	-	ENSTNIP00000022124	385 (aa)	-	Q4RG23

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSTNIG00000018937	pelo	100	80.519	ENSG00000152684	PELO	100	80.519	Homo_sapiens
ENSTNIG00000018937	pelo	64	93.117	ENSAPOG00000000616	pelo	90	93.117	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTNIG00000018937	pelo	100	93.247	ENSAPOG00000023072	pelo	100	93.247	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTNIG00000018937	pelo	64	93.117	ENSAPOG00000023700	-	90	93.117	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTNIG00000018937	pelo	100	80.779	ENSAMEG00000007734	PELO	100	80.779	Ailuropoda_melanoleuca
ENSTNIG00000018937	pelo	97	88.472	ENSACIG00000014386	pelo	97	93.195	Amphilophus_citrinellus
ENSTNIG00000018937	pelo	100	93.506	ENSAOCG00000023717	pelo	100	93.506	Amphiprion_ocellaris
ENSTNIG00000018937	pelo	100	93.506	ENSAPEG00000011235	pelo	100	93.506	Amphiprion_percula
ENSTNIG00000018937	pelo	100	93.247	ENSATEG00000019550	pelo	100	93.247	Anabas_testudineus
ENSTNIG00000018937	pelo	77	70.134	ENSAPLG00000013265	PELO	100	70.134	Anas_platyrhynchos
ENSTNIG00000018937	pelo	97	80.000	ENSACAG00000004352	PELO	100	79.740	Anolis_carolinensis
ENSTNIG00000018937	pelo	100	80.260	ENSANAG00000014096	PELO	100	80.260	Aotus_nancymaae
ENSTNIG00000018937	pelo	100	90.649	ENSACLG00000010305	pelo	100	90.649	Astatotilapia_calliptera
ENSTNIG00000018937	pelo	97	93.029	ENSAMXG00000020299	pelo	100	91.969	Astyanax_mexicanus
ENSTNIG00000018937	pelo	100	80.260	ENSBTAG00000003268	PELO	99	80.260	Bos_taurus
ENSTNIG00000018937	pelo	98	59.631	WBGene00011280	pelo-1	99	59.631	Caenorhabditis_elegans
ENSTNIG00000018937	pelo	100	80.260	ENSCJAG00000035190	PELO	100	80.260	Callithrix_jacchus
ENSTNIG00000018937	pelo	100	81.039	ENSCAFG00020023234	PELO	100	81.039	Canis_lupus_dingo
ENSTNIG00000018937	pelo	100	80.000	ENSCHIG00000016410	PELO	99	80.000	Capra_hircus
ENSTNIG00000018937	pelo	100	81.039	ENSTSYG00000005203	PELO	100	81.039	Carlito_syrichta
ENSTNIG00000018937	pelo	100	81.299	ENSCPOG00000027406	PELO	100	81.299	Cavia_porcellus
ENSTNIG00000018937	pelo	100	80.260	ENSCCAG00000035600	PELO	100	80.260	Cebus_capucinus
ENSTNIG00000018937	pelo	100	80.519	ENSCATG00000011829	PELO	100	80.519	Cercocebus_atys
ENSTNIG00000018937	pelo	100	81.299	ENSCLAG00000005043	PELO	100	81.299	Chinchilla_lanigera
ENSTNIG00000018937	pelo	100	80.519	ENSCSAG00000016692	PELO	100	80.519	Chlorocebus_sabaeus
ENSTNIG00000018937	pelo	100	80.779	ENSCHOG00000000523	PELO	100	80.779	Choloepus_hoffmanni
ENSTNIG00000018937	pelo	97	79.200	ENSCPBG00000007544	PELO	100	78.961	Chrysemys_picta_bellii
ENSTNIG00000018937	pelo	97	64.343	ENSCING00000001979	-	100	64.675	Ciona_intestinalis
ENSTNIG00000018937	pelo	100	65.974	ENSCSAVG00000006158	-	100	65.974	Ciona_savignyi
ENSTNIG00000018937	pelo	100	80.519	ENSCANG00000023382	PELO	100	80.519	Colobus_angolensis_palliatus
ENSTNIG00000018937	pelo	97	80.429	ENSCGRG00001024665	Pelo	100	80.000	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSTNIG00000018937	pelo	97	81.233	ENSCGRG00000004570	Pelo	100	80.779	Cricetulus_griseus_crigri
ENSTNIG00000018937	pelo	100	92.468	ENSCSEG00000008807	pelo	100	92.468	Cynoglossus_semilaevis
ENSTNIG00000018937	pelo	100	91.688	ENSCVAG00000016082	pelo	100	91.688	Cyprinodon_variegatus
ENSTNIG00000018937	pelo	100	89.351	ENSDARG00000055477	pelo	100	89.351	Danio_rerio
ENSTNIG00000018937	pelo	100	77.461	ENSDNOG00000036721	PELO	100	77.461	Dasypus_novemcinctus
ENSTNIG00000018937	pelo	100	81.818	ENSDORG00000016689	Pelo	100	81.818	Dipodomys_ordii
ENSTNIG00000018937	pelo	96	66.757	FBgn0011207	pelo	96	65.873	Drosophila_melanogaster
ENSTNIG00000018937	pelo	71	78.947	ENSEBUG00000004955	pelo	99	78.947	Eptatretus_burgeri
ENSTNIG00000018937	pelo	100	80.519	ENSEASG00005013348	PELO	100	80.519	Equus_asinus_asinus
ENSTNIG00000018937	pelo	100	90.130	ENSELUG00000023229	pelo	100	90.130	Esox_lucius
ENSTNIG00000018937	pelo	100	81.039	ENSFCAG00000032341	PELO	100	81.039	Felis_catus
ENSTNIG00000018937	pelo	100	80.000	ENSFALG00000004559	PELO	100	80.000	Ficedula_albicollis
ENSTNIG00000018937	pelo	74	82.394	ENSFDAG00000002076	PELO	88	82.394	Fukomys_damarensis
ENSTNIG00000018937	pelo	100	90.649	ENSFHEG00000009769	pelo	100	90.649	Fundulus_heteroclitus
ENSTNIG00000018937	pelo	98	90.716	ENSGMOG00000005849	pelo	100	90.130	Gadus_morhua
ENSTNIG00000018937	pelo	100	90.649	ENSGAFG00000019350	pelo	100	90.649	Gambusia_affinis
ENSTNIG00000018937	pelo	100	92.727	ENSGACG00000007245	pelo	100	92.727	Gasterosteus_aculeatus
ENSTNIG00000018937	pelo	97	79.467	ENSGAGG00000004018	PELO	100	79.221	Gopherus_agassizii
ENSTNIG00000018937	pelo	100	80.519	ENSGGOG00000012635	PELO	100	80.519	Gorilla_gorilla
ENSTNIG00000018937	pelo	100	90.649	ENSHBUG00000005866	pelo	100	90.649	Haplochromis_burtoni
ENSTNIG00000018937	pelo	100	80.779	ENSHGLG00000005932	PELO	100	80.779	Heterocephalus_glaber_female
ENSTNIG00000018937	pelo	100	78.701	ENSHGLG00100017627	PELO	100	78.701	Heterocephalus_glaber_male
ENSTNIG00000018937	pelo	100	90.649	ENSHCOG00000016782	pelo	100	90.649	Hippocampus_comes
ENSTNIG00000018937	pelo	100	89.351	ENSIPUG00000020627	pelo	100	89.351	Ictalurus_punctatus
ENSTNIG00000018937	pelo	100	81.299	ENSSTOG00000027378	PELO	100	81.299	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSTNIG00000018937	pelo	100	79.481	ENSJJAG00000015032	Pelo	100	79.481	Jaculus_jaculus
ENSTNIG00000018937	pelo	100	91.688	ENSKMAG00000021305	pelo	100	91.688	Kryptolebias_marmoratus
ENSTNIG00000018937	pelo	99	91.406	ENSLBEG00000022399	pelo	100	91.406	Labrus_bergylta
ENSTNIG00000018937	pelo	100	80.519	ENSLAFG00000020551	PELO	100	80.519	Loxodonta_africana
ENSTNIG00000018937	pelo	100	80.519	ENSMFAG00000000651	PELO	100	80.519	Macaca_fascicularis
ENSTNIG00000018937	pelo	100	80.519	ENSMMUG00000039101	PELO	100	80.519	Macaca_mulatta
ENSTNIG00000018937	pelo	100	80.519	ENSMNEG00000035538	PELO	100	80.519	Macaca_nemestrina
ENSTNIG00000018937	pelo	100	80.519	ENSMLEG00000039113	PELO	100	80.519	Mandrillus_leucophaeus
ENSTNIG00000018937	pelo	97	94.906	ENSMAMG00000013260	pelo	100	94.286	Mastacembelus_armatus
ENSTNIG00000018937	pelo	100	90.649	ENSMZEG00005014258	pelo	100	90.649	Maylandia_zebra
ENSTNIG00000018937	pelo	100	80.779	ENSMAUG00000009770	Pelo	100	80.779	Mesocricetus_auratus
ENSTNIG00000018937	pelo	100	80.779	ENSMICG00000044040	PELO	100	80.779	Microcebus_murinus
ENSTNIG00000018937	pelo	100	80.779	ENSMOCG00000017554	Pelo	100	80.779	Microtus_ochrogaster
ENSTNIG00000018937	pelo	100	91.948	ENSMMOG00000001324	pelo	100	91.948	Mola_mola
ENSTNIG00000018937	pelo	100	93.247	ENSMALG00000008194	pelo	100	93.247	Monopterus_albus
ENSTNIG00000018937	pelo	100	80.519	MGP_CAROLIEiJ_G0018915	Pelo	100	80.519	Mus_caroli
ENSTNIG00000018937	pelo	100	80.519	ENSMUSG00000042275	Pelo	100	80.519	Mus_musculus
ENSTNIG00000018937	pelo	100	80.779	MGP_PahariEiJ_G0015985	Pelo	100	80.779	Mus_pahari
ENSTNIG00000018937	pelo	100	80.519	MGP_SPRETEiJ_G0019793	Pelo	100	80.519	Mus_spretus
ENSTNIG00000018937	pelo	100	80.779	ENSMLUG00000024132	PELO	100	80.779	Myotis_lucifugus
ENSTNIG00000018937	pelo	100	81.299	ENSNGAG00000019331	Pelo	100	81.299	Nannospalax_galili
ENSTNIG00000018937	pelo	100	90.649	ENSNBRG00000011799	pelo	100	90.649	Neolamprologus_brichardi
ENSTNIG00000018937	pelo	100	80.519	ENSNLEG00000035970	PELO	100	80.519	Nomascus_leucogenys
ENSTNIG00000018937	pelo	100	79.221	ENSMEUG00000005468	PELO	100	79.221	Notamacropus_eugenii
ENSTNIG00000018937	pelo	98	80.423	ENSOPRG00000018793	PELO	99	80.423	Ochotona_princeps
ENSTNIG00000018937	pelo	100	81.299	ENSODEG00000017579	PELO	100	81.299	Octodon_degus
ENSTNIG00000018937	pelo	96	91.914	ENSONIG00000011511	pelo	100	91.169	Oreochromis_niloticus
ENSTNIG00000018937	pelo	100	81.039	ENSOCUG00000023902	PELO	100	81.039	Oryctolagus_cuniculus
ENSTNIG00000018937	pelo	100	92.208	ENSORLG00000005827	pelo	100	92.208	Oryzias_latipes
ENSTNIG00000018937	pelo	100	91.948	ENSORLG00020016456	pelo	100	91.948	Oryzias_latipes_hni
ENSTNIG00000018937	pelo	100	92.208	ENSORLG00015014447	pelo	100	92.208	Oryzias_latipes_hsok
ENSTNIG00000018937	pelo	100	93.247	ENSOMEG00000021567	pelo	100	93.247	Oryzias_melastigma
ENSTNIG00000018937	pelo	100	81.039	ENSOGAG00000027940	PELO	100	81.039	Otolemur_garnettii
ENSTNIG00000018937	pelo	100	80.260	ENSOARG00000008324	PELO	99	80.260	Ovis_aries
ENSTNIG00000018937	pelo	100	80.519	ENSPPAG00000038951	PELO	100	80.519	Pan_paniscus
ENSTNIG00000018937	pelo	100	81.039	ENSPPRG00000018800	PELO	100	81.039	Panthera_pardus
ENSTNIG00000018937	pelo	100	81.039	ENSPTIG00000019988	PELO	100	81.039	Panthera_tigris_altaica
ENSTNIG00000018937	pelo	100	80.260	ENSPTRG00000034409	PELO	100	80.260	Pan_troglodytes
ENSTNIG00000018937	pelo	100	80.519	ENSPANG00000010902	PELO	100	80.519	Papio_anubis
ENSTNIG00000018937	pelo	100	89.091	ENSPKIG00000015190	pelo	100	89.091	Paramormyrops_kingsleyae
ENSTNIG00000018937	pelo	97	79.467	ENSPSIG00000004971	PELO	100	79.221	Pelodiscus_sinensis
ENSTNIG00000018937	pelo	66	93.701	ENSPMGG00000014561	pelo	94	93.701	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSTNIG00000018937	pelo	100	81.039	ENSPEMG00000015584	Pelo	100	81.039	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSTNIG00000018937	pelo	100	80.260	ENSPCIG00000004880	PELO	100	80.260	Phascolarctos_cinereus
ENSTNIG00000018937	pelo	100	91.429	ENSPFOG00000007277	pelo	100	91.429	Poecilia_formosa
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ENSTNIG00000018937	pelo	100	91.429	ENSPMEG00000016964	pelo	100	91.429	Poecilia_mexicana
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ENSTNIG00000018937	pelo	97	80.697	ENSPPYG00000015451	PELO	96	80.519	Pongo_abelii
ENSTNIG00000018937	pelo	100	80.779	ENSPCOG00000021178	PELO	100	80.779	Propithecus_coquereli
ENSTNIG00000018937	pelo	100	90.649	ENSPNYG00000017325	pelo	100	90.649	Pundamilia_nyererei
ENSTNIG00000018937	pelo	97	91.957	ENSPNAG00000012458	pelo	99	90.649	Pygocentrus_nattereri
ENSTNIG00000018937	pelo	100	81.039	ENSRNOG00000061128	Pelo	100	81.039	Rattus_norvegicus
ENSTNIG00000018937	pelo	100	80.519	ENSRBIG00000007299	PELO	100	80.519	Rhinopithecus_bieti
ENSTNIG00000018937	pelo	100	80.519	ENSRROG00000035507	PELO	100	80.519	Rhinopithecus_roxellana
ENSTNIG00000018937	pelo	97	32.723	YNL001W	-	98	32.723	Saccharomyces_cerevisiae
ENSTNIG00000018937	pelo	100	80.519	ENSSBOG00000036140	PELO	100	80.519	Saimiri_boliviensis_boliviensis
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