EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSTNIG00000018949 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: xpo6
Alias: Ranbp20|fi24f12|wu:fi24f12
Full Name: exportin 6
Gene Type: protein_coding
Species: Tetraodon_nigroviridis
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 7139 bases
Position: chrUn_random:7829891-7837029
Accession: ZDB-GENE-030131-5912
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSTNIP00000002921	Xpo1	PF08389.12	4.2e-22	1	1
ENSTNIP00000022137	Xpo1	PF08389.12	2.1e-21	1	1
ENSTNIP00000002921	IBN_N	PF03810.19	1.2e-07	1	1
ENSTNIP00000022137	IBN_N	PF03810.19	1.2e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSTNIT00000002437	-	3429	-	ENSTNIP00000002921	1142 (aa)	-	H3C3V2
ENSTNIT00000022374	-	3459	-	ENSTNIP00000022137	1152 (aa)	-	H3DNN8

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSTNIG00000018949	xpo6	99	75.413	ENSG00000169180	XPO6	100	87.324	Homo_sapiens
ENSTNIG00000018949	xpo6	99	93.223	ENSAPOG00000012873	xpo6	99	93.223	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTNIG00000018949	xpo6	99	75.152	ENSAMEG00000011014	XPO6	100	75.152	Ailuropoda_melanoleuca
ENSTNIG00000018949	xpo6	99	90.505	ENSACIG00000008055	xpo6	99	90.505	Amphilophus_citrinellus
ENSTNIG00000018949	xpo6	99	93.397	ENSAOCG00000001326	xpo6	99	93.397	Amphiprion_ocellaris
ENSTNIG00000018949	xpo6	99	93.310	ENSAPEG00000016304	xpo6	99	93.310	Amphiprion_percula
ENSTNIG00000018949	xpo6	99	92.963	ENSATEG00000002273	xpo6	99	92.963	Anabas_testudineus
ENSTNIG00000018949	xpo6	100	76.997	ENSAPLG00000007480	XPO6	100	76.736	Anas_platyrhynchos
ENSTNIG00000018949	xpo6	99	67.675	ENSACAG00000016883	XPO6	99	67.416	Anolis_carolinensis
ENSTNIG00000018949	xpo6	99	75.065	ENSANAG00000031761	XPO6	99	75.065	Aotus_nancymaae
ENSTNIG00000018949	xpo6	99	91.225	ENSACLG00000007048	xpo6	99	91.225	Astatotilapia_calliptera
ENSTNIG00000018949	xpo6	99	77.400	ENSAMXG00000032539	xpo6	99	77.138	Astyanax_mexicanus
ENSTNIG00000018949	xpo6	99	74.978	ENSBTAG00000010309	XPO6	99	74.978	Bos_taurus
ENSTNIG00000018949	xpo6	99	75.326	ENSCJAG00000006014	XPO6	99	75.326	Callithrix_jacchus
ENSTNIG00000018949	xpo6	99	75.413	ENSCAFG00000017356	XPO6	100	75.413	Canis_familiaris
ENSTNIG00000018949	xpo6	99	75.413	ENSCAFG00020011808	XPO6	100	74.583	Canis_lupus_dingo
ENSTNIG00000018949	xpo6	99	75.065	ENSCHIG00000022341	XPO6	99	75.065	Capra_hircus
ENSTNIG00000018949	xpo6	99	72.333	ENSTSYG00000012249	XPO6	100	72.333	Carlito_syrichta
ENSTNIG00000018949	xpo6	99	75.065	ENSCPOG00000012824	XPO6	99	75.065	Cavia_porcellus
ENSTNIG00000018949	xpo6	99	75.065	ENSCCAG00000036360	XPO6	99	75.065	Cebus_capucinus
ENSTNIG00000018949	xpo6	99	75.500	ENSCATG00000034030	XPO6	99	75.500	Cercocebus_atys
ENSTNIG00000018949	xpo6	100	75.000	ENSCLAG00000012270	XPO6	100	75.065	Chinchilla_lanigera
ENSTNIG00000018949	xpo6	91	74.446	ENSCHOG00000004369	XPO6	91	74.446	Choloepus_hoffmanni
ENSTNIG00000018949	xpo6	82	82.353	ENSCPBG00000024660	XPO6	99	82.353	Chrysemys_picta_bellii
ENSTNIG00000018949	xpo6	99	44.530	ENSCING00000006884	-	99	44.530	Ciona_intestinalis
ENSTNIG00000018949	xpo6	100	43.149	ENSCSAVG00000000850	-	100	43.478	Ciona_savignyi
ENSTNIG00000018949	xpo6	99	75.326	ENSCANG00000041578	XPO6	99	75.326	Colobus_angolensis_palliatus
ENSTNIG00000018949	xpo6	99	75.065	ENSCGRG00001013173	Xpo6	99	75.065	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSTNIG00000018949	xpo6	99	90.182	ENSCSEG00000013622	xpo6	99	90.182	Cynoglossus_semilaevis
ENSTNIG00000018949	xpo6	99	90.182	ENSCVAG00000017399	xpo6	99	90.096	Cyprinodon_variegatus
ENSTNIG00000018949	xpo6	97	77.379	ENSDARG00000041217	xpo6	99	77.199	Danio_rerio
ENSTNIG00000018949	xpo6	99	75.413	ENSDNOG00000012449	XPO6	99	75.413	Dasypus_novemcinctus
ENSTNIG00000018949	xpo6	99	75.065	ENSDORG00000000919	Xpo6	99	75.065	Dipodomys_ordii
ENSTNIG00000018949	xpo6	81	31.414	FBgn0266572	ebo	87	31.414	Drosophila_melanogaster
ENSTNIG00000018949	xpo6	83	76.062	ENSETEG00000018768	XPO6	85	76.062	Echinops_telfairi
ENSTNIG00000018949	xpo6	99	58.304	ENSEBUG00000015560	xpo6	99	58.355	Eptatretus_burgeri
ENSTNIG00000018949	xpo6	99	75.586	ENSEASG00005017296	XPO6	99	75.586	Equus_asinus_asinus
ENSTNIG00000018949	xpo6	99	75.500	ENSECAG00000008601	XPO6	99	75.500	Equus_caballus
ENSTNIG00000018949	xpo6	97	69.678	ENSEEUG00000014587	XPO6	100	69.320	Erinaceus_europaeus
ENSTNIG00000018949	xpo6	99	84.275	ENSELUG00000009159	xpo6	99	84.275	Esox_lucius
ENSTNIG00000018949	xpo6	99	75.413	ENSFCAG00000010309	XPO6	99	75.413	Felis_catus
ENSTNIG00000018949	xpo6	100	76.997	ENSFALG00000004441	XPO6	98	77.170	Ficedula_albicollis
ENSTNIG00000018949	xpo6	99	75.413	ENSFDAG00000012689	XPO6	100	75.413	Fukomys_damarensis
ENSTNIG00000018949	xpo6	100	89.323	ENSFHEG00000021190	xpo6	99	90.009	Fundulus_heteroclitus
ENSTNIG00000018949	xpo6	99	76.803	ENSGALG00000035360	XPO6	99	76.803	Gallus_gallus
ENSTNIG00000018949	xpo6	99	89.835	ENSGAFG00000004044	xpo6	99	89.748	Gambusia_affinis
ENSTNIG00000018949	xpo6	95	76.304	ENSGAGG00000022738	XPO6	100	76.029	Gopherus_agassizii
ENSTNIG00000018949	xpo6	99	75.326	ENSGGOG00000005609	XPO6	99	75.326	Gorilla_gorilla
ENSTNIG00000018949	xpo6	99	91.399	ENSHBUG00000019504	xpo6	99	91.399	Haplochromis_burtoni
ENSTNIG00000018949	xpo6	94	56.063	ENSHGLG00000003865	-	99	58.268	Heterocephalus_glaber_female
ENSTNIG00000018949	xpo6	99	75.326	ENSHGLG00000009679	-	99	75.326	Heterocephalus_glaber_female
ENSTNIG00000018949	xpo6	94	62.835	ENSHGLG00100001081	-	99	62.835	Heterocephalus_glaber_male
ENSTNIG00000018949	xpo6	99	75.326	ENSHGLG00100003673	-	99	75.326	Heterocephalus_glaber_male
ENSTNIG00000018949	xpo6	99	90.530	ENSHCOG00000004987	xpo6	99	90.530	Hippocampus_comes
ENSTNIG00000018949	xpo6	99	76.722	ENSIPUG00000006516	xpo6	99	76.062	Ictalurus_punctatus
ENSTNIG00000018949	xpo6	99	74.891	ENSSTOG00000012161	XPO6	99	74.891	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSTNIG00000018949	xpo6	99	74.196	ENSJJAG00000019392	Xpo6	99	74.196	Jaculus_jaculus
ENSTNIG00000018949	xpo6	99	90.877	ENSKMAG00000010403	xpo6	99	90.791	Kryptolebias_marmoratus
ENSTNIG00000018949	xpo6	99	92.876	ENSLBEG00000023039	xpo6	99	92.876	Labrus_bergylta
ENSTNIG00000018949	xpo6	99	74.891	ENSLACG00000017930	XPO6	99	74.805	Latimeria_chalumnae
ENSTNIG00000018949	xpo6	94	80.882	ENSLOCG00000003304	xpo6	100	80.882	Lepisosteus_oculatus
ENSTNIG00000018949	xpo6	99	75.065	ENSLAFG00000011960	XPO6	100	75.065	Loxodonta_africana
ENSTNIG00000018949	xpo6	99	75.500	ENSMFAG00000045067	XPO6	99	75.500	Macaca_fascicularis
ENSTNIG00000018949	xpo6	99	75.500	ENSMMUG00000018623	XPO6	99	75.500	Macaca_mulatta
ENSTNIG00000018949	xpo6	99	75.500	ENSMNEG00000028587	XPO6	99	75.500	Macaca_nemestrina
ENSTNIG00000018949	xpo6	99	75.500	ENSMLEG00000029685	XPO6	99	75.500	Mandrillus_leucophaeus
ENSTNIG00000018949	xpo6	99	92.789	ENSMAMG00000001351	xpo6	99	92.789	Mastacembelus_armatus
ENSTNIG00000018949	xpo6	99	91.312	ENSMZEG00005010620	xpo6	99	91.312	Maylandia_zebra
ENSTNIG00000018949	xpo6	97	75.890	ENSMGAG00000009566	XPO6	100	75.890	Meleagris_gallopavo
ENSTNIG00000018949	xpo6	99	67.018	ENSMAUG00000012539	Xpo6	100	66.813	Mesocricetus_auratus
ENSTNIG00000018949	xpo6	99	75.326	ENSMICG00000001923	XPO6	99	75.326	Microcebus_murinus
ENSTNIG00000018949	xpo6	99	74.978	ENSMOCG00000008015	Xpo6	99	74.978	Microtus_ochrogaster
ENSTNIG00000018949	xpo6	99	90.964	ENSMMOG00000011992	xpo6	99	90.964	Mola_mola
ENSTNIG00000018949	xpo6	99	76.195	ENSMODG00000015516	XPO6	99	76.195	Monodelphis_domestica
ENSTNIG00000018949	xpo6	99	82.476	ENSMALG00000020612	xpo6	99	82.563	Monopterus_albus
ENSTNIG00000018949	xpo6	99	74.978	MGP_CAROLIEiJ_G0030439	Xpo6	99	74.978	Mus_caroli
ENSTNIG00000018949	xpo6	99	74.891	ENSMUSG00000000131	Xpo6	99	74.891	Mus_musculus
ENSTNIG00000018949	xpo6	99	74.978	MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	99	74.978	Mus_pahari
ENSTNIG00000018949	xpo6	99	74.718	MGP_SPRETEiJ_G0031553	Xpo6	99	74.718	Mus_spretus
ENSTNIG00000018949	xpo6	100	74.826	ENSMPUG00000012920	XPO6	98	74.826	Mustela_putorius_furo
ENSTNIG00000018949	xpo6	99	74.457	ENSMLUG00000012970	XPO6	100	74.457	Myotis_lucifugus
ENSTNIG00000018949	xpo6	99	75.065	ENSNGAG00000012740	Xpo6	99	75.065	Nannospalax_galili
ENSTNIG00000018949	xpo6	99	91.659	ENSNBRG00000007275	xpo6	99	91.659	Neolamprologus_brichardi
ENSTNIG00000018949	xpo6	99	75.413	ENSNLEG00000011518	XPO6	99	75.413	Nomascus_leucogenys
ENSTNIG00000018949	xpo6	87	75.545	ENSOPRG00000009278	XPO6	87	75.545	Ochotona_princeps
ENSTNIG00000018949	xpo6	99	75.326	ENSODEG00000012917	XPO6	99	75.326	Octodon_degus
ENSTNIG00000018949	xpo6	99	91.833	ENSONIG00000019366	xpo6	99	91.833	Oreochromis_niloticus
ENSTNIG00000018949	xpo6	99	75.152	ENSOCUG00000002727	XPO6	100	75.152	Oryctolagus_cuniculus
ENSTNIG00000018949	xpo6	99	88.628	ENSORLG00000011231	xpo6	100	87.796	Oryzias_latipes
ENSTNIG00000018949	xpo6	99	88.889	ENSORLG00020000386	xpo6	99	88.802	Oryzias_latipes_hni
ENSTNIG00000018949	xpo6	99	88.628	ENSORLG00015003636	xpo6	99	88.542	Oryzias_latipes_hsok
ENSTNIG00000018949	xpo6	99	89.497	ENSOMEG00000016505	xpo6	99	89.410	Oryzias_melastigma
ENSTNIG00000018949	xpo6	99	75.413	ENSOGAG00000012844	XPO6	100	75.413	Otolemur_garnettii
ENSTNIG00000018949	xpo6	99	74.978	ENSOARG00000000960	XPO6	100	74.978	Ovis_aries
ENSTNIG00000018949	xpo6	99	75.413	ENSPPAG00000033668	XPO6	99	75.413	Pan_paniscus
ENSTNIG00000018949	xpo6	99	75.044	ENSPPRG00000001454	XPO6	100	75.044	Panthera_pardus
ENSTNIG00000018949	xpo6	97	74.304	ENSPTIG00000016663	XPO6	99	74.304	Panthera_tigris_altaica
ENSTNIG00000018949	xpo6	99	75.413	ENSPTRG00000007919	XPO6	99	75.413	Pan_troglodytes
ENSTNIG00000018949	xpo6	99	75.500	ENSPANG00000017103	XPO6	99	75.500	Papio_anubis
ENSTNIG00000018949	xpo6	99	80.465	ENSPKIG00000022550	xpo6	99	81.126	Paramormyrops_kingsleyae
ENSTNIG00000018949	xpo6	99	75.154	ENSPSIG00000018225	XPO6	100	75.154	Pelodiscus_sinensis
ENSTNIG00000018949	xpo6	99	89.016	ENSPMGG00000014436	xpo6	100	89.016	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSTNIG00000018949	xpo6	99	74.891	ENSPEMG00000012100	Xpo6	99	74.891	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSTNIG00000018949	xpo6	100	67.096	ENSPMAG00000003127	xpo6	100	67.096	Petromyzon_marinus
ENSTNIG00000018949	xpo6	97	75.760	ENSPCIG00000003863	XPO6	100	75.275	Phascolarctos_cinereus
ENSTNIG00000018949	xpo6	99	90.278	ENSPFOG00000008763	xpo6	99	90.191	Poecilia_formosa
ENSTNIG00000018949	xpo6	99	90.269	ENSPLAG00000014054	xpo6	99	90.182	Poecilia_latipinna
ENSTNIG00000018949	xpo6	99	90.356	ENSPMEG00000018994	xpo6	99	90.269	Poecilia_mexicana
ENSTNIG00000018949	xpo6	97	90.812	ENSPREG00000016421	xpo6	96	90.723	Poecilia_reticulata
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