EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSTNIG00000018999 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: tyw1
Alias: im:6898509|wu:fb74d01|zgc:153368
Full Name: tRNA-yW synthesizing protein 1 homolog (S. cerevisiae)
Gene Type: protein_coding
Species: Tetraodon_nigroviridis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 13235 bases
Position: chr16:6296237-6309471
Accession: ZDB-GENE-060929-688
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSTNIP00000022189	Wyosine_form	PF08608.12	1.7e-27	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSTNIT00000022427	-	2001	-	ENSTNIP00000022189	666 (aa)	-	H3DNU0

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSTNIG00000018999	tyw1	100	70.165	ENSG00000198874	TYW1	90	70.765	Homo_sapiens
ENSTNIG00000018999	tyw1	98	63.497	ENSG00000277149	TYW1B	93	64.264	Homo_sapiens
ENSTNIG00000018999	tyw1	100	85.307	ENSAPOG00000014391	tyw1	88	86.507	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTNIG00000018999	tyw1	98	84.018	ENSACIG00000007325	tyw1	90	84.018	Amphilophus_citrinellus
ENSTNIG00000018999	tyw1	100	84.731	ENSAOCG00000016792	tyw1	88	86.228	Amphiprion_ocellaris
ENSTNIG00000018999	tyw1	100	85.030	ENSAPEG00000015939	tyw1	97	82.511	Amphiprion_percula
ENSTNIG00000018999	tyw1	89	85.810	ENSATEG00000006856	tyw1	82	85.810	Anabas_testudineus
ENSTNIG00000018999	tyw1	100	69.219	ENSANAG00000037051	-	90	69.219	Aotus_nancymaae
ENSTNIG00000018999	tyw1	100	84.281	ENSACLG00000018688	tyw1	88	84.281	Astatotilapia_calliptera
ENSTNIG00000018999	tyw1	100	77.477	ENSAMXG00000004157	tyw1	93	78.034	Astyanax_mexicanus
ENSTNIG00000018999	tyw1	100	71.214	ENSBTAG00000008446	TYW1	90	71.214	Bos_taurus
ENSTNIG00000018999	tyw1	100	69.760	ENSCJAG00000004295	-	90	69.910	Callithrix_jacchus
ENSTNIG00000018999	tyw1	100	69.970	ENSCAFG00000010867	-	89	71.171	Canis_familiaris
ENSTNIG00000018999	tyw1	100	63.079	ENSCAFG00020005367	-	94	64.425	Canis_lupus_dingo
ENSTNIG00000018999	tyw1	100	71.772	ENSCHIG00000019510	-	90	71.772	Capra_hircus
ENSTNIG00000018999	tyw1	89	70.707	ENSTSYG00000008236	-	89	70.707	Carlito_syrichta
ENSTNIG00000018999	tyw1	97	63.272	ENSCAPG00000013569	-	100	63.889	Cavia_aperea
ENSTNIG00000018999	tyw1	100	68.351	ENSCPOG00000011182	-	90	68.351	Cavia_porcellus
ENSTNIG00000018999	tyw1	100	70.315	ENSCCAG00000026643	-	90	70.315	Cebus_capucinus
ENSTNIG00000018999	tyw1	100	69.715	ENSCATG00000043677	-	90	70.315	Cercocebus_atys
ENSTNIG00000018999	tyw1	100	69.565	ENSCLAG00000006321	-	89	70.015	Chinchilla_lanigera
ENSTNIG00000018999	tyw1	98	65.947	ENSCSAG00000018274	-	89	66.611	Chlorocebus_sabaeus
ENSTNIG00000018999	tyw1	56	82.051	ENSCHOG00000003801	-	56	82.051	Choloepus_hoffmanni
ENSTNIG00000018999	tyw1	100	70.746	ENSCPBG00000014896	-	87	71.642	Chrysemys_picta_bellii
ENSTNIG00000018999	tyw1	90	58.140	ENSCING00000004125	-	97	59.106	Ciona_intestinalis
ENSTNIG00000018999	tyw1	60	67.397	ENSCSAVG00000005712	-	100	54.449	Ciona_savignyi
ENSTNIG00000018999	tyw1	100	69.715	ENSCANG00000033209	-	90	70.315	Colobus_angolensis_palliatus
ENSTNIG00000018999	tyw1	66	75.399	ENSCGRG00001003679	Tyw1	75	75.112	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSTNIG00000018999	tyw1	100	84.234	ENSCSEG00000005810	tyw1	86	84.685	Cynoglossus_semilaevis
ENSTNIG00000018999	tyw1	89	83.250	ENSCVAG00000001054	tyw1	83	83.417	Cyprinodon_variegatus
ENSTNIG00000018999	tyw1	100	77.327	ENSDARG00000062987	tyw1	87	78.679	Danio_rerio
ENSTNIG00000018999	tyw1	100	70.808	ENSDNOG00000024165	-	90	70.958	Dasypus_novemcinctus
ENSTNIG00000018999	tyw1	95	64.929	ENSDORG00000014772	Tyw1	91	65.403	Dipodomys_ordii
ENSTNIG00000018999	tyw1	66	75.000	ENSEBUG00000004494	tyw1	92	75.000	Eptatretus_burgeri
ENSTNIG00000018999	tyw1	100	70.852	ENSEASG00005008818	-	90	71.001	Equus_asinus_asinus
ENSTNIG00000018999	tyw1	92	81.322	ENSECAG00000023164	-	89	64.414	Equus_caballus
ENSTNIG00000018999	tyw1	59	76.768	ENSEEUG00000005950	-	52	76.768	Erinaceus_europaeus
ENSTNIG00000018999	tyw1	100	75.676	ENSELUG00000008449	tyw1	98	71.365	Esox_lucius
ENSTNIG00000018999	tyw1	100	70.270	ENSFCAG00000014262	-	89	70.270	Felis_catus
ENSTNIG00000018999	tyw1	100	67.916	ENSFALG00000013810	-	89	68.516	Ficedula_albicollis
ENSTNIG00000018999	tyw1	99	68.366	ENSFDAG00000013270	-	90	69.323	Fukomys_damarensis
ENSTNIG00000018999	tyw1	93	78.080	ENSFHEG00000020824	tyw1	81	78.080	Fundulus_heteroclitus
ENSTNIG00000018999	tyw1	100	68.216	ENSGALG00000001110	-	89	69.115	Gallus_gallus
ENSTNIG00000018999	tyw1	100	81.437	ENSGACG00000012692	tyw1	91	81.437	Gasterosteus_aculeatus
ENSTNIG00000018999	tyw1	100	70.315	ENSGAGG00000022393	-	89	71.064	Gopherus_agassizii
ENSTNIG00000018999	tyw1	89	62.458	ENSGGOG00000001473	TYW1	92	59.931	Gorilla_gorilla
ENSTNIG00000018999	tyw1	100	84.281	ENSHBUG00000002640	tyw1	88	84.281	Haplochromis_burtoni
ENSTNIG00000018999	tyw1	98	65.846	ENSHGLG00000012093	-	100	65.846	Heterocephalus_glaber_female
ENSTNIG00000018999	tyw1	100	68.966	ENSHGLG00100011743	TYW1	90	68.919	Heterocephalus_glaber_male
ENSTNIG00000018999	tyw1	99	69.955	ENSHCOG00000019949	tyw1	88	69.955	Hippocampus_comes
ENSTNIG00000018999	tyw1	100	75.375	ENSIPUG00000016330	tyw1	87	77.177	Ictalurus_punctatus
ENSTNIG00000018999	tyw1	100	67.868	ENSSTOG00000004067	-	82	69.069	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSTNIG00000018999	tyw1	100	69.219	ENSJJAG00000022959	Tyw1	91	69.565	Jaculus_jaculus
ENSTNIG00000018999	tyw1	100	83.234	ENSKMAG00000018599	tyw1	88	83.234	Kryptolebias_marmoratus
ENSTNIG00000018999	tyw1	100	68.966	ENSLACG00000018917	tyw1	87	70.149	Latimeria_chalumnae
ENSTNIG00000018999	tyw1	100	75.449	ENSLOCG00000004035	tyw1	87	75.449	Lepisosteus_oculatus
ENSTNIG00000018999	tyw1	100	69.865	ENSMFAG00000035457	-	90	70.465	Macaca_fascicularis
ENSTNIG00000018999	tyw1	100	69.865	ENSMMUG00000030374	-	90	70.465	Macaca_mulatta
ENSTNIG00000018999	tyw1	100	69.865	ENSMNEG00000041992	-	90	70.465	Macaca_nemestrina
ENSTNIG00000018999	tyw1	100	69.865	ENSMLEG00000039741	-	90	70.465	Mandrillus_leucophaeus
ENSTNIG00000018999	tyw1	100	86.248	ENSMAMG00000016089	tyw1	92	82.675	Mastacembelus_armatus
ENSTNIG00000018999	tyw1	100	83.058	ENSMZEG00005024386	tyw1	96	83.058	Maylandia_zebra
ENSTNIG00000018999	tyw1	100	68.114	ENSMGAG00000002176	-	89	69.012	Meleagris_gallopavo
ENSTNIG00000018999	tyw1	100	69.670	ENSMAUG00000002959	Tyw1	90	69.970	Mesocricetus_auratus
ENSTNIG00000018999	tyw1	100	70.915	ENSMICG00000014374	-	90	70.915	Microcebus_murinus
ENSTNIG00000018999	tyw1	100	69.910	ENSMOCG00000017720	Tyw1	90	69.910	Microtus_ochrogaster
ENSTNIG00000018999	tyw1	98	82.055	ENSMMOG00000005064	tyw1	88	82.055	Mola_mola
ENSTNIG00000018999	tyw1	100	68.107	ENSMODG00000025697	-	89	69.688	Monodelphis_domestica
ENSTNIG00000018999	tyw1	100	84.281	ENSMALG00000010238	tyw1	88	84.281	Monopterus_albus
ENSTNIG00000018999	tyw1	100	71.064	MGP_CAROLIEiJ_G0027801	Tyw1	91	71.214	Mus_caroli
ENSTNIG00000018999	tyw1	100	71.364	ENSMUSG00000056310	Tyw1	91	71.514	Mus_musculus
ENSTNIG00000018999	tyw1	100	70.165	MGP_PahariEiJ_G0024383	Tyw1	91	70.765	Mus_pahari
ENSTNIG00000018999	tyw1	100	70.915	MGP_SPRETEiJ_G0028799	Tyw1	91	71.064	Mus_spretus
ENSTNIG00000018999	tyw1	100	69.369	ENSMPUG00000016191	-	95	69.369	Mustela_putorius_furo
ENSTNIG00000018999	tyw1	100	67.608	ENSMLUG00000013582	-	90	68.053	Myotis_lucifugus
ENSTNIG00000018999	tyw1	100	68.694	ENSNGAG00000002742	Tyw1	92	69.611	Nannospalax_galili
ENSTNIG00000018999	tyw1	100	80.269	ENSNBRG00000016996	tyw1	94	80.269	Neolamprologus_brichardi
ENSTNIG00000018999	tyw1	100	69.115	ENSNLEG00000013210	-	92	65.798	Nomascus_leucogenys
ENSTNIG00000018999	tyw1	99	53.185	ENSOPRG00000008734	-	87	52.774	Ochotona_princeps
ENSTNIG00000018999	tyw1	98	64.724	ENSODEG00000014729	-	93	64.571	Octodon_degus
ENSTNIG00000018999	tyw1	100	84.305	ENSONIG00000005872	tyw1	88	84.305	Oreochromis_niloticus
ENSTNIG00000018999	tyw1	100	70.270	ENSOCUG00000003173	-	90	70.270	Oryctolagus_cuniculus
ENSTNIG00000018999	tyw1	100	80.510	ENSORLG00000001393	tyw1	88	81.709	Oryzias_latipes
ENSTNIG00000018999	tyw1	100	80.269	ENSORLG00020019361	tyw1	88	81.559	Oryzias_latipes_hni
ENSTNIG00000018999	tyw1	100	80.030	ENSORLG00015008095	tyw1	88	81.465	Oryzias_latipes_hsok
ENSTNIG00000018999	tyw1	100	70.615	ENSOGAG00000016555	-	89	70.615	Otolemur_garnettii
ENSTNIG00000018999	tyw1	100	71.386	ENSOARG00000010673	-	90	71.386	Ovis_aries
ENSTNIG00000018999	tyw1	100	70.420	ENSPPRG00000004945	-	93	66.718	Panthera_pardus
ENSTNIG00000018999	tyw1	100	70.420	ENSPTIG00000019545	-	89	70.420	Panthera_tigris_altaica
ENSTNIG00000018999	tyw1	100	64.435	ENSPTRG00000023076	TYW1B	92	62.423	Pan_troglodytes
ENSTNIG00000018999	tyw1	100	69.565	ENSPANG00000019053	-	90	70.165	Papio_anubis
ENSTNIG00000018999	tyw1	100	71.898	ENSPKIG00000006545	tyw1	87	72.795	Paramormyrops_kingsleyae
ENSTNIG00000018999	tyw1	100	78.228	ENSPMGG00000004240	tyw1	94	78.176	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSTNIG00000018999	tyw1	100	70.790	ENSPEMG00000008274	Tyw1	90	70.939	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSTNIG00000018999	tyw1	100	80.480	ENSPFOG00000015855	tyw1	90	80.480	Poecilia_formosa
ENSTNIG00000018999	tyw1	100	80.180	ENSPLAG00000000838	tyw1	94	75.375	Poecilia_latipinna
ENSTNIG00000018999	tyw1	100	80.180	ENSPMEG00000019437	tyw1	94	77.027	Poecilia_mexicana
ENSTNIG00000018999	tyw1	100	76.126	ENSPREG00000018773	tyw1	88	77.027	Poecilia_reticulata
ENSTNIG00000018999	tyw1	100	70.015	ENSPPYG00000017514	TYW1	90	70.465	Pongo_abelii
ENSTNIG00000018999	tyw1	83	63.406	ENSPCOG00000015294	-	86	60.870	Propithecus_coquereli
ENSTNIG00000018999	tyw1	100	84.281	ENSPNYG00000022381	tyw1	88	84.281	Pundamilia_nyererei
ENSTNIG00000018999	tyw1	100	77.177	ENSPNAG00000009001	tyw1	90	78.228	Pygocentrus_nattereri
ENSTNIG00000018999	tyw1	100	69.760	ENSRNOG00000024352	Tyw1	90	69.910	Rattus_norvegicus
ENSTNIG00000018999	tyw1	100	69.715	ENSRBIG00000039619	-	90	70.315	Rhinopithecus_bieti
ENSTNIG00000018999	tyw1	100	69.715	ENSRROG00000039780	-	90	70.315	Rhinopithecus_roxellana
ENSTNIG00000018999	tyw1	99	40.768	YPL207W	-	73	40.768	Saccharomyces_cerevisiae
ENSTNIG00000018999	tyw1	100	69.715	ENSSBOG00000025873	-	90	69.715	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSTNIG00000018999	tyw1	100	68.666	ENSSHAG00000010346	-	91	68.945	Sarcophilus_harrisii
ENSTNIG00000018999	tyw1	100	75.826	ENSSFOG00015001054	tyw1	96	72.973	Scleropages_formosus
ENSTNIG00000018999	tyw1	100	83.784	ENSSMAG00000020514	tyw1	88	83.784	Scophthalmus_maximus
ENSTNIG00000018999	tyw1	100	87.237	ENSSDUG00000001552	tyw1	93	86.787	Seriola_dumerili
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ENSTNIG00000018999	tyw1	100	67.718	ENSSPUG00000002715	-	89	68.318	Sphenodon_punctatus
ENSTNIG00000018999	tyw1	100	70.615	ENSSSCG00000007733	-	90	70.615	Sus_scrofa
ENSTNIG00000018999	tyw1	90	70.569	ENSTGUG00000003428	-	88	71.237	Taeniopygia_guttata
ENSTNIG00000018999	tyw1	100	91.291	ENSTRUG00000016107	tyw1	86	91.291	Takifugu_rubripes
ENSTNIG00000018999	tyw1	100	70.571	ENSUMAG00000015343	-	89	70.571	Ursus_maritimus
ENSTNIG00000018999	tyw1	100	69.520	ENSVVUG00000016457	-	89	70.420	Vulpes_vulpes
ENSTNIG00000018999	tyw1	100	70.571	ENSXETG00000010094	tyw1	89	71.664	Xenopus_tropicalis
ENSTNIG00000018999	tyw1	100	80.330	ENSXMAG00000013125	tyw1	97	76.426	Xiphophorus_maculatus