EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSTNIG00000019143 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: ptrhd1
Alias: si:dkey-34f16.5
Full Name: peptidyl-tRNA hydrolase domain containing 1
Gene Type: protein_coding
Species: Tetraodon_nigroviridis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 978 bases
Position: chr14:1831510-1832487
Accession: ZDB-GENE-081110-2
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSTNIP00000022340	PTH2	PF01981.16	1.2e-23	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSTNIT00000022579	-	381	-	ENSTNIP00000022340	126 (aa)	-	Q4T548

Gene Model

Click here to download ENSTNIG00000019143's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSTNIG00000019143's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	58.268	ENSG00000184924	PTRHD1	90	58.268	Homo_sapiens
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	87.302	ENSAPOG00000024433	ptrhd1	100	87.302	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	91	56.034	ENSAMEG00000002651	PTRHD1	83	56.034	Ailuropoda_melanoleuca
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	87.302	ENSACIG00000002596	ptrhd1	100	87.302	Amphilophus_citrinellus
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	87.302	ENSAOCG00000007632	ptrhd1	100	87.302	Amphiprion_ocellaris
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	87.302	ENSAPEG00000011491	ptrhd1	100	87.302	Amphiprion_percula
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	86.508	ENSATEG00000019199	ptrhd1	100	86.508	Anabas_testudineus
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	58.268	ENSANAG00000019089	PTRHD1	90	58.268	Aotus_nancymaae
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	86.508	ENSACLG00000000814	ptrhd1	100	86.508	Astatotilapia_calliptera
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	76.378	ENSAMXG00000034266	ptrhd1	88	76.378	Astyanax_mexicanus
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	60.630	ENSBTAG00000015012	PTRHD1	90	60.630	Bos_taurus
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	90	46.018	WBGene00050885	Y94H6A.12	100	41.935	Caenorhabditis_elegans
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	57.480	ENSCJAG00000008012	PTRHD1	90	57.480	Callithrix_jacchus
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	56.693	ENSCAFG00000024865	PTRHD1	90	56.693	Canis_familiaris
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	60.630	ENSCHIG00000014757	PTRHD1	90	60.630	Capra_hircus
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	57.480	ENSTSYG00000009995	PTRHD1	90	57.480	Carlito_syrichta
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	57.480	ENSCPOG00000005561	PTRHD1	90	57.480	Cavia_porcellus
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	58.268	ENSCCAG00000033856	PTRHD1	90	58.268	Cebus_capucinus
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	58.730	ENSCATG00000033690	PTRHD1	90	58.730	Cercocebus_atys
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	58.268	ENSCLAG00000006505	PTRHD1	87	58.268	Chinchilla_lanigera
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	58.268	ENSCSAG00000008490	PTRHD1	90	58.268	Chlorocebus_sabaeus
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	47.619	ENSCHOG00000001920	PTRHD1	91	47.619	Choloepus_hoffmanni
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	59.055	ENSCPBG00000022276	PTRHD1	90	59.055	Chrysemys_picta_bellii
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	93	55.556	ENSCING00000019647	-	99	55.556	Ciona_intestinalis
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	58.268	ENSCANG00000034444	PTRHD1	90	58.268	Colobus_angolensis_palliatus
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	56.693	ENSCGRG00001003289	Ptrhd1	60	56.693	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	56.693	ENSCGRG00000011834	Ptrhd1	90	56.693	Cricetulus_griseus_crigri
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	86.614	ENSCSEG00000006943	ptrhd1	100	86.614	Cynoglossus_semilaevis
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	86.508	ENSCVAG00000016345	ptrhd1	100	86.508	Cyprinodon_variegatus
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	78.571	ENSDARG00000016122	ptrhd1	100	78.571	Danio_rerio
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	56.693	ENSDNOG00000043646	PTRHD1	83	56.693	Dasypus_novemcinctus
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	57.480	ENSDORG00000026776	Ptrhd1	91	57.480	Dipodomys_ordii
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	93	61.538	FBgn0038446	CG14903	98	61.538	Drosophila_melanogaster
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	46.825	ENSETEG00000009379	-	93	46.825	Echinops_telfairi
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	55	57.143	ENSETEG00000001615	-	82	57.143	Echinops_telfairi
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	93	61.538	ENSEBUG00000002249	ptrhd1	97	61.538	Eptatretus_burgeri
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	99	44.444	ENSEASG00005001302	-	88	44.444	Equus_asinus_asinus
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	58.268	ENSECAG00000017730	PTRHD1	90	58.268	Equus_caballus
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	99	44.444	ENSECAG00000005314	-	86	44.444	Equus_caballus
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	57.480	ENSEEUG00000004263	PTRHD1	90	57.480	Erinaceus_europaeus
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	81.746	ENSELUG00000003837	ptrhd1	100	81.746	Esox_lucius
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	55.906	ENSFCAG00000003648	PTRHD1	90	55.906	Felis_catus
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	59.843	ENSFDAG00000004017	PTRHD1	90	59.843	Fukomys_damarensis
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	88.095	ENSFHEG00000009135	ptrhd1	100	88.095	Fundulus_heteroclitus
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	91	56.522	ENSGALG00000016610	PTRHD1	93	55.385	Gallus_gallus
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	83.333	ENSGAFG00000005717	ptrhd1	100	83.333	Gambusia_affinis
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	99	87.200	ENSGACG00000006743	ptrhd1	98	87.200	Gasterosteus_aculeatus
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	61.417	ENSGAGG00000023951	PTRHD1	100	61.417	Gopherus_agassizii
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	57.480	ENSGGOG00000043870	PTRHD1	100	57.480	Gorilla_gorilla
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	85.714	ENSHBUG00000014289	ptrhd1	100	85.714	Haplochromis_burtoni
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	62.205	ENSHGLG00000008203	PTRHD1	90	62.205	Heterocephalus_glaber_female
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	61.417	ENSHGLG00100012553	PTRHD1	90	61.417	Heterocephalus_glaber_male
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	61.417	ENSHGLG00100004341	-	92	61.417	Heterocephalus_glaber_male
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	85.827	ENSHCOG00000013504	ptrhd1	100	85.827	Hippocampus_comes
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	93	75.214	ENSIPUG00000004885	ptrhd1	98	75.214	Ictalurus_punctatus
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	58.268	ENSSTOG00000006030	PTRHD1	90	58.268	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	58.268	ENSJJAG00000024180	Ptrhd1	91	58.268	Jaculus_jaculus
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	89	91.964	ENSKMAG00000016961	ptrhd1	99	91.964	Kryptolebias_marmoratus
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	90.476	ENSLBEG00000024406	ptrhd1	100	90.476	Labrus_bergylta
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	91	68.696	ENSLACG00000018052	PTRHD1	100	65.873	Latimeria_chalumnae
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	80.469	ENSLOCG00000015890	ptrhd1	100	80.469	Lepisosteus_oculatus
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	57.480	ENSLAFG00000014453	PTRHD1	90	57.480	Loxodonta_africana
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	57.480	ENSMFAG00000040267	PTRHD1	90	57.480	Macaca_fascicularis
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	57.480	ENSMMUG00000009598	PTRHD1	90	57.480	Macaca_mulatta
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	57.480	ENSMNEG00000035044	PTRHD1	90	57.480	Macaca_nemestrina
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	57.143	ENSMLEG00000030314	PTRHD1	90	57.143	Mandrillus_leucophaeus
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	83.333	ENSMAMG00000021201	ptrhd1	100	83.333	Mastacembelus_armatus
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	86.508	ENSMZEG00005021808	ptrhd1	100	86.508	Maylandia_zebra
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	56.693	ENSMAUG00000019251	Ptrhd1	90	56.693	Mesocricetus_auratus
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	59.055	ENSMICG00000001578	PTRHD1	90	59.055	Microcebus_murinus
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	56.693	ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	90	56.693	Microtus_ochrogaster
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	89.683	ENSMMOG00000015284	ptrhd1	100	89.683	Mola_mola
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	96	57.377	ENSMODG00000015895	PTRHD1	89	57.377	Monodelphis_domestica
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	84.127	ENSMALG00000003471	ptrhd1	100	84.127	Monopterus_albus
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	56.693	MGP_CAROLIEiJ_G0017582	Ptrhd1	90	56.693	Mus_caroli
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	56.693	ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	90	56.693	Mus_musculus
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	56.693	MGP_SPRETEiJ_G0018426	Ptrhd1	90	56.693	Mus_spretus
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	55.906	ENSMPUG00000014016	PTRHD1	90	55.906	Mustela_putorius_furo
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	55.906	ENSMLUG00000014127	PTRHD1	90	55.906	Myotis_lucifugus
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	55.906	ENSNGAG00000016335	Ptrhd1	90	55.906	Nannospalax_galili
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	86.508	ENSNBRG00000009690	ptrhd1	100	86.508	Neolamprologus_brichardi
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	58.268	ENSNLEG00000000990	PTRHD1	90	58.268	Nomascus_leucogenys
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	55	55.714	ENSMEUG00000010482	-	83	55.714	Notamacropus_eugenii
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	57.480	ENSOPRG00000008600	PTRHD1	90	57.480	Ochotona_princeps
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	56.693	ENSODEG00000007805	PTRHD1	87	56.693	Octodon_degus
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	85.714	ENSONIG00000015722	ptrhd1	93	85.714	Oreochromis_niloticus
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	57.480	ENSOCUG00000015432	PTRHD1	90	57.480	Oryctolagus_cuniculus
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	92	78.632	ENSORLG00000028768	ptrhd1	99	78.632	Oryzias_latipes
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	92	78.632	ENSORLG00020002857	ptrhd1	99	78.632	Oryzias_latipes_hni
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	92	78.632	ENSORLG00015018271	ptrhd1	100	78.632	Oryzias_latipes_hsok
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	75.591	ENSOMEG00000017594	ptrhd1	100	75.591	Oryzias_melastigma
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	95	54.545	ENSOGAG00000000756	PTRHD1	86	54.545	Otolemur_garnettii
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	60.630	ENSOARG00000018052	PTRHD1	90	60.630	Ovis_aries
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	58.268	ENSPPAG00000035395	PTRHD1	90	58.268	Pan_paniscus
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	55.906	ENSPPRG00000022961	PTRHD1	90	55.906	Panthera_pardus
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	55.906	ENSPTIG00000012136	PTRHD1	90	55.906	Panthera_tigris_altaica
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	58.268	ENSPTRG00000011716	PTRHD1	90	58.268	Pan_troglodytes
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	59.055	ENSPANG00000006781	PTRHD1	90	59.055	Papio_anubis
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	75.397	ENSPKIG00000015207	ptrhd1	86	75.397	Paramormyrops_kingsleyae
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	92	87.931	ENSPMGG00000020297	ptrhd1	100	85.714	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	89	65.179	ENSPMAG00000007352	ptrhd1	98	65.041	Petromyzon_marinus
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	57.480	ENSPCIG00000025242	PTRHD1	100	57.480	Phascolarctos_cinereus
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	81.746	ENSPFOG00000004468	ptrhd1	89	81.746	Poecilia_formosa
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	81.746	ENSPLAG00000018019	ptrhd1	100	81.746	Poecilia_latipinna
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	82.540	ENSPMEG00000001321	ptrhd1	100	82.540	Poecilia_mexicana
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	82.540	ENSPREG00000017624	ptrhd1	100	82.540	Poecilia_reticulata
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	58.268	ENSPPYG00000012597	PTRHD1	90	58.268	Pongo_abelii
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	57.480	ENSPCAG00000007535	PTRHD1	90	57.480	Procavia_capensis
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	59.055	ENSPCOG00000003110	PTRHD1	90	59.055	Propithecus_coquereli
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	59.055	ENSPVAG00000017514	PTRHD1	90	59.055	Pteropus_vampyrus
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	86.508	ENSPNYG00000016755	ptrhd1	100	86.508	Pundamilia_nyererei
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	77.165	ENSPNAG00000028214	ptrhd1	100	77.165	Pygocentrus_nattereri
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	57.480	ENSRNOG00000004059	Ptrhd1	90	57.480	Rattus_norvegicus
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	58.268	ENSRBIG00000032190	PTRHD1	90	58.268	Rhinopithecus_bieti
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	58.268	ENSRROG00000029627	PTRHD1	90	58.268	Rhinopithecus_roxellana
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	57.480	ENSSBOG00000031751	PTRHD1	90	57.480	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	57.480	ENSSHAG00000005774	PTRHD1	82	57.480	Sarcophilus_harrisii
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	96	74.380	ENSSFOG00015000526	ptrhd1	99	74.380	Scleropages_formosus
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	92	87.931	ENSSMAG00000004450	ptrhd1	100	85.827	Scophthalmus_maximus
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	87.302	ENSSDUG00000004610	ptrhd1	85	87.302	Seriola_dumerili
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	87.302	ENSSLDG00000006231	ptrhd1	100	87.302	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	91	60.345	ENSSPUG00000002905	PTRHD1	95	58.268	Sphenodon_punctatus
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	88.095	ENSSPAG00000000997	ptrhd1	100	88.095	Stegastes_partitus
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	97	47.541	ENSSSCG00000040441	-	92	47.541	Sus_scrofa
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	99	53.968	ENSTGUG00000015169	-	92	53.968	Taeniopygia_guttata
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	89.683	ENSTRUG00000007201	ptrhd1	100	89.683	Takifugu_rubripes
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	56.693	ENSTTRG00000015128	PTRHD1	90	56.693	Tursiops_truncatus
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	55.118	ENSUAMG00000007305	PTRHD1	90	55.118	Ursus_americanus
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	58.268	ENSVPAG00000005556	PTRHD1	91	58.268	Vicugna_pacos
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	88	63.063	ENSXETG00000021176	ptrhd1	87	62.810	Xenopus_tropicalis
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	83.333	ENSXCOG00000019083	ptrhd1	100	83.333	Xiphophorus_couchianus
ENSTNIG00000019143	ptrhd1	100	83.333	ENSXMAG00000024458	ptrhd1	100	83.333	Xiphophorus_maculatus