EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSTRUG00000000396 (Gene tree)
Gene ID: 101070896
Gene Symbol: mtrf1
Alias: zgc:113104
Full Name: mitochondrial translation release factor 1
Gene Type: protein_coding
Species: Takifugu_rubripes
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 5343 bases
Position: chr8:7238109-7243451
Accession: 101070896
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSTRUP00000000929	RF-1	PF00472.20	1.2e-37	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSTRUT00000000932	-	4615	XM_003966608	ENSTRUP00000000929	449 (aa)	XP_003966657	H2RLB6

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSTRUG00000000396	mtrf1	84	43.501	ENSTRUG00000001172	mtrf1l	84	43.501

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSTRUG00000000396	mtrf1	87	55.641	ENSG00000120662	MTRF1	87	55.641	Homo_sapiens
ENSTRUG00000000396	mtrf1	88	75.188	ENSAPOG00000010181	mtrf1	97	75.188	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTRUG00000000396	mtrf1	87	57.289	ENSAMEG00000008696	MTRF1	87	57.289	Ailuropoda_melanoleuca
ENSTRUG00000000396	mtrf1	55	83.534	ENSACIG00000001495	mtrf1	100	83.534	Amphilophus_citrinellus
ENSTRUG00000000396	mtrf1	99	74.501	ENSAOCG00000002832	mtrf1	100	74.501	Amphiprion_ocellaris
ENSTRUG00000000396	mtrf1	99	74.279	ENSAPEG00000014844	mtrf1	100	74.279	Amphiprion_percula
ENSTRUG00000000396	mtrf1	91	72.771	ENSATEG00000017403	mtrf1	99	72.771	Anabas_testudineus
ENSTRUG00000000396	mtrf1	84	55.263	ENSAPLG00000009317	MTRF1	87	56.201	Anas_platyrhynchos
ENSTRUG00000000396	mtrf1	85	55.643	ENSACAG00000000897	MTRF1	86	55.643	Anolis_carolinensis
ENSTRUG00000000396	mtrf1	91	51.932	ENSANAG00000025310	-	94	58.017	Aotus_nancymaae
ENSTRUG00000000396	mtrf1	90	52.346	ENSANAG00000023063	-	89	52.346	Aotus_nancymaae
ENSTRUG00000000396	mtrf1	99	73.942	ENSACLG00000023945	mtrf1	100	73.942	Astatotilapia_calliptera
ENSTRUG00000000396	mtrf1	54	73.444	ENSAMXG00000031859	mtrf1	100	73.444	Astyanax_mexicanus
ENSTRUG00000000396	mtrf1	89	56.079	ENSBTAG00000012260	MTRF1	89	56.079	Bos_taurus
ENSTRUG00000000396	mtrf1	86	56.923	ENSCJAG00000017739	MTRF1	100	64.943	Callithrix_jacchus
ENSTRUG00000000396	mtrf1	84	57.979	ENSCAFG00000004795	MTRF1	84	57.979	Canis_familiaris
ENSTRUG00000000396	mtrf1	84	57.979	ENSCAFG00020018178	MTRF1	84	57.979	Canis_lupus_dingo
ENSTRUG00000000396	mtrf1	84	57.368	ENSCHIG00000011810	MTRF1	85	57.368	Capra_hircus
ENSTRUG00000000396	mtrf1	86	57.179	ENSTSYG00000006976	MTRF1	87	57.179	Carlito_syrichta
ENSTRUG00000000396	mtrf1	86	56.995	ENSCAPG00000013163	MTRF1	89	56.995	Cavia_aperea
ENSTRUG00000000396	mtrf1	86	56.736	ENSCPOG00000005264	MTRF1	86	56.736	Cavia_porcellus
ENSTRUG00000000396	mtrf1	90	55.941	ENSCCAG00000035116	MTRF1	90	55.941	Cebus_capucinus
ENSTRUG00000000396	mtrf1	93	53.589	ENSCATG00000009909	MTRF1	93	53.589	Cercocebus_atys
ENSTRUG00000000396	mtrf1	86	56.410	ENSCLAG00000000582	MTRF1	87	56.410	Chinchilla_lanigera
ENSTRUG00000000396	mtrf1	93	53.349	ENSCSAG00000017835	MTRF1	93	53.349	Chlorocebus_sabaeus
ENSTRUG00000000396	mtrf1	78	53.977	ENSCHOG00000011915	-	86	53.977	Choloepus_hoffmanni
ENSTRUG00000000396	mtrf1	86	56.298	ENSCPBG00000007969	MTRF1	86	56.923	Chrysemys_picta_bellii
ENSTRUG00000000396	mtrf1	87	55.128	ENSCANG00000040353	MTRF1	87	55.128	Colobus_angolensis_palliatus
ENSTRUG00000000396	mtrf1	86	56.883	ENSCGRG00001003065	Mtrf1	86	56.883	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSTRUG00000000396	mtrf1	86	56.883	ENSCGRG00000002570	Mtrf1	86	56.883	Cricetulus_griseus_crigri
ENSTRUG00000000396	mtrf1	96	67.898	ENSCSEG00000005667	mtrf1	96	67.898	Cynoglossus_semilaevis
ENSTRUG00000000396	mtrf1	99	67.191	ENSCVAG00000021729	mtrf1	100	67.191	Cyprinodon_variegatus
ENSTRUG00000000396	mtrf1	52	63.248	ENSDARG00000033579	mtrf1	99	63.248	Danio_rerio
ENSTRUG00000000396	mtrf1	86	55.612	ENSDNOG00000034196	MTRF1	99	62.136	Dasypus_novemcinctus
ENSTRUG00000000396	mtrf1	84	56.201	ENSDORG00000016429	Mtrf1	85	56.201	Dipodomys_ordii
ENSTRUG00000000396	mtrf1	87	55.867	ENSETEG00000014811	MTRF1	87	55.867	Echinops_telfairi
ENSTRUG00000000396	mtrf1	53	52.941	ENSEBUG00000000778	mtrf1	98	52.941	Eptatretus_burgeri
ENSTRUG00000000396	mtrf1	86	57.179	ENSEASG00005015715	MTRF1	87	57.179	Equus_asinus_asinus
ENSTRUG00000000396	mtrf1	86	56.923	ENSECAG00000014389	MTRF1	84	56.923	Equus_caballus
ENSTRUG00000000396	mtrf1	89	44.198	ENSEEUG00000004450	-	90	44.198	Erinaceus_europaeus
ENSTRUG00000000396	mtrf1	98	63.039	ENSELUG00000006544	mtrf1	98	63.039	Esox_lucius
ENSTRUG00000000396	mtrf1	87	57.545	ENSFCAG00000031635	MTRF1	87	57.545	Felis_catus
ENSTRUG00000000396	mtrf1	86	55.784	ENSFALG00000008036	MTRF1	96	55.784	Ficedula_albicollis
ENSTRUG00000000396	mtrf1	86	56.667	ENSFDAG00000017881	MTRF1	87	56.667	Fukomys_damarensis
ENSTRUG00000000396	mtrf1	97	69.195	ENSFHEG00000019043	mtrf1	99	69.195	Fundulus_heteroclitus
ENSTRUG00000000396	mtrf1	84	64.286	ENSGMOG00000008608	mtrf1	99	64.286	Gadus_morhua
ENSTRUG00000000396	mtrf1	84	56.316	ENSGALG00000016951	MTRF1	83	57.256	Gallus_gallus
ENSTRUG00000000396	mtrf1	99	71.749	ENSGAFG00000007093	mtrf1	100	71.749	Gambusia_affinis
ENSTRUG00000000396	mtrf1	84	78.249	ENSGACG00000013728	mtrf1	98	78.249	Gasterosteus_aculeatus
ENSTRUG00000000396	mtrf1	70	58.991	ENSGAGG00000025696	MTRF1	99	59.748	Gopherus_agassizii
ENSTRUG00000000396	mtrf1	87	55.385	ENSGGOG00000002529	MTRF1	87	55.385	Gorilla_gorilla
ENSTRUG00000000396	mtrf1	86	56.154	ENSHGLG00000003210	MTRF1	87	56.154	Heterocephalus_glaber_female
ENSTRUG00000000396	mtrf1	86	56.154	ENSHGLG00100011843	MTRF1	87	56.154	Heterocephalus_glaber_male
ENSTRUG00000000396	mtrf1	97	65.991	ENSHCOG00000009449	mtrf1	99	65.991	Hippocampus_comes
ENSTRUG00000000396	mtrf1	86	56.923	ENSSTOG00000021682	MTRF1	87	56.923	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSTRUG00000000396	mtrf1	84	58.245	ENSJJAG00000017590	Mtrf1	84	58.245	Jaculus_jaculus
ENSTRUG00000000396	mtrf1	99	70.667	ENSKMAG00000003231	mtrf1	99	70.667	Kryptolebias_marmoratus
ENSTRUG00000000396	mtrf1	53	84.426	ENSLBEG00000027169	-	98	84.426	Labrus_bergylta
ENSTRUG00000000396	mtrf1	53	84.426	ENSLBEG00000023151	mtrf1	98	84.426	Labrus_bergylta
ENSTRUG00000000396	mtrf1	90	55.556	ENSLACG00000010582	MTRF1	95	53.521	Latimeria_chalumnae
ENSTRUG00000000396	mtrf1	87	60.411	ENSLOCG00000005937	MTRF1	87	60.411	Lepisosteus_oculatus
ENSTRUG00000000396	mtrf1	84	57.368	ENSLAFG00000022177	-	85	57.368	Loxodonta_africana
ENSTRUG00000000396	mtrf1	85	42.895	ENSLAFG00000030499	-	83	42.895	Loxodonta_africana
ENSTRUG00000000396	mtrf1	93	53.589	ENSMFAG00000037972	MTRF1	93	53.589	Macaca_fascicularis
ENSTRUG00000000396	mtrf1	93	53.589	ENSMNEG00000035487	MTRF1	93	53.589	Macaca_nemestrina
ENSTRUG00000000396	mtrf1	93	53.589	ENSMLEG00000033582	MTRF1	93	53.589	Mandrillus_leucophaeus
ENSTRUG00000000396	mtrf1	97	72.811	ENSMAMG00000022048	mtrf1	97	72.811	Mastacembelus_armatus
ENSTRUG00000000396	mtrf1	99	73.942	ENSMZEG00005017922	mtrf1	100	73.942	Maylandia_zebra
ENSTRUG00000000396	mtrf1	86	55.297	ENSMGAG00000014971	MTRF1	92	56.072	Meleagris_gallopavo
ENSTRUG00000000396	mtrf1	86	56.883	ENSMAUG00000011661	Mtrf1	86	56.883	Mesocricetus_auratus
ENSTRUG00000000396	mtrf1	86	57.179	ENSMICG00000033131	MTRF1	87	57.179	Microcebus_murinus
ENSTRUG00000000396	mtrf1	91	55.147	ENSMOCG00000011945	Mtrf1	90	55.147	Microtus_ochrogaster
ENSTRUG00000000396	mtrf1	54	70.370	ENSMMOG00000013394	mtrf1	99	70.370	Mola_mola
ENSTRUG00000000396	mtrf1	85	55.469	ENSMODG00000014772	MTRF1	86	55.469	Monodelphis_domestica
ENSTRUG00000000396	mtrf1	98	73.349	ENSMALG00000013274	mtrf1	100	73.349	Monopterus_albus
ENSTRUG00000000396	mtrf1	83	57.867	MGP_CAROLIEiJ_G0019539	Mtrf1	83	57.867	Mus_caroli
ENSTRUG00000000396	mtrf1	85	57.702	ENSMUSG00000022022	Mtrf1	85	57.702	Mus_musculus
ENSTRUG00000000396	mtrf1	85	56.919	MGP_PahariEiJ_G0030557	Mtrf1	85	56.919	Mus_pahari
ENSTRUG00000000396	mtrf1	84	57.672	MGP_SPRETEiJ_G0020435	Mtrf1	84	57.672	Mus_spretus
ENSTRUG00000000396	mtrf1	87	57.436	ENSMPUG00000001874	MTRF1	87	57.436	Mustela_putorius_furo
ENSTRUG00000000396	mtrf1	86	56.736	ENSMLUG00000017237	MTRF1	86	56.736	Myotis_lucifugus
ENSTRUG00000000396	mtrf1	86	57.436	ENSNGAG00000014460	Mtrf1	87	57.436	Nannospalax_galili
ENSTRUG00000000396	mtrf1	52	84.615	ENSNBRG00000004634	mtrf1	99	84.615	Neolamprologus_brichardi
ENSTRUG00000000396	mtrf1	90	54.591	ENSNLEG00000001236	MTRF1	89	54.591	Nomascus_leucogenys
ENSTRUG00000000396	mtrf1	85	53.158	ENSMEUG00000001846	MTRF1	85	53.158	Notamacropus_eugenii
ENSTRUG00000000396	mtrf1	63	33.451	ENSOPRG00000006450	-	85	33.451	Ochotona_princeps
ENSTRUG00000000396	mtrf1	86	56.154	ENSODEG00000005782	MTRF1	87	56.154	Octodon_degus
ENSTRUG00000000396	mtrf1	86	78.182	ENSONIG00000012476	mtrf1	99	78.182	Oreochromis_niloticus
ENSTRUG00000000396	mtrf1	67	58.416	ENSOANG00000003383	-	96	58.416	Ornithorhynchus_anatinus
ENSTRUG00000000396	mtrf1	86	56.667	ENSOCUG00000025207	MTRF1	87	56.667	Oryctolagus_cuniculus
ENSTRUG00000000396	mtrf1	99	67.188	ENSORLG00000003225	mtrf1	100	67.188	Oryzias_latipes
ENSTRUG00000000396	mtrf1	99	67.333	ENSORLG00020021048	mtrf1	100	67.333	Oryzias_latipes_hni
ENSTRUG00000000396	mtrf1	99	67.038	ENSORLG00015020957	mtrf1	100	67.038	Oryzias_latipes_hsok
ENSTRUG00000000396	mtrf1	99	67.785	ENSOMEG00000002022	mtrf1	100	67.785	Oryzias_melastigma
ENSTRUG00000000396	mtrf1	86	54.872	ENSOGAG00000009719	-	87	54.872	Otolemur_garnettii
ENSTRUG00000000396	mtrf1	72	51.703	ENSOGAG00000026411	-	98	51.703	Otolemur_garnettii
ENSTRUG00000000396	mtrf1	84	57.368	ENSOARG00000006994	MTRF1	85	57.368	Ovis_aries
ENSTRUG00000000396	mtrf1	87	55.641	ENSPPAG00000000050	MTRF1	87	55.641	Pan_paniscus
ENSTRUG00000000396	mtrf1	87	58.056	ENSPPRG00000009511	MTRF1	87	58.056	Panthera_pardus
ENSTRUG00000000396	mtrf1	87	57.545	ENSPTIG00000006673	MTRF1	87	57.545	Panthera_tigris_altaica
ENSTRUG00000000396	mtrf1	87	55.641	ENSPTRG00000005815	MTRF1	87	55.641	Pan_troglodytes
ENSTRUG00000000396	mtrf1	93	53.589	ENSPANG00000010809	MTRF1	93	53.589	Papio_anubis
ENSTRUG00000000396	mtrf1	95	54.801	ENSPKIG00000015711	mtrf1	98	54.801	Paramormyrops_kingsleyae
ENSTRUG00000000396	mtrf1	86	54.756	ENSPSIG00000004773	MTRF1	86	55.670	Pelodiscus_sinensis
ENSTRUG00000000396	mtrf1	55	80.408	ENSPMGG00000006724	mtrf1	99	80.408	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSTRUG00000000396	mtrf1	86	57.513	ENSPEMG00000020982	Mtrf1	86	57.513	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSTRUG00000000396	mtrf1	68	53.994	ENSPMAG00000009849	mtrf1	89	54.313	Petromyzon_marinus
ENSTRUG00000000396	mtrf1	85	56.510	ENSPCIG00000012940	MTRF1	86	56.510	Phascolarctos_cinereus
ENSTRUG00000000396	mtrf1	99	69.731	ENSPFOG00000000254	mtrf1	100	69.731	Poecilia_formosa
ENSTRUG00000000396	mtrf1	99	69.955	ENSPLAG00000014280	mtrf1	100	69.955	Poecilia_latipinna
ENSTRUG00000000396	mtrf1	96	70.208	ENSPMEG00000023245	mtrf1	98	70.208	Poecilia_mexicana
ENSTRUG00000000396	mtrf1	52	73.820	ENSPREG00000018619	mtrf1	96	73.820	Poecilia_reticulata
ENSTRUG00000000396	mtrf1	87	54.615	ENSPPYG00000005313	MTRF1	87	54.615	Pongo_abelii
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ENSTRUG00000000396	mtrf1	99	69.283	ENSXMAG00000009853	mtrf1	100	69.283	Xiphophorus_maculatus