EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSTRUG00000000966 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: skiv2l
Alias: fb70b07|wu:fb70b07
Full Name: SKI2 homolog%2C superkiller viralicidic activity 2-like
Gene Type: protein_coding
Species: Takifugu_rubripes
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 13308 bases
Position: chrHE591875.1:55681-68988
Accession: ZDB-GENE-010430-5
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSTRUP00000002286	rRNA_proc-arch	PF13234.6	8.9e-12	1	1
ENSTRUP00000002286	DEAD	PF00270.29	7.7e-15	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSTRUT00000002296	-	2997	-	ENSTRUP00000002286	998 (aa)	-	H2RQ71

Gene Model

Click here to download ENSTRUG00000000966's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSTRUG00000000966's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSTRUG00000000966	skiv2l	75	40.684	ENSTRUG00000014571	mtrex	65	45.399

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	55.138	ENSG00000204351	SKIV2L	85	54.346	Homo_sapiens
ENSTRUG00000000966	skiv2l	84	85.027	ENSAPOG00000008257	skiv2l	70	85.027	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	54.478	ENSAMEG00000002078	SKIV2L	74	61.886	Ailuropoda_melanoleuca
ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	68.762	ENSACIG00000016719	skiv2l	71	87.166	Amphilophus_citrinellus
ENSTRUG00000000966	skiv2l	84	85.561	ENSAOCG00000017352	skiv2l	70	85.561	Amphiprion_ocellaris
ENSTRUG00000000966	skiv2l	84	85.561	ENSAPEG00000001055	skiv2l	70	85.561	Amphiprion_percula
ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	69.700	ENSATEG00000007601	skiv2l	73	86.096	Anabas_testudineus
ENSTRUG00000000966	skiv2l	93	58.308	ENSACAG00000011746	SKIV2L	74	61.830	Anolis_carolinensis
ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	55.874	ENSANAG00000037992	SKIV2L	88	57.101	Aotus_nancymaae
ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	70.583	ENSACLG00000006886	skiv2l	68	92.045	Astatotilapia_calliptera
ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	65.794	ENSAMXG00000011517	skiv2l	69	83.422	Astyanax_mexicanus
ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	55.773	ENSBTAG00000005587	SKIV2L	85	54.886	Bos_taurus
ENSTRUG00000000966	skiv2l	80	52.733	WBGene00008502	skih-2	60	56.881	Caenorhabditis_elegans
ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	55.042	ENSCJAG00000002263	SKIV2L	73	63.939	Callithrix_jacchus
ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	55.504	ENSCAFG00000000679	SKIV2L	74	61.651	Canis_familiaris
ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	55.504	ENSCAFG00020000948	SKIV2L	74	61.651	Canis_lupus_dingo
ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	55.214	ENSCHIG00000012897	SKIV2L	85	54.695	Capra_hircus
ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	55.251	ENSTSYG00000012133	SKIV2L	74	62.534	Carlito_syrichta
ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	55.773	ENSCPOG00000001307	SKIV2L	85	55.525	Cavia_porcellus
ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	55.689	ENSCCAG00000026206	SKIV2L	80	62.534	Cebus_capucinus
ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	56.152	ENSCATG00000036901	SKIV2L	93	53.512	Cercocebus_atys
ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	55.268	ENSCLAG00000007678	SKIV2L	85	54.982	Chinchilla_lanigera
ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	55.771	ENSCSAG00000008988	SKIV2L	85	55.505	Chlorocebus_sabaeus
ENSTRUG00000000966	skiv2l	75	71.084	ENSCPBG00000000343	SKIV2L	71	68.801	Chrysemys_picta_bellii
ENSTRUG00000000966	skiv2l	76	60.988	ENSCING00000005576	-	66	60.988	Ciona_intestinalis
ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	56.152	ENSCANG00000039709	SKIV2L	93	55.967	Colobus_angolensis_palliatus
ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	55.885	ENSCGRG00001008385	Skiv2l	85	55.720	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSTRUG00000000966	skiv2l	84	90.909	ENSCSEG00000011326	skiv2l	70	90.909	Cynoglossus_semilaevis
ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	70.075	ENSCVAG00000003072	skiv2l	70	86.631	Cyprinodon_variegatus
ENSTRUG00000000966	skiv2l	83	85.561	ENSDARG00000062206	skiv2l	70	85.561	Danio_rerio
ENSTRUG00000000966	skiv2l	74	68.333	ENSDNOG00000037590	SKIV2L	63	68.333	Dasypus_novemcinctus
ENSTRUG00000000966	skiv2l	75	55.000	FBgn0039117	tst	72	50.000	Drosophila_melanogaster
ENSTRUG00000000966	skiv2l	82	82.432	ENSETEG00000009522	SKIV2L	68	82.432	Echinops_telfairi
ENSTRUG00000000966	skiv2l	71	69.355	ENSEBUG00000013680	-	64	69.355	Eptatretus_burgeri
ENSTRUG00000000966	skiv2l	93	58.818	ENSEASG00005015534	SKIV2L	92	55.166	Equus_asinus_asinus
ENSTRUG00000000966	skiv2l	86	58.907	ENSECAG00000021823	SKIV2L	81	55.010	Equus_caballus
ENSTRUG00000000966	skiv2l	61	72.157	ENSEEUG00000005049	SKIV2L	56	72.157	Erinaceus_europaeus
ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	67.195	ENSELUG00000000181	skiv2l	73	84.492	Esox_lucius
ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	55.309	ENSFCAG00000004519	SKIV2L	71	64.781	Felis_catus
ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	70.225	ENSFHEG00000008853	skiv2l	73	86.631	Fundulus_heteroclitus
ENSTRUG00000000966	skiv2l	99	66.540	ENSGMOG00000005926	skiv2l	84	65.842	Gadus_morhua
ENSTRUG00000000966	skiv2l	75	61.313	ENSGALG00000035499	SKIV2L	82	58.452	Gallus_gallus
ENSTRUG00000000966	skiv2l	84	86.096	ENSGAFG00000002382	skiv2l	70	86.096	Gambusia_affinis
ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	68.956	ENSGACG00000002927	skiv2l	69	85.027	Gasterosteus_aculeatus
ENSTRUG00000000966	skiv2l	56	69.858	ENSGAGG00000015556	SKIV2L	76	69.858	Gopherus_agassizii
ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	54.857	ENSGGOG00000002270	SKIV2L	76	66.276	Gorilla_gorilla
ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	70.489	ENSHBUG00000000726	skiv2l	73	86.631	Haplochromis_burtoni
ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	55.442	ENSHGLG00000016596	SKIV2L	75	64.978	Heterocephalus_glaber_female
ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	55.690	ENSHGLG00100014161	SKIV2L	74	64.978	Heterocephalus_glaber_male
ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	70.805	ENSHCOG00000007191	skiv2l	75	81.297	Hippocampus_comes
ENSTRUG00000000966	skiv2l	88	83.957	ENSIPUG00000016263	skiv2l	70	83.957	Ictalurus_punctatus
ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	56.052	ENSSTOG00000014596	SKIV2L	70	65.945	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	55.515	ENSLAFG00000014231	SKIV2L	85	55.119	Loxodonta_africana
ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	56.152	ENSMFAG00000034235	SKIV2L	93	55.967	Macaca_fascicularis
ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	56.059	ENSMMUG00000000736	SKIV2L	93	55.874	Macaca_mulatta
ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	56.059	ENSMNEG00000044474	SKIV2L	93	55.596	Macaca_nemestrina
ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	56.059	ENSMLEG00000030512	SKIV2L	93	53.882	Mandrillus_leucophaeus
ENSTRUG00000000966	skiv2l	83	92.045	ENSMAMG00000002927	skiv2l	69	92.045	Mastacembelus_armatus
ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	70.583	ENSMZEG00005026415	skiv2l	68	92.045	Maylandia_zebra
ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	55.825	ENSMAUG00000018613	Skiv2l	85	55.217	Mesocricetus_auratus
ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	56.704	ENSMICG00000046331	SKIV2L	85	56.077	Microcebus_murinus
ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	54.655	ENSMOCG00000014240	Skiv2l	85	54.764	Microtus_ochrogaster
ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	73.126	ENSMMOG00000014547	skiv2l	69	92.045	Mola_mola
ENSTRUG00000000966	skiv2l	93	59.244	ENSMODG00000015052	SKIV2L	85	55.201	Monodelphis_domestica
ENSTRUG00000000966	skiv2l	88	90.909	ENSMALG00000010535	skiv2l	71	90.909	Monopterus_albus
ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	55.784	MGP_CAROLIEiJ_G0021477	Skiv2l	69	66.274	Mus_caroli
ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	55.288	ENSMUSG00000040356	Skiv2l	69	66.274	Mus_musculus
ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	56.157	MGP_PahariEiJ_G0020472	Skiv2l	69	66.863	Mus_pahari
ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	55.288	MGP_SPRETEiJ_G0022382	Skiv2l	69	66.127	Mus_spretus
ENSTRUG00000000966	skiv2l	81	68.470	ENSMPUG00000010567	SKIV2L	74	61.772	Mustela_putorius_furo
ENSTRUG00000000966	skiv2l	83	65.836	ENSMLUG00000000628	SKIV2L	70	65.836	Myotis_lucifugus
ENSTRUG00000000966	skiv2l	88	91.477	ENSNBRG00000018650	skiv2l	73	91.477	Neolamprologus_brichardi
ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	55.985	ENSNLEG00000006451	SKIV2L	93	56.121	Nomascus_leucogenys
ENSTRUG00000000966	skiv2l	68	67.539	ENSMEUG00000006072	SKIV2L	63	61.947	Notamacropus_eugenii
ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	55.659	ENSOPRG00000003972	SKIV2L	85	55.288	Ochotona_princeps
ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	55.009	ENSODEG00000017516	SKIV2L	71	64.823	Octodon_degus
ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	69.981	ENSONIG00000013500	skiv2l	73	86.096	Oreochromis_niloticus
ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	56.122	ENSOCUG00000007019	SKIV2L	71	65.532	Oryctolagus_cuniculus
ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	68.879	ENSORLG00000002021	skiv2l	73	83.957	Oryzias_latipes
ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	68.972	ENSORLG00020009462	skiv2l	73	83.957	Oryzias_latipes_hni
ENSTRUG00000000966	skiv2l	88	83.957	ENSORLG00015016750	skiv2l	73	83.957	Oryzias_latipes_hsok
ENSTRUG00000000966	skiv2l	83	86.631	ENSOMEG00000008531	skiv2l	70	86.631	Oryzias_melastigma
ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	56.037	ENSOGAG00000009578	SKIV2L	85	55.424	Otolemur_garnettii
ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	53.278	ENSOARG00000002411	-	76	59.818	Ovis_aries
ENSTRUG00000000966	skiv2l	88	62.534	ENSPPAG00000040211	SKIV2L	77	64.965	Pan_paniscus
ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	54.848	ENSPPRG00000005017	SKIV2L	74	62.634	Panthera_pardus
ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	55.217	ENSPTIG00000021656	SKIV2L	74	62.231	Panthera_tigris_altaica
ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	55.874	ENSPTRG00000017997	SKIV2L	93	55.432	Pan_troglodytes
ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	55.710	ENSPANG00000011501	SKIV2L	93	53.482	Papio_anubis
ENSTRUG00000000966	skiv2l	99	66.506	ENSPKIG00000011876	skiv2l	87	65.226	Paramormyrops_kingsleyae
ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	70.781	ENSPMGG00000019707	skiv2l	69	88.235	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	55.792	ENSPEMG00000019001	Skiv2l	85	55.535	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	56.192	ENSPCIG00000018792	SKIV2L	85	55.414	Phascolarctos_cinereus
ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	69.101	ENSPFOG00000002424	skiv2l	70	86.096	Poecilia_formosa
ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	68.633	ENSPLAG00000018304	skiv2l	70	86.096	Poecilia_latipinna
ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	69.007	ENSPMEG00000006997	skiv2l	70	86.096	Poecilia_mexicana
ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	70.320	ENSPREG00000002277	skiv2l	69	89.831	Poecilia_reticulata
ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	55.689	ENSPPYG00000016472	SKIV2L	85	54.889	Pongo_abelii
ENSTRUG00000000966	skiv2l	84	67.327	ENSPCAG00000004178	SKIV2L	54	67.513	Procavia_capensis
ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	56.797	ENSPCOG00000010308	SKIV2L	85	55.535	Propithecus_coquereli
ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	55.874	ENSPVAG00000005136	SKIV2L	71	65.532	Pteropus_vampyrus
ENSTRUG00000000966	skiv2l	87	86.441	ENSPNYG00000017853	skiv2l	71	86.441	Pundamilia_nyererei
ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	67.724	ENSPNAG00000011823	skiv2l	73	84.492	Pygocentrus_nattereri
ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	55.131	ENSRNOG00000000421	Skiv2l	69	66.421	Rattus_norvegicus
ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	55.198	ENSRBIG00000035485	SKIV2L	93	55.014	Rhinopithecus_bieti
ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	56.429	ENSRROG00000036429	SKIV2L	93	55.382	Rhinopithecus_roxellana
ENSTRUG00000000966	skiv2l	75	48.499	YLR398C	-	63	48.499	Saccharomyces_cerevisiae
ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	55.138	ENSSBOG00000027920	SKIV2L	75	62.389	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	56.175	ENSSHAG00000008963	SKIV2L	85	53.621	Sarcophilus_harrisii
ENSTRUG00000000966	skiv2l	83	82.353	ENSSFOG00015016930	skiv2l	70	82.353	Scleropages_formosus
ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	69.711	ENSSMAG00000020185	skiv2l	71	85.561	Scophthalmus_maximus
ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	72.515	ENSSDUG00000019977	skiv2l	69	90.909	Seriola_dumerili
ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	73.031	ENSSLDG00000024382	skiv2l	71	90.909	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSTRUG00000000966	skiv2l	77	74.497	ENSSPUG00000012945	SKIV2L	72	65.309	Sphenodon_punctatus
ENSTRUG00000000966	skiv2l	93	68.731	ENSSPAG00000012904	skiv2l	68	80.842	Stegastes_partitus
ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	55.668	ENSSSCG00000001424	SKIV2L	89	55.801	Sus_scrofa
ENSTRUG00000000966	skiv2l	99	71.509	ENSTNIG00000004382	skiv2l	73	85.027	Tetraodon_nigroviridis
ENSTRUG00000000966	skiv2l	92	53.641	ENSTBEG00000003462	SKIV2L	79	53.446	Tupaia_belangeri
ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	50.971	ENSTTRG00000005931	SKIV2L	85	50.503	Tursiops_truncatus
ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	54.764	ENSUAMG00000024336	SKIV2L	74	61.886	Ursus_americanus
ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	55.134	ENSUMAG00000012666	SKIV2L	92	54.155	Ursus_maritimus
ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	55.319	ENSVVUG00000022807	SKIV2L	80	60.676	Vulpes_vulpes
ENSTRUG00000000966	skiv2l	76	68.889	ENSXETG00000010932	skiv2l	69	62.427	Xenopus_tropicalis
ENSTRUG00000000966	skiv2l	83	85.561	ENSXCOG00000019517	skiv2l	68	85.561	Xiphophorus_couchianus
ENSTRUG00000000966	skiv2l	83	86.096	ENSXMAG00000014079	skiv2l	69	86.096	Xiphophorus_maculatus