EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSTRUG00000001499 (Gene tree)
Gene ID: 101075504
Gene Symbol: syf2
Alias: hm:zeh0031|zeh0031|zgc:113871|zgc:92835
Full Name: SYF2 pre-mRNA splicing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Takifugu_rubripes
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 61901 bases
Position: chr2:9777071-9838971
Accession: 101075504
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSTRUP00000003451	SYF2	PF08231.12	3.7e-53	1	1
ENSTRUP00000003452	SYF2	PF08231.12	4.2e-53	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSTRUT00000003471	-	804	XM_003962411	ENSTRUP00000003452	264 (aa)	XP_003962460	H2RTI5
ENSTRUT00000003470	-	772	XM_011615687	ENSTRUP00000003451	249 (aa)	XP_011613989	H2RTI4

Gene Model

Click here to download ENSTRUG00000001499's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
tru03040	Spliceosome	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSTRUG00000001499's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSTRUG00000001499	syf2	86	81.860	ENSG00000117614	SYF2	100	74.486	Homo_sapiens
ENSTRUG00000001499	syf2	90	88.789	ENSAPOG00000001174	syf2	100	85.833	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTRUG00000001499	syf2	78	80.000	ENSAMEG00000010134	-	100	80.000	Ailuropoda_melanoleuca
ENSTRUG00000001499	syf2	90	79.821	ENSAMEG00000010115	-	99	73.967	Ailuropoda_melanoleuca
ENSTRUG00000001499	syf2	90	89.333	ENSACIG00000023688	syf2	90	89.333	Amphilophus_citrinellus
ENSTRUG00000001499	syf2	96	84.937	ENSAOCG00000022046	syf2	98	87.013	Amphiprion_ocellaris
ENSTRUG00000001499	syf2	88	84.091	ENSAOCG00000010912	syf2	69	84.753	Amphiprion_ocellaris
ENSTRUG00000001499	syf2	96	84.937	ENSAPEG00000018858	syf2	92	85.833	Amphiprion_percula
ENSTRUG00000001499	syf2	87	89.401	ENSATEG00000007745	syf2	100	85.833	Anabas_testudineus
ENSTRUG00000001499	syf2	80	81.500	ENSAPLG00000016435	SYF2	99	81.500	Anas_platyrhynchos
ENSTRUG00000001499	syf2	67	69.461	ENSACAG00000026777	-	100	69.461	Anolis_carolinensis
ENSTRUG00000001499	syf2	82	81.373	ENSACAG00000013653	-	100	81.373	Anolis_carolinensis
ENSTRUG00000001499	syf2	86	82.326	ENSANAG00000032473	SYF2	100	75.720	Aotus_nancymaae
ENSTRUG00000001499	syf2	90	88.789	ENSACLG00000019916	syf2	100	85.833	Astatotilapia_calliptera
ENSTRUG00000001499	syf2	95	81.435	ENSAMXG00000004051	syf2	100	81.250	Astyanax_mexicanus
ENSTRUG00000001499	syf2	89	80.631	ENSBTAG00000001651	SYF2	94	80.631	Bos_taurus
ENSTRUG00000001499	syf2	84	52.133	WBGene00019402	syf-2	100	47.325	Caenorhabditis_elegans
ENSTRUG00000001499	syf2	86	82.326	ENSCJAG00000046570	SYF2	100	74.897	Callithrix_jacchus
ENSTRUG00000001499	syf2	84	77.033	ENSCAFG00000030331	-	92	77.033	Canis_familiaris
ENSTRUG00000001499	syf2	86	80.930	ENSCAFG00000012895	-	90	79.821	Canis_familiaris
ENSTRUG00000001499	syf2	86	80.930	ENSCAFG00020021091	-	90	79.821	Canis_lupus_dingo
ENSTRUG00000001499	syf2	75	71.658	ENSCAFG00020021094	-	97	71.658	Canis_lupus_dingo
ENSTRUG00000001499	syf2	89	80.180	ENSCHIG00000020874	SYF2	100	74.897	Capra_hircus
ENSTRUG00000001499	syf2	95	75.417	ENSTSYG00000005114	SYF2	100	75.309	Carlito_syrichta
ENSTRUG00000001499	syf2	80	80.303	ENSCAPG00000010006	SYF2	100	80.303	Cavia_aperea
ENSTRUG00000001499	syf2	95	75.934	ENSCPOG00000005326	SYF2	100	75.820	Cavia_porcellus
ENSTRUG00000001499	syf2	86	82.326	ENSCCAG00000022459	SYF2	100	75.720	Cebus_capucinus
ENSTRUG00000001499	syf2	92	77.253	ENSCATG00000026917	SYF2	100	73.663	Cercocebus_atys
ENSTRUG00000001499	syf2	95	77.083	ENSCLAG00000008474	SYF2	100	76.639	Chinchilla_lanigera
ENSTRUG00000001499	syf2	88	80.275	ENSCSAG00000000948	SYF2	90	80.275	Chlorocebus_sabaeus
ENSTRUG00000001499	syf2	63	66.667	ENSCHOG00000005273	-	96	61.850	Choloepus_hoffmanni
ENSTRUG00000001499	syf2	89	81.982	ENSCPBG00000025073	SYF2	96	79.325	Chrysemys_picta_bellii
ENSTRUG00000001499	syf2	85	55.869	ENSCING00000003017	-	89	56.338	Ciona_intestinalis
ENSTRUG00000001499	syf2	85	51.174	ENSCSAVG00000006627	-	97	51.174	Ciona_savignyi
ENSTRUG00000001499	syf2	92	67.811	ENSCANG00000037322	SYF2	100	64.609	Colobus_angolensis_palliatus
ENSTRUG00000001499	syf2	95	76.569	ENSCGRG00001020733	Syf2	100	76.446	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSTRUG00000001499	syf2	79	81.633	ENSCGRG00000005095	Syf2	96	81.818	Cricetulus_griseus_crigri
ENSTRUG00000001499	syf2	88	86.697	ENSCSEG00000000117	syf2	100	80.488	Cynoglossus_semilaevis
ENSTRUG00000001499	syf2	90	87.892	ENSCVAG00000019543	syf2	100	85.000	Cyprinodon_variegatus
ENSTRUG00000001499	syf2	91	83.186	ENSDARG00000004706	syf2	100	80.833	Danio_rerio
ENSTRUG00000001499	syf2	89	81.081	ENSDNOG00000047605	SYF2	91	81.081	Dasypus_novemcinctus
ENSTRUG00000001499	syf2	89	80.631	ENSDORG00000001274	Syf2	100	75.410	Dipodomys_ordii
ENSTRUG00000001499	syf2	90	55.263	FBgn0033556	CG12343	99	55.263	Drosophila_melanogaster
ENSTRUG00000001499	syf2	83	67.633	ENSETEG00000015729	SYF2	90	67.633	Echinops_telfairi
ENSTRUG00000001499	syf2	79	59.391	ENSEBUG00000015402	syf2	95	59.391	Eptatretus_burgeri
ENSTRUG00000001499	syf2	88	81.651	ENSEASG00005004224	-	100	75.510	Equus_asinus_asinus
ENSTRUG00000001499	syf2	91	70.306	ENSEASG00005004232	-	100	67.490	Equus_asinus_asinus
ENSTRUG00000001499	syf2	91	78.603	ENSECAG00000010440	-	96	78.603	Equus_caballus
ENSTRUG00000001499	syf2	91	79.039	ENSECAG00000012023	-	100	74.694	Equus_caballus
ENSTRUG00000001499	syf2	71	63.687	ENSEEUG00000015084	SYF2	98	62.778	Erinaceus_europaeus
ENSTRUG00000001499	syf2	95	81.435	ENSELUG00000003465	syf2	99	82.500	Esox_lucius
ENSTRUG00000001499	syf2	92	77.682	ENSFCAG00000043095	-	95	77.682	Felis_catus
ENSTRUG00000001499	syf2	99	71.815	ENSFCAG00000010324	-	89	71.815	Felis_catus
ENSTRUG00000001499	syf2	82	79.412	ENSFALG00000000460	SYF2	89	78.182	Ficedula_albicollis
ENSTRUG00000001499	syf2	93	77.021	ENSFDAG00000008310	SYF2	100	75.820	Fukomys_damarensis
ENSTRUG00000001499	syf2	90	74.336	ENSFHEG00000007238	syf2	100	74.336	Fundulus_heteroclitus
ENSTRUG00000001499	syf2	86	87.907	ENSGMOG00000019138	syf2	96	87.907	Gadus_morhua
ENSTRUG00000001499	syf2	89	81.081	ENSGALG00000013639	SYF2	96	75.207	Gallus_gallus
ENSTRUG00000001499	syf2	91	85.903	ENSGAFG00000019435	syf2	100	83.333	Gambusia_affinis
ENSTRUG00000001499	syf2	89	87.387	ENSGACG00000007305	syf2	100	82.917	Gasterosteus_aculeatus
ENSTRUG00000001499	syf2	89	82.432	ENSGAGG00000010670	SYF2	96	80.169	Gopherus_agassizii
ENSTRUG00000001499	syf2	86	81.860	ENSGGOG00000012796	SYF2	100	74.486	Gorilla_gorilla
ENSTRUG00000001499	syf2	91	88.053	ENSHBUG00000020477	syf2	100	85.833	Haplochromis_burtoni
ENSTRUG00000001499	syf2	95	76.349	ENSHGLG00000014393	SYF2	100	76.230	Heterocephalus_glaber_female
ENSTRUG00000001499	syf2	89	69.369	ENSHGLG00000004304	-	93	69.820	Heterocephalus_glaber_female
ENSTRUG00000001499	syf2	95	76.349	ENSHGLG00100014722	SYF2	100	76.230	Heterocephalus_glaber_male
ENSTRUG00000001499	syf2	96	83.058	ENSHCOG00000012904	syf2	80	82.329	Hippocampus_comes
ENSTRUG00000001499	syf2	91	83.628	ENSIPUG00000019859	syf2	100	80.417	Ictalurus_punctatus
ENSTRUG00000001499	syf2	59	75.342	ENSSTOG00000023984	SYF2	100	75.342	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSTRUG00000001499	syf2	80	81.407	ENSJJAG00000013301	Syf2	94	81.407	Jaculus_jaculus
ENSTRUG00000001499	syf2	90	89.333	ENSKMAG00000013856	syf2	100	86.250	Kryptolebias_marmoratus
ENSTRUG00000001499	syf2	87	89.862	ENSLBEG00000014425	syf2	100	85.833	Labrus_bergylta
ENSTRUG00000001499	syf2	89	81.982	ENSLACG00000012064	SYF2	93	81.982	Latimeria_chalumnae
ENSTRUG00000001499	syf2	95	79.747	ENSLOCG00000002728	syf2	100	77.470	Lepisosteus_oculatus
ENSTRUG00000001499	syf2	95	76.446	ENSLAFG00000023150	-	100	76.327	Loxodonta_africana
ENSTRUG00000001499	syf2	73	55.435	ENSLAFG00000030814	-	100	55.435	Loxodonta_africana
ENSTRUG00000001499	syf2	88	80.275	ENSMFAG00000041831	SYF2	100	73.663	Macaca_fascicularis
ENSTRUG00000001499	syf2	86	80.930	ENSMMUG00000002968	SYF2	100	74.486	Macaca_mulatta
ENSTRUG00000001499	syf2	88	80.275	ENSMNEG00000030180	SYF2	100	73.663	Macaca_nemestrina
ENSTRUG00000001499	syf2	92	77.253	ENSMLEG00000030248	SYF2	100	73.663	Mandrillus_leucophaeus
ENSTRUG00000001499	syf2	97	84.836	ENSMAMG00000010403	syf2	99	86.420	Mastacembelus_armatus
ENSTRUG00000001499	syf2	95	84.810	ENSMZEG00005006429	syf2	100	85.833	Maylandia_zebra
ENSTRUG00000001499	syf2	80	81.407	ENSMGAG00000002019	SYF2	100	81.407	Meleagris_gallopavo
ENSTRUG00000001499	syf2	95	76.569	ENSMAUG00000018974	Syf2	100	76.033	Mesocricetus_auratus
ENSTRUG00000001499	syf2	80	81.407	ENSMICG00000016191	SYF2	100	81.407	Microcebus_murinus
ENSTRUG00000001499	syf2	91	79.825	ENSMOCG00000022938	Syf2	100	76.446	Microtus_ochrogaster
ENSTRUG00000001499	syf2	93	87.500	ENSMMOG00000002396	syf2	97	87.500	Mola_mola
ENSTRUG00000001499	syf2	89	76.339	ENSMODG00000013951	-	98	76.339	Monodelphis_domestica
ENSTRUG00000001499	syf2	95	85.294	ENSMALG00000010706	syf2	100	86.307	Monopterus_albus
ENSTRUG00000001499	syf2	89	81.532	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	100	76.446	Mus_caroli
ENSTRUG00000001499	syf2	89	81.532	ENSMUSG00000028821	Syf2	100	76.446	Mus_musculus
ENSTRUG00000001499	syf2	89	81.532	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	100	76.446	Mus_pahari
ENSTRUG00000001499	syf2	89	81.532	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	100	76.446	Mus_spretus
ENSTRUG00000001499	syf2	96	75.104	ENSMPUG00000015801	-	98	75.104	Mustela_putorius_furo
ENSTRUG00000001499	syf2	86	80.930	ENSMPUG00000015802	-	98	75.417	Mustela_putorius_furo
ENSTRUG00000001499	syf2	96	75.720	ENSMLUG00000001885	SYF2	99	75.720	Myotis_lucifugus
ENSTRUG00000001499	syf2	96	75.207	ENSNGAG00000007912	Syf2	100	74.390	Nannospalax_galili
ENSTRUG00000001499	syf2	95	74.689	ENSNBRG00000010720	syf2	99	75.820	Neolamprologus_brichardi
ENSTRUG00000001499	syf2	86	81.860	ENSNLEG00000035185	SYF2	100	74.486	Nomascus_leucogenys
ENSTRUG00000001499	syf2	92	78.448	ENSOPRG00000012870	SYF2	100	75.820	Ochotona_princeps
ENSTRUG00000001499	syf2	94	75.210	ENSODEG00000017664	-	100	75.210	Octodon_degus
ENSTRUG00000001499	syf2	96	66.667	ENSODEG00000014338	-	99	68.936	Octodon_degus
ENSTRUG00000001499	syf2	90	89.238	ENSONIG00000008213	syf2	100	86.250	Oreochromis_niloticus
ENSTRUG00000001499	syf2	81	81.683	ENSOANG00000009552	SYF2	100	81.683	Ornithorhynchus_anatinus
ENSTRUG00000001499	syf2	93	74.897	ENSOCUG00000013050	SYF2	100	76.230	Oryctolagus_cuniculus
ENSTRUG00000001499	syf2	94	84.255	ENSORLG00000028820	syf2	100	84.255	Oryzias_latipes
ENSTRUG00000001499	syf2	94	84.681	ENSORLG00020018333	syf2	100	83.817	Oryzias_latipes_hni
ENSTRUG00000001499	syf2	94	85.106	ENSORLG00015014665	syf2	100	84.232	Oryzias_latipes_hsok
ENSTRUG00000001499	syf2	95	84.810	ENSOMEG00000013911	syf2	100	84.167	Oryzias_melastigma
ENSTRUG00000001499	syf2	95	76.349	ENSOGAG00000009962	SYF2	100	76.230	Otolemur_garnettii
ENSTRUG00000001499	syf2	89	79.464	ENSOARG00000006348	-	91	79.464	Ovis_aries
ENSTRUG00000001499	syf2	78	54.872	ENSOARG00000006269	-	100	54.872	Ovis_aries
ENSTRUG00000001499	syf2	86	81.860	ENSPPAG00000036579	SYF2	100	74.486	Pan_paniscus
ENSTRUG00000001499	syf2	92	77.682	ENSPPRG00000001651	-	95	77.682	Panthera_pardus
ENSTRUG00000001499	syf2	88	81.651	ENSPPRG00000001638	-	89	81.651	Panthera_pardus
ENSTRUG00000001499	syf2	86	82.326	ENSPTIG00000005711	-	80	81.651	Panthera_tigris_altaica
ENSTRUG00000001499	syf2	92	77.253	ENSPTIG00000007036	-	95	77.253	Panthera_tigris_altaica
ENSTRUG00000001499	syf2	86	81.860	ENSPTRG00000000352	SYF2	100	74.486	Pan_troglodytes
ENSTRUG00000001499	syf2	88	80.275	ENSPANG00000008139	SYF2	100	73.663	Papio_anubis
ENSTRUG00000001499	syf2	95	79.747	ENSPKIG00000008130	syf2	100	80.833	Paramormyrops_kingsleyae
ENSTRUG00000001499	syf2	93	77.966	ENSPSIG00000011816	SYF2	92	77.966	Pelodiscus_sinensis
ENSTRUG00000001499	syf2	100	79.681	ENSPMGG00000008755	syf2	98	79.681	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSTRUG00000001499	syf2	95	76.151	ENSPEMG00000008283	Syf2	100	76.033	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSTRUG00000001499	syf2	89	80.180	ENSPCIG00000014235	SYF2	100	74.000	Phascolarctos_cinereus
ENSTRUG00000001499	syf2	91	87.168	ENSPFOG00000004116	syf2	93	87.168	Poecilia_formosa
ENSTRUG00000001499	syf2	91	87.168	ENSPLAG00000006691	syf2	97	86.784	Poecilia_latipinna
ENSTRUG00000001499	syf2	95	80.591	ENSPMEG00000011684	syf2	99	82.251	Poecilia_mexicana
ENSTRUG00000001499	syf2	91	82.917	ENSPREG00000003009	syf2	100	82.917	Poecilia_reticulata
ENSTRUG00000001499	syf2	88	81.193	ENSPPYG00000001713	SYF2	90	81.193	Pongo_abelii
ENSTRUG00000001499	syf2	89	55.405	ENSPCOG00000027011	SYF2	100	52.263	Propithecus_coquereli
ENSTRUG00000001499	syf2	89	70.721	ENSPVAG00000005841	SYF2	91	70.721	Pteropus_vampyrus
ENSTRUG00000001499	syf2	90	88.789	ENSPNYG00000004979	syf2	100	85.417	Pundamilia_nyererei
ENSTRUG00000001499	syf2	91	83.260	ENSPNAG00000015570	syf2	100	80.417	Pygocentrus_nattereri
ENSTRUG00000001499	syf2	89	81.532	ENSRNOG00000060597	Syf2	100	76.446	Rattus_norvegicus
ENSTRUG00000001499	syf2	88	77.982	ENSRBIG00000042970	SYF2	90	77.982	Rhinopithecus_bieti
ENSTRUG00000001499	syf2	88	80.275	ENSRROG00000001347	SYF2	100	73.663	Rhinopithecus_roxellana
ENSTRUG00000001499	syf2	86	81.860	ENSSBOG00000020184	SYF2	100	75.309	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSTRUG00000001499	syf2	89	78.829	ENSSHAG00000015630	-	100	73.092	Sarcophilus_harrisii
ENSTRUG00000001499	syf2	82	80.097	ENSSHAG00000007152	-	100	80.097	Sarcophilus_harrisii
ENSTRUG00000001499	syf2	89	83.710	ENSSFOG00015023647	syf2	100	79.167	Scleropages_formosus
ENSTRUG00000001499	syf2	95	85.232	ENSSMAG00000009867	syf2	100	85.833	Scophthalmus_maximus
ENSTRUG00000001499	syf2	88	90.367	ENSSDUG00000013072	syf2	100	85.417	Seriola_dumerili
ENSTRUG00000001499	syf2	88	90.367	ENSSLDG00000012677	syf2	100	85.417	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSTRUG00000001499	syf2	89	62.162	ENSSARG00000012889	SYF2	91	62.162	Sorex_araneus
ENSTRUG00000001499	syf2	93	78.390	ENSSPUG00000005251	SYF2	99	75.889	Sphenodon_punctatus
ENSTRUG00000001499	syf2	95	85.232	ENSSPAG00000009626	syf2	100	86.250	Stegastes_partitus
ENSTRUG00000001499	syf2	90	80.717	ENSSSCG00000037481	SYF2	91	80.717	Sus_scrofa
ENSTRUG00000001499	syf2	67	52.353	ENSTGUG00000001126	SYF2	84	52.353	Taeniopygia_guttata
ENSTRUG00000001499	syf2	89	93.243	ENSTNIG00000016912	syf2	99	93.243	Tetraodon_nigroviridis
ENSTRUG00000001499	syf2	89	59.009	ENSTBEG00000017370	SYF2	99	55.556	Tupaia_belangeri
ENSTRUG00000001499	syf2	86	81.395	ENSTTRG00000003550	SYF2	100	73.770	Tursiops_truncatus
ENSTRUG00000001499	syf2	90	79.372	ENSUAMG00000002897	SYF2	90	79.372	Ursus_americanus
ENSTRUG00000001499	syf2	86	80.465	ENSUMAG00000013108	SYF2	90	79.372	Ursus_maritimus
ENSTRUG00000001499	syf2	89	79.730	ENSVPAG00000005705	SYF2	91	79.730	Vicugna_pacos
ENSTRUG00000001499	syf2	86	80.930	ENSVVUG00000027175	-	90	79.821	Vulpes_vulpes
ENSTRUG00000001499	syf2	82	80.488	ENSVVUG00000027181	-	100	73.387	Vulpes_vulpes
ENSTRUG00000001499	syf2	95	74.790	ENSXETG00000022797	syf2	99	72.874	Xenopus_tropicalis
ENSTRUG00000001499	syf2	91	82.917	ENSXMAG00000022698	syf2	100	82.917	Xiphophorus_maculatus