EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSTRUG00000002320 (Gene tree)
Gene ID: 101076996
Gene Symbol: ctif
Alias: zmp:0000001000
Full Name: CBP80/20-dependent translation initiation factor-like
Gene Type: protein_coding
Species: Takifugu_rubripes
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 6780 bases
Position: chrHE592397.1:8344-15123
Accession: 101076996
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSTRUP00000005332	MIF4G	PF02854.19	1.7e-23	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSTRUT00000005365	-	1005	XM_011618384	ENSTRUP00000005332	334 (aa)	XP_011616686	H2RYW1

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSTRUG00000002320	ctif	99	75.723	ENSAPOG00000020192	ctif	61	75.723	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTRUG00000002320	ctif	99	75.723	ENSAPEG00000016975	ctif	51	75.723	Amphiprion_percula
ENSTRUG00000002320	ctif	99	74.709	ENSATEG00000016752	ctif	51	74.709	Anabas_testudineus
ENSTRUG00000002320	ctif	76	59.851	ENSAPLG00000014486	-	99	59.851	Anas_platyrhynchos
ENSTRUG00000002320	ctif	99	73.699	ENSACLG00000005956	ctif	51	73.699	Astatotilapia_calliptera
ENSTRUG00000002320	ctif	51	30.159	ENSCPOG00000027094	MIF4GD	83	31.217	Cavia_porcellus
ENSTRUG00000002320	ctif	51	30.159	ENSCATG00000029614	MIF4GD	83	30.159	Cercocebus_atys
ENSTRUG00000002320	ctif	98	60.580	ENSCLAG00000008174	CTIF	58	58.197	Chinchilla_lanigera
ENSTRUG00000002320	ctif	51	30.108	ENSCPBG00000028104	MIF4GD	83	30.108	Chrysemys_picta_bellii
ENSTRUG00000002320	ctif	98	60.511	ENSCANG00000030916	CTIF	52	69.259	Colobus_angolensis_palliatus
ENSTRUG00000002320	ctif	98	62.463	ENSCGRG00001020158	Ctif	57	62.463	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSTRUG00000002320	ctif	98	60.857	ENSCGRG00000000052	Ctif	58	60.857	Cricetulus_griseus_crigri
ENSTRUG00000002320	ctif	99	70.349	ENSCSEG00000019857	ctif	50	70.605	Cynoglossus_semilaevis
ENSTRUG00000002320	ctif	99	69.741	ENSCVAG00000017158	ctif	51	68.946	Cyprinodon_variegatus
ENSTRUG00000002320	ctif	98	59.714	ENSDNOG00000037310	CTIF	78	59.659	Dasypus_novemcinctus
ENSTRUG00000002320	ctif	51	30.769	ENSEBUG00000006460	mif4gda	78	30.769	Eptatretus_burgeri
ENSTRUG00000002320	ctif	98	60.983	ENSEEUG00000012451	CTIF	51	69.928	Erinaceus_europaeus
ENSTRUG00000002320	ctif	99	69.942	ENSFHEG00000004334	ctif	59	66.474	Fundulus_heteroclitus
ENSTRUG00000002320	ctif	76	76.806	ENSGMOG00000003452	ctif	99	76.806	Gadus_morhua
ENSTRUG00000002320	ctif	60	52.913	ENSGALG00000046886	-	71	56.471	Gallus_gallus
ENSTRUG00000002320	ctif	99	68.966	ENSGAFG00000011896	ctif	58	68.091	Gambusia_affinis
ENSTRUG00000002320	ctif	77	80.075	ENSGACG00000016514	ctif	99	80.075	Gasterosteus_aculeatus
ENSTRUG00000002320	ctif	51	30.108	ENSGAGG00000022614	MIF4GD	83	30.108	Gopherus_agassizii
ENSTRUG00000002320	ctif	76	73.541	ENSGAGG00000020663	CTIF	65	70.385	Gopherus_agassizii
ENSTRUG00000002320	ctif	99	73.699	ENSHBUG00000018092	ctif	51	73.699	Haplochromis_burtoni
ENSTRUG00000002320	ctif	99	64.706	ENSHCOG00000011784	ctif	58	64.265	Hippocampus_comes
ENSTRUG00000002320	ctif	99	70.640	ENSKMAG00000014651	ctif	51	70.640	Kryptolebias_marmoratus
ENSTRUG00000002320	ctif	99	75.439	ENSLBEG00000018277	ctif	60	75.723	Labrus_bergylta
ENSTRUG00000002320	ctif	98	57.534	ENSLAFG00000016335	CTIF	99	71.698	Loxodonta_africana
ENSTRUG00000002320	ctif	99	75.652	ENSMAMG00000014741	ctif	51	75.872	Mastacembelus_armatus
ENSTRUG00000002320	ctif	98	62.170	ENSMOCG00000020507	Ctif	57	60.997	Microtus_ochrogaster
ENSTRUG00000002320	ctif	99	71.387	ENSMALG00000020553	ctif	74	71.387	Monopterus_albus
ENSTRUG00000002320	ctif	98	59.392	MGP_CAROLIEiJ_G0022408	Ctif	58	60.055	Mus_caroli
ENSTRUG00000002320	ctif	98	58.266	ENSMUSG00000052928	Ctif	58	57.923	Mus_musculus
ENSTRUG00000002320	ctif	98	62.069	MGP_PahariEiJ_G0019137	Ctif	57	62.865	Mus_pahari
ENSTRUG00000002320	ctif	98	57.995	MGP_SPRETEiJ_G0023321	Ctif	58	57.650	Mus_spretus
ENSTRUG00000002320	ctif	98	60.458	ENSMLUG00000003025	CTIF	57	56.818	Myotis_lucifugus
ENSTRUG00000002320	ctif	99	73.699	ENSNBRG00000008679	ctif	51	73.699	Neolamprologus_brichardi
ENSTRUG00000002320	ctif	99	73.913	ENSONIG00000007750	ctif	57	73.913	Oreochromis_niloticus
ENSTRUG00000002320	ctif	76	48.765	ENSOANG00000001337	CTIF	58	48.624	Ornithorhynchus_anatinus
ENSTRUG00000002320	ctif	51	30.270	ENSOANG00000008325	MIF4GD	83	30.270	Ornithorhynchus_anatinus
ENSTRUG00000002320	ctif	52	30.159	ENSORLG00000009677	mif4gda	86	30.159	Oryzias_latipes
ENSTRUG00000002320	ctif	99	69.942	ENSORLG00000005786	ctif	57	69.942	Oryzias_latipes
ENSTRUG00000002320	ctif	52	30.570	ENSORLG00020016898	mif4gda	86	30.159	Oryzias_latipes_hni
ENSTRUG00000002320	ctif	99	69.767	ENSORLG00020005385	ctif	56	69.767	Oryzias_latipes_hni
ENSTRUG00000002320	ctif	52	30.159	ENSORLG00015006349	mif4gda	86	30.159	Oryzias_latipes_hsok
ENSTRUG00000002320	ctif	99	69.364	ENSORLG00015011872	ctif	58	69.364	Oryzias_latipes_hsok
ENSTRUG00000002320	ctif	52	30.688	ENSOMEG00000013847	mif4gda	80	30.688	Oryzias_melastigma
ENSTRUG00000002320	ctif	99	70.725	ENSOMEG00000007917	ctif	51	70.725	Oryzias_melastigma
ENSTRUG00000002320	ctif	80	71.841	ENSPKIG00000011234	ctif	59	71.429	Paramormyrops_kingsleyae
ENSTRUG00000002320	ctif	51	30.108	ENSPSIG00000008599	MIF4GD	83	30.108	Pelodiscus_sinensis
ENSTRUG00000002320	ctif	98	62.391	ENSPEMG00000022746	Ctif	57	62.170	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSTRUG00000002320	ctif	76	72.374	ENSPCIG00000026247	CTIF	79	72.374	Phascolarctos_cinereus
ENSTRUG00000002320	ctif	99	71.552	ENSPFOG00000009243	ctif	57	71.552	Poecilia_formosa
ENSTRUG00000002320	ctif	99	71.552	ENSPLAG00000019171	ctif	56	71.552	Poecilia_latipinna
ENSTRUG00000002320	ctif	99	71.552	ENSPMEG00000020089	ctif	50	70.455	Poecilia_mexicana
ENSTRUG00000002320	ctif	76	71.536	ENSPPYG00000009147	CTIF	52	69.259	Pongo_abelii
ENSTRUG00000002320	ctif	99	73.699	ENSPNYG00000007879	ctif	59	73.699	Pundamilia_nyererei
ENSTRUG00000002320	ctif	98	64.286	ENSRNOG00000018342	Ctif	98	64.371	Rattus_norvegicus
ENSTRUG00000002320	ctif	98	60.511	ENSRBIG00000043937	CTIF	50	66.443	Rhinopithecus_bieti
ENSTRUG00000002320	ctif	98	60.511	ENSRROG00000006039	CTIF	50	66.443	Rhinopithecus_roxellana
ENSTRUG00000002320	ctif	99	74.493	ENSSMAG00000005707	ctif	61	74.493	Scophthalmus_maximus
ENSTRUG00000002320	ctif	99	75.723	ENSSPAG00000003721	ctif	59	75.723	Stegastes_partitus
ENSTRUG00000002320	ctif	99	80.117	ENSTNIG00000018763	ctif	57	79.532	Tetraodon_nigroviridis
ENSTRUG00000002320	ctif	98	59.777	ENSUMAG00000002735	CTIF	51	63.787	Ursus_maritimus
ENSTRUG00000002320	ctif	99	71.598	ENSXCOG00000002477	ctif	76	71.598	Xiphophorus_couchianus
ENSTRUG00000002320	ctif	99	69.540	ENSXMAG00000004236	ctif	56	69.540	Xiphophorus_maculatus