EuRBPDB

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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSTRUG00000005809 (Gene tree)
Gene ID: 101068893
Gene Symbol: pelo
Alias: wu:fa12c12|wu:fb97f07|zgc:56550
Full Name: pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor
Gene Type: protein_coding
Species: Takifugu_rubripes
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 5951 bases
Position: chr1:8995817-9001767
Accession: 101068893
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSTRUP00000014163	eRF1_2	PF03464.15	6.3e-33	1	1
ENSTRUP00000014163	eRF1_3	PF03465.15	1e-25	1	1
ENSTRUP00000014163	eRF1_1	PF03463.15	3.3e-52	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSTRUT00000014228	-	1850	XM_003961270	ENSTRUP00000014163	385 (aa)	XP_003961319	H2SP26

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
tru03015	mRNA surveillance pathway	KEGG

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSTRUG00000005809	pelo	100	79.740	ENSG00000152684	PELO	100	79.740	Homo_sapiens
ENSTRUG00000005809	pelo	100	92.208	ENSAPOG00000023072	pelo	100	92.208	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTRUG00000005809	pelo	64	90.688	ENSAPOG00000000616	pelo	90	90.688	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTRUG00000005809	pelo	64	90.688	ENSAPOG00000023700	-	90	90.688	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTRUG00000005809	pelo	100	79.481	ENSAMEG00000007734	PELO	100	79.481	Ailuropoda_melanoleuca
ENSTRUG00000005809	pelo	97	86.863	ENSACIG00000014386	pelo	97	92.012	Amphilophus_citrinellus
ENSTRUG00000005809	pelo	100	92.468	ENSAOCG00000023717	pelo	100	92.468	Amphiprion_ocellaris
ENSTRUG00000005809	pelo	100	92.468	ENSAPEG00000011235	pelo	100	92.468	Amphiprion_percula
ENSTRUG00000005809	pelo	100	93.247	ENSATEG00000019550	pelo	100	93.247	Anabas_testudineus
ENSTRUG00000005809	pelo	77	69.463	ENSAPLG00000013265	PELO	100	69.463	Anas_platyrhynchos
ENSTRUG00000005809	pelo	97	79.733	ENSACAG00000004352	PELO	100	79.221	Anolis_carolinensis
ENSTRUG00000005809	pelo	100	79.221	ENSANAG00000014096	PELO	100	79.221	Aotus_nancymaae
ENSTRUG00000005809	pelo	100	89.870	ENSACLG00000010305	pelo	100	89.870	Astatotilapia_calliptera
ENSTRUG00000005809	pelo	97	91.957	ENSAMXG00000020299	pelo	100	91.192	Astyanax_mexicanus
ENSTRUG00000005809	pelo	100	79.481	ENSBTAG00000003268	PELO	99	79.481	Bos_taurus
ENSTRUG00000005809	pelo	98	59.631	WBGene00011280	pelo-1	99	59.631	Caenorhabditis_elegans
ENSTRUG00000005809	pelo	100	79.481	ENSCJAG00000035190	PELO	100	79.481	Callithrix_jacchus
ENSTRUG00000005809	pelo	100	79.740	ENSCAFG00020023234	PELO	100	79.740	Canis_lupus_dingo
ENSTRUG00000005809	pelo	100	79.221	ENSCHIG00000016410	PELO	99	79.221	Capra_hircus
ENSTRUG00000005809	pelo	100	80.260	ENSTSYG00000005203	PELO	100	80.260	Carlito_syrichta
ENSTRUG00000005809	pelo	100	80.000	ENSCPOG00000027406	PELO	100	80.000	Cavia_porcellus
ENSTRUG00000005809	pelo	100	79.481	ENSCCAG00000035600	PELO	100	79.481	Cebus_capucinus
ENSTRUG00000005809	pelo	100	79.740	ENSCATG00000011829	PELO	100	79.740	Cercocebus_atys
ENSTRUG00000005809	pelo	100	79.481	ENSCLAG00000005043	PELO	100	79.481	Chinchilla_lanigera
ENSTRUG00000005809	pelo	100	79.740	ENSCSAG00000016692	PELO	100	79.740	Chlorocebus_sabaeus
ENSTRUG00000005809	pelo	100	80.260	ENSCHOG00000000523	PELO	100	80.260	Choloepus_hoffmanni
ENSTRUG00000005809	pelo	97	79.200	ENSCPBG00000007544	PELO	100	78.701	Chrysemys_picta_bellii
ENSTRUG00000005809	pelo	97	64.879	ENSCING00000001979	-	100	64.935	Ciona_intestinalis
ENSTRUG00000005809	pelo	100	65.714	ENSCSAVG00000006158	-	100	65.714	Ciona_savignyi
ENSTRUG00000005809	pelo	100	79.740	ENSCANG00000023382	PELO	100	79.740	Colobus_angolensis_palliatus
ENSTRUG00000005809	pelo	97	80.697	ENSCGRG00001024665	Pelo	100	80.519	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSTRUG00000005809	pelo	97	81.501	ENSCGRG00000004570	Pelo	100	81.299	Cricetulus_griseus_crigri
ENSTRUG00000005809	pelo	100	91.429	ENSCSEG00000008807	pelo	100	91.429	Cynoglossus_semilaevis
ENSTRUG00000005809	pelo	100	90.909	ENSCVAG00000016082	pelo	100	90.909	Cyprinodon_variegatus
ENSTRUG00000005809	pelo	100	88.831	ENSDARG00000055477	pelo	100	88.831	Danio_rerio
ENSTRUG00000005809	pelo	100	76.684	ENSDNOG00000036721	PELO	100	76.684	Dasypus_novemcinctus
ENSTRUG00000005809	pelo	100	80.779	ENSDORG00000016689	Pelo	100	80.779	Dipodomys_ordii
ENSTRUG00000005809	pelo	96	67.385	FBgn0011207	pelo	97	66.234	Drosophila_melanogaster
ENSTRUG00000005809	pelo	74	73.656	ENSEBUG00000004955	pelo	99	73.656	Eptatretus_burgeri
ENSTRUG00000005809	pelo	100	79.481	ENSEASG00005013348	PELO	100	79.481	Equus_asinus_asinus
ENSTRUG00000005809	pelo	100	89.610	ENSELUG00000023229	pelo	100	89.610	Esox_lucius
ENSTRUG00000005809	pelo	100	79.740	ENSFCAG00000032341	PELO	100	79.740	Felis_catus
ENSTRUG00000005809	pelo	100	79.740	ENSFALG00000004559	PELO	100	79.740	Ficedula_albicollis
ENSTRUG00000005809	pelo	74	81.338	ENSFDAG00000002076	PELO	88	81.338	Fukomys_damarensis
ENSTRUG00000005809	pelo	100	89.870	ENSFHEG00000009769	pelo	100	89.870	Fundulus_heteroclitus
ENSTRUG00000005809	pelo	98	89.125	ENSGMOG00000005849	pelo	100	88.831	Gadus_morhua
ENSTRUG00000005809	pelo	100	90.130	ENSGAFG00000019350	pelo	100	90.130	Gambusia_affinis
ENSTRUG00000005809	pelo	100	92.208	ENSGACG00000007245	pelo	100	92.208	Gasterosteus_aculeatus
ENSTRUG00000005809	pelo	97	79.467	ENSGAGG00000004018	PELO	100	78.961	Gopherus_agassizii
ENSTRUG00000005809	pelo	100	79.740	ENSGGOG00000012635	PELO	100	79.740	Gorilla_gorilla
ENSTRUG00000005809	pelo	100	89.870	ENSHBUG00000005866	pelo	100	89.870	Haplochromis_burtoni
ENSTRUG00000005809	pelo	100	80.000	ENSHGLG00000005932	PELO	100	80.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSTRUG00000005809	pelo	100	78.182	ENSHGLG00100017627	PELO	100	78.182	Heterocephalus_glaber_male
ENSTRUG00000005809	pelo	100	89.870	ENSHCOG00000016782	pelo	100	89.870	Hippocampus_comes
ENSTRUG00000005809	pelo	100	88.312	ENSIPUG00000020627	pelo	100	88.312	Ictalurus_punctatus
ENSTRUG00000005809	pelo	100	80.000	ENSSTOG00000027378	PELO	100	80.000	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSTRUG00000005809	pelo	100	78.701	ENSJJAG00000015032	Pelo	100	78.701	Jaculus_jaculus
ENSTRUG00000005809	pelo	100	91.169	ENSKMAG00000021305	pelo	100	91.169	Kryptolebias_marmoratus
ENSTRUG00000005809	pelo	100	92.208	ENSLBEG00000022399	pelo	100	92.208	Labrus_bergylta
ENSTRUG00000005809	pelo	100	79.740	ENSLAFG00000020551	PELO	100	79.740	Loxodonta_africana
ENSTRUG00000005809	pelo	100	79.740	ENSMFAG00000000651	PELO	100	79.740	Macaca_fascicularis
ENSTRUG00000005809	pelo	100	79.740	ENSMMUG00000039101	PELO	100	79.740	Macaca_mulatta
ENSTRUG00000005809	pelo	100	79.740	ENSMNEG00000035538	PELO	100	79.740	Macaca_nemestrina
ENSTRUG00000005809	pelo	100	79.740	ENSMLEG00000039113	PELO	100	79.740	Mandrillus_leucophaeus
ENSTRUG00000005809	pelo	97	94.102	ENSMAMG00000013260	pelo	100	93.247	Mastacembelus_armatus
ENSTRUG00000005809	pelo	100	89.870	ENSMZEG00005014258	pelo	100	89.870	Maylandia_zebra
ENSTRUG00000005809	pelo	100	80.260	ENSMAUG00000009770	Pelo	100	80.260	Mesocricetus_auratus
ENSTRUG00000005809	pelo	100	80.000	ENSMICG00000044040	PELO	100	80.000	Microcebus_murinus
ENSTRUG00000005809	pelo	100	80.260	ENSMOCG00000017554	Pelo	100	80.260	Microtus_ochrogaster
ENSTRUG00000005809	pelo	100	91.948	ENSMMOG00000001324	pelo	100	91.948	Mola_mola
ENSTRUG00000005809	pelo	100	91.948	ENSMALG00000008194	pelo	100	91.948	Monopterus_albus
ENSTRUG00000005809	pelo	100	80.000	MGP_CAROLIEiJ_G0018915	Pelo	100	80.000	Mus_caroli
ENSTRUG00000005809	pelo	100	80.000	ENSMUSG00000042275	Pelo	100	80.000	Mus_musculus
ENSTRUG00000005809	pelo	100	80.260	MGP_PahariEiJ_G0015985	Pelo	100	80.260	Mus_pahari
ENSTRUG00000005809	pelo	100	80.000	MGP_SPRETEiJ_G0019793	Pelo	100	80.000	Mus_spretus
ENSTRUG00000005809	pelo	100	80.260	ENSMLUG00000024132	PELO	100	80.260	Myotis_lucifugus
ENSTRUG00000005809	pelo	100	80.779	ENSNGAG00000019331	Pelo	100	80.779	Nannospalax_galili
ENSTRUG00000005809	pelo	100	89.870	ENSNBRG00000011799	pelo	100	89.870	Neolamprologus_brichardi
ENSTRUG00000005809	pelo	100	79.740	ENSNLEG00000035970	PELO	100	79.740	Nomascus_leucogenys
ENSTRUG00000005809	pelo	100	79.481	ENSMEUG00000005468	PELO	100	79.481	Notamacropus_eugenii
ENSTRUG00000005809	pelo	98	79.101	ENSOPRG00000018793	PELO	99	79.101	Ochotona_princeps
ENSTRUG00000005809	pelo	100	80.519	ENSODEG00000017579	PELO	100	80.519	Octodon_degus
ENSTRUG00000005809	pelo	96	90.541	ENSONIG00000011511	pelo	100	89.870	Oreochromis_niloticus
ENSTRUG00000005809	pelo	100	79.740	ENSOCUG00000023902	PELO	100	79.740	Oryctolagus_cuniculus
ENSTRUG00000005809	pelo	100	91.169	ENSORLG00000005827	pelo	100	91.169	Oryzias_latipes
ENSTRUG00000005809	pelo	100	91.429	ENSORLG00020016456	pelo	100	91.429	Oryzias_latipes_hni
ENSTRUG00000005809	pelo	100	92.208	ENSORLG00015014447	pelo	100	92.222	Oryzias_latipes_hsok
ENSTRUG00000005809	pelo	100	92.208	ENSOMEG00000021567	pelo	100	92.208	Oryzias_melastigma
ENSTRUG00000005809	pelo	100	80.260	ENSOGAG00000027940	PELO	100	80.260	Otolemur_garnettii
ENSTRUG00000005809	pelo	100	79.481	ENSOARG00000008324	PELO	99	79.481	Ovis_aries
ENSTRUG00000005809	pelo	100	79.740	ENSPPAG00000038951	PELO	100	79.740	Pan_paniscus
ENSTRUG00000005809	pelo	100	79.740	ENSPPRG00000018800	PELO	100	79.740	Panthera_pardus
ENSTRUG00000005809	pelo	100	79.740	ENSPTIG00000019988	PELO	100	79.740	Panthera_tigris_altaica
ENSTRUG00000005809	pelo	100	79.481	ENSPTRG00000034409	PELO	100	79.481	Pan_troglodytes
ENSTRUG00000005809	pelo	100	79.740	ENSPANG00000010902	PELO	100	79.740	Papio_anubis
ENSTRUG00000005809	pelo	100	89.091	ENSPKIG00000015190	pelo	100	89.091	Paramormyrops_kingsleyae
ENSTRUG00000005809	pelo	97	79.733	ENSPSIG00000004971	PELO	100	79.221	Pelodiscus_sinensis
ENSTRUG00000005809	pelo	66	90.945	ENSPMGG00000014561	pelo	94	90.945	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSTRUG00000005809	pelo	100	80.519	ENSPEMG00000015584	Pelo	100	80.519	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSTRUG00000005809	pelo	100	80.260	ENSPCIG00000004880	PELO	100	80.260	Phascolarctos_cinereus
ENSTRUG00000005809	pelo	100	90.390	ENSPFOG00000007277	pelo	100	90.390	Poecilia_formosa
ENSTRUG00000005809	pelo	100	90.390	ENSPLAG00000020787	pelo	100	90.390	Poecilia_latipinna
ENSTRUG00000005809	pelo	100	90.390	ENSPMEG00000016964	pelo	100	90.390	Poecilia_mexicana
ENSTRUG00000005809	pelo	100	90.390	ENSPREG00000023071	pelo	100	90.390	Poecilia_reticulata
ENSTRUG00000005809	pelo	97	80.161	ENSPPYG00000015451	PELO	96	79.740	Pongo_abelii
ENSTRUG00000005809	pelo	100	80.000	ENSPCOG00000021178	PELO	100	80.000	Propithecus_coquereli
ENSTRUG00000005809	pelo	100	89.870	ENSPNYG00000017325	pelo	100	89.870	Pundamilia_nyererei
ENSTRUG00000005809	pelo	97	90.349	ENSPNAG00000012458	pelo	99	89.091	Pygocentrus_nattereri
ENSTRUG00000005809	pelo	100	80.519	ENSRNOG00000061128	Pelo	100	80.519	Rattus_norvegicus
ENSTRUG00000005809	pelo	100	79.740	ENSRBIG00000007299	PELO	100	79.740	Rhinopithecus_bieti
ENSTRUG00000005809	pelo	100	79.740	ENSRROG00000035507	PELO	100	79.740	Rhinopithecus_roxellana
ENSTRUG00000005809	pelo	97	33.158	YNL001W	-	97	33.158	Saccharomyces_cerevisiae
ENSTRUG00000005809	pelo	100	79.740	ENSSBOG00000036140	PELO	100	79.740	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSTRUG00000005809	pelo	63	77.459	ENSSHAG00000010770	PELO	100	77.459	Sarcophilus_harrisii
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