EuRBPDB

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Description

Ensembl ID: ENSTRUG00000006888 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: aco1
Alias: IRP1|wu:fo75b03
Full Name: aconitase 1
Gene Type: protein_coding
Species: Takifugu_rubripes
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 4258 bases
Position: chr8:8880142-8884399
Accession: 101079742
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSTRUP00000016904	Aconitase	PF00330.20	1.5e-165	1	1
ENSTRUP00000016904	Aconitase_C	PF00694.19	1.2e-42	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSTRUT00000016977	-	2625	XM_003966729	ENSTRUP00000016904	875 (aa)	XP_003966778	H2SWW6

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSTRUG00000006888	aco1	99	59.947	ENSTRUG00000015902	ireb2	91	59.814

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSTRUG00000006888	aco1	99	81.695	ENSG00000122729	ACO1	99	81.582	Homo_sapiens
ENSTRUG00000006888	aco1	100	86.420	ENSAPOG00000008670	aco1	99	86.308	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTRUG00000006888	aco1	99	81.264	ENSAMEG00000003746	ACO1	99	81.377	Ailuropoda_melanoleuca
ENSTRUG00000006888	aco1	100	85.410	ENSACIG00000014377	aco1	99	85.522	Amphilophus_citrinellus
ENSTRUG00000006888	aco1	100	86.981	ENSAOCG00000007699	aco1	99	87.093	Amphiprion_ocellaris
ENSTRUG00000006888	aco1	100	86.981	ENSAPEG00000014370	aco1	99	87.093	Amphiprion_percula
ENSTRUG00000006888	aco1	100	87.093	ENSATEG00000000560	aco1	99	87.205	Anabas_testudineus
ENSTRUG00000006888	aco1	99	80.113	ENSAPLG00000015490	ACO1	99	80.226	Anas_platyrhynchos
ENSTRUG00000006888	aco1	98	79.538	ENSACAG00000001541	ACO1	99	79.653	Anolis_carolinensis
ENSTRUG00000006888	aco1	99	80.678	ENSANAG00000003359	ACO1	99	80.565	Aotus_nancymaae
ENSTRUG00000006888	aco1	100	86.308	ENSACLG00000007755	aco1	99	86.420	Astatotilapia_calliptera
ENSTRUG00000006888	aco1	99	83.390	ENSAMXG00000002499	aco1	99	83.503	Astyanax_mexicanus
ENSTRUG00000006888	aco1	99	81.356	ENSBTAG00000000555	ACO1	99	81.469	Bos_taurus
ENSTRUG00000006888	aco1	99	80.565	ENSCJAG00000007687	ACO1	99	80.678	Callithrix_jacchus
ENSTRUG00000006888	aco1	99	81.038	ENSCAFG00000001786	ACO1	98	81.151	Canis_familiaris
ENSTRUG00000006888	aco1	99	81.130	ENSCAFG00020014553	ACO1	99	81.243	Canis_lupus_dingo
ENSTRUG00000006888	aco1	99	81.469	ENSCHIG00000007667	ACO1	99	81.582	Capra_hircus
ENSTRUG00000006888	aco1	99	81.469	ENSTSYG00000004179	ACO1	99	81.582	Carlito_syrichta
ENSTRUG00000006888	aco1	99	66.025	ENSCAPG00000007254	ACO1	99	66.025	Cavia_aperea
ENSTRUG00000006888	aco1	99	81.151	ENSCPOG00000003768	ACO1	99	81.038	Cavia_porcellus
ENSTRUG00000006888	aco1	99	80.339	ENSCCAG00000022465	ACO1	99	80.452	Cebus_capucinus
ENSTRUG00000006888	aco1	99	81.695	ENSCATG00000045333	ACO1	99	81.582	Cercocebus_atys
ENSTRUG00000006888	aco1	99	80.700	ENSCLAG00000002487	ACO1	99	80.813	Chinchilla_lanigera
ENSTRUG00000006888	aco1	99	81.469	ENSCSAG00000009824	ACO1	99	81.356	Chlorocebus_sabaeus
ENSTRUG00000006888	aco1	77	95.556	ENSCHOG00000008996	ACO1	76	95.556	Choloepus_hoffmanni
ENSTRUG00000006888	aco1	99	81.469	ENSCPBG00000008077	ACO1	99	81.582	Chrysemys_picta_bellii
ENSTRUG00000006888	aco1	99	81.469	ENSCANG00000014847	ACO1	99	81.356	Colobus_angolensis_palliatus
ENSTRUG00000006888	aco1	99	81.941	ENSCGRG00001024337	Aco1	99	82.054	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSTRUG00000006888	aco1	99	81.151	ENSCGRG00000004877	-	99	81.264	Cricetulus_griseus_crigri
ENSTRUG00000006888	aco1	100	83.389	ENSCSEG00000018262	aco1	99	83.502	Cynoglossus_semilaevis
ENSTRUG00000006888	aco1	100	79.775	ENSCVAG00000020264	aco1	99	79.888	Cyprinodon_variegatus
ENSTRUG00000006888	aco1	99	83.955	ENSDARG00000026376	aco1	99	84.068	Danio_rerio
ENSTRUG00000006888	aco1	99	81.243	ENSDNOG00000003951	ACO1	99	81.356	Dasypus_novemcinctus
ENSTRUG00000006888	aco1	99	82.506	ENSDORG00000014246	Aco1	99	82.393	Dipodomys_ordii
ENSTRUG00000006888	aco1	79	66.667	ENSETEG00000012415	-	78	66.667	Echinops_telfairi
ENSTRUG00000006888	aco1	99	55.882	ENSEBUG00000015441	aco1	98	55.777	Eptatretus_burgeri
ENSTRUG00000006888	aco1	99	81.808	ENSEASG00005004602	ACO1	99	81.921	Equus_asinus_asinus
ENSTRUG00000006888	aco1	99	81.695	ENSECAG00000014846	ACO1	99	81.808	Equus_caballus
ENSTRUG00000006888	aco1	99	70.169	ENSEEUG00000015174	ACO1	99	70.282	Erinaceus_europaeus
ENSTRUG00000006888	aco1	99	82.938	ENSELUG00000016812	aco1	97	83.051	Esox_lucius
ENSTRUG00000006888	aco1	99	80.904	ENSFCAG00000001293	ACO1	99	81.017	Felis_catus
ENSTRUG00000006888	aco1	99	80.452	ENSFALG00000001167	ACO1	99	80.565	Ficedula_albicollis
ENSTRUG00000006888	aco1	99	81.151	ENSFDAG00000016058	ACO1	99	81.264	Fukomys_damarensis
ENSTRUG00000006888	aco1	100	84.400	ENSFHEG00000005619	aco1	99	84.572	Fundulus_heteroclitus
ENSTRUG00000006888	aco1	100	81.236	ENSGMOG00000005514	aco1	99	81.348	Gadus_morhua
ENSTRUG00000006888	aco1	99	80.113	ENSGALG00000002162	ACO1	99	80.226	Gallus_gallus
ENSTRUG00000006888	aco1	100	84.961	ENSGACG00000001637	aco1	99	85.073	Gasterosteus_aculeatus
ENSTRUG00000006888	aco1	99	81.243	ENSGAGG00000023315	ACO1	99	81.356	Gopherus_agassizii
ENSTRUG00000006888	aco1	99	81.695	ENSGGOG00000016306	ACO1	99	81.582	Gorilla_gorilla
ENSTRUG00000006888	aco1	100	86.420	ENSHBUG00000008952	aco1	99	86.532	Haplochromis_burtoni
ENSTRUG00000006888	aco1	99	81.151	ENSHGLG00000018922	Aco1	99	81.264	Heterocephalus_glaber_female
ENSTRUG00000006888	aco1	99	81.151	ENSHGLG00100000149	Aco1	99	81.264	Heterocephalus_glaber_male
ENSTRUG00000006888	aco1	100	83.053	ENSHCOG00000015881	aco1	99	83.165	Hippocampus_comes
ENSTRUG00000006888	aco1	99	82.599	ENSIPUG00000020088	ACO1	99	82.712	Ictalurus_punctatus
ENSTRUG00000006888	aco1	99	82.280	ENSSTOG00000006942	ACO1	99	82.393	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSTRUG00000006888	aco1	99	81.716	ENSJJAG00000013824	Aco1	99	81.828	Jaculus_jaculus
ENSTRUG00000006888	aco1	100	85.746	ENSKMAG00000015759	aco1	99	85.859	Kryptolebias_marmoratus
ENSTRUG00000006888	aco1	100	82.604	ENSLBEG00000013866	aco1	99	82.716	Labrus_bergylta
ENSTRUG00000006888	aco1	75	69.539	ENSLACG00000000936	ACO1	99	69.403	Latimeria_chalumnae
ENSTRUG00000006888	aco1	99	81.921	ENSLOCG00000011082	aco1	99	82.034	Lepisosteus_oculatus
ENSTRUG00000006888	aco1	99	79.887	ENSLAFG00000013470	ACO1	99	79.774	Loxodonta_africana
ENSTRUG00000006888	aco1	99	81.469	ENSMFAG00000001702	ACO1	99	81.356	Macaca_fascicularis
ENSTRUG00000006888	aco1	99	81.582	ENSMMUG00000008196	ACO1	99	81.469	Macaca_mulatta
ENSTRUG00000006888	aco1	99	81.356	ENSMNEG00000045040	ACO1	99	81.243	Macaca_nemestrina
ENSTRUG00000006888	aco1	99	81.808	ENSMLEG00000005636	ACO1	99	81.695	Mandrillus_leucophaeus
ENSTRUG00000006888	aco1	99	87.191	ENSMAMG00000002915	aco1	99	87.303	Mastacembelus_armatus
ENSTRUG00000006888	aco1	100	84.459	ENSMZEG00005012733	aco1	99	84.459	Maylandia_zebra
ENSTRUG00000006888	aco1	99	66.592	ENSMGAG00000008851	ACO1	99	66.704	Meleagris_gallopavo
ENSTRUG00000006888	aco1	99	81.716	ENSMAUG00000021408	Aco1	99	81.828	Mesocricetus_auratus
ENSTRUG00000006888	aco1	99	81.017	ENSMICG00000006540	ACO1	99	81.130	Microcebus_murinus
ENSTRUG00000006888	aco1	99	81.828	ENSMOCG00000015393	Aco1	99	81.941	Microtus_ochrogaster
ENSTRUG00000006888	aco1	99	86.005	ENSMMOG00000020282	aco1	99	86.117	Mola_mola
ENSTRUG00000006888	aco1	99	80.452	ENSMODG00000004463	ACO1	99	80.565	Monodelphis_domestica
ENSTRUG00000006888	aco1	100	86.532	ENSMALG00000019764	aco1	99	86.644	Monopterus_albus
ENSTRUG00000006888	aco1	99	82.280	MGP_CAROLIEiJ_G0025892	Aco1	99	82.393	Mus_caroli
ENSTRUG00000006888	aco1	99	82.280	ENSMUSG00000028405	Aco1	99	82.393	Mus_musculus
ENSTRUG00000006888	aco1	99	82.054	MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	99	82.167	Mus_pahari
ENSTRUG00000006888	aco1	99	82.280	MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	99	82.393	Mus_spretus
ENSTRUG00000006888	aco1	99	81.921	ENSMPUG00000004340	ACO1	99	82.034	Mustela_putorius_furo
ENSTRUG00000006888	aco1	99	80.226	ENSMLUG00000003029	ACO1	99	80.339	Myotis_lucifugus
ENSTRUG00000006888	aco1	99	81.603	ENSNGAG00000005703	Aco1	99	81.716	Nannospalax_galili
ENSTRUG00000006888	aco1	100	69.619	ENSNBRG00000008973	aco1	99	69.507	Neolamprologus_brichardi
ENSTRUG00000006888	aco1	99	81.356	ENSNLEG00000003409	ACO1	99	81.243	Nomascus_leucogenys
ENSTRUG00000006888	aco1	79	82.593	ENSMEUG00000014756	ACO1	79	82.963	Notamacropus_eugenii
ENSTRUG00000006888	aco1	99	77.853	ENSOPRG00000016791	ACO1	99	77.740	Ochotona_princeps
ENSTRUG00000006888	aco1	99	76.610	ENSODEG00000015432	-	99	76.384	Octodon_degus
ENSTRUG00000006888	aco1	99	79.342	ENSODEG00000001240	-	99	79.455	Octodon_degus
ENSTRUG00000006888	aco1	100	86.532	ENSONIG00000019869	aco1	99	86.644	Oreochromis_niloticus
ENSTRUG00000006888	aco1	81	81.502	ENSOANG00000012132	ACO1	99	81.641	Ornithorhynchus_anatinus
ENSTRUG00000006888	aco1	99	81.006	ENSOCUG00000015960	ACO1	99	80.670	Oryctolagus_cuniculus
ENSTRUG00000006888	aco1	99	87.246	ENSORLG00000020656	aco1	99	87.359	Oryzias_latipes
ENSTRUG00000006888	aco1	99	87.133	ENSORLG00020010991	aco1	99	87.246	Oryzias_latipes_hni
ENSTRUG00000006888	aco1	100	86.756	ENSORLG00015011785	aco1	99	86.869	Oryzias_latipes_hsok
ENSTRUG00000006888	aco1	100	84.287	ENSOMEG00000000660	aco1	99	84.400	Oryzias_melastigma
ENSTRUG00000006888	aco1	99	81.582	ENSOGAG00000010522	ACO1	99	81.469	Otolemur_garnettii
ENSTRUG00000006888	aco1	99	81.236	ENSOARG00000014707	ACO1	98	81.348	Ovis_aries
ENSTRUG00000006888	aco1	99	81.695	ENSPPAG00000033498	ACO1	99	81.582	Pan_paniscus
ENSTRUG00000006888	aco1	99	81.017	ENSPPRG00000009875	ACO1	99	81.130	Panthera_pardus
ENSTRUG00000006888	aco1	99	80.674	ENSPTIG00000016606	ACO1	98	80.787	Panthera_tigris_altaica
ENSTRUG00000006888	aco1	99	81.695	ENSPTRG00000020843	ACO1	99	81.582	Pan_troglodytes
ENSTRUG00000006888	aco1	99	81.808	ENSPANG00000025270	ACO1	99	81.695	Papio_anubis
ENSTRUG00000006888	aco1	100	80.920	ENSPKIG00000023168	aco1	99	81.033	Paramormyrops_kingsleyae
ENSTRUG00000006888	aco1	99	80.791	ENSPSIG00000008030	ACO1	99	80.904	Pelodiscus_sinensis
ENSTRUG00000006888	aco1	100	85.746	ENSPMGG00000020708	aco1	99	85.859	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSTRUG00000006888	aco1	99	82.054	ENSPEMG00000018464	Aco1	99	82.167	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSTRUG00000006888	aco1	99	79.548	ENSPCIG00000029321	ACO1	99	80.440	Phascolarctos_cinereus
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