EuRBPDB

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Description

Ensembl ID: ENSTRUG00000008052 (Gene tree)
Gene ID: 101078091
Gene Symbol: ago4
Alias: Ago4|eif2c4|fd14f04|wu:fd14f04
Full Name: argonaute 4%2C RISC catalytic component
Gene Type: protein_coding
Species: Takifugu_rubripes
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 12564 bases
Position: chr12:7832585-7845148
Accession: 101078091
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSTRUP00000020088	PAZ	PF02170.22	1.7e-28	1	1
ENSTRUP00000020088	Piwi	PF02171.17	9.9e-106	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSTRUT00000020170	-	2922	XM_003969181	ENSTRUP00000020088	874 (aa)	XP_003969230	H2T5Z9

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSTRUG00000008052	ago4	92	78.993	ENSTRUG00000005992	ago3a	100	78.993
ENSTRUG00000008052	ago4	97	76.353	ENSTRUG00000007370	ago2	98	80.545
ENSTRUG00000008052	ago4	99	81.342	ENSTRUG00000024431	ago1	100	82.469
ENSTRUG00000008052	ago4	99	79.679	ENSTRUG00000012737	-	99	79.679

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSTRUG00000008052	ago4	100	95.995	ENSG00000134698	AGO4	100	95.995	Homo_sapiens
ENSTRUG00000008052	ago4	96	99.642	ENSAPOG00000023867	ago4	99	99.642	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTRUG00000008052	ago4	99	95.528	ENSAMEG00000000573	AGO4	100	95.528	Ailuropoda_melanoleuca
ENSTRUG00000008052	ago4	92	98.385	ENSACIG00000014548	ago4	100	98.385	Amphilophus_citrinellus
ENSTRUG00000008052	ago4	92	93.913	ENSAPEG00000022426	ago4	100	93.913	Amphiprion_percula
ENSTRUG00000008052	ago4	100	99.657	ENSATEG00000006717	ago4	100	99.752	Anabas_testudineus
ENSTRUG00000008052	ago4	98	96.154	ENSAPLG00000010882	AGO4	100	96.154	Anas_platyrhynchos
ENSTRUG00000008052	ago4	99	94.954	ENSACAG00000017275	AGO4	99	94.954	Anolis_carolinensis
ENSTRUG00000008052	ago4	100	95.881	ENSANAG00000031428	AGO4	100	95.881	Aotus_nancymaae
ENSTRUG00000008052	ago4	100	99.542	ENSACLG00000005181	ago4	100	99.542	Astatotilapia_calliptera
ENSTRUG00000008052	ago4	100	99.199	ENSAMXG00000010318	ago4	100	99.199	Astyanax_mexicanus
ENSTRUG00000008052	ago4	99	95.293	ENSBTAG00000015220	AGO4	99	95.293	Bos_taurus
ENSTRUG00000008052	ago4	100	95.995	ENSCJAG00000001610	AGO4	100	95.995	Callithrix_jacchus
ENSTRUG00000008052	ago4	92	96.149	ENSCAFG00000024306	AGO4	100	96.149	Canis_familiaris
ENSTRUG00000008052	ago4	100	96.110	ENSCHIG00000026564	AGO4	100	96.110	Capra_hircus
ENSTRUG00000008052	ago4	99	96.181	ENSTSYG00000014007	AGO4	99	96.181	Carlito_syrichta
ENSTRUG00000008052	ago4	94	90.870	ENSCAPG00000009369	AGO4	100	90.870	Cavia_aperea
ENSTRUG00000008052	ago4	99	93.700	ENSCPOG00000011557	AGO4	99	93.700	Cavia_porcellus
ENSTRUG00000008052	ago4	100	95.995	ENSCCAG00000001397	AGO4	100	95.995	Cebus_capucinus
ENSTRUG00000008052	ago4	100	95.995	ENSCATG00000043421	AGO4	100	97.674	Cercocebus_atys
ENSTRUG00000008052	ago4	99	95.949	ENSCLAG00000012097	AGO4	99	95.949	Chinchilla_lanigera
ENSTRUG00000008052	ago4	100	95.995	ENSCSAG00000001090	AGO4	100	95.995	Chlorocebus_sabaeus
ENSTRUG00000008052	ago4	80	97.640	ENSCHOG00000006867	AGO4	81	97.640	Choloepus_hoffmanni
ENSTRUG00000008052	ago4	99	95.968	ENSCPBG00000018602	AGO4	98	95.968	Chrysemys_picta_bellii
ENSTRUG00000008052	ago4	99	95.968	ENSCANG00000016914	AGO4	100	95.968	Colobus_angolensis_palliatus
ENSTRUG00000008052	ago4	100	95.423	ENSCGRG00001002701	Ago4	100	95.423	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSTRUG00000008052	ago4	99	95.602	ENSCGRG00000013335	Ago4	99	95.602	Cricetulus_griseus_crigri
ENSTRUG00000008052	ago4	92	92.069	ENSCSEG00000010696	ago4	100	92.069	Cynoglossus_semilaevis
ENSTRUG00000008052	ago4	100	98.169	ENSDARG00000100854	ago4	100	98.169	Danio_rerio
ENSTRUG00000008052	ago4	100	95.881	ENSDNOG00000015674	AGO4	100	95.881	Dasypus_novemcinctus
ENSTRUG00000008052	ago4	100	95.995	ENSDORG00000008933	Ago4	100	95.995	Dipodomys_ordii
ENSTRUG00000008052	ago4	59	97.044	ENSETEG00000018390	AGO4	83	97.044	Echinops_telfairi
ENSTRUG00000008052	ago4	100	95.995	ENSEASG00005012079	AGO4	100	95.995	Equus_asinus_asinus
ENSTRUG00000008052	ago4	100	95.995	ENSECAG00000024686	AGO4	100	95.995	Equus_caballus
ENSTRUG00000008052	ago4	78	93.333	ENSEEUG00000000745	AGO4	79	93.333	Erinaceus_europaeus
ENSTRUG00000008052	ago4	100	98.747	ENSELUG00000023873	ago4	100	98.747	Esox_lucius
ENSTRUG00000008052	ago4	100	95.881	ENSFCAG00000006218	AGO4	100	95.881	Felis_catus
ENSTRUG00000008052	ago4	99	96.181	ENSFDAG00000021483	AGO4	99	96.181	Fukomys_damarensis
ENSTRUG00000008052	ago4	97	88.784	ENSFHEG00000019658	ago4	100	88.784	Fundulus_heteroclitus
ENSTRUG00000008052	ago4	99	97.471	ENSGMOG00000009544	ago4	99	97.471	Gadus_morhua
ENSTRUG00000008052	ago4	100	95.995	ENSGALG00000039713	AGO4	100	96.149	Gallus_gallus
ENSTRUG00000008052	ago4	100	99.314	ENSGAFG00000017239	ago4	100	99.314	Gambusia_affinis
ENSTRUG00000008052	ago4	99	98.048	ENSGACG00000002683	ago4	99	98.048	Gasterosteus_aculeatus
ENSTRUG00000008052	ago4	92	96.149	ENSGAGG00000012897	AGO4	100	96.149	Gopherus_agassizii
ENSTRUG00000008052	ago4	99	92.807	ENSGGOG00000036532	AGO4	100	92.807	Gorilla_gorilla
ENSTRUG00000008052	ago4	100	99.542	ENSHBUG00000001525	ago4	100	99.542	Haplochromis_burtoni
ENSTRUG00000008052	ago4	100	95.995	ENSHGLG00000010241	AGO4	100	95.995	Heterocephalus_glaber_female
ENSTRUG00000008052	ago4	99	96.167	ENSHGLG00100005233	AGO4	99	96.167	Heterocephalus_glaber_male
ENSTRUG00000008052	ago4	100	99.428	ENSHCOG00000003725	ago4	100	99.428	Hippocampus_comes
ENSTRUG00000008052	ago4	100	99.199	ENSIPUG00000015600	ago4	100	99.199	Ictalurus_punctatus
ENSTRUG00000008052	ago4	99	95.991	ENSSTOG00000004725	AGO4	100	95.991	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSTRUG00000008052	ago4	100	99.428	ENSKMAG00000018602	ago4	100	99.428	Kryptolebias_marmoratus
ENSTRUG00000008052	ago4	100	98.864	ENSLBEG00000010670	ago4	100	98.864	Labrus_bergylta
ENSTRUG00000008052	ago4	100	96.339	ENSLACG00000016888	AGO4	100	96.339	Latimeria_chalumnae
ENSTRUG00000008052	ago4	100	98.970	ENSLOCG00000000584	ago4	100	98.970	Lepisosteus_oculatus
ENSTRUG00000008052	ago4	93	95.567	ENSLAFG00000010394	AGO4	100	95.567	Loxodonta_africana
ENSTRUG00000008052	ago4	100	95.995	ENSMFAG00000035543	AGO4	100	95.995	Macaca_fascicularis
ENSTRUG00000008052	ago4	99	95.752	ENSMMUG00000003343	AGO4	100	96.825	Macaca_mulatta
ENSTRUG00000008052	ago4	100	95.995	ENSMNEG00000037723	AGO4	100	96.825	Macaca_nemestrina
ENSTRUG00000008052	ago4	99	96.065	ENSMLEG00000039490	AGO4	99	96.065	Mandrillus_leucophaeus
ENSTRUG00000008052	ago4	100	99.542	ENSMAMG00000003874	ago4	100	99.730	Mastacembelus_armatus
ENSTRUG00000008052	ago4	100	99.542	ENSMZEG00005026346	ago4	100	99.542	Maylandia_zebra
ENSTRUG00000008052	ago4	99	95.622	ENSMGAG00000003851	AGO4	99	95.622	Meleagris_gallopavo
ENSTRUG00000008052	ago4	83	97.122	ENSMAUG00000021743	Ago4	97	94.454	Mesocricetus_auratus
ENSTRUG00000008052	ago4	99	95.838	ENSMICG00000033507	AGO4	99	95.838	Microcebus_murinus
ENSTRUG00000008052	ago4	100	95.538	ENSMOCG00000005772	Ago4	100	95.538	Microtus_ochrogaster
ENSTRUG00000008052	ago4	92	96.894	ENSMMOG00000013473	ago4	100	96.894	Mola_mola
ENSTRUG00000008052	ago4	100	96.110	ENSMODG00000017888	AGO4	100	96.110	Monodelphis_domestica
ENSTRUG00000008052	ago4	99	96.313	ENSMALG00000011797	ago4	99	96.313	Monopterus_albus
ENSTRUG00000008052	ago4	100	95.195	MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	100	95.195	Mus_caroli
ENSTRUG00000008052	ago4	100	94.966	ENSMUSG00000042500	Ago4	100	94.966	Mus_musculus
ENSTRUG00000008052	ago4	100	94.737	MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	100	94.737	Mus_pahari
ENSTRUG00000008052	ago4	100	94.966	MGP_SPRETEiJ_G0027458	Ago4	100	94.966	Mus_spretus
ENSTRUG00000008052	ago4	92	96.149	ENSMPUG00000014876	AGO4	100	96.149	Mustela_putorius_furo
ENSTRUG00000008052	ago4	99	95.512	ENSMLUG00000017102	AGO4	98	95.512	Myotis_lucifugus
ENSTRUG00000008052	ago4	99	96.181	ENSNGAG00000020544	Ago4	99	96.181	Nannospalax_galili
ENSTRUG00000008052	ago4	100	99.542	ENSNBRG00000013492	ago4	100	99.542	Neolamprologus_brichardi
ENSTRUG00000008052	ago4	99	96.065	ENSNLEG00000011125	AGO4	99	96.065	Nomascus_leucogenys
ENSTRUG00000008052	ago4	88	95.679	ENSMEUG00000001023	AGO4	90	95.679	Notamacropus_eugenii
ENSTRUG00000008052	ago4	99	89.005	ENSOPRG00000012309	AGO4	99	89.005	Ochotona_princeps
ENSTRUG00000008052	ago4	93	96.044	ENSODEG00000006355	AGO4	97	96.044	Octodon_degus
ENSTRUG00000008052	ago4	100	99.542	ENSONIG00000013603	ago4	100	99.542	Oreochromis_niloticus
ENSTRUG00000008052	ago4	92	96.273	ENSOANG00000002082	AGO4	100	96.273	Ornithorhynchus_anatinus
ENSTRUG00000008052	ago4	100	95.881	ENSOCUG00000004076	AGO4	100	95.881	Oryctolagus_cuniculus
ENSTRUG00000008052	ago4	100	99.657	ENSORLG00000009865	ago4	92	99.657	Oryzias_latipes
ENSTRUG00000008052	ago4	100	99.657	ENSORLG00020016978	ago4	92	99.657	Oryzias_latipes_hni
ENSTRUG00000008052	ago4	100	99.657	ENSORLG00015008800	ago4	92	99.657	Oryzias_latipes_hsok
ENSTRUG00000008052	ago4	100	99.657	ENSOMEG00000006399	ago4	100	99.657	Oryzias_melastigma
ENSTRUG00000008052	ago4	100	87.643	ENSOGAG00000027107	-	100	87.643	Otolemur_garnettii
ENSTRUG00000008052	ago4	93	95.185	ENSOGAG00000004233	-	100	95.185	Otolemur_garnettii
ENSTRUG00000008052	ago4	99	95.298	ENSOARG00000019568	AGO4	98	95.298	Ovis_aries
ENSTRUG00000008052	ago4	99	96.065	ENSPPAG00000031752	AGO4	99	96.065	Pan_paniscus
ENSTRUG00000008052	ago4	100	95.881	ENSPPRG00000006520	AGO4	100	95.881	Panthera_pardus
ENSTRUG00000008052	ago4	99	96.065	ENSPTIG00000020262	AGO4	99	96.065	Panthera_tigris_altaica
ENSTRUG00000008052	ago4	100	95.995	ENSPTRG00000000527	AGO4	100	95.995	Pan_troglodytes
ENSTRUG00000008052	ago4	92	96.149	ENSPANG00000007232	AGO4	100	96.149	Papio_anubis
ENSTRUG00000008052	ago4	100	98.970	ENSPKIG00000022598	ago4	100	98.970	Paramormyrops_kingsleyae
ENSTRUG00000008052	ago4	99	95.968	ENSPSIG00000013832	AGO4	99	95.968	Pelodiscus_sinensis
ENSTRUG00000008052	ago4	92	98.261	ENSPMGG00000023325	ago4	100	98.261	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSTRUG00000008052	ago4	89	97.143	ENSPEMG00000022651	-	97	97.143	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSTRUG00000008052	ago4	100	96.110	ENSPCIG00000000092	AGO4	100	96.110	Phascolarctos_cinereus
ENSTRUG00000008052	ago4	100	99.428	ENSPFOG00000001935	ago4	100	99.428	Poecilia_formosa
ENSTRUG00000008052	ago4	100	98.169	ENSPLAG00000011534	ago4	100	98.169	Poecilia_latipinna
ENSTRUG00000008052	ago4	100	99.428	ENSPMEG00000005049	ago4	100	99.428	Poecilia_mexicana
ENSTRUG00000008052	ago4	100	99.428	ENSPREG00000010315	ago4	100	99.428	Poecilia_reticulata
ENSTRUG00000008052	ago4	99	96.065	ENSPPYG00000001552	AGO4	99	96.065	Pongo_abelii
ENSTRUG00000008052	ago4	99	95.954	ENSPCOG00000015935	AGO4	99	95.954	Propithecus_coquereli
ENSTRUG00000008052	ago4	87	96.970	ENSPVAG00000005079	AGO4	88	96.970	Pteropus_vampyrus
ENSTRUG00000008052	ago4	100	99.542	ENSPNYG00000002089	ago4	100	99.542	Pundamilia_nyererei
ENSTRUG00000008052	ago4	100	97.368	ENSPNAG00000005191	ago4	100	97.368	Pygocentrus_nattereri
ENSTRUG00000008052	ago4	70	95.230	ENSRNOG00000025596	Ago4	100	95.230	Rattus_norvegicus
ENSTRUG00000008052	ago4	99	95.012	ENSRBIG00000040185	AGO4	100	96.825	Rhinopithecus_bieti
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ENSTRUG00000008052	ago4	99	95.423	ENSSHAG00000017320	AGO4	99	95.423	Sarcophilus_harrisii
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ENSTRUG00000008052	ago4	100	96.983	ENSSMAG00000000808	ago4	93	98.814	Scophthalmus_maximus
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ENSTRUG00000008052	ago4	77	97.257	ENSSARG00000011504	AGO4	79	97.257	Sorex_araneus
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ENSTRUG00000008052	ago4	92	96.149	ENSVVUG00000000465	-	100	96.149	Vulpes_vulpes
ENSTRUG00000008052	ago4	100	82.326	ENSXETG00000009664	ago4	100	82.326	Xenopus_tropicalis
ENSTRUG00000008052	ago4	100	99.428	ENSXMAG00000016657	ago4	100	99.428	Xiphophorus_maculatus