EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSTRUG00000016422 (Gene tree)
Gene ID: 101074480
Gene Symbol: eftud2
Alias: wu:fi20f05|zgc:66214
Full Name: elongation factor Tu GTP binding domain containing 2
Gene Type: protein_coding
Species: Takifugu_rubripes
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 9749 bases
Position: chr5:10358991-10368739
Accession: 101074480
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSTRUP00000041976	GTP_EFTU	PF00009.27	1.1e-43	1	1
ENSTRUP00000041976	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	2e-12	1	1
ENSTRUP00000041976	EFG_IV	PF03764.18	8.9e-25	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSTRUT00000042120	-	3644	XM_003964812	ENSTRUP00000041976	971 (aa)	XP_003964861	H2UYE7

Gene Model

Click here to download ENSTRUG00000016422's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
tru03040	Spliceosome	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSTRUG00000016422's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSTRUG00000016422	eftud2	86	37.688	ENSTRUG00000017921	-	98	37.688

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	91.255	ENSG00000108883	EFTUD2	100	100.000	Homo_sapiens
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	97.013	ENSAPOG00000002433	eftud2	100	97.013	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	91.152	ENSAMEG00000018390	EFTUD2	100	91.358	Ailuropoda_melanoleuca
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	93.100	ENSACIG00000009096	eftud2	100	93.100	Amphilophus_citrinellus
ENSTRUG00000016422	eftud2	88	90.471	ENSAOCG00000023385	eftud2	100	90.471	Amphiprion_ocellaris
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	96.807	ENSAPEG00000003321	eftud2	100	96.807	Amphiprion_percula
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	96.910	ENSATEG00000000457	eftud2	100	96.910	Anabas_testudineus
ENSTRUG00000016422	eftud2	99	87.951	ENSAPLG00000011036	EFTUD2	99	88.157	Anas_platyrhynchos
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	90.535	ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	90.947	Anolis_carolinensis
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	91.255	ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	91.461	Aotus_nancymaae
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	96.704	ENSACLG00000001296	eftud2	100	96.704	Astatotilapia_calliptera
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	93.040	ENSAMXG00000000568	eftud2	100	93.040	Astyanax_mexicanus
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	91.152	ENSBTAG00000013526	EFTUD2	100	91.358	Bos_taurus
ENSTRUG00000016422	eftud2	99	70.175	WBGene00001166	eftu-2	99	69.731	Caenorhabditis_elegans
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	91.255	ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	91.461	Callithrix_jacchus
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	91.152	ENSCAFG00000014065	EFTUD2	100	91.358	Canis_familiaris
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	91.152	ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	91.358	Canis_lupus_dingo
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	91.152	ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	91.358	Capra_hircus
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	91.255	ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	91.461	Carlito_syrichta
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	91.255	ENSCAPG00000014639	EFTUD2	100	91.358	Cavia_aperea
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	91.255	ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	91.358	Cavia_porcellus
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	91.255	ENSCCAG00000035302	EFTUD2	100	91.461	Cebus_capucinus
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	91.255	ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	91.461	Cercocebus_atys
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	91.152	ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	91.255	Chinchilla_lanigera
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	91.255	ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	91.461	Chlorocebus_sabaeus
ENSTRUG00000016422	eftud2	91	80.068	ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	80.068	Choloepus_hoffmanni
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	91.358	ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	91.564	Chrysemys_picta_bellii
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	77.926	ENSCING00000009372	-	100	77.515	Ciona_intestinalis
ENSTRUG00000016422	eftud2	99	77.732	ENSCSAVG00000004985	-	99	79.245	Ciona_savignyi
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	91.255	ENSCANG00000026557	EFTUD2	100	91.461	Colobus_angolensis_palliatus
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	90.947	ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	91.049	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	90.947	ENSCGRG00000003825	Eftud2	100	91.049	Cricetulus_griseus_crigri
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	96.498	ENSCSEG00000016775	eftud2	100	96.498	Cynoglossus_semilaevis
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	95.984	ENSCVAG00000012537	eftud2	100	95.984	Cyprinodon_variegatus
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	93.628	ENSDARG00000012261	eftud2	100	93.628	Danio_rerio
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	91.152	ENSDNOG00000008033	EFTUD2	100	91.358	Dasypus_novemcinctus
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	91.049	ENSDORG00000011566	Eftud2	100	91.152	Dipodomys_ordii
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	73.900	FBgn0039566	CG4849	100	73.846	Drosophila_melanogaster
ENSTRUG00000016422	eftud2	92	97.826	ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	97.826	Echinops_telfairi
ENSTRUG00000016422	eftud2	74	93.532	ENSEBUG00000004047	-	96	86.926	Eptatretus_burgeri
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	91.152	ENSEASG00005010321	EFTUD2	100	91.358	Equus_asinus_asinus
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	91.049	ENSECAG00000019363	EFTUD2	93	91.255	Equus_caballus
ENSTRUG00000016422	eftud2	83	99.153	ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	99.153	Erinaceus_europaeus
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	93.306	ENSELUG00000017169	eftud2	100	92.894	Esox_lucius
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	91.049	ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	91.255	Felis_catus
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	91.049	ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	91.152	Ficedula_albicollis
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	91.255	ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	91.358	Fukomys_damarensis
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	96.087	ENSFHEG00000013479	eftud2	100	96.087	Fundulus_heteroclitus
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	94.027	ENSGMOG00000014277	eftud2	100	94.027	Gadus_morhua
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	90.947	ENSGALG00000000988	EFTUD2	99	92.935	Gallus_gallus
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	95.881	ENSGAFG00000002263	eftud2	100	95.881	Gambusia_affinis
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	96.395	ENSGACG00000009163	eftud2	100	96.395	Gasterosteus_aculeatus
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	91.255	ENSGGOG00000012999	EFTUD2	100	91.461	Gorilla_gorilla
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	96.601	ENSHBUG00000023546	eftud2	100	96.601	Haplochromis_burtoni
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	91.152	ENSHGLG00000014497	EFTUD2	100	91.152	Heterocephalus_glaber_female
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	91.152	ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	91.152	Heterocephalus_glaber_male
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	97.016	ENSHCOG00000017689	eftud2	100	97.016	Hippocampus_comes
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	93.512	ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	93.512	Ictalurus_punctatus
ENSTRUG00000016422	eftud2	91	92.230	ENSSTOG00000012188	EFTUD2	99	90.055	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSTRUG00000016422	eftud2	95	92.935	ENSJJAG00000018268	Eftud2	98	92.935	Jaculus_jaculus
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	96.087	ENSKMAG00000021027	eftud2	100	96.087	Kryptolebias_marmoratus
ENSTRUG00000016422	eftud2	95	96.436	ENSLBEG00000005875	eftud2	100	95.765	Labrus_bergylta
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	92.585	ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	92.585	Latimeria_chalumnae
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	93.203	ENSLOCG00000011460	eftud2	100	92.894	Lepisosteus_oculatus
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	91.049	ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	91.152	Loxodonta_africana
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	91.255	ENSMFAG00000042655	EFTUD2	100	91.461	Macaca_fascicularis
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	91.255	ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	Macaca_mulatta
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	91.255	ENSMNEG00000037895	EFTUD2	100	91.461	Macaca_nemestrina
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	91.255	ENSMLEG00000032960	EFTUD2	100	91.461	Mandrillus_leucophaeus
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	96.704	ENSMAMG00000022190	eftud2	100	96.704	Mastacembelus_armatus
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	96.704	ENSMZEG00005022885	eftud2	100	96.704	Maylandia_zebra
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	90.760	ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	90.965	Meleagris_gallopavo
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	91.049	ENSMAUG00000021178	Eftud2	100	91.152	Mesocricetus_auratus
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	91.255	ENSMICG00000016592	EFTUD2	100	91.461	Microcebus_murinus
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	91.049	ENSMOCG00000009039	-	100	91.152	Microtus_ochrogaster
ENSTRUG00000016422	eftud2	92	74.607	ENSMOCG00000017653	-	90	74.719	Microtus_ochrogaster
ENSTRUG00000016422	eftud2	88	97.176	ENSMMOG00000020811	eftud2	100	97.176	Mola_mola
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	91.255	ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	91.461	Monodelphis_domestica
ENSTRUG00000016422	eftud2	88	95.176	ENSMALG00000014501	eftud2	100	95.176	Monopterus_albus
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	90.947	MGP_CAROLIEiJ_G0017263	Eftud2	100	91.049	Mus_caroli
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	91.143	ENSMUSG00000020929	Eftud2	100	91.143	Mus_musculus
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	90.947	MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	91.049	Mus_pahari
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	90.947	MGP_SPRETEiJ_G0018106	Eftud2	100	91.049	Mus_spretus
ENSTRUG00000016422	eftud2	97	90.678	ENSMPUG00000009136	EFTUD2	90	90.890	Mustela_putorius_furo
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	91.152	ENSMLUG00000012164	EFTUD2	99	91.358	Myotis_lucifugus
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	90.947	ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	91.049	Nannospalax_galili
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	96.601	ENSNBRG00000020081	eftud2	100	96.601	Neolamprologus_brichardi
ENSTRUG00000016422	eftud2	97	89.160	ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	89.373	Nomascus_leucogenys
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	87.551	ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	87.757	Notamacropus_eugenii
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	83.333	ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	83.539	Ochotona_princeps
ENSTRUG00000016422	eftud2	93	75.431	ENSODEG00000003385	-	100	75.431	Octodon_degus
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	91.152	ENSODEG00000018041	-	100	90.638	Octodon_degus
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	96.704	ENSONIG00000000912	eftud2	100	96.704	Oreochromis_niloticus
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	91.152	ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	91.358	Oryctolagus_cuniculus
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	95.675	ENSORLG00000003109	eftud2	100	95.675	Oryzias_latipes
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	95.778	ENSORLG00020009865	eftud2	100	95.778	Oryzias_latipes_hni
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	95.675	ENSORLG00015002611	eftud2	100	96.296	Oryzias_latipes_hsok
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	89.815	ENSOGAG00000012918	EFTUD2	100	90.021	Otolemur_garnettii
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	91.152	ENSOARG00000009078	EFTUD2	97	91.358	Ovis_aries
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	91.255	ENSPPAG00000029450	EFTUD2	100	91.461	Pan_paniscus
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	91.152	ENSPPRG00000010981	EFTUD2	100	91.358	Panthera_pardus
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	91.152	ENSPTIG00000007703	EFTUD2	100	91.358	Panthera_tigris_altaica
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	91.255	ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	91.461	Pan_troglodytes
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	91.255	ENSPANG00000021284	EFTUD2	100	91.461	Papio_anubis
ENSTRUG00000016422	eftud2	93	89.526	ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	89.746	Pelodiscus_sinensis
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	88.465	ENSPMGG00000007281	eftud2	100	88.465	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	91.152	ENSPEMG00000005129	Eftud2	100	91.255	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	91.255	ENSPCIG00000015027	EFTUD2	100	91.461	Phascolarctos_cinereus
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	96.087	ENSPFOG00000008515	eftud2	100	96.087	Poecilia_formosa
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	96.087	ENSPLAG00000010393	eftud2	100	96.087	Poecilia_latipinna
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	96.087	ENSPMEG00000005087	eftud2	100	96.087	Poecilia_mexicana
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	89.918	ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	90.123	Pongo_abelii
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	87.346	ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	87.551	Procavia_capensis
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	91.255	ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	91.461	Propithecus_coquereli
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	87.037	ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	87.243	Pteropus_vampyrus
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	96.601	ENSPNYG00000012448	eftud2	100	96.601	Pundamilia_nyererei
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	94.027	ENSPNAG00000012490	eftud2	100	94.027	Pygocentrus_nattereri
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	91.246	ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	91.246	Rattus_norvegicus
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	91.152	ENSRBIG00000043255	EFTUD2	100	91.358	Rhinopithecus_bieti
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	91.152	ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	91.358	Rhinopithecus_roxellana
ENSTRUG00000016422	eftud2	97	33.764	YKL173W	SNU114	91	34.325	Saccharomyces_cerevisiae
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	91.255	ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	91.461	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSTRUG00000016422	eftud2	95	92.935	ENSSHAG00000008134	EFTUD2	98	92.935	Sarcophilus_harrisii
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	93.924	ENSSFOG00015023272	eftud2	100	93.512	Scleropages_formosus
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	96.601	ENSSMAG00000010174	eftud2	100	96.601	Scophthalmus_maximus
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	96.807	ENSSDUG00000022675	eftud2	100	96.807	Seriola_dumerili
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	96.910	ENSSLDG00000001595	eftud2	100	96.910	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	83.436	ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	83.642	Sorex_araneus
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	90.844	ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	91.049	Sphenodon_punctatus
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	96.807	ENSSPAG00000016235	eftud2	99	96.807	Stegastes_partitus
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	91.049	ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	91.152	Sus_scrofa
ENSTRUG00000016422	eftud2	83	91.542	ENSTGUG00000002065	EFTUD2	98	91.542	Taeniopygia_guttata
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	94.256	ENSTNIG00000005346	eftud2	99	94.256	Tetraodon_nigroviridis
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	85.905	ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	86.111	Tupaia_belangeri
ENSTRUG00000016422	eftud2	91	88.990	ENSTTRG00000006230	EFTUD2	91	88.990	Tursiops_truncatus
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	90.226	ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	90.329	Ursus_americanus
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	91.152	ENSUMAG00000014323	EFTUD2	100	91.358	Ursus_maritimus
ENSTRUG00000016422	eftud2	88	100.000	ENSVPAG00000002748	EFTUD2	88	100.000	Vicugna_pacos
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	91.152	ENSVVUG00000018113	EFTUD2	100	91.358	Vulpes_vulpes
ENSTRUG00000016422	eftud2	96	91.230	ENSXETG00000003394	eftud2	98	91.948	Xenopus_tropicalis
ENSTRUG00000016422	eftud2	81	96.173	ENSXCOG00000017309	eftud2	96	96.173	Xiphophorus_couchianus
ENSTRUG00000016422	eftud2	100	95.881	ENSXMAG00000008494	eftud2	100	95.881	Xiphophorus_maculatus