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Description

Ensembl ID: ENSTRUG00000018491 (Gene tree)
Gene ID: 101077251
Gene Symbol: tnpo1
Alias: Kapbeta2|karyopherin beta 2
Full Name: transportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Takifugu_rubripes
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 12959 bases
Position: chr6:4711609-4724567
Accession: 101077251
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSTRUP00000047335	IBN_N	PF03810.19	1.2e-15	1	1
ENSTRUP00000047336	IBN_N	PF03810.19	1.2e-15	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSTRUT00000047496	-	3183	-	ENSTRUP00000047336	886 (aa)	-	H2VDP1
ENSTRUT00000047495	-	3062	XM_011604662	ENSTRUP00000047335	886 (aa)	XP_011602964	H2VDP0

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSTRUG00000018491	tnpo1	99	85.811	ENSTRUG00000009453	TNPO2	99	85.923
ENSTRUG00000018491	tnpo1	99	85.586	ENSTRUG00000012698	tnpo2	99	85.811

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSTRUG00000018491	tnpo1	100	92.921	ENSG00000083312	TNPO1	100	92.921	Homo_sapiens
ENSTRUG00000018491	tnpo1	100	97.079	ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	97.079	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTRUG00000018491	tnpo1	100	91.314	ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	92.094	Ailuropoda_melanoleuca
ENSTRUG00000018491	tnpo1	87	97.025	ENSACIG00000003711	tnpo1	99	97.025	Amphilophus_citrinellus
ENSTRUG00000018491	tnpo1	100	97.191	ENSAOCG00000008154	tnpo1	100	97.191	Amphiprion_ocellaris
ENSTRUG00000018491	tnpo1	100	97.191	ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	97.191	Amphiprion_percula
ENSTRUG00000018491	tnpo1	100	96.854	ENSATEG00000010408	tnpo1	100	96.854	Anabas_testudineus
ENSTRUG00000018491	tnpo1	99	88.613	ENSAPLG00000009619	-	97	89.540	Anas_platyrhynchos
ENSTRUG00000018491	tnpo1	100	93.596	ENSACAG00000009599	TNPO1	100	93.596	Anolis_carolinensis
ENSTRUG00000018491	tnpo1	100	82.921	ENSANAG00000025351	-	99	82.921	Aotus_nancymaae
ENSTRUG00000018491	tnpo1	100	92.472	ENSANAG00000022453	-	99	92.472	Aotus_nancymaae
ENSTRUG00000018491	tnpo1	100	60.488	ENSANAG00000027118	-	99	60.155	Aotus_nancymaae
ENSTRUG00000018491	tnpo1	100	95.603	ENSACLG00000027223	tnpo1	100	95.603	Astatotilapia_calliptera
ENSTRUG00000018491	tnpo1	100	94.170	ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	94.170	Astyanax_mexicanus
ENSTRUG00000018491	tnpo1	100	93.034	ENSBTAG00000007979	TNPO1	99	93.034	Bos_taurus
ENSTRUG00000018491	tnpo1	100	92.584	ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	92.584	Callithrix_jacchus
ENSTRUG00000018491	tnpo1	96	92.765	ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	92.765	Canis_familiaris
ENSTRUG00000018491	tnpo1	100	90.449	ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	90.449	Canis_lupus_dingo
ENSTRUG00000018491	tnpo1	100	92.921	ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	92.921	Capra_hircus
ENSTRUG00000018491	tnpo1	99	89.266	ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	91.579	Carlito_syrichta
ENSTRUG00000018491	tnpo1	100	92.472	ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	92.472	Cebus_capucinus
ENSTRUG00000018491	tnpo1	100	92.921	ENSCATG00000043792	TNPO1	100	92.921	Cercocebus_atys
ENSTRUG00000018491	tnpo1	100	92.697	ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	92.697	Chinchilla_lanigera
ENSTRUG00000018491	tnpo1	100	92.921	ENSCSAG00000015616	TNPO1	99	92.921	Chlorocebus_sabaeus
ENSTRUG00000018491	tnpo1	94	81.406	ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	81.406	Choloepus_hoffmanni
ENSTRUG00000018491	tnpo1	100	93.596	ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	93.596	Chrysemys_picta_bellii
ENSTRUG00000018491	tnpo1	99	76.207	ENSCSAVG00000010981	-	99	76.207	Ciona_savignyi
ENSTRUG00000018491	tnpo1	100	92.921	ENSCANG00000004353	TNPO1	99	92.921	Colobus_angolensis_palliatus
ENSTRUG00000018491	tnpo1	100	92.809	ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	92.809	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSTRUG00000018491	tnpo1	96	92.865	ENSCGRG00000010366	Tnpo1	100	92.865	Cricetulus_griseus_crigri
ENSTRUG00000018491	tnpo1	100	95.281	ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	95.281	Cynoglossus_semilaevis
ENSTRUG00000018491	tnpo1	100	96.067	ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	96.067	Cyprinodon_variegatus
ENSTRUG00000018491	tnpo1	100	94.276	ENSDARG00000035390	tnpo1	100	94.164	Danio_rerio
ENSTRUG00000018491	tnpo1	100	87.978	ENSDNOG00000006647	TNPO1	99	87.978	Dasypus_novemcinctus
ENSTRUG00000018491	tnpo1	93	93.012	ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	93.004	Dipodomys_ordii
ENSTRUG00000018491	tnpo1	99	58.248	FBgn0035693	CG8219	99	58.020	Drosophila_melanogaster
ENSTRUG00000018491	tnpo1	86	92.884	ENSETEG00000017805	TNPO1	89	92.884	Echinops_telfairi
ENSTRUG00000018491	tnpo1	94	84.946	ENSEBUG00000001895	tnpo1	99	84.707	Eptatretus_burgeri
ENSTRUG00000018491	tnpo1	100	92.921	ENSEASG00005018055	TNPO1	100	92.921	Equus_asinus_asinus
ENSTRUG00000018491	tnpo1	100	92.697	ENSECAG00000024424	TNPO1	99	92.697	Equus_caballus
ENSTRUG00000018491	tnpo1	100	87.691	ENSELUG00000002821	tnpo1	100	87.364	Esox_lucius
ENSTRUG00000018491	tnpo1	100	92.921	ENSFCAG00000013181	TNPO1	100	92.921	Felis_catus
ENSTRUG00000018491	tnpo1	100	93.708	ENSFALG00000010292	TNPO1	100	93.708	Ficedula_albicollis
ENSTRUG00000018491	tnpo1	100	92.584	ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	92.584	Fukomys_damarensis
ENSTRUG00000018491	tnpo1	100	96.184	ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	96.184	Fundulus_heteroclitus
ENSTRUG00000018491	tnpo1	100	92.385	ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	92.385	Gadus_morhua
ENSTRUG00000018491	tnpo1	100	92.697	ENSGALG00000015014	TNPO1	100	92.697	Gallus_gallus
ENSTRUG00000018491	tnpo1	100	96.188	ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	96.188	Gambusia_affinis
ENSTRUG00000018491	tnpo1	100	95.393	ENSGACG00000015841	tnpo1	99	95.393	Gasterosteus_aculeatus
ENSTRUG00000018491	tnpo1	100	93.820	ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	93.820	Gopherus_agassizii
ENSTRUG00000018491	tnpo1	100	92.921	ENSGGOG00000026800	TNPO1	100	92.921	Gorilla_gorilla
ENSTRUG00000018491	tnpo1	100	77.578	ENSGGOG00000022535	-	98	77.578	Gorilla_gorilla
ENSTRUG00000018491	tnpo1	100	96.742	ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	96.742	Haplochromis_burtoni
ENSTRUG00000018491	tnpo1	100	92.697	ENSHGLG00000000970	-	99	92.697	Heterocephalus_glaber_female
ENSTRUG00000018491	tnpo1	97	72.791	ENSHGLG00100000963	-	99	72.209	Heterocephalus_glaber_male
ENSTRUG00000018491	tnpo1	96	92.640	ENSHGLG00100017090	-	99	92.640	Heterocephalus_glaber_male
ENSTRUG00000018491	tnpo1	100	93.034	ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	93.034	Jaculus_jaculus
ENSTRUG00000018491	tnpo1	100	95.730	ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	95.730	Kryptolebias_marmoratus
ENSTRUG00000018491	tnpo1	91	93.342	ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	92.848	Labrus_bergylta
ENSTRUG00000018491	tnpo1	96	87.442	ENSLACG00000012199	TNPO1	100	87.442	Latimeria_chalumnae
ENSTRUG00000018491	tnpo1	100	94.045	ENSLOCG00000011092	tnpo1	97	94.045	Lepisosteus_oculatus
ENSTRUG00000018491	tnpo1	97	92.148	ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	92.148	Loxodonta_africana
ENSTRUG00000018491	tnpo1	100	92.921	ENSMFAG00000003636	TNPO1	99	92.921	Macaca_fascicularis
ENSTRUG00000018491	tnpo1	100	92.809	ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	92.889	Macaca_mulatta
ENSTRUG00000018491	tnpo1	100	92.921	ENSMNEG00000044581	TNPO1	99	92.921	Macaca_nemestrina
ENSTRUG00000018491	tnpo1	100	92.921	ENSMLEG00000030740	TNPO1	99	92.921	Mandrillus_leucophaeus
ENSTRUG00000018491	tnpo1	100	97.079	ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	97.079	Mastacembelus_armatus
ENSTRUG00000018491	tnpo1	100	96.956	ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	96.956	Maylandia_zebra
ENSTRUG00000018491	tnpo1	100	92.809	ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	93.820	Mesocricetus_auratus
ENSTRUG00000018491	tnpo1	100	89.213	ENSMICG00000008468	TNPO1	99	89.213	Microcebus_murinus
ENSTRUG00000018491	tnpo1	100	92.809	ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	92.809	Microtus_ochrogaster
ENSTRUG00000018491	tnpo1	87	96.392	ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	96.392	Mola_mola
ENSTRUG00000018491	tnpo1	99	92.766	ENSMODG00000001721	TNPO1	80	92.766	Monodelphis_domestica
ENSTRUG00000018491	tnpo1	100	95.393	ENSMALG00000009782	tnpo1	100	95.393	Monopterus_albus
ENSTRUG00000018491	tnpo1	100	92.809	MGP_CAROLIEiJ_G0018826	Tnpo1	100	93.820	Mus_caroli
ENSTRUG00000018491	tnpo1	100	92.809	ENSMUSG00000009470	Tnpo1	100	93.820	Mus_musculus
ENSTRUG00000018491	tnpo1	100	92.921	MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	93.820	Mus_pahari
ENSTRUG00000018491	tnpo1	100	92.809	MGP_SPRETEiJ_G0019708	Tnpo1	100	93.820	Mus_spretus
ENSTRUG00000018491	tnpo1	100	92.921	ENSMPUG00000014387	TNPO1	99	92.921	Mustela_putorius_furo
ENSTRUG00000018491	tnpo1	96	92.433	ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	92.433	Myotis_lucifugus
ENSTRUG00000018491	tnpo1	100	92.921	ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	92.921	Nannospalax_galili
ENSTRUG00000018491	tnpo1	87	97.147	ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	97.147	Neolamprologus_brichardi
ENSTRUG00000018491	tnpo1	100	92.921	ENSNLEG00000004572	TNPO1	100	92.921	Nomascus_leucogenys
ENSTRUG00000018491	tnpo1	90	87.540	ENSOPRG00000012390	TNPO1	89	87.540	Ochotona_princeps
ENSTRUG00000018491	tnpo1	100	92.472	ENSODEG00000001771	TNPO1	99	92.472	Octodon_degus
ENSTRUG00000018491	tnpo1	100	95.982	ENSONIG00000011151	tnpo1	99	95.982	Oreochromis_niloticus
ENSTRUG00000018491	tnpo1	92	93.659	ENSOANG00000015785	TNPO1	100	93.659	Ornithorhynchus_anatinus
ENSTRUG00000018491	tnpo1	96	86.799	ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	86.565	Oryctolagus_cuniculus
ENSTRUG00000018491	tnpo1	87	96.745	ENSORLG00000003182	tnpo1	99	96.745	Oryzias_latipes
ENSTRUG00000018491	tnpo1	99	96.606	ENSORLG00020011559	tnpo1	99	96.606	Oryzias_latipes_hni
ENSTRUG00000018491	tnpo1	99	96.280	ENSORLG00015019113	tnpo1	99	96.280	Oryzias_latipes_hsok
ENSTRUG00000018491	tnpo1	99	95.716	ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	95.716	Oryzias_melastigma
ENSTRUG00000018491	tnpo1	100	92.921	ENSOGAG00000000808	TNPO1	99	92.921	Otolemur_garnettii
ENSTRUG00000018491	tnpo1	100	93.034	ENSOARG00000005038	TNPO1	84	93.034	Ovis_aries
ENSTRUG00000018491	tnpo1	100	92.921	ENSPPAG00000042518	TNPO1	99	92.921	Pan_paniscus
ENSTRUG00000018491	tnpo1	100	92.921	ENSPPRG00000022336	TNPO1	100	92.921	Panthera_pardus
ENSTRUG00000018491	tnpo1	100	92.921	ENSPTIG00000018839	TNPO1	100	92.921	Panthera_tigris_altaica
ENSTRUG00000018491	tnpo1	100	92.921	ENSPTRG00000016972	TNPO1	99	92.921	Pan_troglodytes
ENSTRUG00000018491	tnpo1	94	81.768	ENSPTRG00000047731	-	100	81.768	Pan_troglodytes
ENSTRUG00000018491	tnpo1	100	92.921	ENSPANG00000006074	TNPO1	99	92.921	Papio_anubis
ENSTRUG00000018491	tnpo1	100	91.124	ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	91.124	Paramormyrops_kingsleyae
ENSTRUG00000018491	tnpo1	100	93.820	ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	93.820	Pelodiscus_sinensis
ENSTRUG00000018491	tnpo1	100	93.603	ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	93.266	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSTRUG00000018491	tnpo1	96	92.865	ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	92.865	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSTRUG00000018491	tnpo1	100	93.820	ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	93.820	Phascolarctos_cinereus
ENSTRUG00000018491	tnpo1	100	96.193	ENSPFOG00000011447	tnpo1	100	96.193	Poecilia_formosa
ENSTRUG00000018491	tnpo1	100	96.193	ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	96.193	Poecilia_latipinna
ENSTRUG00000018491	tnpo1	100	96.629	ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	96.629	Poecilia_mexicana
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