EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSTRUG00000020779 (Gene tree)
Gene ID: 101074006
Gene Symbol: polr1e
Alias: zgc:112501
Full Name: RNA polymerase I subunit E
Gene Type: protein_coding
Species: Takifugu_rubripes
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 7374 bases
Position: chrHE591783.1:195681-203054
Accession: 101074006
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSTRUP00000050159	RNA_pol_I_A49	PF06870.12	2.1e-106	1	1
ENSTRUP00000057039	RNA_pol_I_A49	PF06870.12	5.1e-104	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSTRUT00000055761	-	5189	-	ENSTRUP00000057039	379 (aa)	-	-
ENSTRUT00000056902	-	5765	XM_011619392	ENSTRUP00000050159	417 (aa)	XP_011617694	UPI0005D23F75

Gene Model

Click here to download ENSTRUG00000020779's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
tru03020	RNA polymerase	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSTRUG00000020779's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	44.882	ENSG00000137054	POLR1E	98	43.750	Homo_sapiens
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	67.703	ENSAPOG00000012452	polr1e	99	67.703	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	39.578	ENSAMEG00000010193	POLR1E	95	38.961	Ailuropoda_melanoleuca
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	66.842	ENSACIG00000009884	polr1e	99	67.089	Amphilophus_citrinellus
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	72.727	ENSAOCG00000005665	polr1e	99	72.727	Amphiprion_ocellaris
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	73.445	ENSAPEG00000020581	polr1e	99	73.445	Amphiprion_percula
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	73.206	ENSATEG00000020609	polr1e	99	73.206	Anabas_testudineus
ENSTRUG00000020779	polr1e	89	39.119	ENSAPLG00000010340	POLR1E	99	39.119	Anas_platyrhynchos
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	44.737	ENSANAG00000038046	POLR1E	98	43.614	Aotus_nancymaae
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	70.574	ENSACLG00000013685	polr1e	99	70.574	Astatotilapia_calliptera
ENSTRUG00000020779	polr1e	100	53.525	ENSAMXG00000018181	polr1e	100	53.207	Astyanax_mexicanus
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	44.619	ENSBTAG00000012243	POLR1E	98	43.990	Bos_taurus
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	42.520	ENSCJAG00000010512	POLR1E	94	43.717	Callithrix_jacchus
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	43.570	ENSCAFG00000002377	POLR1E	98	42.788	Canis_familiaris
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	43.307	ENSCAFG00020017851	POLR1E	98	42.548	Canis_lupus_dingo
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	44.619	ENSCHIG00000019479	POLR1E	98	43.750	Capra_hircus
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	44.882	ENSTSYG00000002075	POLR1E	98	43.750	Carlito_syrichta
ENSTRUG00000020779	polr1e	77	42.282	ENSCAPG00000015653	POLR1E	99	42.282	Cavia_aperea
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	43.669	ENSCPOG00000009965	POLR1E	98	42.891	Cavia_porcellus
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	41.053	ENSCCAG00000029460	POLR1E	98	40.482	Cebus_capucinus
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	45.144	ENSCATG00000031732	POLR1E	98	44.068	Cercocebus_atys
ENSTRUG00000020779	polr1e	85	45.988	ENSCLAG00000012701	POLR1E	95	44.751	Chinchilla_lanigera
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	45.144	ENSCSAG00000010782	POLR1E	98	43.990	Chlorocebus_sabaeus
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	38.501	ENSCHOG00000013024	POLR1E	82	38.366	Choloepus_hoffmanni
ENSTRUG00000020779	polr1e	100	46.982	ENSCPBG00000006923	POLR1E	100	46.062	Chrysemys_picta_bellii
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	45.407	ENSCANG00000036112	POLR1E	98	46.610	Colobus_angolensis_palliatus
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	42.257	ENSCGRG00001006197	Polr1e	95	41.827	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	41.732	ENSCGRG00000006430	Polr1e	95	41.346	Cricetulus_griseus_crigri
ENSTRUG00000020779	polr1e	100	65.632	ENSCSEG00000005121	polr1e	100	65.632	Cynoglossus_semilaevis
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	69.211	ENSCVAG00000019759	polr1e	99	68.900	Cyprinodon_variegatus
ENSTRUG00000020779	polr1e	97	55.257	ENSDARG00000006434	polr1e	99	54.762	Danio_rerio
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	39.535	ENSDNOG00000010257	POLR1E	99	37.209	Dasypus_novemcinctus
ENSTRUG00000020779	polr1e	83	43.711	ENSETEG00000018204	POLR1E	89	44.025	Echinops_telfairi
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	43.832	ENSEASG00005000675	POLR1E	98	43.029	Equus_asinus_asinus
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	43.832	ENSECAG00000014669	POLR1E	98	43.029	Equus_caballus
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	37.958	ENSEEUG00000011928	POLR1E	86	37.232	Erinaceus_europaeus
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	64.737	ENSELUG00000008150	polr1e	99	63.636	Esox_lucius
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	44.357	ENSFCAG00000013081	POLR1E	98	43.645	Felis_catus
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	44.909	ENSFALG00000012950	POLR1E	99	45.250	Ficedula_albicollis
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	43.669	ENSFDAG00000016917	POLR1E	98	43.128	Fukomys_damarensis
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	68.258	ENSFHEG00000009801	polr1e	99	68.258	Fundulus_heteroclitus
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	52.857	ENSGMOG00000003336	POLR1E	98	52.857	Gadus_morhua
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	45.144	ENSGALG00000005395	POLR1E	99	43.645	Gallus_gallus
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	66.986	ENSGAFG00000004850	polr1e	99	66.986	Gambusia_affinis
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	66.580	ENSGACG00000016087	polr1e	99	66.508	Gasterosteus_aculeatus
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	41.885	ENSGAGG00000001659	POLR1E	99	41.388	Gopherus_agassizii
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	44.882	ENSGGOG00000001882	POLR1E	99	43.802	Gorilla_gorilla
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	70.813	ENSHBUG00000002559	polr1e	99	70.813	Haplochromis_burtoni
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	43.411	ENSHGLG00000002036	POLR1E	98	42.891	Heterocephalus_glaber_female
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	43.669	ENSHGLG00100012784	POLR1E	98	43.128	Heterocephalus_glaber_male
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	66.746	ENSHCOG00000002774	polr1e	99	66.746	Hippocampus_comes
ENSTRUG00000020779	polr1e	100	56.168	ENSIPUG00000003019	polr1e	100	55.131	Ictalurus_punctatus
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	43.386	ENSSTOG00000009810	POLR1E	99	42.548	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	43.307	ENSJJAG00000020731	Polr1e	94	42.615	Jaculus_jaculus
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	69.378	ENSKMAG00000000046	polr1e	99	69.378	Kryptolebias_marmoratus
ENSTRUG00000020779	polr1e	100	70.024	ENSLBEG00000003104	polr1e	99	70.024	Labrus_bergylta
ENSTRUG00000020779	polr1e	95	46.721	ENSLACG00000003416	POLR1E	99	46.721	Latimeria_chalumnae
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	51.706	ENSLOCG00000012859	polr1e	99	51.429	Lepisosteus_oculatus
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	44.357	ENSLAFG00000012831	POLR1E	98	43.510	Loxodonta_africana
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	45.144	ENSMFAG00000045465	POLR1E	98	44.068	Macaca_fascicularis
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	45.144	ENSMMUG00000017892	POLR1E	98	44.068	Macaca_mulatta
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	42.092	ENSMNEG00000040283	POLR1E	98	41.304	Macaca_nemestrina
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	45.144	ENSMLEG00000031135	POLR1E	98	44.068	Mandrillus_leucophaeus
ENSTRUG00000020779	polr1e	100	70.079	ENSMAMG00000001260	polr1e	99	69.690	Mastacembelus_armatus
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	70.813	ENSMZEG00005021536	polr1e	99	70.813	Maylandia_zebra
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	42.782	ENSMAUG00000021044	Polr1e	95	42.548	Mesocricetus_auratus
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	44.619	ENSMICG00000003673	POLR1E	98	43.750	Microcebus_murinus
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	41.732	ENSMOCG00000012920	Polr1e	94	41.404	Microtus_ochrogaster
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	73.421	ENSMMOG00000007391	polr1e	99	72.488	Mola_mola
ENSTRUG00000020779	polr1e	96	45.380	ENSMODG00000002884	POLR1E	98	44.089	Monodelphis_domestica
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	71.531	ENSMALG00000002665	polr1e	99	71.531	Monopterus_albus
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	41.885	MGP_CAROLIEiJ_G0025967	Polr1e	97	42.105	Mus_caroli
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	42.037	ENSMUSG00000028318	Polr1e	97	42.250	Mus_musculus
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	43.603	MGP_PahariEiJ_G0024114	Polr1e	97	43.750	Mus_pahari
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	42.037	MGP_SPRETEiJ_G0026930	Polr1e	97	42.537	Mus_spretus
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	39.907	ENSMPUG00000006040	POLR1E	98	38.197	Mustela_putorius_furo
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	44.882	ENSMLUG00000012688	POLR1E	95	43.990	Myotis_lucifugus
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	43.832	ENSNGAG00000002520	Polr1e	94	42.857	Nannospalax_galili
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	71.053	ENSNBRG00000016822	polr1e	99	71.053	Neolamprologus_brichardi
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	44.882	ENSNLEG00000003616	POLR1E	98	44.068	Nomascus_leucogenys
ENSTRUG00000020779	polr1e	77	49.282	ENSMEUG00000015372	-	80	49.115	Notamacropus_eugenii
ENSTRUG00000020779	polr1e	95	38.567	ENSOPRG00000014206	POLR1E	99	38.567	Ochotona_princeps
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	44.094	ENSODEG00000014565	POLR1E	94	44.146	Octodon_degus
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	70.574	ENSONIG00000008921	polr1e	99	70.574	Oreochromis_niloticus
ENSTRUG00000020779	polr1e	89	45.308	ENSOCUG00000024773	POLR1E	89	45.576	Oryctolagus_cuniculus
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	66.227	ENSORLG00000005143	polr1e	99	65.550	Oryzias_latipes
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	64.116	ENSORLG00020007271	polr1e	99	63.918	Oryzias_latipes_hni
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	67.018	ENSORLG00015000137	polr1e	99	66.029	Oryzias_latipes_hsok
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	64.116	ENSOMEG00000013264	polr1e	98	63.636	Oryzias_melastigma
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	44.094	ENSOGAG00000012981	POLR1E	96	43.269	Otolemur_garnettii
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	44.882	ENSOARG00000011465	POLR1E	95	43.990	Ovis_aries
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	44.882	ENSPPAG00000034566	POLR1E	98	44.068	Pan_paniscus
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	44.882	ENSPPRG00000005649	POLR1E	98	44.125	Panthera_pardus
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	44.882	ENSPTIG00000009774	POLR1E	98	44.125	Panthera_tigris_altaica
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	44.882	ENSPTRG00000020944	POLR1E	98	44.068	Pan_troglodytes
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	45.144	ENSPANG00000025563	POLR1E	98	44.068	Papio_anubis
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	56.771	ENSPKIG00000003562	polr1e	99	54.610	Paramormyrops_kingsleyae
ENSTRUG00000020779	polr1e	100	44.792	ENSPSIG00000003274	POLR1E	93	45.679	Pelodiscus_sinensis
ENSTRUG00000020779	polr1e	100	63.281	ENSPMGG00000024169	polr1e	96	62.935	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	42.782	ENSPEMG00000019151	-	95	42.308	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	35.990	ENSPEMG00000022300	-	94	35.990	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSTRUG00000020779	polr1e	96	45.232	ENSPCIG00000014798	POLR1E	98	44.198	Phascolarctos_cinereus
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	63.657	ENSPFOG00000019627	polr1e	99	63.657	Poecilia_formosa
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	67.703	ENSPLAG00000022679	polr1e	99	67.703	Poecilia_latipinna
ENSTRUG00000020779	polr1e	95	67.680	ENSPMEG00000022123	polr1e	93	67.680	Poecilia_mexicana
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	66.842	ENSPREG00000009470	polr1e	99	66.507	Poecilia_reticulata
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	45.144	ENSPPYG00000019061	POLR1E	98	43.990	Pongo_abelii
ENSTRUG00000020779	polr1e	62	38.462	ENSPCAG00000004891	POLR1E	75	38.462	Procavia_capensis
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	44.094	ENSPCOG00000027448	POLR1E	98	43.269	Propithecus_coquereli
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	44.094	ENSPVAG00000007940	POLR1E	83	44.221	Pteropus_vampyrus
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	70.813	ENSPNYG00000001032	polr1e	99	70.813	Pundamilia_nyererei
ENSTRUG00000020779	polr1e	100	53.806	ENSPNAG00000006987	polr1e	99	53.222	Pygocentrus_nattereri
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	42.782	ENSRNOG00000012664	Polr1e	95	41.866	Rattus_norvegicus
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	45.144	ENSRBIG00000034214	POLR1E	99	45.431	Rhinopithecus_bieti
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	45.144	ENSRROG00000031986	POLR1E	98	44.068	Rhinopithecus_roxellana
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	44.619	ENSSBOG00000021415	POLR1E	97	43.826	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSTRUG00000020779	polr1e	91	44.828	ENSSHAG00000016084	POLR1E	95	44.828	Sarcophilus_harrisii
ENSTRUG00000020779	polr1e	100	57.180	ENSSFOG00015002293	polr1e	100	55.582	Scleropages_formosus
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	71.579	ENSSMAG00000011672	polr1e	93	71.531	Scophthalmus_maximus
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	72.010	ENSSDUG00000022279	polr1e	99	72.010	Seriola_dumerili
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	72.249	ENSSLDG00000024918	polr1e	99	72.249	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSTRUG00000020779	polr1e	61	38.362	ENSSARG00000009810	-	58	38.793	Sorex_araneus
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	46.457	ENSSPUG00000009499	POLR1E	99	45.606	Sphenodon_punctatus
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	74.163	ENSSPAG00000021240	polr1e	99	74.163	Stegastes_partitus
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	44.474	ENSSSCG00000005347	POLR1E	98	43.855	Sus_scrofa
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	39.161	ENSTGUG00000007169	POLR1E	99	39.286	Taeniopygia_guttata
ENSTRUG00000020779	polr1e	100	84.777	ENSTNIG00000017812	polr1e	100	83.771	Tetraodon_nigroviridis
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	45.144	ENSTBEG00000013786	POLR1E	84	45.226	Tupaia_belangeri
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	43.342	ENSTTRG00000008294	POLR1E	84	43.000	Tursiops_truncatus
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	44.094	ENSUAMG00000012474	POLR1E	98	44.598	Ursus_americanus
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	44.094	ENSUMAG00000011496	POLR1E	98	43.269	Ursus_maritimus
ENSTRUG00000020779	polr1e	85	41.049	ENSVPAG00000009048	POLR1E	81	41.056	Vicugna_pacos
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	43.307	ENSVVUG00000019954	POLR1E	97	42.615	Vulpes_vulpes
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	42.078	ENSXETG00000006533	polr1e	99	40.662	Xenopus_tropicalis
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	63.397	ENSXCOG00000013706	polr1e	99	63.876	Xiphophorus_couchianus
ENSTRUG00000020779	polr1e	99	68.421	ENSXMAG00000012484	polr1e	99	68.421	Xiphophorus_maculatus