EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSTRUG00000021287 (Gene tree)
Gene ID: 101078644
Gene Symbol: si:dkey-98f17.5
Alias: -
Full Name: uncharacterized LOC101078644
Gene Type: protein_coding
Species: Takifugu_rubripes
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 6695 bases
Position: chr21:9756867-9763561
Accession: 101078644
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSTRUP00000052657	MMR_HSR1	PF01926.23	1.7e-06	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSTRUT00000057062	-	2216	XM_003974994	ENSTRUP00000052657	448 (aa)	XP_003975043	UPI000298F337

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSTRUG00000021287	si:dkey-98f17.5	100	59.556	ENSTRUG00000020291	si:ch211-11k18.4	99	59.556

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSTRUG00000021287	si:dkey-98f17.5	100	59.111	ENSAPOG00000018833	si:ch211-11k18.4	99	59.111	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTRUG00000021287	si:dkey-98f17.5	100	89.062	ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	100	89.062	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTRUG00000021287	si:dkey-98f17.5	100	57.206	ENSACIG00000006696	si:ch211-11k18.4	99	57.206	Amphilophus_citrinellus
ENSTRUG00000021287	si:dkey-98f17.5	100	90.402	ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	100	90.402	Amphilophus_citrinellus
ENSTRUG00000021287	si:dkey-98f17.5	100	59.333	ENSAOCG00000014284	si:ch211-11k18.4	99	59.333	Amphiprion_ocellaris
ENSTRUG00000021287	si:dkey-98f17.5	100	89.732	ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	100	89.732	Amphiprion_ocellaris
ENSTRUG00000021287	si:dkey-98f17.5	100	89.509	ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	100	89.509	Amphiprion_percula
ENSTRUG00000021287	si:dkey-98f17.5	100	59.111	ENSAPEG00000014910	si:ch211-11k18.4	99	59.111	Amphiprion_percula
ENSTRUG00000021287	si:dkey-98f17.5	100	88.616	ENSATEG00000007188	si:dkey-98f17.5	100	88.616	Anabas_testudineus
ENSTRUG00000021287	si:dkey-98f17.5	100	59.778	ENSATEG00000004775	si:ch211-11k18.4	99	59.778	Anabas_testudineus
ENSTRUG00000021287	si:dkey-98f17.5	99	58.036	ENSACAG00000028632	-	99	58.129	Anolis_carolinensis
ENSTRUG00000021287	si:dkey-98f17.5	100	90.402	ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	100	90.402	Astatotilapia_calliptera
ENSTRUG00000021287	si:dkey-98f17.5	100	58.628	ENSACLG00000007907	si:ch211-11k18.4	99	58.628	Astatotilapia_calliptera
ENSTRUG00000021287	si:dkey-98f17.5	100	79.955	ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	100	79.955	Astyanax_mexicanus
ENSTRUG00000021287	si:dkey-98f17.5	100	59.251	ENSAMXG00000017817	si:ch211-11k18.4	99	59.251	Astyanax_mexicanus
ENSTRUG00000021287	si:dkey-98f17.5	81	59.673	ENSCING00000020807	-	97	59.673	Ciona_intestinalis
ENSTRUG00000021287	si:dkey-98f17.5	98	54.773	ENSCSAVG00000009987	-	98	54.955	Ciona_savignyi
ENSTRUG00000021287	si:dkey-98f17.5	100	58.444	ENSCSEG00000017661	si:ch211-11k18.4	99	58.889	Cynoglossus_semilaevis
ENSTRUG00000021287	si:dkey-98f17.5	100	87.277	ENSCSEG00000017512	si:dkey-98f17.5	98	84.670	Cynoglossus_semilaevis
ENSTRUG00000021287	si:dkey-98f17.5	100	87.500	ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	100	87.500	Cyprinodon_variegatus
ENSTRUG00000021287	si:dkey-98f17.5	100	59.111	ENSCVAG00000015346	si:ch211-11k18.4	99	59.111	Cyprinodon_variegatus
ENSTRUG00000021287	si:dkey-98f17.5	98	81.591	ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	81.591	Danio_rerio
ENSTRUG00000021287	si:dkey-98f17.5	100	60.222	ENSDARG00000087869	si:ch211-11k18.4	100	74.490	Danio_rerio
ENSTRUG00000021287	si:dkey-98f17.5	79	56.338	ENSEBUG00000007620	si:dkey-98f17.5	95	56.338	Eptatretus_burgeri
ENSTRUG00000021287	si:dkey-98f17.5	99	81.390	ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	99	81.390	Esox_lucius
ENSTRUG00000021287	si:dkey-98f17.5	100	58.315	ENSFHEG00000019820	si:ch211-11k18.4	99	58.315	Fundulus_heteroclitus
ENSTRUG00000021287	si:dkey-98f17.5	100	87.946	ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	100	87.946	Fundulus_heteroclitus
ENSTRUG00000021287	si:dkey-98f17.5	89	56.110	ENSGMOG00000003492	si:ch211-11k18.4	99	56.110	Gadus_morhua
ENSTRUG00000021287	si:dkey-98f17.5	100	87.500	ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	89	87.500	Gambusia_affinis
ENSTRUG00000021287	si:dkey-98f17.5	100	58.889	ENSGAFG00000005677	si:ch211-11k18.4	99	58.889	Gambusia_affinis
ENSTRUG00000021287	si:dkey-98f17.5	58	94.574	ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	94.574	Gasterosteus_aculeatus
ENSTRUG00000021287	si:dkey-98f17.5	80	67.867	ENSGACG00000013134	si:ch211-11k18.4	99	61.443	Gasterosteus_aculeatus
ENSTRUG00000021287	si:dkey-98f17.5	100	58.850	ENSHBUG00000020638	si:ch211-11k18.4	99	58.850	Haplochromis_burtoni
ENSTRUG00000021287	si:dkey-98f17.5	100	90.402	ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	100	90.402	Haplochromis_burtoni
ENSTRUG00000021287	si:dkey-98f17.5	100	58.889	ENSHCOG00000014773	si:ch211-11k18.4	99	58.889	Hippocampus_comes
ENSTRUG00000021287	si:dkey-98f17.5	99	82.658	ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	97	82.658	Hippocampus_comes
ENSTRUG00000021287	si:dkey-98f17.5	100	77.506	ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	99	77.506	Ictalurus_punctatus
ENSTRUG00000021287	si:dkey-98f17.5	96	60.369	ENSIPUG00000016678	si:ch211-11k18.4	99	59.908	Ictalurus_punctatus
ENSTRUG00000021287	si:dkey-98f17.5	80	59.167	ENSIPUG00000016694	si:ch211-11k18.4	80	59.167	Ictalurus_punctatus
ENSTRUG00000021287	si:dkey-98f17.5	100	90.179	ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	100	90.179	Kryptolebias_marmoratus
ENSTRUG00000021287	si:dkey-98f17.5	100	58.889	ENSKMAG00000009327	si:ch211-11k18.4	99	59.111	Kryptolebias_marmoratus
ENSTRUG00000021287	si:dkey-98f17.5	100	89.062	ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	100	89.062	Labrus_bergylta
ENSTRUG00000021287	si:dkey-98f17.5	100	62.361	ENSLACG00000004899	-	99	62.361	Latimeria_chalumnae
ENSTRUG00000021287	si:dkey-98f17.5	99	68.919	ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	97	68.919	Latimeria_chalumnae
ENSTRUG00000021287	si:dkey-98f17.5	99	61.798	ENSLACG00000006280	si:ch211-11k18.4	98	61.798	Latimeria_chalumnae
ENSTRUG00000021287	si:dkey-98f17.5	99	74.944	ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	74.944	Lepisosteus_oculatus
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ENSTRUG00000021287	si:dkey-98f17.5	100	57.650	ENSMMOG00000012485	si:ch211-11k18.4	99	57.650	Mola_mola
ENSTRUG00000021287	si:dkey-98f17.5	100	59.111	ENSMALG00000019735	si:ch211-11k18.4	99	59.111	Monopterus_albus
ENSTRUG00000021287	si:dkey-98f17.5	98	86.788	ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	100	86.788	Monopterus_albus
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ENSTRUG00000021287	si:dkey-98f17.5	100	89.955	ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	100	89.955	Neolamprologus_brichardi
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