EuRBPDB

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSTRUG00000024431 (Gene tree)
Gene ID: 101062906
Gene Symbol: ago1
Alias: Ago1|eif2c1|si:ch211-119n15.3
Full Name: argonaute 1%2C RISC catalytic component
Gene Type: protein_coding
Species: Takifugu_rubripes
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 15354 bases
Position: chr7:336127-351480
Accession: 101062906
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSTRUP00000014582	PAZ	PF02170.22	5e-25	1	1
ENSTRUP00000014583	PAZ	PF02170.22	1.3e-24	1	1
ENSTRUP00000014584	PAZ	PF02170.22	8.7e-20	1	1
ENSTRUP00000014583	Piwi	PF02171.17	1.1e-110	1	1
ENSTRUP00000014582	Piwi	PF02171.17	1.4e-110	1	1
ENSTRUP00000014584	Piwi	PF02171.17	1.5e-110	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSTRUT00000014651	-	2364	-	ENSTRUP00000014583	787 (aa)	-	H2SQ96
ENSTRUT00000014650	-	5600	XM_003965633	ENSTRUP00000014582	866 (aa)	XP_003965682	H2SQ95
ENSTRUT00000014652	-	5681	-	ENSTRUP00000014584	893 (aa)	-	H2SQ97

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSTRUG00000024431	ago1	100	82.469	ENSTRUG00000008052	ago4	99	81.342
ENSTRUG00000024431	ago1	100	82.814	ENSTRUG00000012737	-	100	80.952
ENSTRUG00000024431	ago1	100	82.412	ENSTRUG00000005992	ago3a	100	82.412
ENSTRUG00000024431	ago1	96	83.422	ENSTRUG00000007370	ago2	98	83.422

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSTRUG00000024431	ago1	100	96.442	ENSG00000092847	AGO1	100	96.442	Homo_sapiens
ENSTRUG00000024431	ago1	100	99.238	ENSAPOG00000024299	ago1	100	98.845	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTRUG00000024431	ago1	100	96.442	ENSAMEG00000000504	AGO1	100	95.266	Ailuropoda_melanoleuca
ENSTRUG00000024431	ago1	90	92.362	ENSACIG00000005298	ago1	98	92.362	Amphilophus_citrinellus
ENSTRUG00000024431	ago1	100	99.238	ENSAOCG00000017727	ago1	100	98.845	Amphiprion_ocellaris
ENSTRUG00000024431	ago1	100	99.238	ENSAPEG00000004458	ago1	100	98.845	Amphiprion_percula
ENSTRUG00000024431	ago1	100	99.238	ENSATEG00000008523	ago1	100	98.845	Anabas_testudineus
ENSTRUG00000024431	ago1	100	89.760	ENSAPLG00000010440	AGO1	99	88.736	Anas_platyrhynchos
ENSTRUG00000024431	ago1	100	96.315	ENSACAG00000029174	AGO1	100	96.315	Anolis_carolinensis
ENSTRUG00000024431	ago1	100	96.442	ENSANAG00000037711	AGO1	100	95.266	Aotus_nancymaae
ENSTRUG00000024431	ago1	100	99.111	ENSACLG00000000890	ago1	100	98.845	Astatotilapia_calliptera
ENSTRUG00000024431	ago1	88	98.987	ENSAMXG00000001917	ago1	98	98.987	Astyanax_mexicanus
ENSTRUG00000024431	ago1	100	96.442	ENSBTAG00000012253	AGO1	100	95.266	Bos_taurus
ENSTRUG00000024431	ago1	100	96.442	ENSCJAG00000032023	AGO1	100	95.266	Callithrix_jacchus
ENSTRUG00000024431	ago1	100	96.442	ENSCAFG00000003443	AGO1	100	95.266	Canis_familiaris
ENSTRUG00000024431	ago1	100	96.442	ENSCAFG00020009251	AGO1	99	98.095	Canis_lupus_dingo
ENSTRUG00000024431	ago1	100	96.061	ENSCHIG00000011848	-	100	94.598	Capra_hircus
ENSTRUG00000024431	ago1	100	96.442	ENSTSYG00000009767	-	100	95.266	Carlito_syrichta
ENSTRUG00000024431	ago1	100	75.604	ENSTSYG00000032426	-	99	77.447	Carlito_syrichta
ENSTRUG00000024431	ago1	89	92.531	ENSCAPG00000010228	AGO1	99	91.858	Cavia_aperea
ENSTRUG00000024431	ago1	100	96.442	ENSCPOG00000011568	AGO1	100	95.266	Cavia_porcellus
ENSTRUG00000024431	ago1	100	96.442	ENSCCAG00000011823	AGO1	100	95.266	Cebus_capucinus
ENSTRUG00000024431	ago1	100	96.442	ENSCATG00000031521	AGO1	100	96.442	Cercocebus_atys
ENSTRUG00000024431	ago1	100	96.442	ENSCLAG00000011507	AGO1	100	95.266	Chinchilla_lanigera
ENSTRUG00000024431	ago1	100	96.442	ENSCSAG00000001091	AGO1	100	95.266	Chlorocebus_sabaeus
ENSTRUG00000024431	ago1	86	91.473	ENSCHOG00000011591	AGO1	86	91.473	Choloepus_hoffmanni
ENSTRUG00000024431	ago1	100	96.315	ENSCPBG00000018594	AGO1	100	95.150	Chrysemys_picta_bellii
ENSTRUG00000024431	ago1	100	96.442	ENSCANG00000039798	AGO1	100	95.266	Colobus_angolensis_palliatus
ENSTRUG00000024431	ago1	100	96.442	ENSCGRG00001022708	Ago1	100	95.266	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSTRUG00000024431	ago1	100	96.442	ENSCGRG00000010386	Ago1	99	95.673	Cricetulus_griseus_crigri
ENSTRUG00000024431	ago1	100	97.132	ENSCSEG00000001051	ago1	100	96.785	Cynoglossus_semilaevis
ENSTRUG00000024431	ago1	100	99.238	ENSCVAG00000018173	ago1	100	98.499	Cyprinodon_variegatus
ENSTRUG00000024431	ago1	100	98.856	ENSDARG00000092644	ago1	100	98.037	Danio_rerio
ENSTRUG00000024431	ago1	100	96.442	ENSDNOG00000008077	AGO1	100	96.442	Dasypus_novemcinctus
ENSTRUG00000024431	ago1	91	97.087	ENSDORG00000008494	Ago1	100	97.087	Dipodomys_ordii
ENSTRUG00000024431	ago1	83	88.940	ENSETEG00000007626	AGO1	100	88.219	Echinops_telfairi
ENSTRUG00000024431	ago1	100	96.442	ENSEASG00005012086	AGO1	100	95.266	Equus_asinus_asinus
ENSTRUG00000024431	ago1	100	96.442	ENSECAG00000024353	AGO1	100	95.266	Equus_caballus
ENSTRUG00000024431	ago1	100	88.183	ENSEEUG00000005349	AGO1	87	98.323	Erinaceus_europaeus
ENSTRUG00000024431	ago1	100	98.983	ENSELUG00000016803	ago1	100	98.983	Esox_lucius
ENSTRUG00000024431	ago1	100	96.442	ENSFCAG00000000746	AGO1	100	95.266	Felis_catus
ENSTRUG00000024431	ago1	100	90.241	ENSFALG00000000790	AGO1	100	90.241	Ficedula_albicollis
ENSTRUG00000024431	ago1	100	96.442	ENSFDAG00000017210	AGO1	100	95.266	Fukomys_damarensis
ENSTRUG00000024431	ago1	96	98.940	ENSFHEG00000017927	ago1	100	94.626	Fundulus_heteroclitus
ENSTRUG00000024431	ago1	96	85.942	ENSGMOG00000019413	ago1	95	95.397	Gadus_morhua
ENSTRUG00000024431	ago1	100	96.315	ENSGALG00000002249	AGO1	100	95.150	Gallus_gallus
ENSTRUG00000024431	ago1	100	99.238	ENSGAFG00000009775	ago1	100	98.614	Gambusia_affinis
ENSTRUG00000024431	ago1	96	98.545	ENSGACG00000012443	ago1	100	98.545	Gasterosteus_aculeatus
ENSTRUG00000024431	ago1	100	96.315	ENSGAGG00000012893	-	100	96.315	Gopherus_agassizii
ENSTRUG00000024431	ago1	100	96.442	ENSGGOG00000003316	AGO1	100	95.266	Gorilla_gorilla
ENSTRUG00000024431	ago1	100	99.111	ENSHBUG00000010459	ago1	100	98.845	Haplochromis_burtoni
ENSTRUG00000024431	ago1	100	96.442	ENSHGLG00000011540	AGO1	100	95.266	Heterocephalus_glaber_female
ENSTRUG00000024431	ago1	100	96.442	ENSHGLG00100005568	AGO1	100	95.266	Heterocephalus_glaber_male
ENSTRUG00000024431	ago1	100	99.238	ENSHCOG00000005708	ago1	100	98.832	Hippocampus_comes
ENSTRUG00000024431	ago1	100	98.983	ENSIPUG00000023216	ago1	100	98.499	Ictalurus_punctatus
ENSTRUG00000024431	ago1	100	96.442	ENSSTOG00000010857	AGO1	100	95.266	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSTRUG00000024431	ago1	100	96.442	ENSJJAG00000019449	Ago1	100	95.266	Jaculus_jaculus
ENSTRUG00000024431	ago1	100	99.238	ENSKMAG00000019464	ago1	100	98.730	Kryptolebias_marmoratus
ENSTRUG00000024431	ago1	100	99.238	ENSLBEG00000007694	ago1	100	98.730	Labrus_bergylta
ENSTRUG00000024431	ago1	100	90.368	ENSLACG00000017009	AGO1	99	89.977	Latimeria_chalumnae
ENSTRUG00000024431	ago1	100	94.155	ENSLOCG00000000504	AGO1	100	93.649	Lepisosteus_oculatus
ENSTRUG00000024431	ago1	100	96.442	ENSLAFG00000010835	AGO1	100	95.338	Loxodonta_africana
ENSTRUG00000024431	ago1	100	96.442	ENSMFAG00000002846	AGO1	100	95.266	Macaca_fascicularis
ENSTRUG00000024431	ago1	100	91.487	ENSMMUG00000006251	AGO1	100	91.187	Macaca_mulatta
ENSTRUG00000024431	ago1	100	96.442	ENSMNEG00000028881	AGO1	100	96.442	Macaca_nemestrina
ENSTRUG00000024431	ago1	100	96.442	ENSMLEG00000038388	AGO1	100	95.266	Mandrillus_leucophaeus
ENSTRUG00000024431	ago1	100	99.238	ENSMAMG00000008381	ago1	100	98.845	Mastacembelus_armatus
ENSTRUG00000024431	ago1	100	99.111	ENSMZEG00005007996	ago1	100	98.845	Maylandia_zebra
ENSTRUG00000024431	ago1	100	90.554	ENSMGAG00000003822	AGO1	99	89.770	Meleagris_gallopavo
ENSTRUG00000024431	ago1	100	96.442	ENSMAUG00000015189	Ago1	100	95.266	Mesocricetus_auratus
ENSTRUG00000024431	ago1	100	96.442	ENSMICG00000016147	AGO1	100	95.266	Microcebus_murinus
ENSTRUG00000024431	ago1	100	96.315	ENSMOCG00000000537	Ago1	100	95.150	Microtus_ochrogaster
ENSTRUG00000024431	ago1	86	98.815	ENSMMOG00000018459	ago1	93	98.815	Mola_mola
ENSTRUG00000024431	ago1	100	96.188	ENSMODG00000023335	AGO1	100	95.035	Monodelphis_domestica
ENSTRUG00000024431	ago1	100	99.111	ENSMALG00000011057	ago1	100	98.715	Monopterus_albus
ENSTRUG00000024431	ago1	100	96.442	MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	98.011	Mus_caroli
ENSTRUG00000024431	ago1	100	96.442	ENSMUSG00000041530	Ago1	100	98.011	Mus_musculus
ENSTRUG00000024431	ago1	100	96.442	MGP_PahariEiJ_G0028809	Ago1	100	98.011	Mus_pahari
ENSTRUG00000024431	ago1	100	96.442	MGP_SPRETEiJ_G0027457	Ago1	100	98.011	Mus_spretus
ENSTRUG00000024431	ago1	92	96.957	ENSMPUG00000014872	AGO1	100	96.957	Mustela_putorius_furo
ENSTRUG00000024431	ago1	61	93.220	ENSMLUG00000009628	AGO1	99	93.220	Myotis_lucifugus
ENSTRUG00000024431	ago1	100	96.442	ENSNGAG00000017448	Ago1	100	95.150	Nannospalax_galili
ENSTRUG00000024431	ago1	100	99.111	ENSNBRG00000010867	ago1	100	99.111	Neolamprologus_brichardi
ENSTRUG00000024431	ago1	100	96.442	ENSNLEG00000011181	AGO1	100	95.266	Nomascus_leucogenys
ENSTRUG00000024431	ago1	91	91.429	ENSMEUG00000013429	AGO1	91	91.429	Notamacropus_eugenii
ENSTRUG00000024431	ago1	93	98.480	ENSOPRG00000012325	AGO1	93	98.480	Ochotona_princeps
ENSTRUG00000024431	ago1	100	96.442	ENSODEG00000005321	AGO1	100	95.266	Octodon_degus
ENSTRUG00000024431	ago1	100	99.111	ENSONIG00000016345	ago1	100	98.834	Oreochromis_niloticus
ENSTRUG00000024431	ago1	100	87.783	ENSOANG00000002080	AGO1	100	88.018	Ornithorhynchus_anatinus
ENSTRUG00000024431	ago1	100	96.315	ENSOCUG00000023116	AGO1	100	95.150	Oryctolagus_cuniculus
ENSTRUG00000024431	ago1	100	99.238	ENSORLG00000014965	ago1	100	98.730	Oryzias_latipes
ENSTRUG00000024431	ago1	100	99.238	ENSORLG00020018253	ago1	100	98.730	Oryzias_latipes_hni
ENSTRUG00000024431	ago1	100	99.238	ENSORLG00015003287	ago1	100	98.730	Oryzias_latipes_hsok
ENSTRUG00000024431	ago1	100	99.238	ENSOMEG00000020528	ago1	100	98.730	Oryzias_melastigma
ENSTRUG00000024431	ago1	100	96.442	ENSOGAG00000010279	AGO1	99	95.128	Otolemur_garnettii
ENSTRUG00000024431	ago1	100	96.442	ENSOARG00000019591	AGO1	100	95.266	Ovis_aries
ENSTRUG00000024431	ago1	100	96.442	ENSPPAG00000034838	AGO1	100	95.266	Pan_paniscus
ENSTRUG00000024431	ago1	100	96.442	ENSPPRG00000006475	AGO1	100	95.266	Panthera_pardus
ENSTRUG00000024431	ago1	100	96.188	ENSPTIG00000020991	AGO1	100	95.035	Panthera_tigris_altaica
ENSTRUG00000024431	ago1	100	96.442	ENSPTRG00000000528	AGO1	100	95.266	Pan_troglodytes
ENSTRUG00000024431	ago1	100	96.442	ENSPANG00000009060	AGO1	100	95.266	Papio_anubis
ENSTRUG00000024431	ago1	100	95.437	ENSPSIG00000017482	AGO1	100	94.941	Pelodiscus_sinensis
ENSTRUG00000024431	ago1	88	97.974	ENSPMGG00000024099	ago1	98	97.974	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSTRUG00000024431	ago1	100	96.442	ENSPEMG00000023313	Ago1	100	95.266	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSTRUG00000024431	ago1	100	96.188	ENSPCIG00000000172	AGO1	100	95.035	Phascolarctos_cinereus
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