EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSTRUG00000024468 (Gene tree)
Gene ID: 101074522
Gene Symbol: si:dkey-86e18.1
Alias: im:6912651
Full Name: uncharacterized LOC101074522
Gene Type: protein_coding
Species: Takifugu_rubripes
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 5838 bases
Position: chr20:3676702-3682539
Accession: 101074522
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSTRUP00000049541	Isy1	PF06246.12	4.7e-09	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSTRUT00000057995	-	4734	XM_011614738	ENSTRUP00000049541	276 (aa)	XP_011613040	UPI0005D2212F

Gene Model

Click here to download ENSTRUG00000024468's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSTRUG00000024468's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSTRUG00000024468	si:dkey-86e18.1	99	57.006	ENSAPOG00000002792	si:dkey-86e18.1	99	55.732	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTRUG00000024468	si:dkey-86e18.1	100	60.854	ENSACIG00000007867	si:dkey-86e18.1	100	59.786	Amphilophus_citrinellus
ENSTRUG00000024468	si:dkey-86e18.1	99	57.244	ENSAOCG00000014440	si:dkey-86e18.1	99	57.244	Amphiprion_ocellaris
ENSTRUG00000024468	si:dkey-86e18.1	99	56.908	ENSAPEG00000011831	si:dkey-86e18.1	99	56.908	Amphiprion_percula
ENSTRUG00000024468	si:dkey-86e18.1	99	57.667	ENSATEG00000018061	si:dkey-86e18.1	99	58.446	Anabas_testudineus
ENSTRUG00000024468	si:dkey-86e18.1	97	60.490	ENSACLG00000012308	si:dkey-86e18.1	100	60.204	Astatotilapia_calliptera
ENSTRUG00000024468	si:dkey-86e18.1	99	50.355	ENSAMXG00000038638	si:dkey-86e18.1	98	50.000	Astyanax_mexicanus
ENSTRUG00000024468	si:dkey-86e18.1	99	59.107	ENSCSEG00000007482	-	99	59.107	Cynoglossus_semilaevis
ENSTRUG00000024468	si:dkey-86e18.1	100	53.094	ENSCVAG00000020099	si:dkey-86e18.1	99	51.961	Cyprinodon_variegatus
ENSTRUG00000024468	si:dkey-86e18.1	99	47.535	ENSDARG00000043536	si:dkey-86e18.1	99	48.239	Danio_rerio
ENSTRUG00000024468	si:dkey-86e18.1	100	47.962	ENSELUG00000007229	si:dkey-86e18.1	100	47.962	Esox_lucius
ENSTRUG00000024468	si:dkey-86e18.1	99	53.618	ENSFHEG00000023250	si:dkey-86e18.1	99	53.618	Fundulus_heteroclitus
ENSTRUG00000024468	si:dkey-86e18.1	78	60.494	ENSGAFG00000006609	si:dkey-86e18.1	78	62.338	Gambusia_affinis
ENSTRUG00000024468	si:dkey-86e18.1	97	59.375	ENSHBUG00000018237	si:dkey-86e18.1	100	59.122	Haplochromis_burtoni
ENSTRUG00000024468	si:dkey-86e18.1	99	47.811	ENSIPUG00000012213	si:dkey-86e18.1	99	47.973	Ictalurus_punctatus
ENSTRUG00000024468	si:dkey-86e18.1	99	55.921	ENSKMAG00000008387	si:dkey-86e18.1	99	52.805	Kryptolebias_marmoratus
ENSTRUG00000024468	si:dkey-86e18.1	97	53.169	ENSLBEG00000008055	si:dkey-86e18.1	97	53.633	Labrus_bergylta
ENSTRUG00000024468	si:dkey-86e18.1	98	40.333	ENSLACG00000003926	si:dkey-86e18.1	99	40.333	Latimeria_chalumnae
ENSTRUG00000024468	si:dkey-86e18.1	99	45.907	ENSLOCG00000008902	si:dkey-86e18.1	99	45.390	Lepisosteus_oculatus
ENSTRUG00000024468	si:dkey-86e18.1	100	57.143	ENSMAMG00000016989	si:dkey-86e18.1	100	55.873	Mastacembelus_armatus
ENSTRUG00000024468	si:dkey-86e18.1	97	60.490	ENSMZEG00005019446	si:dkey-86e18.1	100	60.204	Maylandia_zebra
ENSTRUG00000024468	si:dkey-86e18.1	100	60.932	ENSMMOG00000002257	si:dkey-86e18.1	100	60.932	Mola_mola
ENSTRUG00000024468	si:dkey-86e18.1	100	60.507	ENSMALG00000004349	si:dkey-86e18.1	100	60.507	Monopterus_albus
ENSTRUG00000024468	si:dkey-86e18.1	97	58.364	ENSNBRG00000023611	si:dkey-86e18.1	100	57.951	Neolamprologus_brichardi
ENSTRUG00000024468	si:dkey-86e18.1	97	61.702	ENSONIG00000002738	si:dkey-86e18.1	100	60.481	Oreochromis_niloticus
ENSTRUG00000024468	si:dkey-86e18.1	100	53.526	ENSORLG00000028970	si:dkey-86e18.1	100	53.548	Oryzias_latipes
ENSTRUG00000024468	si:dkey-86e18.1	100	54.333	ENSORLG00020021835	si:dkey-86e18.1	100	53.667	Oryzias_latipes_hni
ENSTRUG00000024468	si:dkey-86e18.1	100	53.746	ENSORLG00015018600	si:dkey-86e18.1	100	53.094	Oryzias_latipes_hsok
ENSTRUG00000024468	si:dkey-86e18.1	99	54.967	ENSOMEG00000001778	si:dkey-86e18.1	99	54.967	Oryzias_melastigma
ENSTRUG00000024468	si:dkey-86e18.1	99	46.350	ENSPKIG00000009550	si:dkey-86e18.1	99	46.350	Paramormyrops_kingsleyae
ENSTRUG00000024468	si:dkey-86e18.1	99	51.460	ENSPMGG00000008481	si:dkey-86e18.1	98	51.095	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSTRUG00000024468	si:dkey-86e18.1	99	57.092	ENSPFOG00000014484	si:dkey-86e18.1	99	56.738	Poecilia_formosa
ENSTRUG00000024468	si:dkey-86e18.1	100	54.605	ENSPLAG00000009910	si:dkey-86e18.1	100	54.605	Poecilia_latipinna
ENSTRUG00000024468	si:dkey-86e18.1	100	54.934	ENSPMEG00000003114	si:dkey-86e18.1	100	54.934	Poecilia_mexicana
ENSTRUG00000024468	si:dkey-86e18.1	100	56.522	ENSPREG00000002081	si:dkey-86e18.1	100	55.797	Poecilia_reticulata
ENSTRUG00000024468	si:dkey-86e18.1	97	59.790	ENSPNYG00000007473	si:dkey-86e18.1	100	59.524	Pundamilia_nyererei
ENSTRUG00000024468	si:dkey-86e18.1	99	50.515	ENSPNAG00000008048	si:dkey-86e18.1	99	50.172	Pygocentrus_nattereri
ENSTRUG00000024468	si:dkey-86e18.1	99	44.000	ENSSFOG00015002284	si:dkey-86e18.1	99	44.333	Scleropages_formosus
ENSTRUG00000024468	si:dkey-86e18.1	96	57.383	ENSSMAG00000017672	si:dkey-86e18.1	100	57.051	Scophthalmus_maximus
ENSTRUG00000024468	si:dkey-86e18.1	100	59.561	ENSSDUG00000000818	si:dkey-86e18.1	100	59.561	Seriola_dumerili
ENSTRUG00000024468	si:dkey-86e18.1	100	58.750	ENSSLDG00000000289	si:dkey-86e18.1	100	59.062	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSTRUG00000024468	si:dkey-86e18.1	100	54.140	ENSSPAG00000014712	si:dkey-86e18.1	100	54.140	Stegastes_partitus
ENSTRUG00000024468	si:dkey-86e18.1	100	57.246	ENSXCOG00000008851	si:dkey-86e18.1	100	57.246	Xiphophorus_couchianus
ENSTRUG00000024468	si:dkey-86e18.1	100	53.722	ENSXMAG00000011403	si:dkey-86e18.1	100	53.722	Xiphophorus_maculatus