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Description

Ensembl ID: ENSTSYG00000001871 (Gene tree)
Gene ID: 103258766
Gene Symbol: TNPO1
Alias: IPO2|KPNB2|MIP|MIP1|TRN
Full Name: transportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Carlito_syrichta
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 60147 bases
Position: chrKE938639.1:28761-88907
Accession: 103258766
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSTSYP00000032662	IBN_N	PF03810.19	3.2e-14	1	1
ENSTSYP00000001785	IBN_N	PF03810.19	3.2e-14	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSTSYT00000036249	TNPO1-202	8359	XM_021711550	ENSTSYP00000030577	219 (aa)	XP_021567225	UPI000C2F6BE1
ENSTSYT00000025472	TNPO1-204	2496	-	ENSTSYP00000026668	831 (aa)	-	UPI000C2F4E39
ENSTSYT00000044786	TNPO1-203	2646	XM_008056439	ENSTSYP00000032662	881 (aa)	-	UPI000C2F77B7
ENSTSYT00000001923	TNPO1-201	2613	-	ENSTSYP00000001785	870 (aa)	-	UPI000C2F313E

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	84.678	ENSTSYG00000003828	TNPO2	99	82.599

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	98.246	ENSG00000083312	TNPO1	100	98.964	Homo_sapiens
ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	92.632	ENSAPOG00000003453	tnpo1	99	90.282	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTSYG00000001871	TNPO1	100	94.118	ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	94.849	Ailuropoda_melanoleuca
ENSTSYG00000001871	TNPO1	84	91.610	ENSACIG00000003711	tnpo1	99	88.947	Amphilophus_citrinellus
ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	92.749	ENSAOCG00000008154	tnpo1	99	90.395	Amphiprion_ocellaris
ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	92.749	ENSAPEG00000001112	tnpo1	99	90.395	Amphiprion_percula
ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	92.398	ENSATEG00000010408	tnpo1	99	90.056	Anabas_testudineus
ENSTSYG00000001871	TNPO1	98	92.503	ENSAPLG00000009619	-	97	92.157	Anas_platyrhynchos
ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	95.322	ENSACAG00000009599	TNPO1	99	92.881	Anolis_carolinensis
ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	89.474	ENSANAG00000025351	-	95	89.474	Aotus_nancymaae
ENSTSYG00000001871	TNPO1	100	94.513	ENSANAG00000022453	-	99	95.254	Aotus_nancymaae
ENSTSYG00000001871	TNPO1	100	62.851	ENSANAG00000027118	-	99	63.075	Aotus_nancymaae
ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	90.292	ENSACLG00000027223	tnpo1	99	88.023	Astatotilapia_calliptera
ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	91.599	ENSAMXG00000009842	tnpo1	99	89.177	Astyanax_mexicanus
ENSTSYG00000001871	TNPO1	100	94.961	ENSBTAG00000007979	TNPO1	99	95.706	Bos_taurus
ENSTSYG00000001871	TNPO1	100	94.625	ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	95.367	Callithrix_jacchus
ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	98.016	ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	98.016	Canis_familiaris
ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	95.088	ENSCAFG00020017397	TNPO1	99	92.655	Canis_lupus_dingo
ENSTSYG00000001871	TNPO1	100	94.849	ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	95.593	Capra_hircus
ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	97.778	ENSCCAG00000026472	TNPO1	99	95.254	Cebus_capucinus
ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	98.246	ENSCATG00000043792	TNPO1	99	95.706	Cercocebus_atys
ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	97.778	ENSCLAG00000016191	TNPO1	99	95.254	Chinchilla_lanigera
ENSTSYG00000001871	TNPO1	100	95.073	ENSCSAG00000015616	TNPO1	99	95.819	Chlorocebus_sabaeus
ENSTSYG00000001871	TNPO1	91	84.826	ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	81.948	Choloepus_hoffmanni
ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	96.374	ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	93.898	Chrysemys_picta_bellii
ENSTSYG00000001871	TNPO1	98	74.306	ENSCSAVG00000010981	-	99	72.809	Ciona_savignyi
ENSTSYG00000001871	TNPO1	100	94.961	ENSCANG00000004353	TNPO1	99	95.706	Colobus_angolensis_palliatus
ENSTSYG00000001871	TNPO1	100	94.625	ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	95.367	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	97.895	ENSCGRG00000010366	Tnpo1	100	97.895	Cricetulus_griseus_crigri
ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	91.228	ENSCSEG00000012674	tnpo1	99	88.927	Cynoglossus_semilaevis
ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	92.164	ENSCVAG00000001010	tnpo1	99	89.831	Cyprinodon_variegatus
ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	91.472	ENSDARG00000035390	tnpo1	99	89.165	Danio_rerio
ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	91.958	ENSDNOG00000006647	TNPO1	99	89.640	Dasypus_novemcinctus
ENSTSYG00000001871	TNPO1	94	98.193	ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	98.191	Dipodomys_ordii
ENSTSYG00000001871	TNPO1	95	58.987	FBgn0035693	CG8219	96	58.504	Drosophila_melanogaster
ENSTSYG00000001871	TNPO1	86	98.502	ENSETEG00000017805	TNPO1	89	98.502	Echinops_telfairi
ENSTSYG00000001871	TNPO1	96	84.167	ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	84.286	Eptatretus_burgeri
ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	98.246	ENSEASG00005018055	TNPO1	99	95.706	Equus_asinus_asinus
ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	98.129	ENSECAG00000024424	TNPO1	99	95.593	Equus_caballus
ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	85.277	ENSELUG00000002821	tnpo1	96	84.824	Esox_lucius
ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	98.246	ENSFCAG00000013181	TNPO1	99	95.706	Felis_catus
ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	96.023	ENSFALG00000010292	TNPO1	99	93.559	Ficedula_albicollis
ENSTSYG00000001871	TNPO1	100	94.625	ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	95.367	Fukomys_damarensis
ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	92.523	ENSFHEG00000019234	tnpo1	96	92.523	Fundulus_heteroclitus
ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	88.811	ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	86.486	Gadus_morhua
ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	95.205	ENSGALG00000015014	TNPO1	99	92.768	Gallus_gallus
ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	91.132	ENSGAFG00000000943	tnpo1	99	88.726	Gambusia_affinis
ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	92.047	ENSGACG00000015841	tnpo1	99	89.718	Gasterosteus_aculeatus
ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	96.140	ENSGAGG00000013419	TNPO1	99	93.672	Gopherus_agassizii
ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	98.246	ENSGGOG00000026800	TNPO1	99	95.706	Gorilla_gorilla
ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	81.797	ENSGGOG00000022535	-	99	79.596	Gorilla_gorilla
ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	91.930	ENSHBUG00000008068	tnpo1	99	89.605	Haplochromis_burtoni
ENSTSYG00000001871	TNPO1	100	94.289	ENSHGLG00000000970	-	99	95.028	Heterocephalus_glaber_female
ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	97.544	ENSHGLG00100017090	-	99	97.544	Heterocephalus_glaber_male
ENSTSYG00000001871	TNPO1	98	75.870	ENSHGLG00100000963	-	99	75.290	Heterocephalus_glaber_male
ENSTSYG00000001871	TNPO1	100	94.961	ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	94.961	Jaculus_jaculus
ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	92.281	ENSKMAG00000018195	tnpo1	99	89.944	Kryptolebias_marmoratus
ENSTSYG00000001871	TNPO1	88	88.789	ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	85.980	Labrus_bergylta
ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	87.893	ENSLACG00000012199	TNPO1	99	87.893	Latimeria_chalumnae
ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	94.035	ENSLOCG00000011092	tnpo1	97	91.638	Lepisosteus_oculatus
ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	98.012	ENSLAFG00000011796	TNPO1	99	98.012	Loxodonta_africana
ENSTSYG00000001871	TNPO1	100	94.961	ENSMFAG00000003636	TNPO1	99	95.706	Macaca_fascicularis
ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	98.129	ENSMMUG00000020923	TNPO1	100	95.276	Macaca_mulatta
ENSTSYG00000001871	TNPO1	100	94.961	ENSMNEG00000044581	TNPO1	99	95.706	Macaca_nemestrina
ENSTSYG00000001871	TNPO1	100	94.961	ENSMLEG00000030740	TNPO1	99	95.706	Mandrillus_leucophaeus
ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	92.398	ENSMAMG00000001357	tnpo1	99	90.056	Mastacembelus_armatus
ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	91.696	ENSMZEG00005004913	tnpo1	99	89.379	Maylandia_zebra
ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	97.895	ENSMAUG00000020550	Tnpo1	99	95.367	Mesocricetus_auratus
ENSTSYG00000001871	TNPO1	100	91.041	ENSMICG00000008468	TNPO1	99	91.751	Microcebus_murinus
ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	97.895	ENSMOCG00000009301	Tnpo1	98	95.367	Microtus_ochrogaster
ENSTSYG00000001871	TNPO1	84	91.363	ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	87.938	Mola_mola
ENSTSYG00000001871	TNPO1	98	97.234	ENSMODG00000001721	TNPO1	80	97.234	Monodelphis_domestica
ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	91.101	ENSMALG00000009782	tnpo1	99	88.801	Monopterus_albus
ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	97.661	MGP_CAROLIEiJ_G0018826	Tnpo1	99	95.141	Mus_caroli
ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	97.895	ENSMUSG00000009470	Tnpo1	99	95.367	Mus_musculus
ENSTSYG00000001871	TNPO1	100	94.513	MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	99	95.254	Mus_pahari
ENSTSYG00000001871	TNPO1	100	94.401	MGP_SPRETEiJ_G0019708	Tnpo1	99	95.141	Mus_spretus
ENSTSYG00000001871	TNPO1	100	94.849	ENSMPUG00000014387	TNPO1	99	95.593	Mustela_putorius_furo
ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	97.555	ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	97.555	Myotis_lucifugus
ENSTSYG00000001871	TNPO1	100	94.737	ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	95.480	Nannospalax_galili
ENSTSYG00000001871	TNPO1	84	91.475	ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	88.817	Neolamprologus_brichardi
ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	98.246	ENSNLEG00000004572	TNPO1	99	95.706	Nomascus_leucogenys
ENSTSYG00000001871	TNPO1	89	91.411	ENSOPRG00000012390	TNPO1	89	91.411	Ochotona_princeps
ENSTSYG00000001871	TNPO1	100	94.289	ENSODEG00000001771	TNPO1	99	95.028	Octodon_degus
ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	91.173	ENSONIG00000011151	tnpo1	99	88.889	Oreochromis_niloticus
ENSTSYG00000001871	TNPO1	93	96.341	ENSOANG00000015785	TNPO1	100	96.341	Ornithorhynchus_anatinus
ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	91.589	ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	91.589	Oryctolagus_cuniculus
ENSTSYG00000001871	TNPO1	84	91.340	ENSORLG00000003182	tnpo1	99	88.687	Oryzias_latipes
ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	91.696	ENSORLG00020011559	tnpo1	99	89.379	Oryzias_latipes_hni
ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	91.813	ENSORLG00015019113	tnpo1	99	89.492	Oryzias_latipes_hsok
ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	91.696	ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	89.379	Oryzias_melastigma
ENSTSYG00000001871	TNPO1	100	95.073	ENSOGAG00000000808	TNPO1	99	95.819	Otolemur_garnettii
ENSTSYG00000001871	TNPO1	100	94.961	ENSOARG00000005038	TNPO1	84	94.961	Ovis_aries
ENSTSYG00000001871	TNPO1	100	94.961	ENSPPAG00000042518	TNPO1	99	95.706	Pan_paniscus
ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	98.246	ENSPPRG00000022336	TNPO1	99	95.706	Panthera_pardus
ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	98.246	ENSPTIG00000018839	TNPO1	99	95.706	Panthera_tigris_altaica
ENSTSYG00000001871	TNPO1	91	85.362	ENSPTRG00000047731	-	99	82.845	Pan_troglodytes
ENSTSYG00000001871	TNPO1	100	94.961	ENSPTRG00000016972	TNPO1	99	95.706	Pan_troglodytes
ENSTSYG00000001871	TNPO1	100	94.961	ENSPANG00000006074	TNPO1	99	95.706	Papio_anubis
ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	91.145	ENSPKIG00000019795	tnpo1	99	88.826	Paramormyrops_kingsleyae
ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	96.023	ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	93.559	Pelodiscus_sinensis
ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	89.603	ENSPMGG00000017014	tnpo1	99	87.359	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	97.895	ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	97.895	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	96.959	ENSPCIG00000026080	TNPO1	99	94.463	Phascolarctos_cinereus
ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	92.075	ENSPFOG00000011447	tnpo1	96	92.075	Poecilia_formosa
ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	92.075	ENSPLAG00000018696	tnpo1	96	92.075	Poecilia_latipinna
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