EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSTSYG00000002761 (Gene tree)
Gene ID: 103270050
Gene Symbol: POLR1A
Alias: -
Full Name: RNA polymerase I subunit A
Gene Type: protein_coding
Species: Carlito_syrichta
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 75645 bases
Position: chrKE944793.1:281998-357642
Accession: 103270050
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSTSYP00000002581	RNA_pol_Rpb1_5	PF04998.17	2.3e-101	1	1
ENSTSYP00000002581	RNA_pol_Rpb1_4	PF05000.17	8.3e-25	1	1
ENSTSYP00000002581	RNA_pol_Rpb1_2	PF00623.20	2.3e-70	1	1
ENSTSYP00000002581	RNA_pol_Rpb1_3	PF04983.18	1.3e-37	1	1
ENSTSYP00000002581	RNA_pol_Rpb1_1	PF04997.12	4.9e-22	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSTSYT00000002815	POLR1A-201	5290	XM_008067587	ENSTSYP00000002581	1716 (aa)	XP_008065778	A0A1U7UAL5

Gene Model

Click here to download ENSTSYG00000002761's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSTSYG00000002761's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSTSYG00000002761	POLR1A	60	33.043	ENSTSYG00000006671	POLR3A	66	33.043
ENSTSYG00000002761	POLR1A	79	38.571	ENSTSYG00000012803	-	66	38.571

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	89.773	ENSG00000068654	POLR1A	100	90.238	Homo_sapiens
ENSTSYG00000002761	POLR1A	69	67.736	ENSAPOG00000017945	polr1a	99	67.736	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	88.941	ENSAMEG00000005807	POLR1A	100	90.061	Ailuropoda_melanoleuca
ENSTSYG00000002761	POLR1A	96	67.034	ENSACIG00000022147	polr1a	100	67.034	Amphilophus_citrinellus
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	65.563	ENSAOCG00000017336	polr1a	100	67.890	Amphiprion_ocellaris
ENSTSYG00000002761	POLR1A	94	73.239	ENSAPEG00000016105	polr1a	98	73.239	Amphiprion_percula
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	65.436	ENSATEG00000016773	polr1a	100	65.820	Anabas_testudineus
ENSTSYG00000002761	POLR1A	86	71.496	ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	72.049	Anas_platyrhynchos
ENSTSYG00000002761	POLR1A	99	69.191	ENSACAG00000012141	POLR1A	99	68.382	Anolis_carolinensis
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	88.663	ENSANAG00000033927	POLR1A	100	88.721	Aotus_nancymaae
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	62.021	ENSACLG00000020541	polr1a	100	61.761	Astatotilapia_calliptera
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	87.194	ENSBTAG00000006481	POLR1A	100	87.202	Bos_taurus
ENSTSYG00000002761	POLR1A	99	37.773	WBGene00012999	rpoa-1	98	37.718	Caenorhabditis_elegans
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	88.321	ENSCJAG00000019547	POLR1A	100	88.669	Callithrix_jacchus
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	88.947	ENSCAFG00000007613	POLR1A	100	88.947	Canis_familiaris
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	88.747	ENSCAFG00020014752	POLR1A	100	88.747	Canis_lupus_dingo
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	85.938	ENSCHIG00000018204	POLR1A	99	86.788	Capra_hircus
ENSTSYG00000002761	POLR1A	97	82.019	ENSCAPG00000010132	POLR1A	100	82.286	Cavia_aperea
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	86.562	ENSCPOG00000012350	POLR1A	100	86.853	Cavia_porcellus
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	88.727	ENSCCAG00000019839	POLR1A	100	89.076	Cebus_capucinus
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	90.006	ENSCATG00000029786	POLR1A	100	90.471	Cercocebus_atys
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	86.725	ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	86.725	Chinchilla_lanigera
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	89.890	ENSCSAG00000016251	POLR1A	100	90.296	Chlorocebus_sabaeus
ENSTSYG00000002761	POLR1A	99	73.438	ENSCPBG00000001115	POLR1A	99	73.807	Chrysemys_picta_bellii
ENSTSYG00000002761	POLR1A	99	46.098	ENSCSAVG00000007184	-	99	48.195	Ciona_savignyi
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	87.108	ENSCANG00000031785	POLR1A	100	87.166	Colobus_angolensis_palliatus
ENSTSYG00000002761	POLR1A	96	88.553	ENSCGRG00001006651	Polr1a	100	88.553	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSTSYG00000002761	POLR1A	60	84.869	ENSCGRG00000010834	Polr1a	100	84.869	Cricetulus_griseus_crigri
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	61.453	ENSCSEG00000020190	polr1a	100	60.872	Cynoglossus_semilaevis
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	64.315	ENSCVAG00000020941	polr1a	100	64.372	Cyprinodon_variegatus
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	65.533	ENSDARG00000098375	polr1a	100	66.279	Danio_rerio
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	80.916	ENSDNOG00000010829	POLR1A	100	81.254	Dasypus_novemcinctus
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	85.971	ENSDORG00000008298	Polr1a	100	85.971	Dipodomys_ordii
ENSTSYG00000002761	POLR1A	80	44.006	FBgn0019938	RpI1	99	42.949	Drosophila_melanogaster
ENSTSYG00000002761	POLR1A	72	96.875	ENSETEG00000000412	-	72	96.875	Echinops_telfairi
ENSTSYG00000002761	POLR1A	88	66.929	ENSEBUG00000005667	-	99	66.929	Eptatretus_burgeri
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	88.669	ENSEASG00005001625	POLR1A	100	89.024	Equus_asinus_asinus
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	88.669	ENSECAG00000010092	POLR1A	100	91.060	Equus_caballus
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	88.669	ENSECAG00000030510	-	100	91.060	Equus_caballus
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	88.669	ENSECAG00000036306	-	100	91.060	Equus_caballus
ENSTSYG00000002761	POLR1A	85	92.553	ENSEEUG00000000676	POLR1A	85	92.222	Erinaceus_europaeus
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	67.210	ENSELUG00000012769	polr1a	99	67.210	Esox_lucius
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	88.249	ENSFCAG00000008966	POLR1A	100	88.307	Felis_catus
ENSTSYG00000002761	POLR1A	99	70.194	ENSFALG00000010082	POLR1A	99	70.106	Ficedula_albicollis
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	87.151	ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	87.151	Fukomys_damarensis
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	61.556	ENSFHEG00000005996	polr1a	100	61.530	Fundulus_heteroclitus
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	59.033	ENSGMOG00000002230	polr1a	100	58.964	Gadus_morhua
ENSTSYG00000002761	POLR1A	90	69.221	ENSGALG00000038160	-	99	69.285	Gallus_gallus
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	64.423	ENSGAFG00000015266	polr1a	100	64.030	Gambusia_affinis
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	64.142	ENSGACG00000018791	polr1a	100	63.792	Gasterosteus_aculeatus
ENSTSYG00000002761	POLR1A	89	74.225	ENSGAGG00000004984	-	96	79.950	Gopherus_agassizii
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	89.773	ENSGGOG00000001788	POLR1A	100	90.238	Gorilla_gorilla
ENSTSYG00000002761	POLR1A	90	64.217	ENSHBUG00000020021	polr1a	99	64.217	Haplochromis_burtoni
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	87.202	ENSHGLG00000006334	POLR1A	100	87.500	Heterocephalus_glaber_female
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	86.949	ENSHGLG00100006614	POLR1A	100	87.246	Heterocephalus_glaber_male
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	61.490	ENSHCOG00000003345	polr1a	100	61.255	Hippocampus_comes
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	66.086	ENSIPUG00000013174	polr1a	100	65.431	Ictalurus_punctatus
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	85.681	ENSSTOG00000012580	POLR1A	100	85.806	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	86.461	ENSJJAG00000013113	Polr1a	100	86.403	Jaculus_jaculus
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	65.253	ENSKMAG00000007399	polr1a	100	64.716	Kryptolebias_marmoratus
ENSTSYG00000002761	POLR1A	95	68.303	ENSLBEG00000015401	polr1a	99	68.366	Labrus_bergylta
ENSTSYG00000002761	POLR1A	53	75.272	ENSLACG00000003218	polr1a	100	75.272	Latimeria_chalumnae
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	69.485	ENSLOCG00000010881	polr1a	100	69.543	Lepisosteus_oculatus
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	86.725	ENSLAFG00000014948	POLR1A	100	86.790	Loxodonta_africana
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	90.122	ENSMFAG00000046097	POLR1A	100	90.529	Macaca_fascicularis
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	90.122	ENSMMUG00000015815	POLR1A	100	90.529	Macaca_mulatta
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	90.122	ENSMNEG00000043313	POLR1A	100	90.529	Macaca_nemestrina
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	89.309	ENSMLEG00000042428	POLR1A	100	89.773	Mandrillus_leucophaeus
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	65.852	ENSMAMG00000016565	polr1a	100	65.389	Mastacembelus_armatus
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	65.389	ENSMZEG00005004915	polr1a	100	65.180	Maylandia_zebra
ENSTSYG00000002761	POLR1A	99	68.913	ENSMGAG00000013111	POLR1A	99	68.913	Meleagris_gallopavo
ENSTSYG00000002761	POLR1A	92	86.384	ENSMAUG00000008497	Polr1a	100	86.384	Mesocricetus_auratus
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	89.309	ENSMICG00000000757	POLR1A	100	89.367	Microcebus_murinus
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	86.303	ENSMOCG00000000122	Polr1a	100	86.303	Microtus_ochrogaster
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	64.983	ENSMMOG00000010216	polr1a	100	64.344	Mola_mola
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	73.976	ENSMODG00000009335	POLR1A	100	73.705	Monodelphis_domestica
ENSTSYG00000002761	POLR1A	83	66.410	ENSMALG00000013363	polr1a	100	64.986	Monopterus_albus
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	84.968	MGP_CAROLIEiJ_G0028494	Polr1a	100	84.852	Mus_caroli
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	85.200	ENSMUSG00000049553	Polr1a	100	84.968	Mus_musculus
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	85.839	MGP_PahariEiJ_G0022230	Polr1a	100	85.490	Mus_pahari
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	83.305	MGP_SPRETEiJ_G0029499	Polr1a	100	84.000	Mus_spretus
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	88.773	ENSMPUG00000009135	POLR1A	100	88.889	Mustela_putorius_furo
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	86.343	ENSMLUG00000015723	POLR1A	100	86.458	Myotis_lucifugus
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	86.543	ENSNGAG00000017907	Polr1a	100	86.775	Nannospalax_galili
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	65.505	ENSNBRG00000000519	polr1a	100	65.469	Neolamprologus_brichardi
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	87.507	ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	87.796	Nomascus_leucogenys
ENSTSYG00000002761	POLR1A	75	90.551	ENSMEUG00000011665	-	75	90.551	Notamacropus_eugenii
ENSTSYG00000002761	POLR1A	99	80.436	ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	80.613	Ochotona_princeps
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	86.361	ENSODEG00000003542	POLR1A	100	86.535	Octodon_degus
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	65.197	ENSONIG00000015895	polr1a	100	65.471	Oreochromis_niloticus
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	87.456	ENSOCUG00000010138	POLR1A	100	87.631	Oryctolagus_cuniculus
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	64.559	ENSORLG00000008753	polr1a	99	64.132	Oryzias_latipes
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	63.694	ENSORLG00020020726	polr1a	99	63.499	Oryzias_latipes_hni
ENSTSYG00000002761	POLR1A	95	74.468	ENSORLG00015016071	polr1a	98	74.444	Oryzias_latipes_hsok
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	88.263	ENSOGAG00000004031	POLR1A	100	88.030	Otolemur_garnettii
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	86.477	ENSOARG00000020601	POLR1A	100	86.941	Ovis_aries
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	89.425	ENSPPAG00000042450	POLR1A	100	89.890	Pan_paniscus
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	88.598	ENSPPRG00000006702	POLR1A	100	88.598	Panthera_pardus
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	88.058	ENSPTIG00000018783	POLR1A	100	88.058	Panthera_tigris_altaica
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	89.890	ENSPTRG00000012147	POLR1A	100	89.890	Pan_troglodytes
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	90.006	ENSPANG00000025908	POLR1A	100	90.471	Papio_anubis
ENSTSYG00000002761	POLR1A	94	75.694	ENSPKIG00000005468	polr1a	99	75.694	Paramormyrops_kingsleyae
ENSTSYG00000002761	POLR1A	63	71.191	ENSPSIG00000009321	-	99	70.550	Pelodiscus_sinensis
ENSTSYG00000002761	POLR1A	54	68.235	ENSPMGG00000009718	polr1a	95	68.235	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	87.007	ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	87.065	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSTSYG00000002761	POLR1A	95	77.771	ENSPCIG00000004222	POLR1A	99	77.555	Phascolarctos_cinereus
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	65.119	ENSPFOG00000005025	polr1a	100	65.177	Poecilia_formosa
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	65.235	ENSPLAG00000021389	polr1a	100	65.157	Poecilia_latipinna
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	63.378	ENSPMEG00000006463	polr1a	100	63.557	Poecilia_mexicana
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	64.945	ENSPREG00000002389	polr1a	100	64.925	Poecilia_reticulata
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	89.076	ENSPPYG00000012217	POLR1A	100	89.483	Pongo_abelii
ENSTSYG00000002761	POLR1A	92	88.000	ENSPCAG00000011582	POLR1A	91	83.333	Procavia_capensis
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	89.309	ENSPCOG00000026987	POLR1A	100	89.367	Propithecus_coquereli
ENSTSYG00000002761	POLR1A	95	86.765	ENSPVAG00000012674	POLR1A	95	86.572	Pteropus_vampyrus
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	65.389	ENSPNYG00000000026	polr1a	100	65.180	Pundamilia_nyererei
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	66.725	ENSPNAG00000019223	polr1a	100	66.397	Pygocentrus_nattereri
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	86.361	ENSRNOG00000009545	Polr1a	100	86.361	Rattus_norvegicus
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	89.134	ENSRBIG00000028335	POLR1A	100	89.657	Rhinopithecus_bieti
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	89.076	ENSRROG00000031473	POLR1A	100	89.599	Rhinopithecus_roxellana
ENSTSYG00000002761	POLR1A	99	36.738	YOR341W	RPA190	99	36.717	Saccharomyces_cerevisiae
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	87.914	ENSSBOG00000030262	POLR1A	100	88.263	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	72.575	ENSSHAG00000014739	POLR1A	100	72.517	Sarcophilus_harrisii
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	67.712	ENSSFOG00015019716	polr1a	100	66.879	Scleropages_formosus
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	65.759	ENSSMAG00000014342	polr1a	100	65.549	Scophthalmus_maximus
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	66.145	ENSSDUG00000014631	polr1a	100	65.629	Seriola_dumerili
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	64.340	ENSSLDG00000024095	polr1a	100	64.049	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSTSYG00000002761	POLR1A	74	94.681	ENSSARG00000003136	-	74	94.681	Sorex_araneus
ENSTSYG00000002761	POLR1A	94	76.410	ENSSPUG00000004215	POLR1A	100	74.702	Sphenodon_punctatus
ENSTSYG00000002761	POLR1A	64	71.995	ENSSPAG00000016341	polr1a	94	71.995	Stegastes_partitus
ENSTSYG00000002761	POLR1A	83	89.286	ENSSSCG00000008226	POLR1A	99	89.045	Sus_scrofa
ENSTSYG00000002761	POLR1A	99	69.811	ENSTGUG00000010704	POLR1A	100	69.186	Taeniopygia_guttata
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	63.862	ENSTRUG00000002210	polr1a	99	63.668	Takifugu_rubripes
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	60.184	ENSTNIG00000010116	polr1a	100	60.161	Tetraodon_nigroviridis
ENSTSYG00000002761	POLR1A	74	95.133	ENSTBEG00000008646	POLR1A	74	95.133	Tupaia_belangeri
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	84.692	ENSTTRG00000008597	POLR1A	100	84.459	Tursiops_truncatus
ENSTSYG00000002761	POLR1A	69	88.409	ENSUAMG00000012158	-	94	88.280	Ursus_americanus
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	87.900	ENSUMAG00000006700	POLR1A	100	87.696	Ursus_maritimus
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	89.012	ENSVVUG00000001245	POLR1A	100	89.012	Vulpes_vulpes
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	67.940	ENSXETG00000001952	polr1a	100	68.601	Xenopus_tropicalis
ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	64.907	ENSXMAG00000004032	polr1a	100	64.686	Xiphophorus_maculatus