EuRBPDB

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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSTSYG00000003828 (Gene tree)
Gene ID: 103250452
Gene Symbol: TNPO2
Alias: -
Full Name: transportin 2
Gene Type: protein_coding
Species: Carlito_syrichta
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 18800 bases
Position: chrKE930053.1:45577-64376
Accession: 103250452
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSTSYP00000023440	IBN_N	PF03810.19	6.5e-16	1	1
ENSTSYP00000003513	IBN_N	PF03810.19	6.7e-16	1	1
ENSTSYP00000019126	IBN_N	PF03810.19	7.2e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSTSYT00000048551	TNPO2-201	5006	XM_008049039	ENSTSYP00000023440	887 (aa)	XP_008047230	A0A1U7T2S9
ENSTSYT00000003840	TNPO2-203	2625	-	ENSTSYP00000003513	874 (aa)	-	UPI000C2F449F
ENSTSYT00000043837	TNPO2-202	2697	XM_008049042	ENSTSYP00000019126	898 (aa)	-	UPI000C2F58F2

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSTSYG00000003828	TNPO2	99	82.599	ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	84.678

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	99.775	ENSG00000105576	TNPO2	100	100.000	Homo_sapiens
ENSTSYG00000003828	TNPO2	82	90.897	ENSAPOG00000013185	-	96	90.897	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	93.026	ENSAPOG00000009339	TNPO2	100	93.026	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	96.990	ENSAMEG00000012123	TNPO2	100	96.990	Ailuropoda_melanoleuca
ENSTSYG00000003828	TNPO2	87	92.996	ENSACIG00000007518	tnpo2	98	92.636	Amphilophus_citrinellus
ENSTSYG00000003828	TNPO2	87	92.228	ENSACIG00000009586	-	100	92.228	Amphilophus_citrinellus
ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	93.026	ENSAOCG00000010152	-	100	93.026	Amphiprion_ocellaris
ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	92.801	ENSAOCG00000010374	tnpo2	100	92.801	Amphiprion_ocellaris
ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	92.801	ENSAPEG00000008429	tnpo2	100	92.801	Amphiprion_percula
ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	93.026	ENSAPEG00000013268	-	100	93.026	Amphiprion_percula
ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	92.801	ENSATEG00000019171	-	100	92.801	Anabas_testudineus
ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	92.688	ENSATEG00000024761	TNPO2	100	92.688	Anabas_testudineus
ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	96.622	ENSACAG00000003576	TNPO2	100	96.622	Anolis_carolinensis
ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	99.662	ENSANAG00000036645	TNPO2	100	99.662	Aotus_nancymaae
ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	92.913	ENSACLG00000001853	tnpo2	100	92.913	Astatotilapia_calliptera
ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	86.727	ENSACLG00000020672	-	100	86.839	Astatotilapia_calliptera
ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	91.463	ENSAMXG00000010246	tnpo2	100	91.353	Astyanax_mexicanus
ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	99.662	ENSBTAG00000011811	TNPO2	100	99.662	Bos_taurus
ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	98.662	ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	98.662	Callithrix_jacchus
ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	99.887	ENSCAFG00000017226	TNPO2	85	99.887	Canis_familiaris
ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	99.887	ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	99.887	Canis_lupus_dingo
ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	94.983	ENSCHIG00000011718	TNPO2	100	94.983	Capra_hircus
ENSTSYG00000003828	TNPO2	93	96.901	ENSCAPG00000015700	TNPO2	96	96.901	Cavia_aperea
ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	99.436	ENSCPOG00000007033	TNPO2	100	99.436	Cavia_porcellus
ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	99.775	ENSCCAG00000024574	TNPO2	100	99.775	Cebus_capucinus
ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	98.662	ENSCATG00000042599	TNPO2	100	98.662	Cercocebus_atys
ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	99.436	ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	99.436	Chinchilla_lanigera
ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	99.775	ENSCSAG00000006597	TNPO2	100	99.775	Chlorocebus_sabaeus
ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	96.847	ENSCPBG00000023892	TNPO2	100	96.847	Chrysemys_picta_bellii
ENSTSYG00000003828	TNPO2	96	99.766	ENSCANG00000027834	TNPO2	98	99.766	Colobus_angolensis_palliatus
ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	98.774	ENSCGRG00001015917	Tnpo2	100	98.774	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	99.887	ENSCGRG00000012601	Tnpo2	100	99.887	Cricetulus_griseus_crigri
ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	88.764	ENSCSEG00000012923	tnpo2	100	88.652	Cynoglossus_semilaevis
ENSTSYG00000003828	TNPO2	87	90.568	ENSCSEG00000011477	-	100	90.698	Cynoglossus_semilaevis
ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	92.913	ENSCVAG00000001908	TNPO2	100	92.913	Cyprinodon_variegatus
ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	91.348	ENSCVAG00000002750	tnpo2	100	91.348	Cyprinodon_variegatus
ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	89.651	ENSDARG00000038239	tnpo2	100	89.876	Danio_rerio
ENSTSYG00000003828	TNPO2	88	89.231	ENSDNOG00000043264	TNPO2	84	89.231	Dasypus_novemcinctus
ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	92.984	ENSDORG00000014993	Tnpo2	100	100.000	Dipodomys_ordii
ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	72.595	FBgn0024921	Tnpo	100	72.483	Drosophila_melanogaster
ENSTSYG00000003828	TNPO2	91	91.509	ENSETEG00000014785	TNPO2	92	91.509	Echinops_telfairi
ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	99.662	ENSEASG00005004160	TNPO2	100	99.662	Equus_asinus_asinus
ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	99.775	ENSECAG00000013673	TNPO2	100	99.775	Equus_caballus
ENSTSYG00000003828	TNPO2	80	90.237	ENSELUG00000016542	-	99	83.077	Esox_lucius
ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	92.342	ENSELUG00000008680	tnpo2	100	92.342	Esox_lucius
ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	98.662	ENSFCAG00000000467	TNPO2	100	98.662	Felis_catus
ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	99.549	ENSFDAG00000021543	TNPO2	100	99.549	Fukomys_damarensis
ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	91.573	ENSFHEG00000016501	tnpo2	100	91.573	Fundulus_heteroclitus
ENSTSYG00000003828	TNPO2	97	92.326	ENSFHEG00000009734	TNPO2	99	92.326	Fundulus_heteroclitus
ENSTSYG00000003828	TNPO2	83	90.741	ENSGMOG00000014237	-	90	90.741	Gadus_morhua
ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	85.090	ENSGMOG00000009021	tnpo2	100	85.090	Gadus_morhua
ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	92.913	ENSGAFG00000010401	TNPO2	100	92.913	Gambusia_affinis
ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	91.910	ENSGAFG00000018993	tnpo2	100	91.910	Gambusia_affinis
ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	96.959	ENSGAGG00000010150	TNPO2	100	96.959	Gopherus_agassizii
ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	92.913	ENSHBUG00000018317	-	100	92.913	Haplochromis_burtoni
ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	92.913	ENSHBUG00000014849	tnpo2	100	92.913	Haplochromis_burtoni
ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	99.436	ENSHGLG00000016928	TNPO2	100	99.436	Heterocephalus_glaber_female
ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	97.770	ENSHGLG00100009938	TNPO2	100	97.770	Heterocephalus_glaber_male
ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	91.564	ENSHCOG00000005914	tnpo2	100	91.339	Hippocampus_comes
ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	92.913	ENSHCOG00000020440	-	100	92.913	Hippocampus_comes
ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	92.576	ENSIPUG00000005768	tnpo2	100	92.576	Ictalurus_punctatus
ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	92.238	ENSIPUG00000006884	TNPO2	99	92.238	Ictalurus_punctatus
ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	99.775	ENSSTOG00000006952	TNPO2	100	99.775	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	98.662	ENSJJAG00000016820	Tnpo2	100	98.662	Jaculus_jaculus
ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	92.801	ENSKMAG00000018430	TNPO2	100	92.801	Kryptolebias_marmoratus
ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	90.643	ENSKMAG00000021274	TNPO2	100	90.643	Kryptolebias_marmoratus
ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	92.913	ENSLBEG00000026241	tnpo2	100	92.913	Labrus_bergylta
ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	93.251	ENSLBEG00000005301	-	100	93.251	Labrus_bergylta
ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	91.206	ENSLACG00000012322	TNPO2	99	91.206	Latimeria_chalumnae
ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	94.151	ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	94.151	Lepisosteus_oculatus
ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	98.551	ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	98.551	Loxodonta_africana
ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	98.662	ENSMFAG00000037531	TNPO2	100	98.662	Macaca_fascicularis
ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	99.775	ENSMMUG00000005684	TNPO2	100	99.775	Macaca_mulatta
ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	99.775	ENSMNEG00000041024	TNPO2	100	99.775	Macaca_nemestrina
ENSTSYG00000003828	TNPO2	98	97.693	ENSMLEG00000018391	TNPO2	98	98.611	Mandrillus_leucophaeus
ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	93.026	ENSMAMG00000011862	-	100	93.026	Mastacembelus_armatus
ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	91.121	ENSMAMG00000023658	tnpo2	100	91.121	Mastacembelus_armatus
ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	92.913	ENSMZEG00005023965	tnpo2	100	92.913	Maylandia_zebra
ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	92.913	ENSMZEG00005007408	-	100	92.913	Maylandia_zebra
ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	88.652	ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	88.989	Maylandia_zebra
ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	99.775	ENSMICG00000016153	TNPO2	100	99.775	Microcebus_murinus
ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	99.887	ENSMOCG00000016489	Tnpo2	100	99.887	Microtus_ochrogaster
ENSTSYG00000003828	TNPO2	88	91.421	ENSMMOG00000021390	TNPO2	99	92.109	Mola_mola
ENSTSYG00000003828	TNPO2	87	87.549	ENSMMOG00000005063	TNPO2	93	87.289	Mola_mola
ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	96.774	ENSMODG00000006888	TNPO2	100	96.774	Monodelphis_domestica
ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	92.913	ENSMALG00000006232	TNPO2	100	92.913	Monopterus_albus
ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	91.339	ENSMALG00000004721	tnpo2	100	91.676	Monopterus_albus
ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	99.662	MGP_CAROLIEiJ_G0031326	Tnpo2	100	99.662	Mus_caroli
ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	99.662	ENSMUSG00000031691	Tnpo2	100	100.000	Mus_musculus
ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	99.436	MGP_PahariEiJ_G0022931	Tnpo2	100	99.436	Mus_pahari
ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	99.662	MGP_SPRETEiJ_G0032445	Tnpo2	100	99.662	Mus_spretus
ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	99.887	ENSMPUG00000004663	TNPO2	100	99.887	Mustela_putorius_furo
ENSTSYG00000003828	TNPO2	96	99.766	ENSMLUG00000012669	TNPO2	99	99.766	Myotis_lucifugus
ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	99.887	ENSNGAG00000000650	Tnpo2	100	99.887	Nannospalax_galili
ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	88.813	ENSNBRG00000006242	TNPO2	100	88.813	Neolamprologus_brichardi
ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	92.913	ENSNBRG00000023849	TNPO2	100	92.913	Neolamprologus_brichardi
ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	92.105	ENSNLEG00000012758	TNPO2	100	92.105	Nomascus_leucogenys
ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	89.878	ENSMEUG00000016658	TNPO2	100	90.211	Notamacropus_eugenii
ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	99.549	ENSODEG00000009670	TNPO2	100	99.549	Octodon_degus
ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	91.982	ENSONIG00000017706	-	100	91.982	Oreochromis_niloticus
ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	92.801	ENSONIG00000002147	tnpo2	100	92.801	Oreochromis_niloticus
ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	96.171	ENSOANG00000010051	TNPO2	100	96.171	Ornithorhynchus_anatinus
ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	87.100	ENSOCUG00000008251	TNPO2	90	87.100	Oryctolagus_cuniculus
ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	92.576	ENSORLG00000010363	tnpo2	100	92.576	Oryzias_latipes
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