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Description

Ensembl ID: ENSTSYG00000003858 (Gene tree)
Gene ID: 103263670
Gene Symbol: SMARCA2
Alias: -
Full Name: SWI/SNF related%2C matrix associated%2C actin dependent regulator of chromatin%2C subfamily a%2C member 2
Gene Type: protein_coding
Species: Carlito_syrichta
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 179410 bases
Position: chrKE940983.1:287587-466996
Accession: 103263670
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSTSYP00000018838	ResIII	PF04851.15	7.9e-09	1	1
ENSTSYP00000013733	BRK	PF07533.16	2.5e-17	1	1
ENSTSYP00000018838	BRK	PF07533.16	2.7e-17	1	1
ENSTSYP00000017339	BRK	PF07533.16	2.7e-17	1	1
ENSTSYP00000003569	BRK	PF07533.16	2.8e-17	1	1
ENSTSYP00000033605	BRK	PF07533.16	2.8e-17	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSTSYT00000048778	SMARCA2-205	747	-	ENSTSYP00000030018	248 (aa)	-	UPI000C2F5C8E
ENSTSYT00000046811	SMARCA2-209	564	-	ENSTSYP00000019318	187 (aa)	-	UPI000C2F5C88
ENSTSYT00000040214	SMARCA2-204	4563	-	ENSTSYP00000018838	1520 (aa)	-	UPI000C2F5D75
ENSTSYT00000027798	SMARCA2-210	4668	-	ENSTSYP00000017339	1555 (aa)	-	UPI000C2F4CF9
ENSTSYT00000027420	SMARCA2-202	4815	XM_008061337	ENSTSYP00000033605	1604 (aa)	XP_008059528	A0A1U7THL4
ENSTSYT00000039003	SMARCA2-207	783	-	ENSTSYP00000029100	260 (aa)	XP_021569764	UPI000B536EC0
ENSTSYT00000035207	SMARCA2-208	4749	-	ENSTSYP00000013733	1582 (aa)	-	UPI000C2F519E
ENSTSYT00000041800	SMARCA2-206	837	-	ENSTSYP00000027313	278 (aa)	XP_021569762	UPI000B534F40
ENSTSYT00000003904	SMARCA2-203	4782	-	ENSTSYP00000003569	1593 (aa)	-	UPI000C2F43E8
ENSTSYT00000041136	SMARCA2-201	1868	XM_008061340	ENSTSYP00000032027	276 (aa)	XP_008059531	A0A1U7U0V0

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	99	74.345	ENSTSYG00000012966	SMARCA4	95	79.371

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	100	98.054	ENSG00000080503	SMARCA2	100	100.000	Homo_sapiens
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	100	79.268	ENSAPOG00000002641	SMARCA2	97	78.917	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	91	89.046	ENSAMEG00000012325	SMARCA2	100	99.452	Ailuropoda_melanoleuca
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	100	78.403	ENSACIG00000015607	SMARCA2	97	77.568	Amphilophus_citrinellus
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	99	80.480	ENSAOCG00000009647	-	97	77.976	Amphiprion_ocellaris
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	99	80.417	ENSAPEG00000007646	SMARCA2	97	78.917	Amphiprion_percula
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	99	81.226	ENSATEG00000006916	SMARCA2	96	78.520	Anabas_testudineus
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	94	87.642	ENSAPLG00000013873	SMARCA2	93	86.309	Anas_platyrhynchos
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	99	90.090	ENSACAG00000002423	SMARCA2	100	87.268	Anolis_carolinensis
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	100	98.054	ENSANAG00000026498	SMARCA2	100	98.054	Aotus_nancymaae
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	99	80.559	ENSACLG00000004248	SMARCA2	97	79.013	Astatotilapia_calliptera
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	100	80.554	ENSAMXG00000012404	smarca2	97	79.596	Astyanax_mexicanus
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	100	96.018	ENSBTAG00000007494	SMARCA2	100	95.292	Bos_taurus
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	99	98.038	ENSCJAG00000010710	SMARCA2	99	98.018	Callithrix_jacchus
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	100	96.822	ENSCAFG00000002013	SMARCA2	100	96.805	Canis_familiaris
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	77	94.906	ENSCAFG00020026802	SMARCA2	98	94.906	Canis_lupus_dingo
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	100	96.422	ENSCHIG00000025863	SMARCA2	100	96.422	Capra_hircus
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	99	92.672	ENSCAPG00000002890	SMARCA2	100	92.798	Cavia_aperea
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	100	96.273	ENSCPOG00000005475	SMARCA2	100	95.609	Cavia_porcellus
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	100	98.054	ENSCCAG00000030636	SMARCA2	100	98.054	Cebus_capucinus
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	100	96.987	ENSCATG00000031470	SMARCA2	100	96.987	Cercocebus_atys
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	100	96.532	ENSCLAG00000014484	SMARCA2	100	96.048	Chinchilla_lanigera
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	94	97.170	ENSCSAG00000008650	SMARCA2	99	97.170	Chlorocebus_sabaeus
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	87	90.818	ENSCHOG00000004316	SMARCA2	87	90.816	Choloepus_hoffmanni
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	99	91.624	ENSCPBG00000025463	SMARCA2	99	95.253	Chrysemys_picta_bellii
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	100	97.740	ENSCANG00000039597	SMARCA2	100	97.740	Colobus_angolensis_palliatus
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	100	89.768	ENSCGRG00001002323	Smarca2	100	89.421	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	99	76.869	ENSCSEG00000019311	SMARCA2	97	74.852	Cynoglossus_semilaevis
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	86	79.572	ENSCVAG00000016571	SMARCA2	95	76.235	Cyprinodon_variegatus
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	99	81.542	ENSDARG00000008904	smarca2	97	79.180	Danio_rerio
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	100	95.125	ENSDNOG00000006402	SMARCA2	99	95.125	Dasypus_novemcinctus
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	100	96.738	ENSDORG00000014832	Smarca2	100	96.698	Dipodomys_ordii
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	80	60.170	FBgn0000212	brm	90	51.158	Drosophila_melanogaster
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	86	61.571	ENSEBUG00000002449	-	89	68.574	Eptatretus_burgeri
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	95	70.402	ENSEBUG00000011442	-	96	74.682	Eptatretus_burgeri
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	100	96.212	ENSEASG00005010312	SMARCA2	100	95.549	Equus_asinus_asinus
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	66	98.611	ENSEEUG00000015540	-	69	98.611	Erinaceus_europaeus
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	93	79.294	ENSELUG00000010318	smarca2	96	75.972	Esox_lucius
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	100	96.366	ENSFCAG00000001568	SMARCA2	100	96.366	Felis_catus
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	99	91.571	ENSFALG00000010416	SMARCA2	100	89.384	Ficedula_albicollis
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	100	95.628	ENSFDAG00000010502	SMARCA2	99	96.139	Fukomys_damarensis
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	99	81.262	ENSFHEG00000021250	SMARCA2	97	80.888	Fundulus_heteroclitus
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	98	77.707	ENSGMOG00000014229	SMARCA2	97	76.335	Gadus_morhua
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	99	92.263	ENSGALG00000010164	SMARCA2	100	88.740	Gallus_gallus
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	95	76.680	ENSGAFG00000001164	SMARCA2	93	73.634	Gambusia_affinis
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	99	78.755	ENSGACG00000014488	SMARCA2	97	76.292	Gasterosteus_aculeatus
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	99	91.396	ENSGAGG00000024412	SMARCA2	100	88.804	Gopherus_agassizii
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	100	93.158	ENSGGOG00000000513	SMARCA2	100	97.506	Gorilla_gorilla
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	99	80.342	ENSHBUG00000006691	SMARCA2	96	78.968	Haplochromis_burtoni
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	99	96.962	ENSHGLG00000005215	SMARCA2	99	96.962	Heterocephalus_glaber_female
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	100	95.358	ENSHGLG00100010496	SMARCA2	100	95.358	Heterocephalus_glaber_male
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	91	74.384	ENSHCOG00000015348	-	88	86.733	Hippocampus_comes
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	99	81.317	ENSIPUG00000011060	smarca2	97	78.516	Ictalurus_punctatus
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	100	97.445	ENSSTOG00000006812	SMARCA2	100	97.445	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	100	96.402	ENSJJAG00000010867	Smarca2	99	96.780	Jaculus_jaculus
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	99	80.752	ENSKMAG00000015844	-	97	80.488	Kryptolebias_marmoratus
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	98	83.429	ENSLOCG00000011499	smarca2	97	80.358	Lepisosteus_oculatus
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	99	95.241	ENSLAFG00000014061	SMARCA2	100	94.011	Loxodonta_africana
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	100	96.296	ENSMFAG00000003814	SMARCA2	100	96.296	Macaca_fascicularis
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	100	97.803	ENSMMUG00000015279	SMARCA2	100	97.803	Macaca_mulatta
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	100	97.367	ENSMNEG00000041069	SMARCA2	100	97.367	Macaca_nemestrina
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	100	95.292	ENSMLEG00000027418	SMARCA2	100	95.292	Mandrillus_leucophaeus
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	99	82.093	ENSMAMG00000003056	SMARCA2	97	81.600	Mastacembelus_armatus
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	99	80.496	ENSMZEG00005020709	SMARCA2	96	79.125	Maylandia_zebra
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	78	77.955	ENSMGAG00000005160	-	100	72.883	Meleagris_gallopavo
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	100	97.489	ENSMICG00000005162	SMARCA2	100	97.552	Microcebus_murinus
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	100	96.366	ENSMOCG00000001611	Smarca2	100	96.366	Microtus_ochrogaster
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	99	78.957	ENSMMOG00000014196	SMARCA2	97	75.607	Mola_mola
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	100	91.584	ENSMODG00000003578	SMARCA2	100	90.915	Monodelphis_domestica
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	99	80.534	ENSMALG00000009611	SMARCA2	97	80.013	Monopterus_albus
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	100	96.824	MGP_CAROLIEiJ_G0022841	Smarca2	100	96.869	Mus_caroli
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	100	96.638	ENSMUSG00000024921	Smarca2	99	99.441	Mus_musculus
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	100	96.575	MGP_PahariEiJ_G0014334	Smarca2	100	96.575	Mus_pahari
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	100	96.513	MGP_SPRETEiJ_G0023759	Smarca2	100	96.513	Mus_spretus
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	80	99.297	ENSMPUG00000005171	SMARCA2	94	99.297	Mustela_putorius_furo
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	100	91.359	ENSMLUG00000002342	SMARCA2	99	90.547	Myotis_lucifugus
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	99	95.358	ENSNGAG00000000108	Smarca2	99	95.358	Nannospalax_galili
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	95	66.558	ENSNBRG00000017998	SMARCA2	94	83.085	Neolamprologus_brichardi
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	100	94.514	ENSNLEG00000008575	SMARCA2	100	94.514	Nomascus_leucogenys
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	100	85.311	ENSMEUG00000009812	SMARCA2	100	85.122	Notamacropus_eugenii
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	100	91.087	ENSOPRG00000013474	SMARCA2	100	90.337	Ochotona_princeps
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	99	95.938	ENSODEG00000005452	SMARCA2	99	96.178	Octodon_degus
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	99	80.347	ENSONIG00000014163	SMARCA2	97	77.664	Oreochromis_niloticus
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	51	94.480	ENSOANG00000008299	-	95	98.248	Ornithorhynchus_anatinus
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	100	96.776	ENSOCUG00000006320	SMARCA2	100	96.010	Oryctolagus_cuniculus
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	99	80.000	ENSORLG00000020820	SMARCA2	100	76.272	Oryzias_latipes
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	99	80.127	ENSORLG00015006289	SMARCA2	97	91.310	Oryzias_latipes_hsok
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	99	80.000	ENSOMEG00000009736	-	97	77.785	Oryzias_melastigma
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	99	93.371	ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	93.672	Otolemur_garnettii
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	100	94.700	ENSOARG00000013265	SMARCA2	100	94.110	Ovis_aries
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	100	94.596	ENSPPAG00000038717	SMARCA2	100	94.596	Pan_paniscus
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	100	96.429	ENSPPRG00000001879	SMARCA2	100	96.429	Panthera_pardus
ENSTSYG00000003858	SMARCA2	100	96.173	ENSPTRG00000051168	SMARCA2	100	96.072	Pan_troglodytes
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ENSTSYG00000003858	SMARCA2	100	81.767	ENSPKIG00000018469	-	99	82.181	Paramormyrops_kingsleyae
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