EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSTSYG00000003866 (Gene tree)
Gene ID: 103264671
Gene Symbol: CELF1
Alias: -
Full Name: CUGBP Elav-like family member 1
Gene Type: protein_coding
Species: Carlito_syrichta
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 32329 bases
Position: chrKE927078.1:12033-44361
Accession: 103264671
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSTSYP00000026589	RRM_1	PF00076.22	2.3e-52	1	3
ENSTSYP00000026589	RRM_1	PF00076.22	2.3e-52	2	3
ENSTSYP00000026589	RRM_1	PF00076.22	2.3e-52	3	3
ENSTSYP00000003537	RRM_1	PF00076.22	2.9e-52	1	3
ENSTSYP00000003537	RRM_1	PF00076.22	2.9e-52	2	3
ENSTSYP00000003537	RRM_1	PF00076.22	2.9e-52	3	3

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSTSYT00000003867	CELF1-202	2484	XM_008062392	ENSTSYP00000003537	512 (aa)	XP_008060583	A0A1U7TVY6
ENSTSYT00000037450	CELF1-201	4421	XM_008062387	ENSTSYP00000026589	486 (aa)	XP_008060578	A0A1U7TVY3

Gene Model

Click here to download ENSTSYG00000003866's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSTSYG00000003866's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSTSYG00000003866	CELF1	70	45.679	ENSTSYG00000008248	ELAVL1	98	45.679
ENSTSYG00000003866	CELF1	69	41.975	ENSTSYG00000013066	ELAVL2	82	41.975
ENSTSYG00000003866	CELF1	70	38.636	ENSTSYG00000006532	PABPC4	53	38.889
ENSTSYG00000003866	CELF1	97	44.906	ENSTSYG00000033066	CELF3	89	55.191
ENSTSYG00000003866	CELF1	50	39.474	ENSTSYG00000001167	RBMS2	58	39.474
ENSTSYG00000003866	CELF1	57	36.047	ENSTSYG00000004229	PABPC1	53	36.047
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	65.377	ENSTSYG00000025428	-	96	63.636
ENSTSYG00000003866	CELF1	97	78.032	ENSTSYG00000005118	CELF2	98	71.250
ENSTSYG00000003866	CELF1	56	43.590	ENSTSYG00000036621	ELAVL3	71	42.391

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	100.000	ENSG00000149187	CELF1	100	100.000	Homo_sapiens
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	84.178	ENSAPOG00000024000	celf1	100	85.193	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	99.383	ENSAMEG00000007596	CELF1	100	99.220	Ailuropoda_melanoleuca
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	82.172	ENSACIG00000023843	celf1	100	80.943	Amphilophus_citrinellus
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	84.178	ENSAOCG00000001252	celf1	100	85.193	Amphiprion_ocellaris
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	84.381	ENSAPEG00000002340	celf1	100	83.890	Amphiprion_percula
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	83.162	ENSATEG00000010871	celf1	100	82.136	Anabas_testudineus
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	95.697	ENSACAG00000002114	CELF1	100	94.932	Anolis_carolinensis
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	100.000	ENSANAG00000031770	CELF1	100	99.805	Aotus_nancymaae
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	85.216	ENSACLG00000010181	-	100	84.047	Astatotilapia_calliptera
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	81.980	ENSAMXG00000020576	celf1	96	81.071	Astyanax_mexicanus
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	98.765	ENSBTAG00000002520	CELF1	100	98.765	Bos_taurus
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	99.795	ENSCJAG00000020133	CELF1	100	99.611	Callithrix_jacchus
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	99.588	ENSCAFG00000008452	CELF1	100	99.415	Canis_familiaris
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	99.588	ENSCAFG00020025487	CELF1	100	99.415	Canis_lupus_dingo
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	98.971	ENSCHIG00000024582	CELF1	100	98.830	Capra_hircus
ENSTSYG00000003866	CELF1	99	73.125	ENSCAPG00000006787	CELF1	100	71.401	Cavia_aperea
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	99.589	ENSCPOG00000036381	CELF1	100	99.589	Cavia_porcellus
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	100.000	ENSCCAG00000033487	CELF1	100	100.000	Cebus_capucinus
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	100.000	ENSCATG00000040143	CELF1	100	100.000	Cercocebus_atys
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	100.000	ENSCLAG00000011791	CELF1	100	99.610	Chinchilla_lanigera
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	99.794	ENSCSAG00000005786	CELF1	100	99.610	Chlorocebus_sabaeus
ENSTSYG00000003866	CELF1	62	100.000	ENSCHOG00000004196	-	68	100.000	Choloepus_hoffmanni
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	96.721	ENSCPBG00000022914	CELF1	100	96.524	Chrysemys_picta_bellii
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	100.000	ENSCANG00000032689	CELF1	100	100.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	99.383	ENSCGRG00001011274	Celf1	100	99.220	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	99.383	ENSCGRG00000015357	Celf1	100	99.220	Cricetulus_griseus_crigri
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	74.538	ENSCSEG00000008675	celf1	100	73.511	Cynoglossus_semilaevis
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	82.772	ENSDARG00000005315	celf1	100	88.757	Danio_rerio
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	100.000	ENSDNOG00000009523	CELF1	100	100.000	Dasypus_novemcinctus
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	88.694	ENSDORG00000013721	Celf1	100	88.694	Dipodomys_ordii
ENSTSYG00000003866	CELF1	73	100.000	ENSETEG00000004507	CELF1	83	100.000	Echinops_telfairi
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	92.203	ENSEASG00005010831	CELF1	100	91.813	Equus_asinus_asinus
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	99.588	ENSECAG00000007741	CELF1	100	98.765	Equus_caballus
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	81.276	ENSEEUG00000009782	CELF1	100	81.276	Erinaceus_europaeus
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	83.573	ENSELUG00000023173	celf1	100	83.333	Esox_lucius
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	99.588	ENSFCAG00000002535	CELF1	100	99.588	Felis_catus
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	95.092	ENSFALG00000006402	CELF1	100	94.358	Ficedula_albicollis
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	99.588	ENSFDAG00000008517	CELF1	100	99.384	Fukomys_damarensis
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	83.265	ENSGMOG00000012783	celf1	99	82.520	Gadus_morhua
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	95.706	ENSGALG00000008097	CELF1	100	95.706	Gallus_gallus
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	78.373	ENSGACG00000014226	celf1	95	78.063	Gasterosteus_aculeatus
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	96.721	ENSGAGG00000011562	CELF1	100	95.902	Gopherus_agassizii
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	99.795	ENSGGOG00000004106	CELF1	100	99.611	Gorilla_gorilla
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	85.216	ENSHBUG00000017881	celf1	100	84.047	Haplochromis_burtoni
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	99.589	ENSHGLG00000006909	-	100	99.589	Heterocephalus_glaber_female
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	91.170	ENSHGLG00000019214	-	100	90.760	Heterocephalus_glaber_female
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	94.456	ENSHGLG00100017423	-	100	94.045	Heterocephalus_glaber_male
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	99.589	ENSHGLG00100013863	-	100	99.589	Heterocephalus_glaber_male
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	85.451	ENSHCOG00000000258	celf1	100	84.836	Hippocampus_comes
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	81.782	ENSIPUG00000023708	celf1	100	82.178	Ictalurus_punctatus
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	100.000	ENSSTOG00000000613	CELF1	100	99.795	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	99.588	ENSJJAG00000020280	Celf1	100	99.415	Jaculus_jaculus
ENSTSYG00000003866	CELF1	70	85.546	ENSLBEG00000002047	-	98	83.776	Labrus_bergylta
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	86.653	ENSLBEG00000018296	celf1	93	85.425	Labrus_bergylta
ENSTSYG00000003866	CELF1	71	80.978	ENSLACG00000018990	CELF1	92	81.250	Latimeria_chalumnae
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	86.653	ENSLOCG00000005966	celf1	94	86.853	Lepisosteus_oculatus
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	99.588	ENSLAFG00000003484	CELF1	100	99.025	Loxodonta_africana
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	99.795	ENSMFAG00000003505	CELF1	100	99.795	Macaca_fascicularis
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	100.000	ENSMMUG00000011657	CELF1	100	100.000	Macaca_mulatta
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	100.000	ENSMNEG00000022558	CELF1	100	100.000	Macaca_nemestrina
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	100.000	ENSMLEG00000040834	CELF1	100	100.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	82.992	ENSMAMG00000010052	celf1	100	81.557	Mastacembelus_armatus
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	85.216	ENSMZEG00005018307	celf1	100	84.047	Maylandia_zebra
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	95.510	ENSMGAG00000010629	CELF1	96	95.510	Meleagris_gallopavo
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	99.383	ENSMAUG00000009468	Celf1	100	99.220	Mesocricetus_auratus
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	99.795	ENSMICG00000045113	CELF1	100	99.611	Microcebus_murinus
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	99.588	ENSMOCG00000012633	Celf1	100	99.415	Microtus_ochrogaster
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	82.377	ENSMMOG00000015460	celf1	95	82.377	Mola_mola
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	98.354	ENSMODG00000019913	CELF1	100	98.354	Monodelphis_domestica
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	99.588	MGP_CAROLIEiJ_G0023949	Celf1	100	99.415	Mus_caroli
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	99.588	ENSMUSG00000005506	Celf1	100	99.588	Mus_musculus
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	99.588	MGP_PahariEiJ_G0025385	Celf1	100	99.588	Mus_pahari
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	99.383	MGP_SPRETEiJ_G0024859	Celf1	100	99.220	Mus_spretus
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	99.588	ENSMPUG00000003960	CELF1	93	99.415	Mustela_putorius_furo
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	98.571	ENSMLUG00000016631	CELF1	100	98.453	Myotis_lucifugus
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	97.942	ENSNGAG00000017390	Celf1	100	97.856	Nannospalax_galili
ENSTSYG00000003866	CELF1	99	55.556	ENSNBRG00000023547	-	85	55.350	Neolamprologus_brichardi
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	100.000	ENSNLEG00000014638	CELF1	100	100.000	Nomascus_leucogenys
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	98.148	ENSMEUG00000007763	CELF1	100	98.148	Notamacropus_eugenii
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	99.177	ENSOPRG00000003239	-	100	99.177	Ochotona_princeps
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	100.000	ENSODEG00000015204	CELF1	100	99.610	Octodon_degus
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	84.600	ENSONIG00000008300	celf1	100	83.495	Oreochromis_niloticus
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	98.152	ENSOANG00000007896	CELF1	99	97.471	Ornithorhynchus_anatinus
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	99.588	ENSOCUG00000001311	CELF1	100	99.220	Oryctolagus_cuniculus
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	79.346	ENSOMEG00000002381	celf1	100	79.141	Oryzias_melastigma
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	98.776	ENSOGAG00000011600	CELF1	100	98.646	Otolemur_garnettii
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	98.971	ENSOARG00000006924	CELF1	100	98.971	Ovis_aries
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	100.000	ENSPPAG00000033870	CELF1	100	100.000	Pan_paniscus
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	99.609	ENSPPRG00000002376	CELF1	100	99.609	Panthera_pardus
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	99.609	ENSPTIG00000003974	CELF1	100	99.609	Panthera_tigris_altaica
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	99.795	ENSPTRG00000052299	CELF1	100	99.795	Pan_troglodytes
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	99.795	ENSPANG00000021676	CELF1	100	99.611	Papio_anubis
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	86.885	ENSPKIG00000012324	celf1	100	85.861	Paramormyrops_kingsleyae
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	94.274	ENSPSIG00000003922	CELF1	100	93.605	Pelodiscus_sinensis
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	86.957	ENSPMGG00000013192	celf1	96	76.687	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	99.588	ENSPEMG00000015644	Celf1	100	99.415	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	98.354	ENSPCIG00000022947	CELF1	100	98.008	Phascolarctos_cinereus
ENSTSYG00000003866	CELF1	70	70.118	ENSPFOG00000000961	-	100	67.160	Poecilia_formosa
ENSTSYG00000003866	CELF1	88	70.468	ENSPLAG00000019373	-	88	66.760	Poecilia_latipinna
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	74.319	ENSPREG00000022185	-	100	72.266	Poecilia_reticulata
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	98.973	ENSPPYG00000003302	CELF1	100	98.833	Pongo_abelii
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	97.942	ENSPCAG00000002631	CELF1	100	97.942	Procavia_capensis
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	95.136	ENSPCOG00000021865	CELF1	100	95.136	Propithecus_coquereli
ENSTSYG00000003866	CELF1	97	99.531	ENSPVAG00000007340	CELF1	100	99.531	Pteropus_vampyrus
ENSTSYG00000003866	CELF1	78	73.669	ENSPNYG00000023719	-	88	71.302	Pundamilia_nyererei
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	82.213	ENSPNAG00000013418	celf1	96	81.679	Pygocentrus_nattereri
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	99.179	ENSRNOG00000010379	Celf1	100	99.179	Rattus_norvegicus
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	99.795	ENSRBIG00000042406	CELF1	100	99.611	Rhinopithecus_bieti
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	100.000	ENSRROG00000032588	CELF1	100	99.805	Rhinopithecus_roxellana
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	88.716	ENSSBOG00000021912	CELF1	100	88.716	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	98.357	ENSSHAG00000017438	CELF1	100	98.357	Sarcophilus_harrisii
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	87.910	ENSSFOG00015019353	celf1	97	83.721	Scleropages_formosus
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	86.066	ENSSMAG00000013827	celf1	96	83.826	Scophthalmus_maximus
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	85.861	ENSSDUG00000011558	celf1	96	83.629	Seriola_dumerili
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	86.214	ENSSLDG00000012863	celf1	100	86.214	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	93.621	ENSSARG00000003207	CELF1	100	93.621	Sorex_araneus
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	96.319	ENSSPUG00000004228	CELF1	100	96.124	Sphenodon_punctatus
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	84.178	ENSSPAG00000009569	celf1	100	85.193	Stegastes_partitus
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	99.588	ENSSSCG00000013233	CELF1	100	99.588	Sus_scrofa
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	96.311	ENSTGUG00000010377	CELF1	100	95.922	Taeniopygia_guttata
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	66.871	ENSTRUG00000000617	celf1	100	66.871	Takifugu_rubripes
ENSTSYG00000003866	CELF1	83	99.338	ENSTBEG00000005140	CELF1	83	99.338	Tupaia_belangeri
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	99.588	ENSTTRG00000014157	CELF1	100	99.588	Tursiops_truncatus
ENSTSYG00000003866	CELF1	90	99.541	ENSUAMG00000000223	CELF1	100	99.352	Ursus_americanus
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	99.588	ENSUMAG00000009218	CELF1	100	99.415	Ursus_maritimus
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	86.008	ENSVPAG00000000336	CELF1	100	86.008	Vicugna_pacos
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	99.588	ENSVVUG00000023439	CELF1	100	99.588	Vulpes_vulpes
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	87.928	ENSXETG00000009044	celf1	100	87.123	Xenopus_tropicalis
ENSTSYG00000003866	CELF1	87	59.882	ENSXCOG00000017706	-	87	60.117	Xiphophorus_couchianus
ENSTSYG00000003866	CELF1	100	73.101	ENSXMAG00000029339	-	100	71.869	Xiphophorus_maculatus