EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSTSYG00000005114 (Gene tree)
Gene ID: 103275661
Gene Symbol: SYF2
Alias: CBPIN|DKFZp564O2082|NTC31|fSAP29|p29
Full Name: pre-mRNA-splicing factor SYF2
Gene Type: protein_coding
Species: Carlito_syrichta
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 9474 bases
Position: chrKE949949.1:184291-193764
Accession: 103275661
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSTSYP00000004672	SYF2	PF08231.12	1.7e-54	1	1
ENSTSYP00000023362	SYF2	PF08231.12	4.5e-54	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSTSYT00000040781	SYF2-201	732	XM_008073063	ENSTSYP00000023362	243 (aa)	XP_008071254	UPI000C2F3E1D
ENSTSYT00000005112	SYF2-202	606	-	ENSTSYP00000004672	201 (aa)	-	UPI000C2F806C

Gene Model

Click here to download ENSTSYG00000005114's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSTSYG00000005114's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSTSYG00000005114	SYF2	100	93.827	ENSG00000117614	SYF2	100	93.827	Homo_sapiens
ENSTSYG00000005114	SYF2	91	82.883	ENSAPOG00000001174	syf2	99	79.583	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTSYG00000005114	SYF2	99	91.736	ENSAMEG00000010115	-	99	91.736	Ailuropoda_melanoleuca
ENSTSYG00000005114	SYF2	80	94.872	ENSAMEG00000010134	-	100	94.872	Ailuropoda_melanoleuca
ENSTSYG00000005114	SYF2	99	73.896	ENSACIG00000023688	syf2	99	73.896	Amphilophus_citrinellus
ENSTSYG00000005114	SYF2	99	80.417	ENSAOCG00000022046	syf2	98	81.197	Amphiprion_ocellaris
ENSTSYG00000005114	SYF2	92	78.924	ENSAOCG00000010912	syf2	69	78.924	Amphiprion_ocellaris
ENSTSYG00000005114	SYF2	99	80.417	ENSAPEG00000018858	syf2	92	80.417	Amphiprion_percula
ENSTSYG00000005114	SYF2	89	82.407	ENSATEG00000007745	syf2	99	77.917	Anabas_testudineus
ENSTSYG00000005114	SYF2	82	87.500	ENSAPLG00000016435	SYF2	99	87.500	Anas_platyrhynchos
ENSTSYG00000005114	SYF2	79	75.625	ENSACAG00000026777	-	96	75.625	Anolis_carolinensis
ENSTSYG00000005114	SYF2	84	85.784	ENSACAG00000013653	-	100	85.784	Anolis_carolinensis
ENSTSYG00000005114	SYF2	100	93.416	ENSANAG00000032473	SYF2	100	93.416	Aotus_nancymaae
ENSTSYG00000005114	SYF2	91	79.730	ENSACLG00000019916	syf2	99	77.083	Astatotilapia_calliptera
ENSTSYG00000005114	SYF2	100	77.366	ENSAMXG00000004051	syf2	100	77.366	Astyanax_mexicanus
ENSTSYG00000005114	SYF2	100	93.061	ENSBTAG00000001651	SYF2	100	94.068	Bos_taurus
ENSTSYG00000005114	SYF2	86	50.952	WBGene00019402	syf-2	90	50.711	Caenorhabditis_elegans
ENSTSYG00000005114	SYF2	100	93.827	ENSCJAG00000046570	SYF2	100	93.827	Callithrix_jacchus
ENSTSYG00000005114	SYF2	92	87.054	ENSCAFG00000030331	-	96	87.054	Canis_familiaris
ENSTSYG00000005114	SYF2	100	91.463	ENSCAFG00000012895	-	100	91.463	Canis_familiaris
ENSTSYG00000005114	SYF2	100	91.463	ENSCAFG00020021091	-	100	91.463	Canis_lupus_dingo
ENSTSYG00000005114	SYF2	100	83.582	ENSCAFG00020021094	-	100	83.582	Canis_lupus_dingo
ENSTSYG00000005114	SYF2	100	92.181	ENSCHIG00000020874	SYF2	99	93.277	Capra_hircus
ENSTSYG00000005114	SYF2	81	96.970	ENSCAPG00000010006	SYF2	100	96.970	Cavia_aperea
ENSTSYG00000005114	SYF2	100	92.213	ENSCPOG00000005326	SYF2	100	92.213	Cavia_porcellus
ENSTSYG00000005114	SYF2	100	93.827	ENSCCAG00000022459	SYF2	100	93.827	Cebus_capucinus
ENSTSYG00000005114	SYF2	100	93.004	ENSCATG00000026917	SYF2	100	93.004	Cercocebus_atys
ENSTSYG00000005114	SYF2	100	93.443	ENSCLAG00000008474	SYF2	100	93.443	Chinchilla_lanigera
ENSTSYG00000005114	SYF2	100	92.593	ENSCSAG00000000948	SYF2	100	92.593	Chlorocebus_sabaeus
ENSTSYG00000005114	SYF2	74	76.243	ENSCHOG00000005273	-	100	76.243	Choloepus_hoffmanni
ENSTSYG00000005114	SYF2	92	87.892	ENSCPBG00000025073	SYF2	94	85.470	Chrysemys_picta_bellii
ENSTSYG00000005114	SYF2	87	53.052	ENSCING00000003017	-	89	52.582	Ciona_intestinalis
ENSTSYG00000005114	SYF2	87	50.704	ENSCSAVG00000006627	-	97	50.704	Ciona_savignyi
ENSTSYG00000005114	SYF2	100	79.835	ENSCANG00000037322	SYF2	100	79.835	Colobus_angolensis_palliatus
ENSTSYG00000005114	SYF2	100	90.947	ENSCGRG00001020733	Syf2	100	90.947	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSTSYG00000005114	SYF2	81	94.898	ENSCGRG00000005095	Syf2	96	94.949	Cricetulus_griseus_crigri
ENSTSYG00000005114	SYF2	90	77.064	ENSCSEG00000000117	syf2	100	72.803	Cynoglossus_semilaevis
ENSTSYG00000005114	SYF2	91	80.543	ENSCVAG00000019543	syf2	100	76.132	Cyprinodon_variegatus
ENSTSYG00000005114	SYF2	99	77.500	ENSDARG00000004706	syf2	99	77.500	Danio_rerio
ENSTSYG00000005114	SYF2	100	92.653	ENSDNOG00000047605	SYF2	100	92.653	Dasypus_novemcinctus
ENSTSYG00000005114	SYF2	100	92.213	ENSDORG00000001274	Syf2	100	92.213	Dipodomys_ordii
ENSTSYG00000005114	SYF2	90	55.909	FBgn0033556	CG12343	97	55.909	Drosophila_melanogaster
ENSTSYG00000005114	SYF2	94	75.546	ENSETEG00000015729	SYF2	100	76.419	Echinops_telfairi
ENSTSYG00000005114	SYF2	81	59.391	ENSEBUG00000015402	syf2	95	59.391	Eptatretus_burgeri
ENSTSYG00000005114	SYF2	100	92.245	ENSEASG00005004224	-	100	92.245	Equus_asinus_asinus
ENSTSYG00000005114	SYF2	100	82.305	ENSEASG00005004232	-	100	82.305	Equus_asinus_asinus
ENSTSYG00000005114	SYF2	100	93.061	ENSECAG00000012023	-	100	93.061	Equus_caballus
ENSTSYG00000005114	SYF2	94	94.760	ENSECAG00000010440	-	96	94.760	Equus_caballus
ENSTSYG00000005114	SYF2	75	81.421	ENSEEUG00000015084	SYF2	100	81.421	Erinaceus_europaeus
ENSTSYG00000005114	SYF2	100	79.012	ENSELUG00000003465	syf2	99	79.012	Esox_lucius
ENSTSYG00000005114	SYF2	100	92.245	ENSFCAG00000010324	-	85	92.245	Felis_catus
ENSTSYG00000005114	SYF2	100	93.089	ENSFCAG00000043095	-	100	93.089	Felis_catus
ENSTSYG00000005114	SYF2	84	84.314	ENSFALG00000000460	SYF2	96	78.661	Ficedula_albicollis
ENSTSYG00000005114	SYF2	100	92.593	ENSFDAG00000008310	SYF2	100	92.593	Fukomys_damarensis
ENSTSYG00000005114	SYF2	92	66.071	ENSFHEG00000007238	syf2	99	66.071	Fundulus_heteroclitus
ENSTSYG00000005114	SYF2	90	82.569	ENSGMOG00000019138	syf2	97	82.569	Gadus_morhua
ENSTSYG00000005114	SYF2	92	86.607	ENSGALG00000013639	SYF2	93	84.615	Gallus_gallus
ENSTSYG00000005114	SYF2	99	75.000	ENSGAFG00000019435	syf2	99	75.000	Gambusia_affinis
ENSTSYG00000005114	SYF2	88	82.326	ENSGACG00000007305	syf2	98	77.872	Gasterosteus_aculeatus
ENSTSYG00000005114	SYF2	92	88.341	ENSGAGG00000010670	SYF2	94	85.897	Gopherus_agassizii
ENSTSYG00000005114	SYF2	100	94.239	ENSGGOG00000012796	SYF2	100	94.239	Gorilla_gorilla
ENSTSYG00000005114	SYF2	93	78.788	ENSHBUG00000020477	syf2	99	78.788	Haplochromis_burtoni
ENSTSYG00000005114	SYF2	100	92.213	ENSHGLG00000014393	SYF2	100	92.213	Heterocephalus_glaber_female
ENSTSYG00000005114	SYF2	92	83.036	ENSHGLG00000004304	-	100	77.366	Heterocephalus_glaber_female
ENSTSYG00000005114	SYF2	100	92.213	ENSHGLG00100014722	SYF2	100	92.213	Heterocephalus_glaber_male
ENSTSYG00000005114	SYF2	98	77.593	ENSHCOG00000012904	syf2	79	77.593	Hippocampus_comes
ENSTSYG00000005114	SYF2	100	78.601	ENSIPUG00000019859	syf2	100	78.601	Ictalurus_punctatus
ENSTSYG00000005114	SYF2	60	95.890	ENSSTOG00000023984	SYF2	100	95.890	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSTSYG00000005114	SYF2	82	96.985	ENSJJAG00000013301	Syf2	94	96.985	Jaculus_jaculus
ENSTSYG00000005114	SYF2	99	77.500	ENSKMAG00000013856	syf2	99	77.500	Kryptolebias_marmoratus
ENSTSYG00000005114	SYF2	90	82.192	ENSLBEG00000014425	syf2	99	78.333	Labrus_bergylta
ENSTSYG00000005114	SYF2	97	81.277	ENSLACG00000012064	SYF2	97	81.277	Latimeria_chalumnae
ENSTSYG00000005114	SYF2	99	77.551	ENSLOCG00000002728	syf2	98	77.551	Lepisosteus_oculatus
ENSTSYG00000005114	SYF2	100	92.245	ENSLAFG00000023150	-	100	92.245	Loxodonta_africana
ENSTSYG00000005114	SYF2	75	64.130	ENSLAFG00000030814	-	100	64.130	Loxodonta_africana
ENSTSYG00000005114	SYF2	100	93.004	ENSMFAG00000041831	SYF2	100	93.004	Macaca_fascicularis
ENSTSYG00000005114	SYF2	100	93.004	ENSMMUG00000002968	SYF2	100	93.004	Macaca_mulatta
ENSTSYG00000005114	SYF2	100	93.004	ENSMNEG00000030180	SYF2	100	93.004	Macaca_nemestrina
ENSTSYG00000005114	SYF2	100	93.004	ENSMLEG00000030248	SYF2	100	93.004	Mandrillus_leucophaeus
ENSTSYG00000005114	SYF2	89	81.019	ENSMAMG00000010403	syf2	98	76.132	Mastacembelus_armatus
ENSTSYG00000005114	SYF2	99	77.083	ENSMZEG00005006429	syf2	99	77.083	Maylandia_zebra
ENSTSYG00000005114	SYF2	82	87.940	ENSMGAG00000002019	SYF2	100	87.940	Meleagris_gallopavo
ENSTSYG00000005114	SYF2	100	90.947	ENSMAUG00000018974	Syf2	100	90.947	Mesocricetus_auratus
ENSTSYG00000005114	SYF2	89	96.629	ENSMICG00000016191	SYF2	100	97.487	Microcebus_murinus
ENSTSYG00000005114	SYF2	100	92.593	ENSMOCG00000022938	Syf2	100	92.593	Microtus_ochrogaster
ENSTSYG00000005114	SYF2	91	79.279	ENSMMOG00000002396	syf2	93	79.279	Mola_mola
ENSTSYG00000005114	SYF2	93	87.719	ENSMODG00000013951	-	99	87.719	Monodelphis_domestica
ENSTSYG00000005114	SYF2	100	75.820	ENSMALG00000010706	syf2	100	76.230	Monopterus_albus
ENSTSYG00000005114	SYF2	100	91.770	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	100	91.770	Mus_caroli
ENSTSYG00000005114	SYF2	100	91.770	ENSMUSG00000028821	Syf2	100	91.770	Mus_musculus
ENSTSYG00000005114	SYF2	100	91.770	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	100	91.770	Mus_pahari
ENSTSYG00000005114	SYF2	100	91.770	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	100	91.770	Mus_spretus
ENSTSYG00000005114	SYF2	100	91.463	ENSMPUG00000015801	-	100	91.463	Mustela_putorius_furo
ENSTSYG00000005114	SYF2	100	92.276	ENSMPUG00000015802	-	100	92.276	Mustela_putorius_furo
ENSTSYG00000005114	SYF2	94	94.760	ENSMLUG00000001885	SYF2	94	94.760	Myotis_lucifugus
ENSTSYG00000005114	SYF2	100	92.276	ENSNGAG00000007912	Syf2	100	92.276	Nannospalax_galili
ENSTSYG00000005114	SYF2	99	70.492	ENSNBRG00000010720	syf2	99	70.492	Neolamprologus_brichardi
ENSTSYG00000005114	SYF2	100	94.239	ENSNLEG00000035185	SYF2	100	94.239	Nomascus_leucogenys
ENSTSYG00000005114	SYF2	100	91.358	ENSOPRG00000012870	SYF2	100	91.358	Ochotona_princeps
ENSTSYG00000005114	SYF2	100	81.557	ENSODEG00000014338	-	100	81.557	Octodon_degus
ENSTSYG00000005114	SYF2	97	92.340	ENSODEG00000017664	-	99	92.340	Octodon_degus
ENSTSYG00000005114	SYF2	91	79.730	ENSONIG00000008213	syf2	99	77.083	Oreochromis_niloticus
ENSTSYG00000005114	SYF2	83	90.099	ENSOANG00000009552	SYF2	100	90.099	Ornithorhynchus_anatinus
ENSTSYG00000005114	SYF2	100	93.443	ENSOCUG00000013050	SYF2	100	93.443	Oryctolagus_cuniculus
ENSTSYG00000005114	SYF2	91	80.631	ENSORLG00000028820	syf2	94	81.735	Oryzias_latipes
ENSTSYG00000005114	SYF2	97	77.021	ENSORLG00020018333	syf2	99	77.021	Oryzias_latipes_hni
ENSTSYG00000005114	SYF2	89	82.407	ENSORLG00015014665	syf2	91	82.407	Oryzias_latipes_hsok
ENSTSYG00000005114	SYF2	91	81.532	ENSOMEG00000013911	syf2	92	82.648	Oryzias_melastigma
ENSTSYG00000005114	SYF2	100	94.262	ENSOGAG00000009962	SYF2	100	94.262	Otolemur_garnettii
ENSTSYG00000005114	SYF2	80	67.179	ENSOARG00000006269	-	100	67.179	Ovis_aries
ENSTSYG00000005114	SYF2	100	91.903	ENSOARG00000006348	-	100	91.903	Ovis_aries
ENSTSYG00000005114	SYF2	100	94.239	ENSPPAG00000036579	SYF2	100	94.239	Pan_paniscus
ENSTSYG00000005114	SYF2	100	93.089	ENSPPRG00000001651	-	100	93.089	Panthera_pardus
ENSTSYG00000005114	SYF2	99	92.213	ENSPPRG00000001638	-	99	92.213	Panthera_pardus
ENSTSYG00000005114	SYF2	90	97.248	ENSPTIG00000005711	-	80	97.248	Panthera_tigris_altaica
ENSTSYG00000005114	SYF2	100	93.089	ENSPTIG00000007036	-	100	93.089	Panthera_tigris_altaica
ENSTSYG00000005114	SYF2	100	94.239	ENSPTRG00000000352	SYF2	100	94.239	Pan_troglodytes
ENSTSYG00000005114	SYF2	100	93.004	ENSPANG00000008139	SYF2	100	93.004	Papio_anubis
ENSTSYG00000005114	SYF2	100	79.508	ENSPKIG00000008130	syf2	100	79.508	Paramormyrops_kingsleyae
ENSTSYG00000005114	SYF2	96	84.681	ENSPSIG00000011816	SYF2	91	84.681	Pelodiscus_sinensis
ENSTSYG00000005114	SYF2	92	79.911	ENSPMGG00000008755	syf2	88	79.911	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSTSYG00000005114	SYF2	100	92.181	ENSPEMG00000008283	Syf2	100	92.181	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSTSYG00000005114	SYF2	93	92.000	ENSPCIG00000014235	SYF2	100	85.600	Phascolarctos_cinereus
ENSTSYG00000005114	SYF2	96	76.824	ENSPFOG00000004116	syf2	95	76.824	Poecilia_formosa
ENSTSYG00000005114	SYF2	97	76.271	ENSPLAG00000006691	syf2	100	76.271	Poecilia_latipinna
ENSTSYG00000005114	SYF2	99	73.333	ENSPMEG00000011684	syf2	99	74.359	Poecilia_mexicana
ENSTSYG00000005114	SYF2	89	80.556	ENSPREG00000003009	syf2	100	74.074	Poecilia_reticulata
ENSTSYG00000005114	SYF2	100	93.827	ENSPPYG00000001713	SYF2	100	93.827	Pongo_abelii
ENSTSYG00000005114	SYF2	100	78.109	ENSPCOG00000027011	SYF2	100	78.109	Propithecus_coquereli
ENSTSYG00000005114	SYF2	100	81.224	ENSPVAG00000005841	SYF2	100	81.224	Pteropus_vampyrus
ENSTSYG00000005114	SYF2	91	79.730	ENSPNYG00000004979	syf2	99	77.083	Pundamilia_nyererei
ENSTSYG00000005114	SYF2	99	79.583	ENSPNAG00000015570	syf2	99	79.583	Pygocentrus_nattereri
ENSTSYG00000005114	SYF2	100	91.770	ENSRNOG00000060597	Syf2	100	91.770	Rattus_norvegicus
ENSTSYG00000005114	SYF2	100	90.535	ENSRBIG00000042970	SYF2	100	90.535	Rhinopithecus_bieti
ENSTSYG00000005114	SYF2	100	93.004	ENSRROG00000001347	SYF2	100	93.004	Rhinopithecus_roxellana
ENSTSYG00000005114	SYF2	100	93.004	ENSSBOG00000020184	SYF2	100	93.004	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSTSYG00000005114	SYF2	93	91.593	ENSSHAG00000015630	-	100	85.542	Sarcophilus_harrisii
ENSTSYG00000005114	SYF2	84	93.689	ENSSHAG00000007152	-	100	93.689	Sarcophilus_harrisii
ENSTSYG00000005114	SYF2	100	78.601	ENSSFOG00015023647	syf2	100	78.601	Scleropages_formosus
ENSTSYG00000005114	SYF2	100	74.486	ENSSMAG00000009867	syf2	100	74.486	Scophthalmus_maximus
ENSTSYG00000005114	SYF2	99	77.500	ENSSDUG00000013072	syf2	99	77.917	Seriola_dumerili
ENSTSYG00000005114	SYF2	99	77.500	ENSSLDG00000012677	syf2	99	77.917	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSTSYG00000005114	SYF2	100	75.410	ENSSARG00000012889	SYF2	100	75.410	Sorex_araneus
ENSTSYG00000005114	SYF2	97	83.966	ENSSPUG00000005251	SYF2	94	83.966	Sphenodon_punctatus
ENSTSYG00000005114	SYF2	95	78.723	ENSSPAG00000009626	syf2	99	78.723	Stegastes_partitus
ENSTSYG00000005114	SYF2	100	91.837	ENSSSCG00000037481	SYF2	100	91.837	Sus_scrofa
ENSTSYG00000005114	SYF2	69	62.676	ENSTGUG00000001126	SYF2	86	58.857	Taeniopygia_guttata
ENSTSYG00000005114	SYF2	100	75.309	ENSTRUG00000001499	syf2	95	75.417	Takifugu_rubripes
ENSTSYG00000005114	SYF2	92	78.475	ENSTNIG00000016912	syf2	100	78.475	Tetraodon_nigroviridis
ENSTSYG00000005114	SYF2	100	71.605	ENSTBEG00000017370	SYF2	99	71.193	Tupaia_belangeri
ENSTSYG00000005114	SYF2	100	93.033	ENSTTRG00000003550	SYF2	100	93.033	Tursiops_truncatus
ENSTSYG00000005114	SYF2	100	91.870	ENSUAMG00000002897	SYF2	100	91.870	Ursus_americanus
ENSTSYG00000005114	SYF2	100	91.870	ENSUMAG00000013108	SYF2	100	91.870	Ursus_maritimus
ENSTSYG00000005114	SYF2	100	91.803	ENSVPAG00000005705	SYF2	100	91.803	Vicugna_pacos
ENSTSYG00000005114	SYF2	100	91.463	ENSVVUG00000027175	-	100	91.463	Vulpes_vulpes
ENSTSYG00000005114	SYF2	100	88.710	ENSVVUG00000027181	-	100	88.710	Vulpes_vulpes
ENSTSYG00000005114	SYF2	97	81.702	ENSXETG00000022797	syf2	94	81.702	Xenopus_tropicalis
ENSTSYG00000005114	SYF2	88	80.000	ENSXMAG00000022698	syf2	100	73.251	Xiphophorus_maculatus