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Ensembl ID: ENSTSYG00000005996 (Gene tree)
Gene ID: 103257041
Gene Symbol: RAB1A
Alias: -
Full Name: ras-related protein Rab-1A
Gene Type: protein_coding
Species: Carlito_syrichta
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 21886 bases
Position: chrABRT02354307.1:1-21886
Accession: 103257041
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSTSYP00000019702	MMR_HSR1	PF01926.23	1.4e-05	1	1
ENSTSYP00000027988	MMR_HSR1	PF01926.23	1.6e-05	1	1
ENSTSYP00000018371	MMR_HSR1	PF01926.23	1.8e-05	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSTSYT00000035316	RAB1A-203	420	-	ENSTSYP00000031209	139 (aa)	-	UPI000C2F4A94
ENSTSYT00000025677	RAB1A-205	633	-	ENSTSYP00000018371	210 (aa)	-	UPI000C2F4CC1
ENSTSYT00000039517	RAB1A-201	976	XM_008054779	ENSTSYP00000019702	197 (aa)	XP_008052970	A0A1U7T5A1
ENSTSYT00000034032	RAB1A-202	612	-	ENSTSYP00000027988	203 (aa)	-	UPI000C2F515E
ENSTSYT00000038154	RAB1A-207	501	-	ENSTSYP00000031132	166 (aa)	-	UPI000C2F7A19
ENSTSYT00000006012	RAB1A-204	384	-	ENSTSYP00000005497	127 (aa)	-	UPI000C2F4D9F
ENSTSYT00000047462	RAB1A-206	537	-	ENSTSYP00000017440	178 (aa)	-	UPI000C2F328A

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSTSYG00000005996	RAB1A	98	45.596	ENSTSYG00000014136	-	90	45.128
ENSTSYG00000005996	RAB1A	80	39.752	ENSTSYG00000030891	RAB34	62	39.752
ENSTSYG00000005996	RAB1A	93	48.087	ENSTSYG00000030301	RAB2A	99	44.550
ENSTSYG00000005996	RAB1A	91	33.514	ENSTSYG00000011437	RERG	90	33.514
ENSTSYG00000005996	RAB1A	98	43.299	ENSTSYG00000009576	RAB5B	90	43.299
ENSTSYG00000005996	RAB1A	81	37.500	ENSTSYG00000000768	RAB41	72	37.500
ENSTSYG00000005996	RAB1A	60	32.031	ENSTSYG00000033922	ARL4C	63	32.031
ENSTSYG00000005996	RAB1A	84	44.000	ENSTSYG00000033032	RAB33B	76	44.000
ENSTSYG00000005996	RAB1A	83	37.805	ENSTSYG00000032750	KRAS	95	35.912
ENSTSYG00000005996	RAB1A	84	50.909	ENSTSYG00000031189	RAB11A	96	52.239
ENSTSYG00000005996	RAB1A	98	39.086	ENSTSYG00000034530	-	97	39.086
ENSTSYG00000005996	RAB1A	100	45.894	ENSTSYG00000014758	RAB11B	97	45.050
ENSTSYG00000005996	RAB1A	78	37.419	ENSTSYG00000004323	-	65	37.419
ENSTSYG00000005996	RAB1A	86	44.767	ENSTSYG00000030186	RAB39B	81	44.767
ENSTSYG00000005996	RAB1A	84	38.462	ENSTSYG00000002313	RAB7A	79	39.264
ENSTSYG00000005996	RAB1A	100	92.893	ENSTSYG00000025638	RAB1B	96	92.893
ENSTSYG00000005996	RAB1A	98	38.384	ENSTSYG00000013951	RAB6A	94	38.384
ENSTSYG00000005996	RAB1A	83	48.214	ENSTSYG00000028731	RAB33A	71	48.214
ENSTSYG00000005996	RAB1A	87	35.028	ENSTSYG00000003745	HRAS	97	33.929
ENSTSYG00000005996	RAB1A	92	46.703	ENSTSYG00000013092	RAB18	93	45.361
ENSTSYG00000005996	RAB1A	86	33.908	ENSTSYG00000029126	RAB23	73	33.908
ENSTSYG00000005996	RAB1A	83	46.341	ENSTSYG00000013028	RAB25	77	46.341
ENSTSYG00000005996	RAB1A	79	39.623	ENSTSYG00000008912	RAB9B	86	37.791
ENSTSYG00000005996	RAB1A	56	33.043	ENSTSYG00000026739	-	59	33.043
ENSTSYG00000005996	RAB1A	98	43.077	ENSTSYG00000030531	RAB5C	89	43.077
ENSTSYG00000005996	RAB1A	85	31.953	ENSTSYG00000034760	-	92	31.548
ENSTSYG00000005996	RAB1A	83	38.415	ENSTSYG00000027718	NRAS	86	38.415
ENSTSYG00000005996	RAB1A	98	43.814	ENSTSYG00000007642	-	90	43.814
ENSTSYG00000005996	RAB1A	81	30.909	ENSTSYG00000014096	DNAJC27	89	31.013
ENSTSYG00000005996	RAB1A	83	50.610	ENSTSYG00000009392	RAB30	83	50.296
ENSTSYG00000005996	RAB1A	93	48.634	ENSTSYG00000033832	RAB2B	86	48.108
ENSTSYG00000005996	RAB1A	85	31.361	ENSTSYG00000027100	-	92	31.176
ENSTSYG00000005996	RAB1A	98	42.347	ENSTSYG00000030238	-	89	42.347

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSTSYG00000005996	RAB1A	100	100.000	ENSG00000138069	RAB1A	100	100.000	Homo_sapiens
ENSTSYG00000005996	RAB1A	100	95.431	ENSAPOG00000008143	-	100	94.059	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTSYG00000005996	RAB1A	100	100.000	ENSAMEG00000001127	RAB1A	100	98.049	Ailuropoda_melanoleuca
ENSTSYG00000005996	RAB1A	100	95.431	ENSAOCG00000020606	-	99	95.431	Amphiprion_ocellaris
ENSTSYG00000005996	RAB1A	100	95.431	ENSAPEG00000022488	-	100	94.059	Amphiprion_percula
ENSTSYG00000005996	RAB1A	100	100.000	ENSANAG00000020929	RAB1A	100	98.049	Aotus_nancymaae
ENSTSYG00000005996	RAB1A	100	95.939	ENSACLG00000003326	-	100	94.554	Astatotilapia_calliptera
ENSTSYG00000005996	RAB1A	100	94.416	ENSAMXG00000034850	-	100	93.069	Astyanax_mexicanus
ENSTSYG00000005996	RAB1A	100	100.000	ENSBTAG00000016720	RAB1A	100	99.495	Bos_taurus
ENSTSYG00000005996	RAB1A	100	100.000	ENSCJAG00000046275	RAB1A	99	100.000	Callithrix_jacchus
ENSTSYG00000005996	RAB1A	100	100.000	ENSCAFG00000003187	RAB1A	100	98.049	Canis_familiaris
ENSTSYG00000005996	RAB1A	100	100.000	ENSCAFG00020026971	RAB1A	100	98.049	Canis_lupus_dingo
ENSTSYG00000005996	RAB1A	100	100.000	ENSCHIG00000014060	RAB1A	100	97.087	Capra_hircus
ENSTSYG00000005996	RAB1A	100	100.000	ENSCPOG00000015437	RAB1A	100	98.049	Cavia_porcellus
ENSTSYG00000005996	RAB1A	100	100.000	ENSCCAG00000021869	RAB1A	100	98.049	Cebus_capucinus
ENSTSYG00000005996	RAB1A	100	100.000	ENSCATG00000030853	RAB1A	100	98.049	Cercocebus_atys
ENSTSYG00000005996	RAB1A	100	100.000	ENSCLAG00000014766	RAB1A	100	98.049	Chinchilla_lanigera
ENSTSYG00000005996	RAB1A	100	99.492	ENSCPBG00000013243	RAB1A	100	97.561	Chrysemys_picta_bellii
ENSTSYG00000005996	RAB1A	100	97.462	ENSCANG00000035916	RAB1A	99	97.462	Colobus_angolensis_palliatus
ENSTSYG00000005996	RAB1A	100	100.000	ENSCGRG00001012691	-	100	98.049	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSTSYG00000005996	RAB1A	100	100.000	ENSCGRG00000008456	-	100	98.049	Cricetulus_griseus_crigri
ENSTSYG00000005996	RAB1A	100	100.000	ENSDNOG00000018236	RAB1A	100	98.049	Dasypus_novemcinctus
ENSTSYG00000005996	RAB1A	100	100.000	ENSDORG00000028628	-	100	98.049	Dipodomys_ordii
ENSTSYG00000005996	RAB1A	100	84.343	FBgn0285937	Rab1	100	82.524	Drosophila_melanogaster
ENSTSYG00000005996	RAB1A	100	100.000	ENSETEG00000002205	RAB1A	100	98.515	Echinops_telfairi
ENSTSYG00000005996	RAB1A	100	100.000	ENSEASG00005007298	RAB1A	100	98.049	Equus_asinus_asinus
ENSTSYG00000005996	RAB1A	100	100.000	ENSECAG00000009926	RAB1A	100	98.049	Equus_caballus
ENSTSYG00000005996	RAB1A	100	100.000	ENSEEUG00000011721	RAB1A	100	98.515	Erinaceus_europaeus
ENSTSYG00000005996	RAB1A	100	95.477	ENSELUG00000012166	RAB1A	96	94.118	Esox_lucius
ENSTSYG00000005996	RAB1A	100	100.000	ENSFCAG00000002536	RAB1A	100	98.049	Felis_catus
ENSTSYG00000005996	RAB1A	100	99.492	ENSFALG00000013624	RAB1A	100	97.073	Ficedula_albicollis
ENSTSYG00000005996	RAB1A	100	100.000	ENSFDAG00000019505	-	100	98.049	Fukomys_damarensis
ENSTSYG00000005996	RAB1A	100	94.416	ENSFHEG00000014414	-	100	93.069	Fundulus_heteroclitus
ENSTSYG00000005996	RAB1A	100	99.492	ENSGALG00000031582	RAB1A	100	97.561	Gallus_gallus
ENSTSYG00000005996	RAB1A	100	94.416	ENSGAFG00000000918	-	100	93.069	Gambusia_affinis
ENSTSYG00000005996	RAB1A	100	99.492	ENSGAGG00000006802	RAB1A	100	97.561	Gopherus_agassizii
ENSTSYG00000005996	RAB1A	100	100.000	ENSGGOG00000026603	RAB1A	99	100.000	Gorilla_gorilla
ENSTSYG00000005996	RAB1A	100	100.000	ENSHGLG00000013585	RAB1A	100	98.049	Heterocephalus_glaber_female
ENSTSYG00000005996	RAB1A	100	100.000	ENSHGLG00100007994	RAB1A	98	99.497	Heterocephalus_glaber_male
ENSTSYG00000005996	RAB1A	100	100.000	ENSSTOG00000020693	-	100	98.049	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSTSYG00000005996	RAB1A	100	100.000	ENSJJAG00000014396	Rab1a	100	100.000	Jaculus_jaculus
ENSTSYG00000005996	RAB1A	100	95.431	ENSKMAG00000014038	-	94	95.000	Kryptolebias_marmoratus
ENSTSYG00000005996	RAB1A	100	94.924	ENSLBEG00000028426	RAB1A	100	93.564	Labrus_bergylta
ENSTSYG00000005996	RAB1A	100	98.985	ENSLACG00000012869	RAB1A	100	96.585	Latimeria_chalumnae
ENSTSYG00000005996	RAB1A	100	100.000	ENSLAFG00000016666	RAB1A	100	98.049	Loxodonta_africana
ENSTSYG00000005996	RAB1A	100	100.000	ENSMFAG00000046246	RAB1A	100	98.049	Macaca_fascicularis
ENSTSYG00000005996	RAB1A	100	100.000	ENSMMUG00000021721	RAB1A	96	96.635	Macaca_mulatta
ENSTSYG00000005996	RAB1A	94	99.462	ENSMNEG00000028414	-	97	97.423	Macaca_nemestrina
ENSTSYG00000005996	RAB1A	100	100.000	ENSMLEG00000042535	RAB1A	100	98.049	Mandrillus_leucophaeus
ENSTSYG00000005996	RAB1A	100	95.939	ENSMZEG00005013959	-	100	94.554	Maylandia_zebra
ENSTSYG00000005996	RAB1A	100	99.492	ENSMGAG00000004611	RAB1A	100	98.039	Meleagris_gallopavo
ENSTSYG00000005996	RAB1A	100	99.492	ENSMAUG00000012156	Rab1a	100	97.561	Mesocricetus_auratus
ENSTSYG00000005996	RAB1A	100	100.000	ENSMICG00000012587	RAB1A	100	98.049	Microcebus_murinus
ENSTSYG00000005996	RAB1A	100	99.492	ENSMOCG00000017022	Rab1a	100	97.561	Microtus_ochrogaster
ENSTSYG00000005996	RAB1A	100	93.401	ENSMMOG00000018709	RAB1A	100	92.079	Mola_mola
ENSTSYG00000005996	RAB1A	100	99.492	ENSMODG00000003340	RAB1A	100	97.561	Monodelphis_domestica
ENSTSYG00000005996	RAB1A	100	100.000	MGP_CAROLIEiJ_G0016115	Rab1a	100	98.049	Mus_caroli
ENSTSYG00000005996	RAB1A	100	100.000	ENSMUSG00000020149	Rab1a	100	98.515	Mus_musculus
ENSTSYG00000005996	RAB1A	100	100.000	MGP_PahariEiJ_G0016776	Rab1a	100	98.049	Mus_pahari
ENSTSYG00000005996	RAB1A	100	100.000	MGP_SPRETEiJ_G0016958	Rab1a	100	98.515	Mus_spretus
ENSTSYG00000005996	RAB1A	100	100.000	ENSMPUG00000006139	RAB1A	82	98.049	Mustela_putorius_furo
ENSTSYG00000005996	RAB1A	100	100.000	ENSMLUG00000009489	RAB1A	100	98.049	Myotis_lucifugus
ENSTSYG00000005996	RAB1A	100	100.000	ENSNGAG00000005838	Rab1a	100	98.049	Nannospalax_galili
ENSTSYG00000005996	RAB1A	100	95.939	ENSNBRG00000020492	-	100	94.554	Neolamprologus_brichardi
ENSTSYG00000005996	RAB1A	100	100.000	ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	100.000	Ochotona_princeps
ENSTSYG00000005996	RAB1A	97	100.000	ENSODEG00000011248	-	96	100.000	Octodon_degus
ENSTSYG00000005996	RAB1A	100	93.909	ENSONIG00000006819	-	100	92.157	Oreochromis_niloticus
ENSTSYG00000005996	RAB1A	100	99.492	ENSOANG00000012438	RAB1A	100	97.561	Ornithorhynchus_anatinus
ENSTSYG00000005996	RAB1A	100	100.000	ENSOCUG00000017003	RAB1A	100	98.049	Oryctolagus_cuniculus
ENSTSYG00000005996	RAB1A	100	100.000	ENSOGAG00000026181	RAB1A	100	98.049	Otolemur_garnettii
ENSTSYG00000005996	RAB1A	100	100.000	ENSOARG00000019997	RAB1A	100	98.049	Ovis_aries
ENSTSYG00000005996	RAB1A	100	100.000	ENSPPAG00000030253	RAB1A	100	98.515	Pan_paniscus
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