EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSTSYG00000009767 (Gene tree)
Gene ID: 103271693
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: argonaute 1%2C RISC catalytic component
Gene Type: protein_coding
Species: Carlito_syrichta
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 39951 bases
Position: chrKE946660.1:114948-154898
Accession: 103271693
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSTSYP00000009030	PAZ	PF02170.22	1e-28	1	1
ENSTSYP00000029078	PAZ	PF02170.22	1e-28	1	1
ENSTSYP00000009030	Piwi	PF02171.17	1.3e-110	1	1
ENSTSYP00000029078	Piwi	PF02171.17	1.3e-110	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSTSYT00000042550	-	7411	XM_008069184	ENSTSYP00000029078	857 (aa)	XP_008067375	A0A1U7UB89
ENSTSYT00000009852	-	2559	-	ENSTSYP00000009030	852 (aa)	-	UPI000C2F35BC

Gene Model

Click here to download ENSTSYG00000009767's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSTSYG00000009767's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSTSYG00000009767	-	83	83.590	ENSTSYG00000011897	AGO3	98	83.590
ENSTSYG00000009767	-	98	84.010	ENSTSYG00000007281	AGO2	98	83.669
ENSTSYG00000009767	-	99	83.489	ENSTSYG00000014007	AGO4	99	83.489
ENSTSYG00000009767	-	100	78.763	ENSTSYG00000032426	-	99	79.499

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSTSYG00000009767	-	100	100.000	ENSG00000092847	AGO1	100	100.000	Homo_sapiens
ENSTSYG00000009767	-	100	96.154	ENSAPOG00000024299	ago1	99	96.576	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTSYG00000009767	-	100	100.000	ENSAMEG00000000504	AGO1	100	100.000	Ailuropoda_melanoleuca
ENSTSYG00000009767	-	82	92.023	ENSACIG00000005298	ago1	98	92.023	Amphilophus_citrinellus
ENSTSYG00000009767	-	100	96.154	ENSAOCG00000017727	ago1	99	96.576	Amphiprion_ocellaris
ENSTSYG00000009767	-	100	96.154	ENSAPEG00000004458	ago1	99	96.576	Amphiprion_percula
ENSTSYG00000009767	-	100	96.154	ENSATEG00000008523	ago1	99	96.576	Anabas_testudineus
ENSTSYG00000009767	-	99	93.794	ENSAPLG00000010440	AGO1	98	93.794	Anas_platyrhynchos
ENSTSYG00000009767	-	92	99.872	ENSACAG00000029174	AGO1	100	99.872	Anolis_carolinensis
ENSTSYG00000009767	-	100	100.000	ENSANAG00000037711	AGO1	100	100.000	Aotus_nancymaae
ENSTSYG00000009767	-	100	95.921	ENSACLG00000000890	ago1	99	96.340	Astatotilapia_calliptera
ENSTSYG00000009767	-	81	98.542	ENSAMXG00000001917	ago1	98	98.542	Astyanax_mexicanus
ENSTSYG00000009767	-	100	99.883	ENSBTAG00000012253	AGO1	100	99.883	Bos_taurus
ENSTSYG00000009767	-	100	100.000	ENSCJAG00000032023	AGO1	100	100.000	Callithrix_jacchus
ENSTSYG00000009767	-	100	100.000	ENSCAFG00000003443	AGO1	100	100.000	Canis_familiaris
ENSTSYG00000009767	-	99	99.762	ENSCAFG00020009251	AGO1	99	99.683	Canis_lupus_dingo
ENSTSYG00000009767	-	100	99.072	ENSCHIG00000011848	-	100	99.072	Capra_hircus
ENSTSYG00000009767	-	90	93.983	ENSCAPG00000010228	AGO1	100	93.111	Cavia_aperea
ENSTSYG00000009767	-	100	100.000	ENSCPOG00000011568	AGO1	100	100.000	Cavia_porcellus
ENSTSYG00000009767	-	100	100.000	ENSCCAG00000011823	AGO1	100	100.000	Cebus_capucinus
ENSTSYG00000009767	-	100	99.301	ENSCATG00000031521	AGO1	100	100.000	Cercocebus_atys
ENSTSYG00000009767	-	100	100.000	ENSCLAG00000011507	AGO1	100	100.000	Chinchilla_lanigera
ENSTSYG00000009767	-	100	100.000	ENSCSAG00000001091	AGO1	100	100.000	Chlorocebus_sabaeus
ENSTSYG00000009767	-	86	94.574	ENSCHOG00000011591	AGO1	86	94.574	Choloepus_hoffmanni
ENSTSYG00000009767	-	100	99.767	ENSCPBG00000018594	AGO1	100	99.767	Chrysemys_picta_bellii
ENSTSYG00000009767	-	100	100.000	ENSCANG00000039798	AGO1	100	100.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSTSYG00000009767	-	100	100.000	ENSCGRG00001022708	Ago1	100	100.000	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSTSYG00000009767	-	99	100.000	ENSCGRG00000010386	Ago1	100	100.000	Cricetulus_griseus_crigri
ENSTSYG00000009767	-	99	94.780	ENSCSEG00000001051	ago1	99	94.780	Cynoglossus_semilaevis
ENSTSYG00000009767	-	100	95.921	ENSCVAG00000018173	ago1	99	96.576	Cyprinodon_variegatus
ENSTSYG00000009767	-	100	96.503	ENSDARG00000092644	ago1	99	96.812	Danio_rerio
ENSTSYG00000009767	-	92	100.000	ENSDNOG00000008077	AGO1	100	100.000	Dasypus_novemcinctus
ENSTSYG00000009767	-	93	99.255	ENSDORG00000008494	Ago1	100	100.000	Dipodomys_ordii
ENSTSYG00000009767	-	84	93.204	ENSETEG00000007626	AGO1	100	93.204	Echinops_telfairi
ENSTSYG00000009767	-	100	100.000	ENSEASG00005012086	AGO1	100	100.000	Equus_asinus_asinus
ENSTSYG00000009767	-	100	100.000	ENSECAG00000024353	AGO1	100	100.000	Equus_caballus
ENSTSYG00000009767	-	92	91.614	ENSEEUG00000005349	AGO1	92	91.614	Erinaceus_europaeus
ENSTSYG00000009767	-	92	97.059	ENSELUG00000016803	ago1	100	97.059	Esox_lucius
ENSTSYG00000009767	-	100	100.000	ENSFCAG00000000746	AGO1	100	100.000	Felis_catus
ENSTSYG00000009767	-	92	92.219	ENSFALG00000000790	AGO1	100	92.219	Ficedula_albicollis
ENSTSYG00000009767	-	100	99.883	ENSFDAG00000017210	AGO1	100	99.883	Fukomys_damarensis
ENSTSYG00000009767	-	99	92.680	ENSFHEG00000017927	ago1	99	93.001	Fundulus_heteroclitus
ENSTSYG00000009767	-	88	84.646	ENSGMOG00000019413	ago1	100	84.646	Gadus_morhua
ENSTSYG00000009767	-	100	99.883	ENSGALG00000002249	AGO1	100	99.883	Gallus_gallus
ENSTSYG00000009767	-	100	96.270	ENSGAFG00000009775	ago1	99	96.694	Gambusia_affinis
ENSTSYG00000009767	-	88	97.204	ENSGACG00000012443	ago1	100	97.204	Gasterosteus_aculeatus
ENSTSYG00000009767	-	92	99.872	ENSGAGG00000012893	-	100	99.872	Gopherus_agassizii
ENSTSYG00000009767	-	100	100.000	ENSGGOG00000003316	AGO1	100	100.000	Gorilla_gorilla
ENSTSYG00000009767	-	100	95.921	ENSHBUG00000010459	ago1	99	96.340	Haplochromis_burtoni
ENSTSYG00000009767	-	100	100.000	ENSHGLG00000011540	AGO1	100	100.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSTSYG00000009767	-	100	100.000	ENSHGLG00100005568	AGO1	100	100.000	Heterocephalus_glaber_male
ENSTSYG00000009767	-	99	96.576	ENSHCOG00000005708	ago1	99	96.576	Hippocampus_comes
ENSTSYG00000009767	-	100	96.154	ENSIPUG00000023216	ago1	99	96.576	Ictalurus_punctatus
ENSTSYG00000009767	-	100	100.000	ENSSTOG00000010857	AGO1	100	100.000	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSTSYG00000009767	-	100	99.883	ENSJJAG00000019449	Ago1	100	99.883	Jaculus_jaculus
ENSTSYG00000009767	-	100	96.154	ENSKMAG00000019464	ago1	99	96.576	Kryptolebias_marmoratus
ENSTSYG00000009767	-	100	96.270	ENSLBEG00000007694	ago1	99	96.694	Labrus_bergylta
ENSTSYG00000009767	-	99	93.522	ENSLACG00000017009	AGO1	99	93.625	Latimeria_chalumnae
ENSTSYG00000009767	-	100	94.056	ENSLOCG00000000504	AGO1	99	94.340	Lepisosteus_oculatus
ENSTSYG00000009767	-	99	100.000	ENSLAFG00000010835	AGO1	99	100.000	Loxodonta_africana
ENSTSYG00000009767	-	100	100.000	ENSMFAG00000002846	AGO1	100	100.000	Macaca_fascicularis
ENSTSYG00000009767	-	99	95.289	ENSMMUG00000006251	AGO1	100	95.255	Macaca_mulatta
ENSTSYG00000009767	-	100	96.033	ENSMNEG00000028881	AGO1	100	100.000	Macaca_nemestrina
ENSTSYG00000009767	-	100	100.000	ENSMLEG00000038388	AGO1	100	100.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSTSYG00000009767	-	100	96.154	ENSMAMG00000008381	ago1	99	96.576	Mastacembelus_armatus
ENSTSYG00000009767	-	100	95.921	ENSMZEG00005007996	ago1	99	96.340	Maylandia_zebra
ENSTSYG00000009767	-	99	94.399	ENSMGAG00000003822	AGO1	99	94.484	Meleagris_gallopavo
ENSTSYG00000009767	-	100	100.000	ENSMAUG00000015189	Ago1	100	100.000	Mesocricetus_auratus
ENSTSYG00000009767	-	100	100.000	ENSMICG00000016147	AGO1	100	100.000	Microcebus_murinus
ENSTSYG00000009767	-	100	99.883	ENSMOCG00000000537	Ago1	100	99.883	Microtus_ochrogaster
ENSTSYG00000009767	-	79	98.657	ENSMMOG00000018459	ago1	93	98.657	Mola_mola
ENSTSYG00000009767	-	100	99.650	ENSMODG00000023335	AGO1	100	99.650	Monodelphis_domestica
ENSTSYG00000009767	-	99	96.458	ENSMALG00000011057	ago1	99	96.797	Monopterus_albus
ENSTSYG00000009767	-	100	100.000	MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	100.000	Mus_caroli
ENSTSYG00000009767	-	100	100.000	ENSMUSG00000041530	Ago1	100	100.000	Mus_musculus
ENSTSYG00000009767	-	100	100.000	MGP_PahariEiJ_G0028809	Ago1	100	100.000	Mus_pahari
ENSTSYG00000009767	-	100	100.000	MGP_SPRETEiJ_G0027457	Ago1	100	100.000	Mus_spretus
ENSTSYG00000009767	-	84	100.000	ENSMPUG00000014872	AGO1	100	100.000	Mustela_putorius_furo
ENSTSYG00000009767	-	61	99.617	ENSMLUG00000009628	AGO1	99	99.617	Myotis_lucifugus
ENSTSYG00000009767	-	100	99.767	ENSNGAG00000017448	Ago1	100	99.767	Nannospalax_galili
ENSTSYG00000009767	-	92	97.059	ENSNBRG00000010867	ago1	100	97.059	Neolamprologus_brichardi
ENSTSYG00000009767	-	100	99.883	ENSNLEG00000011181	AGO1	100	99.883	Nomascus_leucogenys
ENSTSYG00000009767	-	85	100.000	ENSMEUG00000013429	AGO1	91	100.000	Notamacropus_eugenii
ENSTSYG00000009767	-	93	100.000	ENSOPRG00000012325	AGO1	93	100.000	Ochotona_princeps
ENSTSYG00000009767	-	100	100.000	ENSODEG00000005321	AGO1	100	100.000	Octodon_degus
ENSTSYG00000009767	-	99	96.340	ENSONIG00000016345	ago1	99	96.679	Oreochromis_niloticus
ENSTSYG00000009767	-	100	91.003	ENSOANG00000002080	AGO1	100	91.977	Ornithorhynchus_anatinus
ENSTSYG00000009767	-	100	99.883	ENSOCUG00000023116	AGO1	100	99.883	Oryctolagus_cuniculus
ENSTSYG00000009767	-	100	96.154	ENSORLG00000014965	ago1	99	96.576	Oryzias_latipes
ENSTSYG00000009767	-	100	96.154	ENSORLG00020018253	ago1	99	96.576	Oryzias_latipes_hni
ENSTSYG00000009767	-	100	96.154	ENSORLG00015003287	ago1	99	96.576	Oryzias_latipes_hsok
ENSTSYG00000009767	-	100	96.154	ENSOMEG00000020528	ago1	99	96.576	Oryzias_melastigma
ENSTSYG00000009767	-	99	100.000	ENSOGAG00000010279	AGO1	99	100.000	Otolemur_garnettii
ENSTSYG00000009767	-	100	99.883	ENSOARG00000019591	AGO1	100	99.883	Ovis_aries
ENSTSYG00000009767	-	100	100.000	ENSPPAG00000034838	AGO1	100	100.000	Pan_paniscus
ENSTSYG00000009767	-	100	100.000	ENSPPRG00000006475	AGO1	100	100.000	Panthera_pardus
ENSTSYG00000009767	-	100	99.767	ENSPTIG00000020991	AGO1	100	99.767	Panthera_tigris_altaica
ENSTSYG00000009767	-	100	100.000	ENSPTRG00000000528	AGO1	100	100.000	Pan_troglodytes
ENSTSYG00000009767	-	100	100.000	ENSPANG00000009060	AGO1	100	100.000	Papio_anubis
ENSTSYG00000009767	-	99	99.050	ENSPSIG00000017482	AGO1	100	99.050	Pelodiscus_sinensis
ENSTSYG00000009767	-	81	97.384	ENSPMGG00000024099	ago1	98	97.384	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSTSYG00000009767	-	100	100.000	ENSPEMG00000023313	Ago1	100	100.000	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSTSYG00000009767	-	100	99.650	ENSPCIG00000000172	AGO1	100	99.650	Phascolarctos_cinereus
ENSTSYG00000009767	-	100	96.270	ENSPFOG00000005867	ago1	99	96.694	Poecilia_formosa
ENSTSYG00000009767	-	100	96.270	ENSPLAG00000002824	ago1	99	98.119	Poecilia_latipinna
ENSTSYG00000009767	-	100	96.270	ENSPMEG00000001787	ago1	99	98.119	Poecilia_mexicana
ENSTSYG00000009767	-	100	96.270	ENSPREG00000006534	ago1	99	96.694	Poecilia_reticulata
ENSTSYG00000009767	-	100	100.000	ENSPPYG00000001551	AGO1	100	100.000	Pongo_abelii
ENSTSYG00000009767	-	58	100.000	ENSPCAG00000005604	AGO1	66	100.000	Procavia_capensis
ENSTSYG00000009767	-	100	100.000	ENSPCOG00000022061	AGO1	100	100.000	Propithecus_coquereli
ENSTSYG00000009767	-	100	100.000	ENSPVAG00000005082	AGO1	100	100.000	Pteropus_vampyrus
ENSTSYG00000009767	-	92	92.219	ENSPNYG00000012586	ago1	100	92.219	Pundamilia_nyererei
ENSTSYG00000009767	-	93	92.356	ENSPNAG00000000597	ago1	99	92.356	Pygocentrus_nattereri
ENSTSYG00000009767	-	100	99.883	ENSRNOG00000055915	Ago1	100	99.883	Rattus_norvegicus
ENSTSYG00000009767	-	100	100.000	ENSRBIG00000032611	AGO1	100	100.000	Rhinopithecus_bieti
ENSTSYG00000009767	-	100	100.000	ENSRROG00000044469	AGO1	100	100.000	Rhinopithecus_roxellana
ENSTSYG00000009767	-	100	100.000	ENSSBOG00000020867	AGO1	100	100.000	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSTSYG00000009767	-	100	98.363	ENSSHAG00000017468	AGO1	100	98.480	Sarcophilus_harrisii
ENSTSYG00000009767	-	100	96.154	ENSSFOG00015020982	ago1	99	96.576	Scleropages_formosus
ENSTSYG00000009767	-	100	96.154	ENSSMAG00000002841	ago1	99	96.576	Scophthalmus_maximus
ENSTSYG00000009767	-	100	96.154	ENSSDUG00000010864	ago1	99	96.576	Seriola_dumerili
ENSTSYG00000009767	-	100	96.154	ENSSLDG00000000386	ago1	99	96.576	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSTSYG00000009767	-	74	100.000	ENSSARG00000011520	AGO1	74	100.000	Sorex_araneus
ENSTSYG00000009767	-	99	99.646	ENSSPUG00000000836	AGO1	100	99.646	Sphenodon_punctatus
ENSTSYG00000009767	-	100	96.154	ENSSPAG00000019154	ago1	99	96.576	Stegastes_partitus
ENSTSYG00000009767	-	100	95.266	ENSTRUG00000024431	ago1	100	96.442	Takifugu_rubripes
ENSTSYG00000009767	-	100	95.925	ENSTNIG00000012102	ago1	99	96.344	Tetraodon_nigroviridis
ENSTSYG00000009767	-	85	99.445	ENSTBEG00000016514	AGO1	100	99.445	Tupaia_belangeri
ENSTSYG00000009767	-	100	98.250	ENSTTRG00000015088	AGO1	100	98.250	Tursiops_truncatus
ENSTSYG00000009767	-	100	100.000	ENSUAMG00000027154	AGO1	100	100.000	Ursus_americanus
ENSTSYG00000009767	-	99	96.475	ENSUMAG00000002480	AGO1	99	96.226	Ursus_maritimus
ENSTSYG00000009767	-	95	92.289	ENSVPAG00000006663	AGO1	100	92.289	Vicugna_pacos
ENSTSYG00000009767	-	100	100.000	ENSVVUG00000000405	AGO1	100	100.000	Vulpes_vulpes
ENSTSYG00000009767	-	100	98.021	ENSXETG00000004364	ago1	100	98.021	Xenopus_tropicalis
ENSTSYG00000009767	-	92	96.419	ENSXCOG00000007669	ago1	100	96.419	Xiphophorus_couchianus
ENSTSYG00000009767	-	100	96.270	ENSXMAG00000021899	ago1	99	96.694	Xiphophorus_maculatus