EuRBPDB

  • Home
  • Cancer
  • Family
  • Species
  • RBPredictor
  • Search
  • Download
  • Submit
  • Help
  • Contact

  • Description
  • RBDs
  • Transcripts
  • Gene Model
  • PPI
  • Paralogs
  • Orthologs
Description
Ensembl ID
ENSTSYG00000012133 (Gene tree)
Gene ID
103271299
Gene Symbol
SKIV2L
Alias
-
Full Name
Ski2 like RNA helicase
Gene Type
protein_coding
Species
Carlito_syrichta
Status
putative
Strand
Plus strand
Length
11140 bases
Position
chrKE946350.1:159643-170782
Accession
103271299
RBP type
canonical RBP
Summary
-
RNA binding domains(RBDs)
Protein IDDomain Pfam IDE-value Domain number Total number
ENSTSYP00000011132rRNA_proc-archPF13234.63.3e-4011
ENSTSYP00000011132DEADPF00270.294.6e-1611
Transcripts
Transcript IDNameLengthRefSeq ID Protein IDLengthRefSeq IDUniportKB ID
ENSTSYT00000044817SKIV2L-2023417-ENSTSYP0000001625878 (aa)-UPI000C2F7ED9
ENSTSYT00000012133SKIV2L-2014181XM_008068760ENSTSYP000000111321246 (aa)XP_008066951A0A1U7UM76
Gene Model
Click here to download ENSTSYG00000012133's gene model file
Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSTSYG00000012133's network
Paralogs
Ensembl IDGene SymbolCoverageIdentiy ParalogGene SymbolCoverageIdentiy
ENSTSYG00000012133SKIV2L7443.987ENSTSYG00000007389MTREX8743.987
Orthologs
Ensembl IDGene SymbolCoverageIdentiy OrthologGene SymbolCoverageIdentiy Species
ENSTSYG00000012133SKIV2L10094.703ENSG00000204351SKIV2L10094.703Homo_sapiens
ENSTSYG00000012133SKIV2L9961.252ENSAPOG00000008257skiv2l9961.687Acanthochromis_polyacanthus
ENSTSYG00000012133SKIV2L10094.543ENSAMEG00000002078SKIV2L10094.543Ailuropoda_melanoleuca
ENSTSYG00000012133SKIV2L9959.648ENSACIG00000016719skiv2l9959.790Amphilophus_citrinellus
ENSTSYG00000012133SKIV2L9960.966ENSAOCG00000017352skiv2l9960.897Amphiprion_ocellaris
ENSTSYG00000012133SKIV2L9960.808ENSAPEG00000001055skiv2l9960.737Amphiprion_percula
ENSTSYG00000012133SKIV2L9960.397ENSATEG00000007601skiv2l9960.288Anabas_testudineus
ENSTSYG00000012133SKIV2L9964.886ENSACAG00000011746SKIV2L9865.391Anolis_carolinensis
ENSTSYG00000012133SKIV2L10095.024ENSANAG00000037992SKIV2L10095.024Aotus_nancymaae
ENSTSYG00000012133SKIV2L9961.353ENSACLG00000006886skiv2l9961.464Astatotilapia_calliptera
ENSTSYG00000012133SKIV2L9859.313ENSAMXG00000011517skiv2l9959.375Astyanax_mexicanus
ENSTSYG00000012133SKIV2L10094.382ENSBTAG00000005587SKIV2L10094.382Bos_taurus
ENSTSYG00000012133SKIV2L9639.969WBGene00008502skih-29940.109Caenorhabditis_elegans
ENSTSYG00000012133SKIV2L10094.543ENSCJAG00000002263SKIV2L10094.543Callithrix_jacchus
ENSTSYG00000012133SKIV2L10094.623ENSCAFG00000000679SKIV2L10094.623Canis_familiaris
ENSTSYG00000012133SKIV2L10094.543ENSCAFG00020000948SKIV2L10094.543Canis_lupus_dingo
ENSTSYG00000012133SKIV2L10094.543ENSCHIG00000012897SKIV2L10094.543Capra_hircus
ENSTSYG00000012133SKIV2L10092.135ENSCPOG00000001307SKIV2L10092.135Cavia_porcellus
ENSTSYG00000012133SKIV2L10094.864ENSCCAG00000026206SKIV2L10094.864Cebus_capucinus
ENSTSYG00000012133SKIV2L10094.462ENSCATG00000036901SKIV2L10094.462Cercocebus_atys
ENSTSYG00000012133SKIV2L10092.697ENSCLAG00000007678SKIV2L10092.697Chinchilla_lanigera
ENSTSYG00000012133SKIV2L10094.543ENSCSAG00000008988SKIV2L10094.543Chlorocebus_sabaeus
ENSTSYG00000012133SKIV2L8764.327ENSCPBG00000000343SKIV2L9664.648Chrysemys_picta_bellii
ENSTSYG00000012133SKIV2L9451.096ENSCING00000005576-9951.184Ciona_intestinalis
ENSTSYG00000012133SKIV2L9994.699ENSCANG00000039709SKIV2L10094.699Colobus_angolensis_palliatus
ENSTSYG00000012133SKIV2L10093.264ENSCGRG00001008385Skiv2l10093.264Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSTSYG00000012133SKIV2L9960.908ENSCSEG00000011326skiv2l9860.806Cynoglossus_semilaevis
ENSTSYG00000012133SKIV2L9961.200ENSCVAG00000003072skiv2l9961.062Cyprinodon_variegatus
ENSTSYG00000012133SKIV2L9960.331ENSDARG00000062206skiv2l9960.592Danio_rerio
ENSTSYG00000012133SKIV2L9494.744ENSDNOG00000037590SKIV2L10088.409Dasypus_novemcinctus
ENSTSYG00000012133SKIV2L9344.081FBgn0039117tst9743.829Drosophila_melanogaster
ENSTSYG00000012133SKIV2L7292.802ENSETEG00000009522SKIV2L6992.802Echinops_telfairi
ENSTSYG00000012133SKIV2L8956.146ENSEBUG00000013680-9556.530Eptatretus_burgeri
ENSTSYG00000012133SKIV2L9394.832ENSEASG00005015534SKIV2L9994.832Equus_asinus_asinus
ENSTSYG00000012133SKIV2L9694.034ENSECAG00000021823SKIV2L9694.034Equus_caballus
ENSTSYG00000012133SKIV2L5498.419ENSEEUG00000005049SKIV2L5798.419Erinaceus_europaeus
ENSTSYG00000012133SKIV2L9960.331ENSELUG00000000181skiv2l9466.598Esox_lucius
ENSTSYG00000012133SKIV2L10095.024ENSFCAG00000004519SKIV2L10095.024Felis_catus
ENSTSYG00000012133SKIV2L10089.896ENSFDAG00000009438SKIV2L10090.217Fukomys_damarensis
ENSTSYG00000012133SKIV2L9960.979ENSFHEG00000008853skiv2l9961.075Fundulus_heteroclitus
ENSTSYG00000012133SKIV2L9958.673ENSGMOG00000005926skiv2l9858.517Gadus_morhua
ENSTSYG00000012133SKIV2L7760.811ENSGALG00000035499SKIV2L9960.408Gallus_gallus
ENSTSYG00000012133SKIV2L9961.124ENSGAFG00000002382skiv2l9961.062Gambusia_affinis
ENSTSYG00000012133SKIV2L9959.762ENSGACG00000002927skiv2l9860.081Gasterosteus_aculeatus
ENSTSYG00000012133SKIV2L10094.462ENSGGOG00000002270SKIV2L10094.462Gorilla_gorilla
ENSTSYG00000012133SKIV2L9961.173ENSHBUG00000000726skiv2l9961.303Haplochromis_burtoni
ENSTSYG00000012133SKIV2L10090.785ENSHGLG00000016596SKIV2L10091.026Heterocephalus_glaber_female
ENSTSYG00000012133SKIV2L10088.221ENSHGLG00100014161SKIV2L10088.462Heterocephalus_glaber_male
ENSTSYG00000012133SKIV2L9859.350ENSHCOG00000007191skiv2l10059.350Hippocampus_comes
ENSTSYG00000012133SKIV2L9959.621ENSIPUG00000016263skiv2l10059.665Ictalurus_punctatus
ENSTSYG00000012133SKIV2L10094.382ENSSTOG00000014596SKIV2L10094.382Ictidomys_tridecemlineatus
ENSTSYG00000012133SKIV2L7159.712ENSLACG00000002986-7358.586Latimeria_chalumnae
ENSTSYG00000012133SKIV2L10093.258ENSLAFG00000014231SKIV2L10093.258Loxodonta_africana
ENSTSYG00000012133SKIV2L10094.462ENSMFAG00000034235SKIV2L10094.462Macaca_fascicularis
ENSTSYG00000012133SKIV2L10094.382ENSMMUG00000000736SKIV2L10094.382Macaca_mulatta
ENSTSYG00000012133SKIV2L10094.382ENSMNEG00000044474SKIV2L10094.382Macaca_nemestrina
ENSTSYG00000012133SKIV2L10094.462ENSMLEG00000030512SKIV2L10094.462Mandrillus_leucophaeus
ENSTSYG00000012133SKIV2L9960.887ENSMAMG00000002927skiv2l9960.754Mastacembelus_armatus
ENSTSYG00000012133SKIV2L9961.192ENSMZEG00005026415skiv2l9961.303Maylandia_zebra
ENSTSYG00000012133SKIV2L7051.153ENSMGAG00000001320SKIV2L9750.103Meleagris_gallopavo
ENSTSYG00000012133SKIV2L10092.141ENSMAUG00000018613Skiv2l10092.468Mesocricetus_auratus
ENSTSYG00000012133SKIV2L10095.265ENSMICG00000046331SKIV2L10095.265Microcebus_murinus
ENSTSYG00000012133SKIV2L10091.099ENSMOCG00000014240Skiv2l10091.179Microtus_ochrogaster
ENSTSYG00000012133SKIV2L9961.187ENSMMOG00000014547skiv2l9861.183Mola_mola
ENSTSYG00000012133SKIV2L10087.030ENSMODG00000015052SKIV2L10087.030Monodelphis_domestica
ENSTSYG00000012133SKIV2L9959.694ENSMALG00000010535skiv2l9859.561Monopterus_albus
ENSTSYG00000012133SKIV2L10092.863MGP_CAROLIEiJ_G0021477Skiv2l10092.863Mus_caroli
ENSTSYG00000012133SKIV2L10092.863ENSMUSG00000040356Skiv2l10092.863Mus_musculus
ENSTSYG00000012133SKIV2L10092.542MGP_PahariEiJ_G0020472Skiv2l10092.542Mus_pahari
ENSTSYG00000012133SKIV2L10092.542MGP_SPRETEiJ_G0022382Skiv2l10092.542Mus_spretus
ENSTSYG00000012133SKIV2L10094.623ENSMPUG00000010567SKIV2L10094.623Mustela_putorius_furo
ENSTSYG00000012133SKIV2L10093.178ENSMLUG00000000628SKIV2L10093.178Myotis_lucifugus
ENSTSYG00000012133SKIV2L9960.447ENSNBRG00000018650skiv2l9860.677Neolamprologus_brichardi
ENSTSYG00000012133SKIV2L9891.117ENSNLEG00000006451SKIV2L9991.361Nomascus_leucogenys
ENSTSYG00000012133SKIV2L7891.150ENSMEUG00000006072SKIV2L7891.150Notamacropus_eugenii
ENSTSYG00000012133SKIV2L10093.660ENSOPRG00000003972SKIV2L10093.660Ochotona_princeps
ENSTSYG00000012133SKIV2L10091.814ENSODEG00000017516SKIV2L10091.814Octodon_degus
ENSTSYG00000012133SKIV2L9961.673ENSONIG00000013500skiv2l9961.483Oreochromis_niloticus
ENSTSYG00000012133SKIV2L10094.703ENSOCUG00000007019SKIV2L10094.703Oryctolagus_cuniculus
ENSTSYG00000012133SKIV2L9961.551ENSORLG00000002021skiv2l9961.687Oryzias_latipes
ENSTSYG00000012133SKIV2L9961.423ENSORLG00020009462skiv2l9961.606Oryzias_latipes_hni
ENSTSYG00000012133SKIV2L9961.076ENSORLG00015016750skiv2l9961.205Oryzias_latipes_hsok
ENSTSYG00000012133SKIV2L9961.875ENSOMEG00000008531skiv2l9961.836Oryzias_melastigma
ENSTSYG00000012133SKIV2L10095.024ENSOGAG00000009578SKIV2L10095.024Otolemur_garnettii
ENSTSYG00000012133SKIV2L10088.958ENSOARG00000002411-10088.958Ovis_aries
ENSTSYG00000012133SKIV2L9893.598ENSPPAG00000040211SKIV2L9993.598Pan_paniscus
ENSTSYG00000012133SKIV2L10095.185ENSPPRG00000005017SKIV2L10095.185Panthera_pardus
ENSTSYG00000012133SKIV2L10094.703ENSPTIG00000021656SKIV2L10094.703Panthera_tigris_altaica
ENSTSYG00000012133SKIV2L10094.623ENSPTRG00000017997SKIV2L10094.623Pan_troglodytes
ENSTSYG00000012133SKIV2L9893.431ENSPANG00000011501SKIV2L9993.431Papio_anubis
ENSTSYG00000012133SKIV2L9959.906ENSPKIG00000011876skiv2l9959.857Paramormyrops_kingsleyae
ENSTSYG00000012133SKIV2L9960.674ENSPMGG00000019707skiv2l9860.845Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSTSYG00000012133SKIV2L10092.783ENSPEMG00000019001Skiv2l10092.783Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSTSYG00000012133SKIV2L10086.880ENSPCIG00000018792SKIV2L10086.880Phascolarctos_cinereus
ENSTSYG00000012133SKIV2L9960.966ENSPFOG00000002424skiv2l9960.866Poecilia_formosa
ENSTSYG00000012133SKIV2L9961.094ENSPLAG00000018304skiv2l9960.995Poecilia_latipinna
ENSTSYG00000012133SKIV2L9960.966ENSPMEG00000006997skiv2l9960.866Poecilia_mexicana
ENSTSYG00000012133SKIV2L9958.842ENSPREG00000002277skiv2l9666.081Poecilia_reticulata
ENSTSYG00000012133SKIV2L10093.981ENSPPYG00000016472SKIV2L10093.981Pongo_abelii
ENSTSYG00000012133SKIV2L7793.702ENSPCAG00000004178SKIV2L7793.702Procavia_capensis
ENSTSYG00000012133SKIV2L10095.907ENSPCOG00000010308SKIV2L10095.907Propithecus_coquereli
ENSTSYG00000012133SKIV2L10092.937ENSPVAG00000005136SKIV2L10092.937Pteropus_vampyrus
ENSTSYG00000012133SKIV2L9959.598ENSPNYG00000017853skiv2l9859.334Pundamilia_nyererei
ENSTSYG00000012133SKIV2L9860.769ENSPNAG00000011823skiv2l9960.803Pygocentrus_nattereri
ENSTSYG00000012133SKIV2L10093.344ENSRNOG00000000421Skiv2l10093.344Rattus_norvegicus
ENSTSYG00000012133SKIV2L9891.984ENSRBIG00000035485SKIV2L9991.984Rhinopithecus_bieti
ENSTSYG00000012133SKIV2L10094.543ENSRROG00000036429SKIV2L10094.543Rhinopithecus_roxellana
ENSTSYG00000012133SKIV2L9237.862YLR398C-9337.849Saccharomyces_cerevisiae
ENSTSYG00000012133SKIV2L10094.703ENSSBOG00000027920SKIV2L10094.703Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSTSYG00000012133SKIV2L10086.789ENSSHAG00000008963SKIV2L10085.749Sarcophilus_harrisii
ENSTSYG00000012133SKIV2L9960.976ENSSFOG00015016930skiv2l9961.164Scleropages_formosus
ENSTSYG00000012133SKIV2L9960.495ENSSMAG00000020185skiv2l9960.273Scophthalmus_maximus
ENSTSYG00000012133SKIV2L9961.173ENSSDUG00000019977skiv2l9961.365Seriola_dumerili
ENSTSYG00000012133SKIV2L9959.856ENSSLDG00000024382skiv2l9859.919Seriola_lalandi_dorsalis
ENSTSYG00000012133SKIV2L9961.395ENSSPUG00000012945SKIV2L9861.054Sphenodon_punctatus
ENSTSYG00000012133SKIV2L9461.069ENSSPAG00000012904skiv2l9861.102Stegastes_partitus
ENSTSYG00000012133SKIV2L10094.462ENSSSCG00000001424SKIV2L10094.462Sus_scrofa
ENSTSYG00000012133SKIV2L7462.534ENSTRUG00000000966skiv2l10055.251Takifugu_rubripes
ENSTSYG00000012133SKIV2L9959.554ENSTNIG00000004382skiv2l9859.468Tetraodon_nigroviridis
ENSTSYG00000012133SKIV2L9492.515ENSTBEG00000003462SKIV2L9492.515Tupaia_belangeri
ENSTSYG00000012133SKIV2L10089.727ENSTTRG00000005931SKIV2L10089.727Tursiops_truncatus
ENSTSYG00000012133SKIV2L10095.104ENSUAMG00000024336SKIV2L10095.104Ursus_americanus
ENSTSYG00000012133SKIV2L9395.004ENSUMAG00000012666SKIV2L9995.004Ursus_maritimus
ENSTSYG00000012133SKIV2L9894.947ENSVVUG00000022807SKIV2L9894.947Vulpes_vulpes
ENSTSYG00000012133SKIV2L10058.082ENSXETG00000010932skiv2l10057.983Xenopus_tropicalis
ENSTSYG00000012133SKIV2L9961.347ENSXCOG00000019517skiv2l9661.251Xiphophorus_couchianus
ENSTSYG00000012133SKIV2L9960.966ENSXMAG00000014079skiv2l9960.915Xiphophorus_maculatus

Copyright © , Bioinformatics Center, Sun Yat-sen Memorial Hospital, Sun Yat-sen University, China. All Rights Reserved.

Any comment and suggestion, please contact us