EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSTSYG00000012749 (Gene tree)
Gene ID: 103274150
Gene Symbol: SBNO1
Alias: -
Full Name: strawberry notch homolog 1
Gene Type: protein_coding
Species: Carlito_syrichta
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 60987 bases
Position: chrKE948990.1:750683-811669
Accession: 103274150
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSTSYP00000033549	ResIII	PF04851.15	1.9e-07	1	1
ENSTSYP00000011694	ResIII	PF04851.15	2e-07	1	1
ENSTSYP00000028471	ResIII	PF04851.15	2.5e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSTSYT00000049806	SBNO1-203	3708	-	ENSTSYP00000028471	1235 (aa)	-	UPI000C2F499C
ENSTSYT00000012749	SBNO1-201	4182	XM_008071615	ENSTSYP00000011694	1393 (aa)	XP_008069806	A0A1U7UVA8
ENSTSYT00000046208	SBNO1-202	4074	-	ENSTSYP00000033549	1357 (aa)	-	UPI000C2F7A08

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSTSYG00000012749	SBNO1	100	98.349	ENSG00000139697	SBNO1	100	98.349	Homo_sapiens
ENSTSYG00000012749	SBNO1	85	81.590	ENSAPOG00000003196	sbno1	98	81.169	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTSYG00000012749	SBNO1	100	98.352	ENSAMEG00000015151	SBNO1	100	98.352	Ailuropoda_melanoleuca
ENSTSYG00000012749	SBNO1	99	76.739	ENSACIG00000008088	sbno1	99	76.245	Amphilophus_citrinellus
ENSTSYG00000012749	SBNO1	99	76.165	ENSAOCG00000014859	sbno1	99	75.351	Amphiprion_ocellaris
ENSTSYG00000012749	SBNO1	99	76.165	ENSAPEG00000006069	sbno1	99	75.351	Amphiprion_percula
ENSTSYG00000012749	SBNO1	99	78.261	ENSATEG00000006667	sbno1	99	75.980	Anabas_testudineus
ENSTSYG00000012749	SBNO1	100	92.175	ENSAPLG00000015674	SBNO1	100	92.181	Anas_platyrhynchos
ENSTSYG00000012749	SBNO1	100	90.306	ENSACAG00000015441	SBNO1	88	89.942	Anolis_carolinensis
ENSTSYG00000012749	SBNO1	100	98.305	ENSANAG00000029958	-	100	98.305	Aotus_nancymaae
ENSTSYG00000012749	SBNO1	99	76.194	ENSACLG00000024913	sbno1	99	76.061	Astatotilapia_calliptera
ENSTSYG00000012749	SBNO1	99	80.832	ENSAMXG00000019473	sbno1	99	79.587	Astyanax_mexicanus
ENSTSYG00000012749	SBNO1	99	98.674	ENSBTAG00000020505	SBNO1	99	98.674	Bos_taurus
ENSTSYG00000012749	SBNO1	100	98.277	ENSCJAG00000016599	SBNO1	100	98.277	Callithrix_jacchus
ENSTSYG00000012749	SBNO1	100	98.495	ENSCAFG00000007503	SBNO1	100	98.495	Canis_familiaris
ENSTSYG00000012749	SBNO1	100	97.775	ENSCAFG00020015363	SBNO1	100	97.775	Canis_lupus_dingo
ENSTSYG00000012749	SBNO1	99	98.348	ENSCHIG00000008382	SBNO1	99	98.913	Capra_hircus
ENSTSYG00000012749	SBNO1	97	97.808	ENSCAPG00000000384	SBNO1	99	99.458	Cavia_aperea
ENSTSYG00000012749	SBNO1	100	97.272	ENSCPOG00000008109	SBNO1	99	99.458	Cavia_porcellus
ENSTSYG00000012749	SBNO1	100	93.962	ENSCCAG00000035316	SBNO1	99	95.205	Cebus_capucinus
ENSTSYG00000012749	SBNO1	98	98.119	ENSCATG00000008239	SBNO1	98	99.819	Cercocebus_atys
ENSTSYG00000012749	SBNO1	100	97.416	ENSCLAG00000008995	SBNO1	99	99.458	Chinchilla_lanigera
ENSTSYG00000012749	SBNO1	85	99.396	ENSCSAG00000002064	SBNO1	100	99.396	Chlorocebus_sabaeus
ENSTSYG00000012749	SBNO1	95	98.049	ENSCHOG00000008814	SBNO1	96	94.712	Choloepus_hoffmanni
ENSTSYG00000012749	SBNO1	100	92.784	ENSCPBG00000025968	SBNO1	99	92.268	Chrysemys_picta_bellii
ENSTSYG00000012749	SBNO1	100	92.975	ENSCANG00000042688	-	100	92.903	Colobus_angolensis_palliatus
ENSTSYG00000012749	SBNO1	100	97.703	ENSCGRG00001017470	Sbno1	100	97.703	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSTSYG00000012749	SBNO1	100	97.703	ENSCGRG00000004756	Sbno1	100	97.703	Cricetulus_griseus_crigri
ENSTSYG00000012749	SBNO1	99	76.036	ENSCSEG00000011919	sbno1	99	75.175	Cynoglossus_semilaevis
ENSTSYG00000012749	SBNO1	99	77.117	ENSCVAG00000007038	sbno1	99	75.965	Cyprinodon_variegatus
ENSTSYG00000012749	SBNO1	99	80.581	ENSDARG00000099080	sbno1	99	79.657	Danio_rerio
ENSTSYG00000012749	SBNO1	100	97.194	ENSDNOG00000017147	SBNO1	98	98.047	Dasypus_novemcinctus
ENSTSYG00000012749	SBNO1	100	90.681	ENSDORG00000015261	Sbno1	95	91.171	Dipodomys_ordii
ENSTSYG00000012749	SBNO1	92	98.582	ENSETEG00000005620	SBNO1	88	98.582	Echinops_telfairi
ENSTSYG00000012749	SBNO1	74	86.802	ENSEBUG00000013823	sbno1	85	86.802	Eptatretus_burgeri
ENSTSYG00000012749	SBNO1	54	98.655	ENSEASG00005012595	-	92	99.258	Equus_asinus_asinus
ENSTSYG00000012749	SBNO1	100	98.851	ENSECAG00000006127	SBNO1	100	98.851	Equus_caballus
ENSTSYG00000012749	SBNO1	83	98.901	ENSEEUG00000003793	SBNO1	83	98.901	Erinaceus_europaeus
ENSTSYG00000012749	SBNO1	99	80.651	ENSELUG00000002886	sbno1	99	78.059	Esox_lucius
ENSTSYG00000012749	SBNO1	99	98.779	ENSFCAG00000015331	SBNO1	99	98.779	Felis_catus
ENSTSYG00000012749	SBNO1	100	92.319	ENSFALG00000009273	SBNO1	100	92.396	Ficedula_albicollis
ENSTSYG00000012749	SBNO1	99	95.833	ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	95.833	Fukomys_damarensis
ENSTSYG00000012749	SBNO1	99	77.297	ENSFHEG00000007360	sbno1	99	75.738	Fundulus_heteroclitus
ENSTSYG00000012749	SBNO1	96	79.777	ENSGMOG00000018229	sbno1	99	78.795	Gadus_morhua
ENSTSYG00000012749	SBNO1	88	96.515	ENSGALG00000003392	SBNO1	99	92.370	Gallus_gallus
ENSTSYG00000012749	SBNO1	99	77.477	ENSGAFG00000003960	sbno1	99	76.867	Gambusia_affinis
ENSTSYG00000012749	SBNO1	96	79.027	ENSGACG00000015633	sbno1	99	78.871	Gasterosteus_aculeatus
ENSTSYG00000012749	SBNO1	97	94.662	ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	95.479	Gopherus_agassizii
ENSTSYG00000012749	SBNO1	100	98.452	ENSGGOG00000015000	SBNO1	99	99.819	Gorilla_gorilla
ENSTSYG00000012749	SBNO1	99	70.373	ENSHBUG00000011910	sbno1	99	70.335	Haplochromis_burtoni
ENSTSYG00000012749	SBNO1	100	97.559	ENSHGLG00000014165	-	99	99.458	Heterocephalus_glaber_female
ENSTSYG00000012749	SBNO1	94	83.269	ENSHCOG00000003246	sbno1	95	84.980	Hippocampus_comes
ENSTSYG00000012749	SBNO1	99	79.964	ENSIPUG00000015830	Sbno1	93	87.599	Ictalurus_punctatus
ENSTSYG00000012749	SBNO1	100	98.895	ENSSTOG00000023221	SBNO1	100	98.895	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSTSYG00000012749	SBNO1	100	97.990	ENSJJAG00000001741	Sbno1	100	97.990	Jaculus_jaculus
ENSTSYG00000012749	SBNO1	99	77.536	ENSKMAG00000009696	sbno1	99	76.633	Kryptolebias_marmoratus
ENSTSYG00000012749	SBNO1	99	78.378	ENSLBEG00000007623	sbno1	99	75.891	Labrus_bergylta
ENSTSYG00000012749	SBNO1	99	81.214	ENSLACG00000017227	SBNO1	98	92.246	Latimeria_chalumnae
ENSTSYG00000012749	SBNO1	99	82.491	ENSLOCG00000005725	sbno1	97	81.805	Lepisosteus_oculatus
ENSTSYG00000012749	SBNO1	100	97.344	ENSLAFG00000002135	SBNO1	100	97.344	Loxodonta_africana
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ENSTSYG00000012749	SBNO1	100	98.349	ENSMMUG00000011496	SBNO1	100	98.349	Macaca_mulatta
ENSTSYG00000012749	SBNO1	100	96.758	ENSMLEG00000033260	SBNO1	99	99.819	Mandrillus_leucophaeus
ENSTSYG00000012749	SBNO1	99	78.333	ENSMAMG00000005473	sbno1	99	76.039	Mastacembelus_armatus
ENSTSYG00000012749	SBNO1	100	92.247	ENSMGAG00000003274	SBNO1	100	92.324	Meleagris_gallopavo
ENSTSYG00000012749	SBNO1	54	98.185	ENSMAUG00000004834	-	100	98.039	Mesocricetus_auratus
ENSTSYG00000012749	SBNO1	100	97.642	ENSMICG00000006573	-	100	97.642	Microcebus_murinus
ENSTSYG00000012749	SBNO1	100	94.724	ENSMOCG00000009390	Sbno1	99	98.915	Microtus_ochrogaster
ENSTSYG00000012749	SBNO1	99	77.061	ENSMMOG00000008691	sbno1	99	73.574	Mola_mola
ENSTSYG00000012749	SBNO1	99	95.187	ENSMODG00000012470	SBNO1	98	95.187	Monodelphis_domestica
ENSTSYG00000012749	SBNO1	99	76.036	ENSMALG00000001056	sbno1	99	75.332	Monopterus_albus
ENSTSYG00000012749	SBNO1	99	97.270	MGP_CAROLIEiJ_G0027749	Sbno1	100	97.888	Mus_caroli
ENSTSYG00000012749	SBNO1	99	97.773	ENSMUSG00000038095	Sbno1	100	98.190	Mus_musculus
ENSTSYG00000012749	SBNO1	99	97.701	MGP_PahariEiJ_G0024329	Sbno1	100	97.888	Mus_pahari
ENSTSYG00000012749	SBNO1	99	97.557	MGP_SPRETEiJ_G0028747	Sbno1	100	98.190	Mus_spretus
ENSTSYG00000012749	SBNO1	100	98.708	ENSMPUG00000001658	SBNO1	100	98.708	Mustela_putorius_furo
ENSTSYG00000012749	SBNO1	100	97.918	ENSMLUG00000017159	SBNO1	100	97.918	Myotis_lucifugus
ENSTSYG00000012749	SBNO1	100	98.421	ENSNGAG00000012620	Sbno1	100	98.421	Nannospalax_galili
ENSTSYG00000012749	SBNO1	99	76.285	ENSNBRG00000019189	sbno1	99	76.152	Neolamprologus_brichardi
ENSTSYG00000012749	SBNO1	100	94.768	ENSNLEG00000001502	SBNO1	100	94.768	Nomascus_leucogenys
ENSTSYG00000012749	SBNO1	62	96.774	ENSMEUG00000008768	-	93	89.241	Notamacropus_eugenii
ENSTSYG00000012749	SBNO1	100	94.552	ENSOPRG00000011054	SBNO1	100	94.480	Ochotona_princeps
ENSTSYG00000012749	SBNO1	100	97.416	ENSODEG00000009997	SBNO1	99	99.458	Octodon_degus
ENSTSYG00000012749	SBNO1	99	76.993	ENSONIG00000015348	sbno1	99	75.474	Oreochromis_niloticus
ENSTSYG00000012749	SBNO1	98	96.499	ENSOCUG00000002441	SBNO1	95	96.499	Oryctolagus_cuniculus
ENSTSYG00000012749	SBNO1	99	76.087	ENSORLG00000001593	sbno1	99	75.145	Oryzias_latipes
ENSTSYG00000012749	SBNO1	99	75.906	ENSORLG00020015216	sbno1	99	75.088	Oryzias_latipes_hni
ENSTSYG00000012749	SBNO1	99	76.087	ENSORLG00015002726	sbno1	99	75.158	Oryzias_latipes_hsok
ENSTSYG00000012749	SBNO1	99	76.321	ENSOMEG00000019313	sbno1	99	75.441	Oryzias_melastigma
ENSTSYG00000012749	SBNO1	54	95.310	ENSOGAG00000010781	-	100	95.030	Otolemur_garnettii
ENSTSYG00000012749	SBNO1	99	98.135	ENSOARG00000004404	SBNO1	99	98.135	Ovis_aries
ENSTSYG00000012749	SBNO1	100	98.452	ENSPPAG00000024635	SBNO1	99	99.638	Pan_paniscus
ENSTSYG00000012749	SBNO1	99	98.779	ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	98.779	Panthera_pardus
ENSTSYG00000012749	SBNO1	100	98.564	ENSPTIG00000017803	SBNO1	100	98.564	Panthera_tigris_altaica
ENSTSYG00000012749	SBNO1	100	98.526	ENSPTRG00000005597	SBNO1	99	99.819	Pan_troglodytes
ENSTSYG00000012749	SBNO1	100	98.600	ENSPANG00000011640	SBNO1	99	99.819	Papio_anubis
ENSTSYG00000012749	SBNO1	99	80.272	ENSPKIG00000001441	sbno1	99	80.500	Paramormyrops_kingsleyae
ENSTSYG00000012749	SBNO1	92	87.801	ENSPSIG00000009256	-	100	87.801	Pelodiscus_sinensis
ENSTSYG00000012749	SBNO1	100	92.415	ENSPSIG00000009572	-	100	91.900	Pelodiscus_sinensis
ENSTSYG00000012749	SBNO1	100	97.344	ENSPEMG00000016087	Sbno1	99	98.553	Peromyscus_maniculatus_bairdii
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ENSTSYG00000012749	SBNO1	99	77.477	ENSPMEG00000021212	sbno1	99	76.104	Poecilia_mexicana
ENSTSYG00000012749	SBNO1	99	77.117	ENSPREG00000017746	sbno1	99	75.753	Poecilia_reticulata
ENSTSYG00000012749	SBNO1	100	97.918	ENSPPYG00000005084	SBNO1	100	97.918	Pongo_abelii
ENSTSYG00000012749	SBNO1	89	92.466	ENSPCAG00000008634	SBNO1	88	92.435	Procavia_capensis
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