EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSTSYG00000012922 (Gene tree)
Gene ID: 103275531
Gene Symbol: EEFSEC
Alias: -
Full Name: eukaryotic elongation factor%2C selenocysteine-tRNA specific
Gene Type: protein_coding
Species: Carlito_syrichta
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 281294 bases
Position: chrKE949854.1:24742-306035
Accession: 103275531
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSTSYP00000015254	GTP_EFTU	PF00009.27	8.2e-25	1	1
ENSTSYP00000011856	GTP_EFTU	PF00009.27	2.5e-24	1	1
ENSTSYP00000015254	MMR_HSR1	PF01926.23	3.4e-05	1	1
ENSTSYP00000011856	MMR_HSR1	PF01926.23	6.6e-05	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSTSYT00000045359	EEFSEC-202	1311	-	ENSTSYP00000015254	436 (aa)	-	UPI000C2F5A53
ENSTSYT00000012920	EEFSEC-201	1791	XM_008072921	ENSTSYP00000011856	596 (aa)	XP_008071112	A0A1U7V0C9

Gene Model

Click here to download ENSTSYG00000012922's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSTSYG00000012922's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	100	93.121	ENSG00000132394	EEFSEC	100	93.121	Homo_sapiens
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	99	63.300	ENSAPOG00000015931	eefsec	98	63.317	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	83	84.708	ENSAMEG00000015165	EEFSEC	99	84.708	Ailuropoda_melanoleuca
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	65	65.125	ENSACIG00000022407	eefsec	99	65.125	Amphilophus_citrinellus
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	99	63.805	ENSAOCG00000008603	eefsec	98	63.805	Amphiprion_ocellaris
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	99	62.810	ENSAPEG00000017090	eefsec	98	62.810	Amphiprion_percula
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	99	62.086	ENSATEG00000002753	eefsec	99	62.149	Anabas_testudineus
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	72	80.093	ENSAPLG00000006745	EEFSEC	100	80.093	Anas_platyrhynchos
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	100	92.282	ENSANAG00000032691	EEFSEC	100	92.282	Aotus_nancymaae
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	99	62.500	ENSACLG00000024565	eefsec	98	65.125	Astatotilapia_calliptera
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	99	62.604	ENSAMXG00000002260	eefsec	97	62.604	Astyanax_mexicanus
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	100	86.913	ENSBTAG00000030962	EEFSEC	100	87.069	Bos_taurus
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	88	31.227	WBGene00008133	efsc-1	90	31.227	Caenorhabditis_elegans
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	100	92.785	ENSCJAG00000005387	EEFSEC	100	92.785	Callithrix_jacchus
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	99	91.290	ENSCAFG00000004135	EEFSEC	81	92.000	Canis_familiaris
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	100	91.333	ENSCAFG00020004811	EEFSEC	100	92.000	Canis_lupus_dingo
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	100	86.600	ENSCHIG00000021838	EEFSEC	100	86.767	Capra_hircus
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	82	84.318	ENSCAPG00000000084	EEFSEC	98	84.318	Cavia_aperea
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	100	88.087	ENSCPOG00000024352	EEFSEC	100	88.087	Cavia_porcellus
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	100	92.617	ENSCCAG00000031336	EEFSEC	100	92.617	Cebus_capucinus
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	100	93.121	ENSCATG00000019414	EEFSEC	100	93.121	Cercocebus_atys
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	100	88.926	ENSCLAG00000006973	EEFSEC	100	88.926	Chinchilla_lanigera
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	100	92.953	ENSCSAG00000008599	EEFSEC	100	92.953	Chlorocebus_sabaeus
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	99	74.242	ENSCPBG00000014356	EEFSEC	86	77.632	Chrysemys_picta_bellii
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	97	65.196	ENSCSAVG00000002208	-	100	55.195	Ciona_savignyi
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	100	92.617	ENSCANG00000031492	EEFSEC	99	92.617	Colobus_angolensis_palliatus
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	100	86.767	ENSCGRG00001018089	Eefsec	100	86.767	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	100	86.097	ENSCGRG00000010063	Eefsec	100	86.097	Cricetulus_griseus_crigri
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	99	62.086	ENSCSEG00000003008	eefsec	99	65.480	Cynoglossus_semilaevis
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	99	63.228	ENSCVAG00000005381	eefsec	98	63.394	Cyprinodon_variegatus
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	99	62.729	ENSDARG00000004696	eefsec	99	63.062	Danio_rerio
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	100	83.221	ENSDNOG00000008925	EEFSEC	100	84.925	Dasypus_novemcinctus
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	74	83.801	ENSDORG00000000264	Eefsec	99	86.598	Dipodomys_ordii
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	97	40.171	FBgn0034627	eEFSec	95	44.030	Drosophila_melanogaster
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	99	79.160	ENSETEG00000007406	EEFSEC	99	79.160	Echinops_telfairi
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	77	61.111	ENSEBUG00000015029	eefsec	98	48.142	Eptatretus_burgeri
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	100	92.617	ENSEASG00005006786	EEFSEC	100	93.289	Equus_asinus_asinus
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	100	92.953	ENSECAG00000016565	EEFSEC	100	93.624	Equus_caballus
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	99	60.899	ENSELUG00000016632	eefsec	98	60.899	Esox_lucius
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	100	93.144	ENSFCAG00000006153	EEFSEC	100	93.813	Felis_catus
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	82	75.051	ENSFALG00000007901	EEFSEC	99	75.051	Ficedula_albicollis
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	82	90.612	ENSFDAG00000010243	EEFSEC	100	94.079	Fukomys_damarensis
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	99	63.545	ENSFHEG00000007155	eefsec	98	63.500	Fundulus_heteroclitus
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	99	60.135	ENSGMOG00000007705	eefsec	98	60.943	Gadus_morhua
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	99	75.169	ENSGALG00000038684	EEFSEC	99	75.169	Gallus_gallus
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	99	63.149	ENSGAFG00000021692	eefsec	99	63.378	Gambusia_affinis
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	99	64.262	ENSGACG00000000793	eefsec	99	63.394	Gasterosteus_aculeatus
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	99	74.242	ENSGAGG00000002059	EEFSEC	98	74.579	Gopherus_agassizii
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	87	93.269	ENSGGOG00000001445	EEFSEC	100	93.269	Gorilla_gorilla
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	99	64.189	ENSHBUG00000008917	eefsec	98	64.081	Haplochromis_burtoni
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	100	88.758	ENSHGLG00000000094	EEFSEC	100	94.737	Heterocephalus_glaber_female
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	100	88.255	ENSHGLG00100011393	EEFSEC	96	88.255	Heterocephalus_glaber_male
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	99	64.020	ENSHCOG00000004193	eefsec	99	64.081	Hippocampus_comes
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	99	61.937	ENSIPUG00000017291	eefsec	97	64.991	Ictalurus_punctatus
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	82	84.286	ENSSTOG00000019802	EEFSEC	100	84.286	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	99	62.791	ENSKMAG00000019907	eefsec	98	62.852	Kryptolebias_marmoratus
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	99	62.709	ENSLBEG00000017908	eefsec	98	62.938	Labrus_bergylta
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	88	67.614	ENSLACG00000013137	EEFSEC	99	67.614	Latimeria_chalumnae
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	99	64.983	ENSLOCG00000014535	eefsec	98	65.488	Lepisosteus_oculatus
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	99	84.590	ENSLAFG00000001997	EEFSEC	100	85.092	Loxodonta_africana
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	100	93.456	ENSMFAG00000042128	EEFSEC	100	93.456	Macaca_fascicularis
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	100	92.890	ENSMMUG00000018663	EEFSEC	100	93.182	Macaca_mulatta
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	100	93.289	ENSMNEG00000028574	EEFSEC	100	93.289	Macaca_nemestrina
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	83	92.727	ENSMLEG00000041771	EEFSEC	93	92.727	Mandrillus_leucophaeus
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	99	62.521	ENSMAMG00000023964	eefsec	99	65.950	Mastacembelus_armatus
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	65	65.125	ENSMZEG00005009380	eefsec	98	65.125	Maylandia_zebra
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	65	76.276	ENSMGAG00000007243	EEFSEC	100	76.276	Meleagris_gallopavo
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	89	86.891	ENSMAUG00000011197	Eefsec	97	86.891	Mesocricetus_auratus
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	100	86.935	ENSMOCG00000017748	Eefsec	100	86.935	Microtus_ochrogaster
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	65	65.734	ENSMMOG00000021820	eefsec	99	65.734	Mola_mola
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	97	82.804	ENSMODG00000008034	EEFSEC	91	82.804	Monodelphis_domestica
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	97	63.069	ENSMALG00000016211	eefsec	99	65.385	Monopterus_albus
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	100	87.772	MGP_CAROLIEiJ_G0028627	Eefsec	100	96.711	Mus_caroli
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	100	88.107	ENSMUSG00000033216	Eefsec	100	96.711	Mus_musculus
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	100	87.772	MGP_PahariEiJ_G0022366	Eefsec	100	96.711	Mus_pahari
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	100	88.107	MGP_SPRETEiJ_G0029640	Eefsec	100	96.711	Mus_spretus
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	99	92.256	ENSMPUG00000017340	EEFSEC	96	92.256	Mustela_putorius_furo
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	83	89.879	ENSMLUG00000004261	EEFSEC	100	89.879	Myotis_lucifugus
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	99	62.664	ENSNBRG00000002387	eefsec	98	65.480	Neolamprologus_brichardi
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	100	92.953	ENSNLEG00000014303	EEFSEC	100	92.953	Nomascus_leucogenys
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	82	78.980	ENSMEUG00000005747	EEFSEC	100	78.980	Notamacropus_eugenii
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	99	90.924	ENSOPRG00000011276	EEFSEC	100	90.924	Ochotona_princeps
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	100	87.919	ENSODEG00000002928	EEFSEC	100	87.919	Octodon_degus
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	81	61.523	ENSONIG00000019038	eefsec	100	62.374	Oreochromis_niloticus
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	81	75.983	ENSOANG00000009108	EEFSEC	99	75.983	Ornithorhynchus_anatinus
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	100	91.275	ENSOCUG00000016517	EEFSEC	100	91.275	Oryctolagus_cuniculus
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	99	62.814	ENSORLG00000001377	eefsec	98	64.413	Oryzias_latipes
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	99	62.814	ENSORLG00020000729	eefsec	98	68.077	Oryzias_latipes_hni
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	99	62.814	ENSORLG00015001986	eefsec	98	62.709	Oryzias_latipes_hsok
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	83	61.924	ENSOMEG00000010071	eefsec	89	62.325	Oryzias_melastigma
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	73	93.333	ENSOGAG00000014084	EEFSEC	97	93.333	Otolemur_garnettii
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	63	86.933	ENSOARG00000004600	EEFSEC	99	86.933	Ovis_aries
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	100	93.289	ENSPPAG00000030936	EEFSEC	100	93.289	Pan_paniscus
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	100	93.960	ENSPPRG00000002846	EEFSEC	100	93.960	Panthera_pardus
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	84	92.323	ENSPTIG00000013855	EEFSEC	92	92.323	Panthera_tigris_altaica
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	100	93.121	ENSPTRG00000015353	EEFSEC	100	93.121	Pan_troglodytes
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	100	92.953	ENSPANG00000017041	EEFSEC	100	92.953	Papio_anubis
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	99	62.643	ENSPKIG00000005220	eefsec	98	64.765	Paramormyrops_kingsleyae
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	89	77.736	ENSPSIG00000015135	EEFSEC	97	77.736	Pelodiscus_sinensis
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	99	62.144	ENSPMGG00000020300	eefsec	99	62.207	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	100	86.767	ENSPEMG00000013677	Eefsec	100	86.767	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	91	64.457	ENSPMAG00000006779	eefsec	99	64.825	Petromyzon_marinus
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	81	78.763	ENSPCIG00000020494	EEFSEC	100	79.175	Phascolarctos_cinereus
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	99	63.167	ENSPFOG00000003748	eefsec	98	63.272	Poecilia_formosa
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	99	63.167	ENSPLAG00000018012	eefsec	99	63.272	Poecilia_latipinna
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	99	63.167	ENSPMEG00000001202	eefsec	99	63.272	Poecilia_mexicana
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	99	62.562	ENSPREG00000012235	eefsec	99	62.667	Poecilia_reticulata
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	100	92.953	ENSPPYG00000013436	EEFSEC	100	92.953	Pongo_abelii
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	98	73.029	ENSPCAG00000005883	EEFSEC	100	79.737	Procavia_capensis
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	100	84.396	ENSPCOG00000023432	EEFSEC	100	84.396	Propithecus_coquereli
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	65	92.366	ENSPVAG00000007070	EEFSEC	65	92.366	Pteropus_vampyrus
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	99	62.664	ENSPNYG00000005726	eefsec	98	65.125	Pundamilia_nyererei
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	99	62.458	ENSPNAG00000016724	eefsec	99	62.625	Pygocentrus_nattereri
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	100	88.107	ENSRNOG00000012954	Eefsec	100	88.107	Rattus_norvegicus
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	100	93.121	ENSRBIG00000032635	EEFSEC	100	93.121	Rhinopithecus_bieti
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	50	86.175	ENSRROG00000030260	-	86	88.889	Rhinopithecus_roxellana
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	97	91.962	ENSSBOG00000031478	EEFSEC	100	92.562	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	81	79.588	ENSSHAG00000014760	EEFSEC	100	79.588	Sarcophilus_harrisii
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	99	62.563	ENSSFOG00015021109	eefsec	98	62.563	Scleropages_formosus
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	99	62.149	ENSSMAG00000001454	eefsec	99	62.376	Scophthalmus_maximus
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	99	62.149	ENSSDUG00000007924	eefsec	99	65.934	Seriola_dumerili
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	97	61.551	ENSSLDG00000024985	eefsec	98	61.616	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	51	87.162	ENSSARG00000003789	-	56	87.162	Sorex_araneus
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	81	73.706	ENSSPUG00000004191	EEFSEC	100	74.120	Sphenodon_punctatus
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	99	62.336	ENSSPAG00000001320	eefsec	99	64.769	Stegastes_partitus
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	100	88.815	ENSSSCG00000011619	EEFSEC	100	93.103	Sus_scrofa
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	99	74.790	ENSTGUG00000007895	EEFSEC	100	74.790	Taeniopygia_guttata
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	99	62.729	ENSTRUG00000010327	eefsec	98	62.791	Takifugu_rubripes
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	99	62.852	ENSTNIG00000003225	eefsec	99	62.852	Tetraodon_nigroviridis
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	100	87.437	ENSTTRG00000000994	EEFSEC	100	87.437	Tursiops_truncatus
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	100	92.953	ENSUAMG00000017283	EEFSEC	100	92.953	Ursus_americanus
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	72	92.593	ENSVVUG00000018372	EEFSEC	91	92.593	Vulpes_vulpes
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	98	64.108	ENSXETG00000002066	eefsec	99	73.597	Xenopus_tropicalis
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	99	62.876	ENSXCOG00000019916	eefsec	99	63.378	Xiphophorus_couchianus
ENSTSYG00000012922	EEFSEC	99	62.876	ENSXMAG00000001839	eefsec	99	63.378	Xiphophorus_maculatus