EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSTSYG00000013172 (Gene tree)
Gene ID: 103258860
Gene Symbol: EFTUD2
Alias: -
Full Name: elongation factor Tu GTP binding domain containing 2
Gene Type: protein_coding
Species: Carlito_syrichta
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 46693 bases
Position: chrKE938672.1:75503-122195
Accession: 103258860
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSTSYP00000033120	GTP_EFTU	PF00009.27	3.8e-45	1	1
ENSTSYP00000012084	GTP_EFTU	PF00009.27	3e-40	1	1
ENSTSYP00000021403	GTP_EFTU	PF00009.27	9e-32	1	1
ENSTSYP00000033330	GTP_EFTU	PF00009.27	4.2e-20	1	2
ENSTSYP00000033330	GTP_EFTU	PF00009.27	4.2e-20	2	2
ENSTSYP00000021403	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	1.3e-12	1	1
ENSTSYP00000012084	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	1.3e-12	1	1
ENSTSYP00000033120	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	1.3e-12	1	1
ENSTSYP00000033330	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	1.3e-12	1	1
ENSTSYP00000021403	EFG_IV	PF03764.18	2.5e-23	1	1
ENSTSYP00000033120	EFG_IV	PF03764.18	2.6e-23	1	1
ENSTSYP00000012084	EFG_IV	PF03764.18	2.6e-23	1	1
ENSTSYP00000033330	EFG_IV	PF03764.18	2.8e-23	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSTSYT00000050029	EFTUD2-204	2865	-	ENSTSYP00000021403	954 (aa)	-	UPI000C2F6E17
ENSTSYT00000043433	EFTUD2-203	2880	-	ENSTSYP00000033330	959 (aa)	-	UPI000C2F7660
ENSTSYT00000013172	EFTUD2-202	2916	-	ENSTSYP00000012084	971 (aa)	-	UPI000C2F39DE
ENSTSYT00000030775	EFTUD2-201	3328	XM_008056537	ENSTSYP00000033120	972 (aa)	XP_008054728	A0A1U7TE97

Gene Model

Click here to download ENSTSYG00000013172's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSTSYG00000013172's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	51	30.986	ENSTSYG00000002013	GFM1	59	30.986
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	87	38.832	ENSTSYG00000028021	EEF2	98	45.758

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	99.486	ENSG00000108883	EFTUD2	100	100.000	Homo_sapiens
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	92.284	ENSAPOG00000002433	eftud2	100	92.078	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	99.383	ENSAMEG00000018390	EFTUD2	100	99.383	Ailuropoda_melanoleuca
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	88.786	ENSACIG00000009096	eftud2	100	88.580	Amphilophus_citrinellus
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	87	88.118	ENSAOCG00000023385	eftud2	100	88.118	Amphiprion_ocellaris
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	92.387	ENSAPEG00000003321	eftud2	100	92.181	Amphiprion_percula
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	92.695	ENSATEG00000000457	eftud2	100	92.490	Anabas_testudineus
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	99	94.130	ENSAPLG00000011036	EFTUD2	99	94.130	Anas_platyrhynchos
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	97.325	ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	97.325	Anolis_carolinensis
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	99.588	ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	99.588	Aotus_nancymaae
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	92.284	ENSACLG00000001296	eftud2	100	92.078	Astatotilapia_calliptera
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	91.709	ENSAMXG00000000568	eftud2	100	91.709	Astyanax_mexicanus
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	99.074	ENSBTAG00000013526	EFTUD2	100	99.074	Bos_taurus
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	99	70.351	WBGene00001166	eftu-2	99	69.938	Caenorhabditis_elegans
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	99.588	ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	99.588	Callithrix_jacchus
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	99.383	ENSCAFG00000014065	EFTUD2	100	99.383	Canis_familiaris
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	99.383	ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	99.383	Canis_lupus_dingo
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	99.074	ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	99.074	Capra_hircus
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	98.765	ENSCAPG00000014639	EFTUD2	100	98.765	Cavia_aperea
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	98.765	ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	98.765	Cavia_porcellus
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	99.588	ENSCCAG00000035302	EFTUD2	100	99.588	Cebus_capucinus
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	99.588	ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	99.588	Cercocebus_atys
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	98.663	ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	98.663	Chinchilla_lanigera
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	99.588	ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	99.588	Chlorocebus_sabaeus
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	91	86.486	ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	86.486	Choloepus_hoffmanni
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	98.251	ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	98.251	Chrysemys_picta_bellii
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	77.538	ENSCING00000009372	-	100	77.538	Ciona_intestinalis
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	99	77.846	ENSCSAVG00000004985	-	99	79.599	Ciona_savignyi
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	99.588	ENSCANG00000026557	EFTUD2	100	99.588	Colobus_angolensis_palliatus
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	99.280	ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	99.280	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	99.280	ENSCGRG00000003825	Eftud2	100	99.280	Cricetulus_griseus_crigri
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	91.872	ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.667	Cynoglossus_semilaevis
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	92.284	ENSCVAG00000012537	eftud2	100	92.078	Cyprinodon_variegatus
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	90.947	ENSDARG00000012261	eftud2	100	91.049	Danio_rerio
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	98.971	ENSDNOG00000008033	EFTUD2	100	98.971	Dasypus_novemcinctus
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	99.074	ENSDORG00000011566	Eftud2	100	99.074	Dipodomys_ordii
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	75.077	FBgn0039566	CG4849	100	74.872	Drosophila_melanogaster
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	92	99.457	ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	99.457	Echinops_telfairi
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	75	93.035	ENSEBUG00000004047	-	96	86.787	Eptatretus_burgeri
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	99.383	ENSEASG00005010321	EFTUD2	100	99.383	Equus_asinus_asinus
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	99.280	ENSECAG00000019363	EFTUD2	93	99.280	Equus_caballus
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	83	100.000	ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	91.049	ENSELUG00000017169	eftud2	100	91.049	Esox_lucius
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	99.280	ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	99.280	Felis_catus
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	97.737	ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	97.737	Ficedula_albicollis
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	98.971	ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	98.971	Fukomys_damarensis
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	92.387	ENSFHEG00000013479	eftud2	100	92.181	Fundulus_heteroclitus
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	91.152	ENSGMOG00000014277	eftud2	100	91.770	Gadus_morhua
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	97.840	ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	98.491	Gallus_gallus
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	92.078	ENSGAFG00000002263	eftud2	100	91.975	Gambusia_affinis
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	91.770	ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.564	Gasterosteus_aculeatus
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	99.588	ENSGGOG00000012999	EFTUD2	100	99.588	Gorilla_gorilla
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	92.181	ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.975	Haplochromis_burtoni
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	98.663	ENSHGLG00000014497	EFTUD2	100	98.663	Heterocephalus_glaber_female
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	98.663	ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	98.663	Heterocephalus_glaber_male
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	91.049	ENSHCOG00000017689	eftud2	100	91.049	Hippocampus_comes
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	91.564	ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	91.975	Ictalurus_punctatus
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	93.210	ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	93.210	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	96	99.252	ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	99.252	Jaculus_jaculus
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	91.564	ENSKMAG00000021027	eftud2	100	91.358	Kryptolebias_marmoratus
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	95	91.802	ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.706	Labrus_bergylta
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	94.239	ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.758	Latimeria_chalumnae
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	92.181	ENSLOCG00000011460	eftud2	100	92.181	Lepisosteus_oculatus
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	99.074	ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	99.074	Loxodonta_africana
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	99.588	ENSMFAG00000042655	EFTUD2	100	99.588	Macaca_fascicularis
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	99.588	ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	Macaca_mulatta
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	99.588	ENSMNEG00000037895	EFTUD2	100	99.588	Macaca_nemestrina
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	99.588	ENSMLEG00000032960	EFTUD2	100	99.588	Mandrillus_leucophaeus
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	92.695	ENSMAMG00000022190	eftud2	100	92.490	Mastacembelus_armatus
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	92.284	ENSMZEG00005022885	eftud2	100	92.078	Maylandia_zebra
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	97.639	ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	97.639	Meleagris_gallopavo
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	99.383	ENSMAUG00000021178	Eftud2	100	99.383	Mesocricetus_auratus
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	99.588	ENSMICG00000016592	EFTUD2	100	99.588	Microcebus_murinus
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	92	81.798	ENSMOCG00000017653	-	90	81.798	Microtus_ochrogaster
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	99.383	ENSMOCG00000009039	-	100	99.383	Microtus_ochrogaster
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	87	93.882	ENSMMOG00000020811	eftud2	100	93.882	Mola_mola
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	99.177	ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	99.177	Monodelphis_domestica
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	87	92.118	ENSMALG00000014501	eftud2	100	92.118	Monopterus_albus
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	99.074	MGP_CAROLIEiJ_G0017263	Eftud2	100	99.074	Mus_caroli
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	99.074	ENSMUSG00000020929	Eftud2	100	99.074	Mus_musculus
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	99.074	MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	99.074	Mus_pahari
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	99.074	MGP_SPRETEiJ_G0018106	Eftud2	100	99.074	Mus_spretus
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	97	99.364	ENSMPUG00000009136	EFTUD2	90	99.364	Mustela_putorius_furo
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	99.383	ENSMLUG00000012164	EFTUD2	99	99.383	Myotis_lucifugus
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	99.280	ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	99.280	Nannospalax_galili
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	92.181	ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.975	Neolamprologus_brichardi
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	97	97.768	ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	97.768	Nomascus_leucogenys
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	95.576	ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	95.576	Notamacropus_eugenii
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	91.049	ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	91.049	Ochotona_princeps
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	98.560	ENSODEG00000018041	-	100	98.560	Octodon_degus
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	93	79.598	ENSODEG00000003385	-	100	79.598	Octodon_degus
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	92.284	ENSONIG00000000912	eftud2	100	92.078	Oreochromis_niloticus
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	99.383	ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	99.383	Oryctolagus_cuniculus
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	91.872	ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.872	Oryzias_latipes
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	91.770	ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.770	Oryzias_latipes_hni
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	91.770	ENSORLG00015002611	eftud2	100	93.682	Oryzias_latipes_hsok
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	97.428	ENSOGAG00000012918	EFTUD2	100	97.428	Otolemur_garnettii
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	99.074	ENSOARG00000009078	EFTUD2	97	99.074	Ovis_aries
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	99.486	ENSPPAG00000029450	EFTUD2	100	99.486	Pan_paniscus
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	99.383	ENSPPRG00000010981	EFTUD2	100	99.383	Panthera_pardus
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	99.383	ENSPTIG00000007703	EFTUD2	100	99.383	Panthera_tigris_altaica
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	99.486	ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	99.486	Pan_troglodytes
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	99.588	ENSPANG00000021284	EFTUD2	100	99.588	Papio_anubis
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	93	96.692	ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	96.692	Pelodiscus_sinensis
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	84.671	ENSPMGG00000007281	eftud2	100	84.568	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	99.280	ENSPEMG00000005129	Eftud2	100	99.280	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	99.280	ENSPCIG00000015027	EFTUD2	100	99.280	Phascolarctos_cinereus
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	92.078	ENSPFOG00000008515	eftud2	100	91.975	Poecilia_formosa
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	92.078	ENSPLAG00000010393	eftud2	100	91.975	Poecilia_latipinna
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	92.078	ENSPMEG00000005087	eftud2	100	91.975	Poecilia_mexicana
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	98.148	ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	98.148	Pongo_abelii
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	95.267	ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	95.267	Procavia_capensis
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	99.486	ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	99.486	Propithecus_coquereli
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	94.444	ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	94.444	Pteropus_vampyrus
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	92.181	ENSPNYG00000012448	eftud2	100	91.975	Pundamilia_nyererei
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	92.181	ENSPNAG00000012490	eftud2	100	92.490	Pygocentrus_nattereri
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	99.074	ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	99.074	Rattus_norvegicus
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	99.486	ENSRBIG00000043255	EFTUD2	100	99.486	Rhinopithecus_bieti
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	99.486	ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	99.486	Rhinopithecus_roxellana
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	97	34.190	YKL173W	SNU114	97	33.992	Saccharomyces_cerevisiae
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	99.588	ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	99.588	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	97	99.254	ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	99.254	Sarcophilus_harrisii
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	91.770	ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.770	Scleropages_formosus
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	92.078	ENSSMAG00000010174	eftud2	100	91.872	Scophthalmus_maximus
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	92.387	ENSSDUG00000022675	eftud2	100	92.181	Seriola_dumerili
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	92.490	ENSSLDG00000001595	eftud2	100	92.284	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	90.741	ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	90.741	Sorex_araneus
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	97.325	ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	97.325	Sphenodon_punctatus
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	92.490	ENSSPAG00000016235	eftud2	99	92.284	Stegastes_partitus
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	99.177	ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	99.177	Sus_scrofa
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	84	97.080	ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	97.080	Taeniopygia_guttata
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	91.461	ENSTRUG00000016422	eftud2	100	91.255	Takifugu_rubripes
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	86.988	ENSTNIG00000005346	eftud2	99	86.783	Tetraodon_nigroviridis
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	93.930	ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	93.930	Tupaia_belangeri
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	90.638	ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	90.638	Tursiops_truncatus
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	98.867	ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	98.867	Ursus_americanus
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	99.383	ENSUMAG00000014323	EFTUD2	100	99.383	Ursus_maritimus
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	88	100.000	ENSVPAG00000002748	EFTUD2	88	100.000	Vicugna_pacos
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	99.383	ENSVVUG00000018113	EFTUD2	100	99.383	Vulpes_vulpes
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	97	94.670	ENSXETG00000003394	eftud2	98	95.756	Xenopus_tropicalis
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	81	93.495	ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.495	Xiphophorus_couchianus
ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	92.078	ENSXMAG00000008494	eftud2	100	91.975	Xiphophorus_maculatus