EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSTSYG00000026377 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: POLR2E
Alias: RPABC1|RPB5|XAP4|hRPB25|hsRPB5
Full Name: RNA polymerase II subunit E
Gene Type: protein_coding
Species: Carlito_syrichta
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 4372 bases
Position: chrKE926440.1:2660-7031
Accession: 103259240
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSTSYP00000026618	RNA_pol_Rpb5_N	PF03871.14	6.1e-35	1	1
ENSTSYP00000019339	RNA_pol_Rpb5_N	PF03871.14	8.8e-35	1	1
ENSTSYP00000019339	RNA_pol_Rpb5_C	PF01191.19	1.8e-07	1	1
ENSTSYP00000026618	RNA_pol_Rpb5_C	PF01191.19	4.7e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSTSYT00000040299	POLR2E-202	480	-	ENSTSYP00000026618	159 (aa)	-	UPI000C2F62B0
ENSTSYT00000031836	POLR2E-201	591	XM_008056904	ENSTSYP00000019339	196 (aa)	-	UPI000C2F5E56

Gene Model

Click here to download ENSTSYG00000026377's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSTSYG00000026377's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	80.930	ENSG00000099817	POLR2E	100	80.930	Homo_sapiens
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	78.605	ENSAPOG00000002935	polr2eb	100	78.605	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	81.395	ENSAMEG00000003159	POLR2E	100	81.395	Ailuropoda_melanoleuca
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	75.410	ENSACIG00000024371	polr2eb	100	75.410	Amphilophus_citrinellus
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	78.605	ENSAOCG00000018166	polr2eb	100	78.605	Amphiprion_ocellaris
ENSTSYG00000026377	POLR2E	87	100.000	ENSAPEG00000009000	polr2eb	100	78.605	Amphiprion_percula
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	78.605	ENSATEG00000023760	polr2eb	100	78.605	Anabas_testudineus
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	81.395	ENSANAG00000038488	POLR2E	100	81.395	Aotus_nancymaae
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	79.070	ENSACLG00000005254	polr2eb	100	79.070	Astatotilapia_calliptera
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	78.605	ENSAMXG00000018915	POLR2E	100	78.605	Astyanax_mexicanus
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	81.395	ENSBTAG00000020776	POLR2E	100	81.395	Bos_taurus
ENSTSYG00000026377	POLR2E	99	63.942	WBGene00019246	rpb-5	99	63.942	Caenorhabditis_elegans
ENSTSYG00000026377	POLR2E	64	68.276	ENSCJAG00000007666	-	77	68.276	Callithrix_jacchus
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	81.604	ENSCAFG00000019546	POLR2E	100	81.604	Canis_familiaris
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	81.395	ENSCAFG00020017111	POLR2E	100	81.395	Canis_lupus_dingo
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	81.395	ENSCHIG00000014151	POLR2E	100	81.395	Capra_hircus
ENSTSYG00000026377	POLR2E	91	79.695	ENSCAPG00000010843	POLR2E	93	79.695	Cavia_aperea
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	81.395	ENSCPOG00000001542	POLR2E	100	81.395	Cavia_porcellus
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	81.395	ENSCCAG00000025658	POLR2E	100	81.395	Cebus_capucinus
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	81.395	ENSCATG00000008926	POLR2E	100	81.395	Cercocebus_atys
ENSTSYG00000026377	POLR2E	97	60.952	ENSCLAG00000009238	-	100	60.952	Chinchilla_lanigera
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	81.905	ENSCLAG00000014874	-	100	81.905	Chinchilla_lanigera
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	81.395	ENSCSAG00000012336	POLR2E	100	81.395	Chlorocebus_sabaeus
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	80.930	ENSCPBG00000009702	POLR2E	100	80.930	Chrysemys_picta_bellii
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	72.170	ENSCING00000024933	-	99	72.170	Ciona_intestinalis
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	83.495	ENSCANG00000025560	POLR2E	100	83.495	Colobus_angolensis_palliatus
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	81.860	ENSCGRG00001022927	Polr2e	100	81.860	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	81.860	ENSCGRG00000016441	Polr2e	100	81.860	Cricetulus_griseus_crigri
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	77.674	ENSCSEG00000007107	polr2eb	100	73.770	Cynoglossus_semilaevis
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	78.605	ENSCVAG00000019940	polr2eb	100	78.605	Cyprinodon_variegatus
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	77.674	ENSDARG00000026183	polr2eb	100	77.674	Danio_rerio
ENSTSYG00000026377	POLR2E	73	100.000	ENSDNOG00000044994	POLR2E	63	99.306	Dasypus_novemcinctus
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	81.395	ENSDORG00000001154	Polr2e	100	81.395	Dipodomys_ordii
ENSTSYG00000026377	POLR2E	99	71.770	FBgn0033571	Rpb5	99	71.770	Drosophila_melanogaster
ENSTSYG00000026377	POLR2E	73	90.972	ENSEBUG00000010159	-	70	90.972	Eptatretus_burgeri
ENSTSYG00000026377	POLR2E	67	67.333	ENSEASG00005021615	POLR2E	67	64.072	Equus_asinus_asinus
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	78.142	ENSECAG00000011124	POLR2E	100	78.142	Equus_caballus
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	78.571	ENSELUG00000020646	polr2e	100	78.571	Esox_lucius
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	79.048	ENSELUG00000005815	POLR2E	100	79.048	Esox_lucius
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	80.930	ENSFCAG00000007318	POLR2E	100	80.930	Felis_catus
ENSTSYG00000026377	POLR2E	91	79.188	ENSFALG00000013986	POLR2E	99	79.188	Ficedula_albicollis
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	81.395	ENSFDAG00000014539	POLR2E	100	81.395	Fukomys_damarensis
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	78.605	ENSFHEG00000022398	polr2eb	100	78.605	Fundulus_heteroclitus
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	77.674	ENSGMOG00000007615	polr2eb	100	77.674	Gadus_morhua
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	80.930	ENSGALG00000002591	POLR2E	100	80.930	Gallus_gallus
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	79.070	ENSGAFG00000005087	polr2eb	100	79.070	Gambusia_affinis
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	79.048	ENSGACG00000013247	polr2eb	100	79.048	Gasterosteus_aculeatus
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	80.930	ENSGAGG00000008356	POLR2E	100	80.930	Gopherus_agassizii
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	81.395	ENSGGOG00000011267	POLR2E	100	81.395	Gorilla_gorilla
ENSTSYG00000026377	POLR2E	65	65.306	ENSHBUG00000011099	polr2eb	100	65.306	Haplochromis_burtoni
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	80.465	ENSHGLG00000013330	POLR2E	100	80.465	Heterocephalus_glaber_female
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	80.465	ENSHGLG00100011014	POLR2E	100	80.465	Heterocephalus_glaber_male
ENSTSYG00000026377	POLR2E	62	86.179	ENSHCOG00000012099	-	97	86.179	Hippocampus_comes
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	77.209	ENSHCOG00000000906	polr2eb	100	77.209	Hippocampus_comes
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	78.605	ENSIPUG00000019801	polr2e	100	78.605	Ictalurus_punctatus
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	81.395	ENSSTOG00000002853	POLR2E	100	81.395	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSTSYG00000026377	POLR2E	73	79.167	ENSJJAG00000015812	-	89	79.167	Jaculus_jaculus
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	71.038	ENSJJAG00000003145	-	100	71.038	Jaculus_jaculus
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	80.930	ENSJJAG00000016595	-	100	80.930	Jaculus_jaculus
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	78.605	ENSKMAG00000005954	polr2eb	100	78.605	Kryptolebias_marmoratus
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	78.605	ENSLBEG00000024802	polr2eb	100	78.605	Labrus_bergylta
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	78.605	ENSLACG00000013686	POLR2E	100	78.605	Latimeria_chalumnae
ENSTSYG00000026377	POLR2E	73	96.552	ENSLOCG00000004599	POLR2E	89	96.528	Lepisosteus_oculatus
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	62.212	ENSLAFG00000025587	POLR2E	100	62.212	Loxodonta_africana
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	81.395	ENSMFAG00000002884	POLR2E	100	81.395	Macaca_fascicularis
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	81.395	ENSMMUG00000013927	POLR2E	100	81.395	Macaca_mulatta
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	61.735	ENSMNEG00000033452	-	100	61.735	Macaca_nemestrina
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	81.395	ENSMNEG00000034046	-	100	81.395	Macaca_nemestrina
ENSTSYG00000026377	POLR2E	91	61.616	ENSMLEG00000012405	POLR2E	94	61.616	Mandrillus_leucophaeus
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	78.605	ENSMAMG00000018703	polr2eb	100	78.605	Mastacembelus_armatus
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	75.410	ENSMZEG00005010796	polr2eb	100	75.410	Maylandia_zebra
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	79.630	ENSMGAG00000003769	POLR2E	100	79.630	Meleagris_gallopavo
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	52.857	ENSMAUG00000011003	-	100	52.857	Mesocricetus_auratus
ENSTSYG00000026377	POLR2E	91	78.788	ENSMAUG00000010125	-	100	79.082	Mesocricetus_auratus
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	81.395	ENSMICG00000013063	POLR2E	100	81.395	Microcebus_murinus
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	80.930	ENSMOCG00000013414	Polr2e	100	80.930	Microtus_ochrogaster
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	73.224	ENSMMOG00000001161	polr2eb	100	73.224	Mola_mola
ENSTSYG00000026377	POLR2E	90	70.157	ENSMMOG00000001167	polr2eb	88	70.157	Mola_mola
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	80.930	ENSMODG00000005494	POLR2E	100	80.930	Monodelphis_domestica
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	79.070	ENSMALG00000021888	polr2eb	100	79.070	Monopterus_albus
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	80.930	MGP_CAROLIEiJ_G0015561	Polr2e	100	80.930	Mus_caroli
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	80.930	ENSMUSG00000004667	Polr2e	100	80.930	Mus_musculus
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	80.930	MGP_PahariEiJ_G0030974	Polr2e	100	80.930	Mus_pahari
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	80.930	MGP_SPRETEiJ_G0016379	Polr2e	100	80.930	Mus_spretus
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	80.465	ENSMPUG00000008953	POLR2E	100	80.465	Mustela_putorius_furo
ENSTSYG00000026377	POLR2E	73	93.966	ENSMLUG00000006376	-	93	88.816	Myotis_lucifugus
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	81.395	ENSMLUG00000013193	POLR2E	100	81.395	Myotis_lucifugus
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	80.930	ENSNGAG00000001147	Polr2e	100	80.930	Nannospalax_galili
ENSTSYG00000026377	POLR2E	74	67.097	ENSNGAG00000017344	-	81	67.097	Nannospalax_galili
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	75.410	ENSNBRG00000022772	polr2eb	100	75.410	Neolamprologus_brichardi
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	61.722	ENSNLEG00000031364	-	100	61.722	Nomascus_leucogenys
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	78.241	ENSNLEG00000001207	-	100	78.241	Nomascus_leucogenys
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	69.626	ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	69.626	Ochotona_princeps
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	81.395	ENSODEG00000013230	-	100	81.395	Octodon_degus
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	68.333	ENSODEG00000011490	-	100	68.333	Octodon_degus
ENSTSYG00000026377	POLR2E	73	86.806	ENSODEG00000007985	-	77	86.806	Octodon_degus
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	78.605	ENSONIG00000002519	polr2eb	100	78.605	Oreochromis_niloticus
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	79.070	ENSORLG00000015346	polr2eb	100	79.070	Oryzias_latipes
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	79.070	ENSORLG00020020700	polr2e	100	79.070	Oryzias_latipes_hni
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	79.070	ENSORLG00015016842	polr2e	100	79.070	Oryzias_latipes_hsok
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	81.863	ENSOMEG00000002709	polr2eb	100	81.863	Oryzias_melastigma
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	81.395	ENSOGAG00000012311	POLR2E	100	81.395	Otolemur_garnettii
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	81.395	ENSOARG00000010994	POLR2E	100	81.395	Ovis_aries
ENSTSYG00000026377	POLR2E	90	79.592	ENSPPAG00000003145	POLR2E	100	79.592	Pan_paniscus
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	80.930	ENSPPRG00000000777	POLR2E	100	80.930	Panthera_pardus
ENSTSYG00000026377	POLR2E	96	69.841	ENSPTIG00000012237	POLR2E	86	92.537	Panthera_tigris_altaica
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	81.395	ENSPTRG00000010183	POLR2E	100	81.395	Pan_troglodytes
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	81.395	ENSPANG00000018011	POLR2E	100	81.395	Papio_anubis
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	79.048	ENSPKIG00000024123	POLR2E	100	79.048	Paramormyrops_kingsleyae
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	78.140	ENSPKIG00000009607	POLR2E	100	78.140	Paramormyrops_kingsleyae
ENSTSYG00000026377	POLR2E	97	76.667	ENSPSIG00000002870	POLR2E	99	76.667	Pelodiscus_sinensis
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	74.863	ENSPMGG00000014354	polr2eb	100	74.863	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	80.930	ENSPEMG00000023261	Polr2e	100	80.930	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSTSYG00000026377	POLR2E	73	99.138	ENSPCIG00000007312	POLR2E	57	98.611	Phascolarctos_cinereus
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	79.070	ENSPFOG00000005734	polr2eb	100	79.070	Poecilia_formosa
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	79.070	ENSPLAG00000014496	polr2eb	100	79.070	Poecilia_latipinna
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	79.070	ENSPMEG00000008053	polr2eb	100	79.070	Poecilia_mexicana
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	79.070	ENSPREG00000006489	polr2eb	100	79.070	Poecilia_reticulata
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	82.938	ENSPPYG00000009305	POLR2E	100	82.938	Pongo_abelii
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	81.395	ENSPCOG00000014491	POLR2E	100	81.395	Propithecus_coquereli
ENSTSYG00000026377	POLR2E	86	100.000	ENSPVAG00000007718	-	65	100.000	Pteropus_vampyrus
ENSTSYG00000026377	POLR2E	73	96.552	ENSPNYG00000019797	polr2eb	73	96.528	Pundamilia_nyererei
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	79.048	ENSPNAG00000026263	POLR2E	100	79.048	Pygocentrus_nattereri
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	80.930	ENSRNOG00000013545	Polr2e	100	80.930	Rattus_norvegicus
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	65.049	ENSRBIG00000027259	-	100	65.049	Rhinopithecus_bieti
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	81.395	ENSRBIG00000028726	-	100	81.395	Rhinopithecus_bieti
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	81.395	ENSRROG00000043763	POLR2E	100	81.395	Rhinopithecus_roxellana
ENSTSYG00000026377	POLR2E	99	35.321	YBR154C	RPB5	98	35.321	Saccharomyces_cerevisiae
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	81.395	ENSSBOG00000027241	POLR2E	100	81.395	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	80.930	ENSSHAG00000010690	POLR2E	100	80.930	Sarcophilus_harrisii
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	78.605	ENSSFOG00015006073	polr2e	100	78.605	Scleropages_formosus
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	80.473	ENSSMAG00000012782	polr2eb	100	80.473	Scophthalmus_maximus
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	78.605	ENSSDUG00000003352	polr2eb	100	78.605	Seriola_dumerili
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	78.605	ENSSLDG00000004965	polr2eb	100	78.605	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	79.535	ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	79.535	Sphenodon_punctatus
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	78.605	ENSSPAG00000017556	polr2eb	100	78.605	Stegastes_partitus
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	81.395	ENSSSCG00000021472	POLR2E	100	81.395	Sus_scrofa
ENSTSYG00000026377	POLR2E	74	99.145	ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	90.000	Taeniopygia_guttata
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	74.863	ENSTRUG00000018238	polr2eb	100	74.863	Takifugu_rubripes
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	78.605	ENSTNIG00000013187	polr2eb	100	78.605	Tetraodon_nigroviridis
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	80.930	ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	80.930	Tursiops_truncatus
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	78.571	ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	78.571	Ursus_americanus
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	81.395	ENSVVUG00000022818	POLR2E	54	81.395	Vulpes_vulpes
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	80.465	ENSXETG00000003291	polr2e	100	80.465	Xenopus_tropicalis
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	75.410	ENSXCOG00000009197	polr2eb	100	75.410	Xiphophorus_couchianus
ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	79.070	ENSXMAG00000026495	polr2eb	100	79.070	Xiphophorus_maculatus