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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSTSYG00000033949 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: MSI1
Alias: -
Full Name: musashi RNA binding protein 1
Gene Type: protein_coding
Species: Carlito_syrichta
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 22354 bases
Position: chrKE946712.1:59947-82300
Accession: 103271807
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSTSYP00000015651	RRM_1	PF00076.22	6.5e-29	1	2
ENSTSYP00000015651	RRM_1	PF00076.22	6.5e-29	2	2
ENSTSYP00000027994	RRM_1	PF00076.22	8.9e-17	1	2
ENSTSYP00000027994	RRM_1	PF00076.22	8.9e-17	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSTSYT00000046168	MSI1-202	915	-	ENSTSYP00000027994	304 (aa)	-	UPI000C2F4D93
ENSTSYT00000046988	MSI1-201	1041	XM_008069305	ENSTSYP00000015651	346 (aa)	XP_008067496	UPI000C2F38B6

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSTSYG00000033949	MSI1	51	38.857	ENSTSYG00000037019	-	62	38.857
ENSTSYG00000033949	MSI1	55	42.308	ENSTSYG00000027054	DAZAP1	58	39.378
ENSTSYG00000033949	MSI1	51	33.333	ENSTSYG00000036821	-	81	32.000
ENSTSYG00000033949	MSI1	51	43.750	ENSTSYG00000008124	HNRNPA2B1	67	43.750

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSTSYG00000033949	MSI1	95	100.000	ENSG00000135097	MSI1	94	100.000	Homo_sapiens
ENSTSYG00000033949	MSI1	95	85.321	ENSAPOG00000023458	-	94	85.321	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTSYG00000033949	MSI1	95	85.321	ENSAPOG00000003191	MSI1	94	85.321	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTSYG00000033949	MSI1	95	81.266	ENSAMEG00000013302	MSI1	100	81.266	Ailuropoda_melanoleuca
ENSTSYG00000033949	MSI1	91	81.847	ENSACIG00000017754	-	78	81.847	Amphilophus_citrinellus
ENSTSYG00000033949	MSI1	95	85.321	ENSAOCG00000003804	MSI1	94	85.321	Amphiprion_ocellaris
ENSTSYG00000033949	MSI1	95	76.453	ENSAOCG00000009031	-	95	76.758	Amphiprion_ocellaris
ENSTSYG00000033949	MSI1	95	85.321	ENSAPEG00000003245	MSI1	94	85.321	Amphiprion_percula
ENSTSYG00000033949	MSI1	95	85.321	ENSAPEG00000006857	-	79	85.321	Amphiprion_percula
ENSTSYG00000033949	MSI1	95	85.015	ENSATEG00000017059	MSI1	95	85.015	Anabas_testudineus
ENSTSYG00000033949	MSI1	95	82.317	ENSATEG00000023779	-	93	82.317	Anabas_testudineus
ENSTSYG00000033949	MSI1	95	96.942	ENSACAG00000002762	MSI1	94	96.942	Anolis_carolinensis
ENSTSYG00000033949	MSI1	95	100.000	ENSANAG00000027151	MSI1	94	100.000	Aotus_nancymaae
ENSTSYG00000033949	MSI1	76	96.198	ENSANAG00000027901	-	92	96.198	Aotus_nancymaae
ENSTSYG00000033949	MSI1	95	84.709	ENSACLG00000011230	MSI1	94	84.709	Astatotilapia_calliptera
ENSTSYG00000033949	MSI1	95	84.709	ENSACLG00000000117	-	100	84.709	Astatotilapia_calliptera
ENSTSYG00000033949	MSI1	95	83.792	ENSAMXG00000038960	msi1	76	83.792	Astyanax_mexicanus
ENSTSYG00000033949	MSI1	95	100.000	ENSBTAG00000009800	MSI1	100	100.000	Bos_taurus
ENSTSYG00000033949	MSI1	95	100.000	ENSCJAG00000008578	MSI1	94	100.000	Callithrix_jacchus
ENSTSYG00000033949	MSI1	95	99.694	ENSCAFG00000010283	MSI1	94	99.694	Canis_familiaris
ENSTSYG00000033949	MSI1	95	100.000	ENSCAFG00020020585	MSI1	100	100.000	Canis_lupus_dingo
ENSTSYG00000033949	MSI1	95	94.012	ENSCHIG00000024304	MSI1	98	94.012	Capra_hircus
ENSTSYG00000033949	MSI1	95	89.776	ENSCAPG00000003919	MSI1	89	89.776	Cavia_aperea
ENSTSYG00000033949	MSI1	95	100.000	ENSCPOG00000012361	MSI1	100	100.000	Cavia_porcellus
ENSTSYG00000033949	MSI1	95	100.000	ENSCCAG00000035567	MSI1	94	100.000	Cebus_capucinus
ENSTSYG00000033949	MSI1	95	100.000	ENSCATG00000030019	MSI1	94	100.000	Cercocebus_atys
ENSTSYG00000033949	MSI1	95	100.000	ENSCLAG00000011329	MSI1	100	100.000	Chinchilla_lanigera
ENSTSYG00000033949	MSI1	68	95.868	ENSCSAG00000002265	MSI1	89	95.868	Chlorocebus_sabaeus
ENSTSYG00000033949	MSI1	95	96.024	ENSCPBG00000011349	MSI1	94	96.024	Chrysemys_picta_bellii
ENSTSYG00000033949	MSI1	95	100.000	ENSCANG00000040651	MSI1	99	100.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSTSYG00000033949	MSI1	95	100.000	ENSCGRG00001018883	Msi1	94	100.000	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSTSYG00000033949	MSI1	95	100.000	ENSCGRG00000002191	Msi1	73	100.000	Cricetulus_griseus_crigri
ENSTSYG00000033949	MSI1	100	74.522	ENSCSEG00000011032	MSI1	100	77.370	Cynoglossus_semilaevis
ENSTSYG00000033949	MSI1	95	83.792	ENSCSEG00000008352	-	94	83.792	Cynoglossus_semilaevis
ENSTSYG00000033949	MSI1	95	85.015	ENSCSEG00000005834	-	98	81.857	Cynoglossus_semilaevis
ENSTSYG00000033949	MSI1	95	85.321	ENSCVAG00000009100	MSI1	94	85.321	Cyprinodon_variegatus
ENSTSYG00000033949	MSI1	81	65.098	ENSCVAG00000017463	-	93	68.050	Cyprinodon_variegatus
ENSTSYG00000033949	MSI1	96	82.174	ENSDARG00000102015	CABZ01037298.1	94	80.000	Danio_rerio
ENSTSYG00000033949	MSI1	95	81.346	ENSDARG00000010710	msi1	100	85.022	Danio_rerio
ENSTSYG00000033949	MSI1	95	89.908	ENSDNOG00000005713	MSI1	91	89.908	Dasypus_novemcinctus
ENSTSYG00000033949	MSI1	95	100.000	ENSDORG00000005610	Msi1	93	100.000	Dipodomys_ordii
ENSTSYG00000033949	MSI1	95	95.719	ENSETEG00000004756	MSI1	99	95.719	Echinops_telfairi
ENSTSYG00000033949	MSI1	95	100.000	ENSEASG00005004736	MSI1	94	100.000	Equus_asinus_asinus
ENSTSYG00000033949	MSI1	95	100.000	ENSECAG00000017526	MSI1	94	100.000	Equus_caballus
ENSTSYG00000033949	MSI1	95	80.428	ENSELUG00000023280	-	100	80.122	Esox_lucius
ENSTSYG00000033949	MSI1	95	79.539	ENSELUG00000023219	MSI1	92	79.539	Esox_lucius
ENSTSYG00000033949	MSI1	95	100.000	ENSFCAG00000011007	MSI1	94	100.000	Felis_catus
ENSTSYG00000033949	MSI1	95	95.820	ENSFALG00000007574	MSI1	100	95.820	Ficedula_albicollis
ENSTSYG00000033949	MSI1	95	99.694	ENSFDAG00000019586	MSI1	99	99.694	Fukomys_damarensis
ENSTSYG00000033949	MSI1	95	85.627	ENSFHEG00000022446	MSI1	94	85.627	Fundulus_heteroclitus
ENSTSYG00000033949	MSI1	95	85.321	ENSFHEG00000003560	-	94	85.321	Fundulus_heteroclitus
ENSTSYG00000033949	MSI1	95	76.758	ENSGMOG00000017838	-	90	76.758	Gadus_morhua
ENSTSYG00000033949	MSI1	95	82.875	ENSGMOG00000001006	MSI1	94	82.569	Gadus_morhua
ENSTSYG00000033949	MSI1	95	95.238	ENSGALG00000007227	MSI1	96	86.236	Gallus_gallus
ENSTSYG00000033949	MSI1	97	67.062	ENSGAFG00000005860	-	91	67.062	Gambusia_affinis
ENSTSYG00000033949	MSI1	95	84.709	ENSGAFG00000021522	MSI1	94	84.709	Gambusia_affinis
ENSTSYG00000033949	MSI1	95	81.040	ENSGACG00000008674	-	94	81.040	Gasterosteus_aculeatus
ENSTSYG00000033949	MSI1	95	84.098	ENSGACG00000012679	MSI1	94	84.098	Gasterosteus_aculeatus
ENSTSYG00000033949	MSI1	95	96.024	ENSGAGG00000016037	MSI1	94	96.024	Gopherus_agassizii
ENSTSYG00000033949	MSI1	95	100.000	ENSGGOG00000010328	MSI1	100	100.000	Gorilla_gorilla
ENSTSYG00000033949	MSI1	95	84.709	ENSHBUG00000021921	MSI1	94	84.709	Haplochromis_burtoni
ENSTSYG00000033949	MSI1	95	84.709	ENSHBUG00000011841	-	94	84.709	Haplochromis_burtoni
ENSTSYG00000033949	MSI1	95	99.694	ENSHGLG00000012782	MSI1	98	99.694	Heterocephalus_glaber_female
ENSTSYG00000033949	MSI1	95	99.694	ENSHGLG00100016848	MSI1	99	99.694	Heterocephalus_glaber_male
ENSTSYG00000033949	MSI1	95	80.122	ENSHCOG00000012019	MSI1	100	80.122	Hippocampus_comes
ENSTSYG00000033949	MSI1	95	83.792	ENSHCOG00000012067	-	89	83.792	Hippocampus_comes
ENSTSYG00000033949	MSI1	95	83.180	ENSIPUG00000001976	msi1	99	79.511	Ictalurus_punctatus
ENSTSYG00000033949	MSI1	95	100.000	ENSSTOG00000009799	MSI1	100	100.000	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSTSYG00000033949	MSI1	95	100.000	ENSJJAG00000010463	Msi1	94	100.000	Jaculus_jaculus
ENSTSYG00000033949	MSI1	95	82.875	ENSJJAG00000010643	-	94	82.569	Jaculus_jaculus
ENSTSYG00000033949	MSI1	95	82.875	ENSKMAG00000019877	-	100	82.875	Kryptolebias_marmoratus
ENSTSYG00000033949	MSI1	95	84.404	ENSKMAG00000011251	MSI1	94	84.404	Kryptolebias_marmoratus
ENSTSYG00000033949	MSI1	95	84.709	ENSLBEG00000008789	MSI1	94	84.709	Labrus_bergylta
ENSTSYG00000033949	MSI1	95	84.709	ENSLBEG00000001375	-	94	84.709	Labrus_bergylta
ENSTSYG00000033949	MSI1	95	86.850	ENSLACG00000018287	MSI1	100	86.850	Latimeria_chalumnae
ENSTSYG00000033949	MSI1	100	90.520	ENSLAFG00000009412	MSI1	100	89.362	Loxodonta_africana
ENSTSYG00000033949	MSI1	95	100.000	ENSMFAG00000001798	MSI1	100	100.000	Macaca_fascicularis
ENSTSYG00000033949	MSI1	95	100.000	ENSMMUG00000031527	MSI1	96	100.000	Macaca_mulatta
ENSTSYG00000033949	MSI1	95	100.000	ENSMNEG00000040034	MSI1	94	100.000	Macaca_nemestrina
ENSTSYG00000033949	MSI1	95	100.000	ENSMLEG00000003921	MSI1	99	100.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSTSYG00000033949	MSI1	95	84.098	ENSMAMG00000002279	MSI1	94	84.098	Mastacembelus_armatus
ENSTSYG00000033949	MSI1	95	85.321	ENSMAMG00000018426	-	94	85.321	Mastacembelus_armatus
ENSTSYG00000033949	MSI1	95	84.709	ENSMZEG00005026892	MSI1	94	84.709	Maylandia_zebra
ENSTSYG00000033949	MSI1	95	84.709	ENSMZEG00005000340	-	94	84.709	Maylandia_zebra
ENSTSYG00000033949	MSI1	59	98.817	ENSMGAG00000016518	-	100	98.817	Meleagris_gallopavo
ENSTSYG00000033949	MSI1	66	100.000	ENSMAUG00000016820	Msi1	100	100.000	Mesocricetus_auratus
ENSTSYG00000033949	MSI1	95	100.000	ENSMICG00000033181	MSI1	94	100.000	Microcebus_murinus
ENSTSYG00000033949	MSI1	99	99.694	ENSMOCG00000002286	Msi1	98	99.694	Microtus_ochrogaster
ENSTSYG00000033949	MSI1	95	75.229	ENSMMOG00000010492	MSI1	96	75.229	Mola_mola
ENSTSYG00000033949	MSI1	95	81.957	ENSMMOG00000012265	-	96	81.957	Mola_mola
ENSTSYG00000033949	MSI1	95	67.576	ENSMODG00000003189	-	100	67.576	Monodelphis_domestica
ENSTSYG00000033949	MSI1	95	84.709	ENSMALG00000017889	MSI1	94	84.709	Monopterus_albus
ENSTSYG00000033949	MSI1	95	84.404	ENSMALG00000001426	-	100	84.404	Monopterus_albus
ENSTSYG00000033949	MSI1	95	99.388	MGP_CAROLIEiJ_G0027626	Msi1	98	99.388	Mus_caroli
ENSTSYG00000033949	MSI1	95	99.388	ENSMUSG00000054256	Msi1	98	99.388	Mus_musculus
ENSTSYG00000033949	MSI1	95	99.083	MGP_PahariEiJ_G0024206	Msi1	98	99.083	Mus_pahari
ENSTSYG00000033949	MSI1	95	99.388	MGP_SPRETEiJ_G0028624	Msi1	98	99.388	Mus_spretus
ENSTSYG00000033949	MSI1	95	100.000	ENSMPUG00000003168	MSI1	100	100.000	Mustela_putorius_furo
ENSTSYG00000033949	MSI1	95	90.120	ENSMLUG00000010313	MSI1	100	90.120	Myotis_lucifugus
ENSTSYG00000033949	MSI1	95	100.000	ENSNGAG00000014508	Msi1	93	100.000	Nannospalax_galili
ENSTSYG00000033949	MSI1	95	84.709	ENSNBRG00000000841	-	94	84.709	Neolamprologus_brichardi
ENSTSYG00000033949	MSI1	97	83.691	ENSNBRG00000018012	MSI1	99	77.432	Neolamprologus_brichardi
ENSTSYG00000033949	MSI1	95	89.602	ENSNLEG00000015636	MSI1	99	89.602	Nomascus_leucogenys
ENSTSYG00000033949	MSI1	95	77.676	ENSMEUG00000015759	MSI1	99	77.676	Notamacropus_eugenii
ENSTSYG00000033949	MSI1	91	92.038	ENSOPRG00000016879	MSI1	99	92.038	Ochotona_princeps
ENSTSYG00000033949	MSI1	95	100.000	ENSODEG00000006328	MSI1	99	100.000	Octodon_degus
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ENSTSYG00000033949	MSI1	95	85.015	ENSONIG00000019452	-	94	85.015	Oreochromis_niloticus
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ENSTSYG00000033949	MSI1	95	75.841	ENSTRUG00000015636	-	79	75.841	Takifugu_rubripes
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ENSTSYG00000033949	MSI1	100	71.924	ENSXCOG00000017605	MSI1	89	70.642	Xiphophorus_couchianus
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ENSTSYG00000033949	MSI1	95	85.015	ENSXMAG00000018237	-	94	85.015	Xiphophorus_maculatus