EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSTSYG00000036426 (Gene tree)
Gene ID: 103249738
Gene Symbol: SRRT
Alias: ARS2|Asr2|serrate
Full Name: serrate%2C RNA effector molecule
Gene Type: protein_coding
Species: Carlito_syrichta
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 7725 bases
Position: chrKE929290.1:5565-13289
Accession: 103249738
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSTSYP00000016479	ARS2	PF04959.13	2.6e-90	1	1
ENSTSYP00000019446	ARS2	PF04959.13	2.6e-90	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSTSYT00000040820	SRRT-202	2460	-	ENSTSYP00000019446	819 (aa)	-	UPI000C2F7E52
ENSTSYT00000032494	SRRT-201	2460	XM_008048354	ENSTSYP00000016479	819 (aa)	XP_008046545	UPI000C2F76F2

Gene Model

Click here to download ENSTSYG00000036426's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSTSYG00000036426's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSTSYG00000036426	SRRT	99	94.737	ENSG00000087087	SRRT	99	100.000	Homo_sapiens
ENSTSYG00000036426	SRRT	56	76.190	ENSAPOG00000002304	srrt	96	62.877	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTSYG00000036426	SRRT	99	89.510	ENSAMEG00000014506	SRRT	95	90.909	Ailuropoda_melanoleuca
ENSTSYG00000036426	SRRT	82	75.974	ENSACIG00000015795	srrt	84	75.974	Amphilophus_citrinellus
ENSTSYG00000036426	SRRT	96	53.902	ENSAOCG00000009189	-	96	55.686	Amphiprion_ocellaris
ENSTSYG00000036426	SRRT	82	76.407	ENSAOCG00000009693	srrt	83	76.407	Amphiprion_ocellaris
ENSTSYG00000036426	SRRT	96	53.902	ENSAPEG00000020016	-	96	55.686	Amphiprion_percula
ENSTSYG00000036426	SRRT	82	75.974	ENSAPEG00000003646	srrt	84	75.974	Amphiprion_percula
ENSTSYG00000036426	SRRT	59	62.020	ENSATEG00000003652	-	85	64.076	Anabas_testudineus
ENSTSYG00000036426	SRRT	85	73.810	ENSATEG00000014425	srrt	96	62.442	Anabas_testudineus
ENSTSYG00000036426	SRRT	99	74.881	ENSACAG00000001014	SRRT	96	74.911	Anolis_carolinensis
ENSTSYG00000036426	SRRT	99	96.446	ENSANAG00000031718	SRRT	96	96.446	Aotus_nancymaae
ENSTSYG00000036426	SRRT	56	74.892	ENSACLG00000013156	srrt	50	74.892	Astatotilapia_calliptera
ENSTSYG00000036426	SRRT	96	52.524	ENSACLG00000009423	-	52	63.404	Astatotilapia_calliptera
ENSTSYG00000036426	SRRT	55	76.149	ENSAMXG00000016671	srrt	92	62.877	Astyanax_mexicanus
ENSTSYG00000036426	SRRT	99	93.062	ENSBTAG00000001134	SRRT	96	92.738	Bos_taurus
ENSTSYG00000036426	SRRT	64	47.656	WBGene00017085	E01A2.2	85	42.857	Caenorhabditis_elegans
ENSTSYG00000036426	SRRT	99	93.660	ENSCJAG00000014917	SRRT	96	93.333	Callithrix_jacchus
ENSTSYG00000036426	SRRT	99	93.900	ENSCAFG00000023538	SRRT	96	93.571	Canis_familiaris
ENSTSYG00000036426	SRRT	99	94.471	ENSCAFG00020013358	SRRT	99	91.198	Canis_lupus_dingo
ENSTSYG00000036426	SRRT	99	93.397	ENSCHIG00000010495	SRRT	96	92.738	Capra_hircus
ENSTSYG00000036426	SRRT	99	93.261	ENSCAPG00000013586	SRRT	100	93.261	Cavia_aperea
ENSTSYG00000036426	SRRT	99	93.907	ENSCPOG00000001739	SRRT	96	93.579	Cavia_porcellus
ENSTSYG00000036426	SRRT	99	94.019	ENSCCAG00000015877	SRRT	96	93.690	Cebus_capucinus
ENSTSYG00000036426	SRRT	99	95.146	ENSCATG00000036306	SRRT	97	95.146	Cercocebus_atys
ENSTSYG00000036426	SRRT	99	94.258	ENSCLAG00000007568	SRRT	100	93.858	Chinchilla_lanigera
ENSTSYG00000036426	SRRT	99	93.690	ENSCSAG00000017996	SRRT	96	93.690	Chlorocebus_sabaeus
ENSTSYG00000036426	SRRT	59	94.118	ENSCHOG00000007815	SRRT	67	94.675	Choloepus_hoffmanni
ENSTSYG00000036426	SRRT	75	84.739	ENSCPBG00000011553	SRRT	82	83.922	Chrysemys_picta_bellii
ENSTSYG00000036426	SRRT	96	41.877	ENSCING00000003506	-	54	52.083	Ciona_intestinalis
ENSTSYG00000036426	SRRT	96	38.679	ENSCSAVG00000008394	-	81	53.760	Ciona_savignyi
ENSTSYG00000036426	SRRT	99	94.471	ENSCANG00000034556	SRRT	96	94.139	Colobus_angolensis_palliatus
ENSTSYG00000036426	SRRT	99	92.363	ENSCGRG00001001594	Srrt	96	92.874	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSTSYG00000036426	SRRT	99	85.595	ENSCGRG00000007292	Srrt	100	92.925	Cricetulus_griseus_crigri
ENSTSYG00000036426	SRRT	99	58.324	ENSCSEG00000017878	srrt	96	57.583	Cynoglossus_semilaevis
ENSTSYG00000036426	SRRT	96	51.235	ENSCSEG00000005233	-	80	63.297	Cynoglossus_semilaevis
ENSTSYG00000036426	SRRT	93	54.130	ENSCVAG00000017344	-	94	54.135	Cyprinodon_variegatus
ENSTSYG00000036426	SRRT	99	63.095	ENSCVAG00000019848	srrt	54	74.675	Cyprinodon_variegatus
ENSTSYG00000036426	SRRT	56	76.674	ENSDARG00000017762	srrt	95	65.557	Danio_rerio
ENSTSYG00000036426	SRRT	99	93.780	ENSDNOG00000003851	SRRT	96	93.452	Dasypus_novemcinctus
ENSTSYG00000036426	SRRT	99	90.107	ENSDORG00000005584	Srrt	96	90.036	Dipodomys_ordii
ENSTSYG00000036426	SRRT	85	47.929	FBgn0033062	Ars2	67	50.740	Drosophila_melanogaster
ENSTSYG00000036426	SRRT	85	92.456	ENSETEG00000016175	SRRT	82	92.857	Echinops_telfairi
ENSTSYG00000036426	SRRT	66	62.826	ENSEBUG00000008517	-	76	65.278	Eptatretus_burgeri
ENSTSYG00000036426	SRRT	99	94.019	ENSEASG00005016956	SRRT	96	93.690	Equus_asinus_asinus
ENSTSYG00000036426	SRRT	99	93.900	ENSECAG00000012292	SRRT	96	93.571	Equus_caballus
ENSTSYG00000036426	SRRT	86	95.833	ENSEEUG00000009117	SRRT	81	95.833	Erinaceus_europaeus
ENSTSYG00000036426	SRRT	96	54.653	ENSELUG00000021216	-	96	55.239	Esox_lucius
ENSTSYG00000036426	SRRT	99	94.019	ENSFCAG00000006855	SRRT	96	93.690	Felis_catus
ENSTSYG00000036426	SRRT	61	53.947	ENSFALG00000007524	-	81	70.115	Ficedula_albicollis
ENSTSYG00000036426	SRRT	99	89.784	ENSFDAG00000021347	SRRT	100	87.379	Fukomys_damarensis
ENSTSYG00000036426	SRRT	58	55.010	ENSFHEG00000004105	-	93	55.957	Fundulus_heteroclitus
ENSTSYG00000036426	SRRT	77	74.458	ENSFHEG00000002756	srrt	88	74.458	Fundulus_heteroclitus
ENSTSYG00000036426	SRRT	99	60.961	ENSGMOG00000018619	srrt	96	59.510	Gadus_morhua
ENSTSYG00000036426	SRRT	96	52.422	ENSGAFG00000020383	-	96	53.278	Gambusia_affinis
ENSTSYG00000036426	SRRT	56	74.675	ENSGAFG00000005423	srrt	51	74.675	Gambusia_affinis
ENSTSYG00000036426	SRRT	97	49.296	ENSGACG00000001100	-	53	61.099	Gasterosteus_aculeatus
ENSTSYG00000036426	SRRT	99	62.053	ENSGACG00000020387	srrt	96	61.432	Gasterosteus_aculeatus
ENSTSYG00000036426	SRRT	99	97.287	ENSGGOG00000001508	SRRT	96	97.287	Gorilla_gorilla
ENSTSYG00000036426	SRRT	56	74.892	ENSHBUG00000002942	srrt	50	74.892	Haplochromis_burtoni
ENSTSYG00000036426	SRRT	99	93.317	ENSHGLG00000008344	Srrt	96	90.974	Heterocephalus_glaber_female
ENSTSYG00000036426	SRRT	99	94.231	ENSHGLG00100018857	Srrt	100	94.757	Heterocephalus_glaber_male
ENSTSYG00000036426	SRRT	97	51.355	ENSHCOG00000008904	-	56	61.242	Hippocampus_comes
ENSTSYG00000036426	SRRT	99	61.820	ENSHCOG00000005403	srrt	96	60.542	Hippocampus_comes
ENSTSYG00000036426	SRRT	56	76.724	ENSIPUG00000021150	srrt	51	76.724	Ictalurus_punctatus
ENSTSYG00000036426	SRRT	99	94.139	ENSSTOG00000013776	SRRT	96	94.139	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSTSYG00000036426	SRRT	99	92.909	ENSJJAG00000010446	Srrt	100	93.592	Jaculus_jaculus
ENSTSYG00000036426	SRRT	59	60.792	ENSKMAG00000008468	-	53	62.319	Kryptolebias_marmoratus
ENSTSYG00000036426	SRRT	99	62.785	ENSKMAG00000013599	srrt	96	62.284	Kryptolebias_marmoratus
ENSTSYG00000036426	SRRT	84	72.271	ENSLBEG00000016308	srrt	54	76.724	Labrus_bergylta
ENSTSYG00000036426	SRRT	99	63.909	ENSLACG00000001089	SRRT	96	63.925	Latimeria_chalumnae
ENSTSYG00000036426	SRRT	94	61.322	ENSLOCG00000013658	srrt	52	72.912	Lepisosteus_oculatus
ENSTSYG00000036426	SRRT	99	92.464	ENSLAFG00000007725	SRRT	96	91.667	Loxodonta_africana
ENSTSYG00000036426	SRRT	99	95.383	ENSMFAG00000033745	SRRT	99	95.383	Macaca_fascicularis
ENSTSYG00000036426	SRRT	99	95.048	ENSMMUG00000021255	SRRT	96	95.048	Macaca_mulatta
ENSTSYG00000036426	SRRT	99	95.383	ENSMNEG00000041864	SRRT	97	95.383	Macaca_nemestrina
ENSTSYG00000036426	SRRT	99	95.383	ENSMLEG00000029479	SRRT	98	95.383	Mandrillus_leucophaeus
ENSTSYG00000036426	SRRT	56	73.970	ENSMAMG00000014311	srrt	96	64.195	Mastacembelus_armatus
ENSTSYG00000036426	SRRT	96	53.357	ENSMAMG00000010681	-	94	56.348	Mastacembelus_armatus
ENSTSYG00000036426	SRRT	56	74.892	ENSMZEG00005016135	srrt	50	74.892	Maylandia_zebra
ENSTSYG00000036426	SRRT	96	52.404	ENSMZEG00005028002	-	52	63.404	Maylandia_zebra
ENSTSYG00000036426	SRRT	99	92.225	ENSMAUG00000011386	Srrt	100	92.871	Mesocricetus_auratus
ENSTSYG00000036426	SRRT	99	94.686	ENSMICG00000009471	SRRT	98	94.686	Microcebus_murinus
ENSTSYG00000036426	SRRT	99	92.225	ENSMOCG00000001971	Srrt	100	94.027	Microtus_ochrogaster
ENSTSYG00000036426	SRRT	90	56.101	ENSMMOG00000011137	-	55	65.665	Mola_mola
ENSTSYG00000036426	SRRT	99	63.314	ENSMMOG00000016399	srrt	97	59.425	Mola_mola
ENSTSYG00000036426	SRRT	57	87.657	ENSMODG00000004862	SRRT	90	88.773	Monodelphis_domestica
ENSTSYG00000036426	SRRT	62	48.235	ENSMALG00000005567	-	84	52.495	Monopterus_albus
ENSTSYG00000036426	SRRT	94	60.662	ENSMALG00000018604	srrt	53	71.367	Monopterus_albus
ENSTSYG00000036426	SRRT	99	92.105	MGP_CAROLIEiJ_G0027870	Srrt	100	98.507	Mus_caroli
ENSTSYG00000036426	SRRT	99	92.105	ENSMUSG00000037364	Srrt	99	98.507	Mus_musculus
ENSTSYG00000036426	SRRT	99	92.225	MGP_PahariEiJ_G0024456	Srrt	100	98.881	Mus_pahari
ENSTSYG00000036426	SRRT	99	92.105	MGP_SPRETEiJ_G0028875	Srrt	100	98.507	Mus_spretus
ENSTSYG00000036426	SRRT	99	93.900	ENSMPUG00000015839	SRRT	96	93.571	Mustela_putorius_furo
ENSTSYG00000036426	SRRT	99	93.214	ENSMLUG00000009975	SRRT	96	93.214	Myotis_lucifugus
ENSTSYG00000036426	SRRT	99	93.182	ENSNGAG00000023715	Srrt	100	95.055	Nannospalax_galili
ENSTSYG00000036426	SRRT	56	73.753	ENSNBRG00000019100	srrt	95	61.810	Neolamprologus_brichardi
ENSTSYG00000036426	SRRT	99	84.281	ENSNLEG00000011987	SRRT	99	82.906	Nomascus_leucogenys
ENSTSYG00000036426	SRRT	98	73.245	ENSMEUG00000011941	SRRT	94	72.816	Notamacropus_eugenii
ENSTSYG00000036426	SRRT	64	100.000	ENSOPRG00000002502	-	67	100.000	Ochotona_princeps
ENSTSYG00000036426	SRRT	99	93.750	ENSODEG00000016856	SRRT	100	94.757	Octodon_degus
ENSTSYG00000036426	SRRT	96	53.597	ENSONIG00000016080	-	52	63.136	Oreochromis_niloticus
ENSTSYG00000036426	SRRT	56	75.325	ENSONIG00000004242	srrt	96	64.252	Oreochromis_niloticus
ENSTSYG00000036426	SRRT	99	63.446	ENSORLG00000008120	srrt	52	74.242	Oryzias_latipes
ENSTSYG00000036426	SRRT	99	63.785	ENSORLG00020003058	srrt	52	74.026	Oryzias_latipes_hni
ENSTSYG00000036426	SRRT	99	63.795	ENSORLG00015008062	srrt	52	74.026	Oryzias_latipes_hsok
ENSTSYG00000036426	SRRT	99	63.795	ENSOMEG00000003155	srrt	96	62.907	Oryzias_melastigma
ENSTSYG00000036426	SRRT	96	55.637	ENSOMEG00000006963	-	96	54.911	Oryzias_melastigma
ENSTSYG00000036426	SRRT	99	94.258	ENSOGAG00000017242	SRRT	96	93.929	Otolemur_garnettii
ENSTSYG00000036426	SRRT	99	93.630	ENSOARG00000015645	SRRT	96	93.301	Ovis_aries
ENSTSYG00000036426	SRRT	99	94.654	ENSPPAG00000041090	SRRT	97	94.654	Pan_paniscus
ENSTSYG00000036426	SRRT	99	94.111	ENSPPRG00000009557	SRRT	96	93.780	Panthera_pardus
ENSTSYG00000036426	SRRT	99	93.900	ENSPTIG00000014355	SRRT	96	93.571	Panthera_tigris_altaica
ENSTSYG00000036426	SRRT	99	94.498	ENSPTRG00000019511	SRRT	99	92.169	Pan_troglodytes
ENSTSYG00000036426	SRRT	99	95.383	ENSPANG00000020763	SRRT	96	95.383	Papio_anubis
ENSTSYG00000036426	SRRT	99	67.376	ENSPKIG00000005434	srrt	95	66.207	Paramormyrops_kingsleyae
ENSTSYG00000036426	SRRT	97	66.146	ENSPKIG00000022212	-	96	65.171	Paramormyrops_kingsleyae
ENSTSYG00000036426	SRRT	99	76.162	ENSPSIG00000016311	SRRT	96	77.251	Pelodiscus_sinensis
ENSTSYG00000036426	SRRT	99	91.827	ENSPEMG00000010834	Srrt	100	93.981	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSTSYG00000036426	SRRT	100	53.538	ENSPMAG00000009614	-	55	64.496	Petromyzon_marinus
ENSTSYG00000036426	SRRT	99	87.990	ENSPCIG00000000816	SRRT	96	88.166	Phascolarctos_cinereus
ENSTSYG00000036426	SRRT	96	51.921	ENSPFOG00000016554	-	96	53.333	Poecilia_formosa
ENSTSYG00000036426	SRRT	56	74.730	ENSPFOG00000005704	srrt	96	62.153	Poecilia_formosa
ENSTSYG00000036426	SRRT	99	62.065	ENSPLAG00000021992	srrt	51	74.242	Poecilia_latipinna
ENSTSYG00000036426	SRRT	96	52.222	ENSPLAG00000004526	-	96	53.389	Poecilia_latipinna
ENSTSYG00000036426	SRRT	93	51.023	ENSPMEG00000001520	-	95	52.515	Poecilia_mexicana
ENSTSYG00000036426	SRRT	82	74.298	ENSPMEG00000001182	srrt	96	62.369	Poecilia_mexicana
ENSTSYG00000036426	SRRT	99	63.244	ENSPREG00000022308	srrt	96	62.269	Poecilia_reticulata
ENSTSYG00000036426	SRRT	99	83.612	ENSPPYG00000017432	SRRT	96	83.452	Pongo_abelii
ENSTSYG00000036426	SRRT	99	89.929	ENSPCAG00000001621	SRRT	96	88.797	Procavia_capensis
ENSTSYG00000036426	SRRT	99	94.139	ENSPCOG00000025751	SRRT	96	93.810	Propithecus_coquereli
ENSTSYG00000036426	SRRT	83	88.382	ENSPVAG00000000834	SRRT	100	88.382	Pteropus_vampyrus
ENSTSYG00000036426	SRRT	56	74.892	ENSPNYG00000018710	srrt	52	74.892	Pundamilia_nyererei
ENSTSYG00000036426	SRRT	82	70.732	ENSPNAG00000010629	srrt	94	52.506	Pygocentrus_nattereri
ENSTSYG00000036426	SRRT	57	84.076	ENSRNOG00000048277	AABR07035787.1	93	84.076	Rattus_norvegicus
ENSTSYG00000036426	SRRT	99	95.383	ENSRBIG00000035718	SRRT	97	95.383	Rhinopithecus_bieti
ENSTSYG00000036426	SRRT	99	95.383	ENSRROG00000030622	SRRT	98	95.383	Rhinopithecus_roxellana
ENSTSYG00000036426	SRRT	99	96.914	ENSSBOG00000033570	SRRT	96	96.914	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSTSYG00000036426	SRRT	76	86.614	ENSSHAG00000007349	-	100	86.772	Sarcophilus_harrisii
ENSTSYG00000036426	SRRT	97	67.840	ENSSFOG00015017293	srrt	95	68.245	Scleropages_formosus
ENSTSYG00000036426	SRRT	56	61.996	ENSSMAG00000018195	-	96	52.725	Scophthalmus_maximus
ENSTSYG00000036426	SRRT	99	63.572	ENSSMAG00000015342	srrt	88	72.017	Scophthalmus_maximus
ENSTSYG00000036426	SRRT	58	54.021	ENSSDUG00000002051	-	93	54.797	Seriola_dumerili
ENSTSYG00000036426	SRRT	56	74.892	ENSSDUG00000012049	srrt	91	62.818	Seriola_dumerili
ENSTSYG00000036426	SRRT	83	74.675	ENSSLDG00000017477	srrt	81	75.541	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSTSYG00000036426	SRRT	88	51.651	ENSSPAG00000018943	-	95	55.428	Stegastes_partitus
ENSTSYG00000036426	SRRT	56	75.054	ENSSPAG00000005665	srrt	94	62.428	Stegastes_partitus
ENSTSYG00000036426	SRRT	99	91.536	ENSSSCG00000024789	SRRT	99	91.443	Sus_scrofa
ENSTSYG00000036426	SRRT	94	52.978	ENSTRUG00000000023	-	51	60.135	Takifugu_rubripes
ENSTSYG00000036426	SRRT	99	62.574	ENSTRUG00000016075	srrt	96	64.228	Takifugu_rubripes
ENSTSYG00000036426	SRRT	79	62.405	ENSTNIG00000011779	srrt	100	61.411	Tetraodon_nigroviridis
ENSTSYG00000036426	SRRT	96	49.041	ENSTNIG00000003111	-	95	51.744	Tetraodon_nigroviridis
ENSTSYG00000036426	SRRT	56	100.000	ENSTBEG00000005212	SRRT	60	91.228	Tupaia_belangeri
ENSTSYG00000036426	SRRT	99	93.571	ENSTTRG00000011104	SRRT	96	93.571	Tursiops_truncatus
ENSTSYG00000036426	SRRT	99	93.907	ENSUAMG00000027997	SRRT	99	93.713	Ursus_americanus
ENSTSYG00000036426	SRRT	99	94.019	ENSUMAG00000011295	SRRT	96	93.690	Ursus_maritimus
ENSTSYG00000036426	SRRT	99	93.900	ENSVVUG00000023572	SRRT	96	93.571	Vulpes_vulpes
ENSTSYG00000036426	SRRT	73	81.646	ENSXETG00000025124	srrt	96	59.441	Xenopus_tropicalis
ENSTSYG00000036426	SRRT	56	50.862	ENSXCOG00000013105	-	90	51.078	Xiphophorus_couchianus
ENSTSYG00000036426	SRRT	96	52.605	ENSXMAG00000002090	-	96	52.927	Xiphophorus_maculatus
ENSTSYG00000036426	SRRT	83	75.108	ENSXMAG00000007627	srrt	85	75.108	Xiphophorus_maculatus