EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSTTRG00000000209 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: TNPO1
Alias: IPO2|KPNB2|MIP|MIP1|TRN
Full Name: transportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Tursiops_truncatus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 70318 bases
Position: chrGeneScaffold_366:30037-100354
Accession: 6401
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSTTRP00000000194	IBN_N	PF03810.19	3.4e-15	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSTTRT00000000208	TNPO1-201	2697	-	ENSTTRP00000000194	898 (aa)	-	UPI00018B6C0E

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	81.503	ENSTTRG00000005443	TNPO2	96	81.503

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	95.906	ENSG00000083312	TNPO1	96	95.906	Homo_sapiens
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	90.292	ENSAPOG00000003453	tnpo1	96	90.292	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	94.902	ENSAMEG00000007147	TNPO1	95	95.017	Ailuropoda_melanoleuca
ENSTTRG00000000209	TNPO1	82	93.099	ENSACIG00000003711	tnpo1	95	93.099	Amphilophus_citrinellus
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	90.409	ENSAOCG00000008154	tnpo1	96	90.409	Amphiprion_ocellaris
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	90.409	ENSAPEG00000001112	tnpo1	96	90.409	Amphiprion_percula
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	90.058	ENSATEG00000010408	tnpo1	96	90.058	Anabas_testudineus
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	90.708	ENSAPLG00000009619	-	96	90.360	Anas_platyrhynchos
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	93.099	ENSACAG00000009599	TNPO1	96	93.099	Anolis_carolinensis
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	95.439	ENSANAG00000022453	-	95	95.439	Aotus_nancymaae
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	62.053	ENSANAG00000027118	-	97	61.938	Aotus_nancymaae
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	87.251	ENSANAG00000025351	-	95	87.251	Aotus_nancymaae
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	88.070	ENSACLG00000027223	tnpo1	96	88.070	Astatotilapia_calliptera
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	89.382	ENSAMXG00000009842	tnpo1	96	89.032	Astyanax_mexicanus
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	95.789	ENSBTAG00000007979	TNPO1	95	95.789	Bos_taurus
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	95.556	ENSCJAG00000016409	TNPO1	95	95.556	Callithrix_jacchus
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	95.683	ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	95.683	Canis_familiaris
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	92.749	ENSCAFG00020017397	TNPO1	96	92.749	Canis_lupus_dingo
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	95.673	ENSCHIG00000023462	TNPO1	95	95.673	Capra_hircus
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	94.386	ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	94.386	Carlito_syrichta
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	95.439	ENSCCAG00000026472	TNPO1	96	95.439	Cebus_capucinus
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	95.906	ENSCATG00000043792	TNPO1	96	95.906	Cercocebus_atys
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	95.439	ENSCLAG00000016191	TNPO1	96	95.439	Chinchilla_lanigera
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	95.906	ENSCSAG00000015616	TNPO1	95	95.906	Chlorocebus_sabaeus
ENSTTRG00000000209	TNPO1	82	88.859	ENSCHOG00000001746	TNPO1	87	88.859	Choloepus_hoffmanni
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	94.152	ENSCPBG00000000260	TNPO1	91	94.152	Chrysemys_picta_bellii
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	72.093	ENSCSAVG00000010981	-	96	72.093	Ciona_savignyi
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	95.906	ENSCANG00000004353	TNPO1	95	95.906	Colobus_angolensis_palliatus
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	95.556	ENSCGRG00001016580	Tnpo1	95	95.556	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	95.556	ENSCGRG00000010366	Tnpo1	100	95.556	Cricetulus_griseus_crigri
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	89.006	ENSCSEG00000012674	tnpo1	96	89.006	Cynoglossus_semilaevis
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	89.708	ENSCVAG00000001010	tnpo1	96	89.708	Cyprinodon_variegatus
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	89.252	ENSDARG00000035390	tnpo1	96	88.902	Danio_rerio
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	89.394	ENSDNOG00000006647	TNPO1	96	89.394	Dasypus_novemcinctus
ENSTTRG00000000209	TNPO1	92	95.663	ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	95.657	Dipodomys_ordii
ENSTTRG00000000209	TNPO1	93	57.623	FBgn0035693	CG8219	96	57.143	Drosophila_melanogaster
ENSTTRG00000000209	TNPO1	82	86.891	ENSETEG00000017805	TNPO1	85	86.891	Echinops_telfairi
ENSTTRG00000000209	TNPO1	94	81.548	ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	81.667	Eptatretus_burgeri
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	95.906	ENSEASG00005018055	TNPO1	96	95.906	Equus_asinus_asinus
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	95.789	ENSECAG00000024424	TNPO1	95	95.789	Equus_caballus
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	83.126	ENSELUG00000002821	tnpo1	96	82.673	Esox_lucius
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	95.906	ENSFCAG00000013181	TNPO1	96	95.906	Felis_catus
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	93.801	ENSFALG00000010292	TNPO1	96	93.801	Ficedula_albicollis
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	95.556	ENSFDAG00000013345	TNPO1	95	95.556	Fukomys_damarensis
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	90.070	ENSFHEG00000019234	tnpo1	96	90.070	Fundulus_heteroclitus
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	86.480	ENSGMOG00000000347	tnpo1	96	86.480	Gadus_morhua
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	93.216	ENSGALG00000015014	TNPO1	96	93.216	Gallus_gallus
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	88.798	ENSGAFG00000000943	tnpo1	96	88.798	Gambusia_affinis
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	89.591	ENSGACG00000015841	tnpo1	96	89.591	Gasterosteus_aculeatus
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	93.918	ENSGAGG00000013419	TNPO1	96	93.918	Gopherus_agassizii
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	81.214	ENSGGOG00000022535	-	95	81.214	Gorilla_gorilla
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	95.906	ENSGGOG00000026800	TNPO1	96	95.906	Gorilla_gorilla
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	89.708	ENSHBUG00000008068	tnpo1	96	89.708	Haplochromis_burtoni
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	95.205	ENSHGLG00000000970	-	95	95.205	Heterocephalus_glaber_female
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	95.205	ENSHGLG00100017090	-	99	95.205	Heterocephalus_glaber_male
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	74.122	ENSHGLG00100000963	-	98	73.536	Heterocephalus_glaber_male
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	95.673	ENSJJAG00000010244	Tnpo1	93	95.673	Jaculus_jaculus
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	89.942	ENSKMAG00000018195	tnpo1	96	89.942	Kryptolebias_marmoratus
ENSTTRG00000000209	TNPO1	83	93.001	ENSLBEG00000009521	tnpo1	89	93.001	Labrus_bergylta
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	85.565	ENSLACG00000012199	TNPO1	99	85.565	Latimeria_chalumnae
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	91.696	ENSLOCG00000011092	tnpo1	93	91.696	Lepisosteus_oculatus
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	95.673	ENSLAFG00000011796	TNPO1	99	95.673	Loxodonta_africana
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	95.906	ENSMFAG00000003636	TNPO1	95	95.906	Macaca_fascicularis
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	95.789	ENSMMUG00000020923	TNPO1	96	95.789	Macaca_mulatta
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	95.906	ENSMNEG00000044581	TNPO1	95	95.906	Macaca_nemestrina
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	95.906	ENSMLEG00000030740	TNPO1	95	95.906	Mandrillus_leucophaeus
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	90.058	ENSMAMG00000001357	tnpo1	96	90.058	Mastacembelus_armatus
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	89.474	ENSMZEG00005004913	tnpo1	96	89.474	Maylandia_zebra
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	95.556	ENSMAUG00000020550	Tnpo1	95	95.556	Mesocricetus_auratus
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	91.579	ENSMICG00000008468	TNPO1	95	91.579	Microcebus_murinus
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	95.556	ENSMOCG00000009301	Tnpo1	95	95.556	Microtus_ochrogaster
ENSTTRG00000000209	TNPO1	82	92.848	ENSMMOG00000005551	tnpo1	95	92.848	Mola_mola
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	90.638	ENSMODG00000001721	TNPO1	77	90.638	Monodelphis_domestica
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	88.889	ENSMALG00000009782	tnpo1	96	88.889	Monopterus_albus
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	95.322	MGP_CAROLIEiJ_G0018826	Tnpo1	94	99.212	Mus_caroli
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	95.556	ENSMUSG00000009470	Tnpo1	94	99.474	Mus_musculus
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	95.439	MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	94	99.343	Mus_pahari
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	95.322	MGP_SPRETEiJ_G0019708	Tnpo1	94	99.212	Mus_spretus
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	95.789	ENSMPUG00000014387	TNPO1	95	95.789	Mustela_putorius_furo
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	95.227	ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	95.227	Myotis_lucifugus
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	95.673	ENSNGAG00000021263	Tnpo1	96	95.673	Nannospalax_galili
ENSTTRG00000000209	TNPO1	82	92.963	ENSNBRG00000009998	tnpo1	95	92.963	Neolamprologus_brichardi
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	95.906	ENSNLEG00000004572	TNPO1	96	95.906	Nomascus_leucogenys
ENSTTRG00000000209	TNPO1	86	93.662	ENSOPRG00000012390	TNPO1	86	93.662	Ochotona_princeps
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	95.205	ENSODEG00000001771	TNPO1	95	95.205	Octodon_degus
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	88.966	ENSONIG00000011151	tnpo1	95	88.966	Oreochromis_niloticus
ENSTTRG00000000209	TNPO1	91	93.780	ENSOANG00000015785	TNPO1	100	93.780	Ornithorhynchus_anatinus
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	89.136	ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	88.551	Oryctolagus_cuniculus
ENSTTRG00000000209	TNPO1	82	92.828	ENSORLG00000003182	tnpo1	95	92.828	Oryzias_latipes
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	89.357	ENSORLG00020011559	tnpo1	96	89.357	Oryzias_latipes_hni
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	89.474	ENSORLG00015019113	tnpo1	96	89.474	Oryzias_latipes_hsok
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	89.357	ENSOMEG00000014567	tnpo1	96	89.357	Oryzias_melastigma
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	95.906	ENSOGAG00000000808	TNPO1	95	95.906	Otolemur_garnettii
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	95.789	ENSOARG00000005038	TNPO1	80	95.789	Ovis_aries
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	95.906	ENSPPAG00000042518	TNPO1	95	95.906	Pan_paniscus
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	95.906	ENSPPRG00000022336	TNPO1	96	95.906	Panthera_pardus
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	95.906	ENSPTIG00000018839	TNPO1	96	95.906	Panthera_tigris_altaica
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	95.906	ENSPTRG00000016972	TNPO1	95	95.906	Pan_troglodytes
ENSTTRG00000000209	TNPO1	83	88.333	ENSPTRG00000047731	-	93	88.333	Pan_troglodytes
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	95.906	ENSPANG00000006074	TNPO1	95	95.906	Papio_anubis
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	87.018	ENSPKIG00000019795	tnpo1	96	87.018	Paramormyrops_kingsleyae
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	93.801	ENSPSIG00000014366	TNPO1	95	93.801	Pelodiscus_sinensis
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	87.033	ENSPMGG00000017014	tnpo1	96	87.150	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	95.556	ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	95.556	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	94.503	ENSPCIG00000026080	TNPO1	96	94.503	Phascolarctos_cinereus
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	89.627	ENSPFOG00000011447	tnpo1	96	89.627	Poecilia_formosa
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	89.627	ENSPLAG00000018696	tnpo1	96	89.627	Poecilia_latipinna
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	89.825	ENSPMEG00000024121	tnpo1	96	89.825	Poecilia_mexicana
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	89.732	ENSPREG00000020705	tnpo1	96	89.732	Poecilia_reticulata
ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	95.789	ENSPPYG00000015545	TNPO1	95	95.789	Pongo_abelii
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