EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSTTRG00000001484 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: POLR2E
Alias: RPABC1|RPB5|XAP4|hRPB25|hsRPB5
Full Name: RNA polymerase II subunit E
Gene Type: protein_coding
Species: Tursiops_truncatus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 6902 bases
Position: chrGeneScaffold_3283:195776-202677
Accession: 9192
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSTTRP00000001400	RNA_pol_Rpb5_N	PF03871.14	8.8e-34	1	1
ENSTTRP00000001400	RNA_pol_Rpb5_C	PF01191.19	3.5e-35	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSTTRT00000001484	POLR2E-201	633	-	ENSTTRP00000001400	210 (aa)	-	UPI00018B64BC

Gene Model

Click here to download ENSTTRG00000001484's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSTTRG00000001484's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	99.048	ENSG00000099817	POLR2E	100	99.048	Homo_sapiens
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	95.238	ENSAPOG00000002935	polr2eb	100	95.238	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	99.524	ENSAMEG00000003159	POLR2E	100	99.524	Ailuropoda_melanoleuca
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	82.857	ENSACIG00000024371	polr2eb	100	82.857	Amphilophus_citrinellus
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	95.238	ENSAOCG00000018166	polr2eb	100	95.238	Amphiprion_ocellaris
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	95.238	ENSAPEG00000009000	polr2eb	100	95.238	Amphiprion_percula
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	95.238	ENSATEG00000023760	polr2eb	100	95.238	Anabas_testudineus
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	99.524	ENSANAG00000038488	POLR2E	100	99.524	Aotus_nancymaae
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	95.714	ENSACLG00000005254	polr2eb	100	95.714	Astatotilapia_calliptera
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	95.714	ENSAMXG00000018915	POLR2E	100	95.714	Astyanax_mexicanus
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	99.524	ENSBTAG00000020776	POLR2E	100	99.524	Bos_taurus
ENSTTRG00000001484	POLR2E	99	77.404	WBGene00019246	rpb-5	99	77.404	Caenorhabditis_elegans
ENSTTRG00000001484	POLR2E	67	95.714	ENSCJAG00000007666	-	77	95.714	Callithrix_jacchus
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	96.190	ENSCAFG00000019546	POLR2E	100	96.190	Canis_familiaris
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	99.524	ENSCAFG00020017111	POLR2E	100	99.524	Canis_lupus_dingo
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	99.524	ENSCHIG00000014151	POLR2E	100	99.524	Capra_hircus
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	80.930	ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	80.930	Carlito_syrichta
ENSTTRG00000001484	POLR2E	91	100.000	ENSCAPG00000010843	POLR2E	93	100.000	Cavia_aperea
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	99.524	ENSCPOG00000001542	POLR2E	100	99.524	Cavia_porcellus
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	99.524	ENSCCAG00000025658	POLR2E	100	99.524	Cebus_capucinus
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	99.524	ENSCATG00000008926	POLR2E	100	99.524	Cercocebus_atys
ENSTTRG00000001484	POLR2E	98	76.098	ENSCLAG00000009238	-	100	76.098	Chinchilla_lanigera
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	99.048	ENSCLAG00000014874	-	100	99.048	Chinchilla_lanigera
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	99.524	ENSCSAG00000012336	POLR2E	100	99.524	Chlorocebus_sabaeus
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	99.048	ENSCPBG00000009702	POLR2E	100	99.048	Chrysemys_picta_bellii
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	85.714	ENSCING00000024933	-	99	85.714	Ciona_intestinalis
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	99.524	ENSCANG00000025560	POLR2E	100	99.524	Colobus_angolensis_palliatus
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	98.571	ENSCGRG00001022927	Polr2e	100	98.571	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	92.093	ENSCGRG00000016441	Polr2e	100	92.093	Cricetulus_griseus_crigri
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	94.286	ENSCSEG00000007107	polr2eb	92	94.286	Cynoglossus_semilaevis
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	95.238	ENSCVAG00000019940	polr2eb	100	95.238	Cyprinodon_variegatus
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	94.286	ENSDARG00000026183	polr2eb	100	94.286	Danio_rerio
ENSTTRG00000001484	POLR2E	90	99.474	ENSDNOG00000044994	POLR2E	84	99.474	Dasypus_novemcinctus
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	99.524	ENSDORG00000001154	Polr2e	100	99.524	Dipodomys_ordii
ENSTTRG00000001484	POLR2E	99	85.167	FBgn0033571	Rpb5	99	85.167	Drosophila_melanogaster
ENSTTRG00000001484	POLR2E	75	91.083	ENSEBUG00000010159	-	76	91.083	Eptatretus_burgeri
ENSTTRG00000001484	POLR2E	69	93.793	ENSEASG00005021615	POLR2E	67	87.654	Equus_asinus_asinus
ENSTTRG00000001484	POLR2E	91	98.429	ENSECAG00000011124	POLR2E	100	86.667	Equus_caballus
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	93.810	ENSELUG00000005815	POLR2E	100	93.810	Esox_lucius
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	92.857	ENSELUG00000020646	polr2e	100	92.857	Esox_lucius
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	99.048	ENSFCAG00000007318	POLR2E	100	99.048	Felis_catus
ENSTTRG00000001484	POLR2E	91	99.479	ENSFALG00000013986	POLR2E	99	99.479	Ficedula_albicollis
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	99.524	ENSFDAG00000014539	POLR2E	100	99.524	Fukomys_damarensis
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	95.238	ENSFHEG00000022398	polr2eb	100	95.238	Fundulus_heteroclitus
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	93.810	ENSGMOG00000007615	polr2eb	100	93.810	Gadus_morhua
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	99.048	ENSGALG00000002591	POLR2E	100	99.048	Gallus_gallus
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	95.714	ENSGAFG00000005087	polr2eb	100	95.714	Gambusia_affinis
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	93.810	ENSGACG00000013247	polr2eb	100	93.810	Gasterosteus_aculeatus
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	99.048	ENSGAGG00000008356	POLR2E	100	99.048	Gopherus_agassizii
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	99.524	ENSGGOG00000011267	POLR2E	100	99.524	Gorilla_gorilla
ENSTTRG00000001484	POLR2E	68	90.141	ENSHBUG00000011099	polr2eb	100	90.141	Haplochromis_burtoni
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	98.571	ENSHGLG00000013330	POLR2E	100	98.571	Heterocephalus_glaber_female
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	98.571	ENSHGLG00100011014	POLR2E	100	98.571	Heterocephalus_glaber_male
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	93.810	ENSHCOG00000000906	polr2eb	100	93.810	Hippocampus_comes
ENSTTRG00000001484	POLR2E	53	91.964	ENSHCOG00000012099	-	88	91.964	Hippocampus_comes
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	95.238	ENSIPUG00000019801	polr2e	100	95.238	Ictalurus_punctatus
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	99.524	ENSSTOG00000002853	POLR2E	100	99.524	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSTTRG00000001484	POLR2E	77	80.745	ENSJJAG00000015812	-	100	80.745	Jaculus_jaculus
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	98.571	ENSJJAG00000016595	-	100	98.571	Jaculus_jaculus
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	79.524	ENSJJAG00000003145	-	100	79.524	Jaculus_jaculus
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	95.238	ENSKMAG00000005954	polr2eb	100	95.238	Kryptolebias_marmoratus
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	95.238	ENSLBEG00000024802	polr2eb	100	95.238	Labrus_bergylta
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	95.238	ENSLACG00000013686	POLR2E	100	95.238	Latimeria_chalumnae
ENSTTRG00000001484	POLR2E	77	96.296	ENSLOCG00000004599	POLR2E	100	96.296	Lepisosteus_oculatus
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	79.717	ENSLAFG00000025587	POLR2E	100	79.717	Loxodonta_africana
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	99.524	ENSMFAG00000002884	POLR2E	100	99.524	Macaca_fascicularis
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	99.524	ENSMMUG00000013927	POLR2E	100	99.524	Macaca_mulatta
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	65.877	ENSMNEG00000033452	-	100	65.877	Macaca_nemestrina
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	99.524	ENSMNEG00000034046	-	100	99.524	Macaca_nemestrina
ENSTTRG00000001484	POLR2E	92	81.347	ENSMLEG00000012405	POLR2E	94	81.347	Mandrillus_leucophaeus
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	95.238	ENSMAMG00000018703	polr2eb	100	95.238	Mastacembelus_armatus
ENSTTRG00000001484	POLR2E	90	95.263	ENSMZEG00005010796	polr2eb	96	95.263	Maylandia_zebra
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	97.630	ENSMGAG00000003769	POLR2E	100	97.630	Meleagris_gallopavo
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	67.619	ENSMAUG00000011003	-	100	67.619	Mesocricetus_auratus
ENSTTRG00000001484	POLR2E	92	98.446	ENSMAUG00000010125	-	100	98.953	Mesocricetus_auratus
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	99.524	ENSMICG00000013063	POLR2E	100	99.524	Microcebus_murinus
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	98.571	ENSMOCG00000013414	Polr2e	100	98.571	Microtus_ochrogaster
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	80.952	ENSMMOG00000001161	polr2eb	100	80.952	Mola_mola
ENSTTRG00000001484	POLR2E	91	86.387	ENSMMOG00000001167	polr2eb	88	86.387	Mola_mola
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	99.048	ENSMODG00000005494	POLR2E	100	99.048	Monodelphis_domestica
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	95.714	ENSMALG00000021888	polr2eb	100	95.714	Monopterus_albus
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	98.571	MGP_CAROLIEiJ_G0015561	Polr2e	100	98.571	Mus_caroli
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	98.571	ENSMUSG00000004667	Polr2e	100	98.571	Mus_musculus
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	98.571	MGP_PahariEiJ_G0030974	Polr2e	100	98.571	Mus_pahari
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	98.571	MGP_SPRETEiJ_G0016379	Polr2e	100	98.571	Mus_spretus
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	98.571	ENSMPUG00000008953	POLR2E	100	98.571	Mustela_putorius_furo
ENSTTRG00000001484	POLR2E	66	93.478	ENSMLUG00000006376	-	100	82.099	Myotis_lucifugus
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	99.524	ENSMLUG00000013193	POLR2E	100	99.524	Myotis_lucifugus
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	98.571	ENSNGAG00000001147	Polr2e	100	98.571	Nannospalax_galili
ENSTTRG00000001484	POLR2E	85	73.743	ENSNGAG00000017344	-	96	73.743	Nannospalax_galili
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	82.857	ENSNBRG00000022772	polr2eb	100	82.857	Neolamprologus_brichardi
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	95.735	ENSNLEG00000001207	-	100	95.735	Nomascus_leucogenys
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	75.714	ENSNLEG00000031364	-	100	75.714	Nomascus_leucogenys
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	86.667	ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	86.667	Ochotona_princeps
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	71.905	ENSODEG00000011490	-	100	71.905	Octodon_degus
ENSTTRG00000001484	POLR2E	89	88.172	ENSODEG00000007985	-	100	88.172	Octodon_degus
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	99.524	ENSODEG00000013230	-	100	99.524	Octodon_degus
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	95.238	ENSONIG00000002519	polr2eb	100	95.238	Oreochromis_niloticus
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	95.714	ENSORLG00000015346	polr2eb	100	95.714	Oryzias_latipes
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	95.714	ENSORLG00020020700	polr2e	100	95.714	Oryzias_latipes_hni
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	95.714	ENSORLG00015016842	polr2e	100	95.714	Oryzias_latipes_hsok
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	95.238	ENSOMEG00000002709	polr2eb	100	95.238	Oryzias_melastigma
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	99.524	ENSOGAG00000012311	POLR2E	100	99.524	Otolemur_garnettii
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	99.524	ENSOARG00000010994	POLR2E	100	99.524	Ovis_aries
ENSTTRG00000001484	POLR2E	91	100.000	ENSPPAG00000003145	POLR2E	100	100.000	Pan_paniscus
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	99.048	ENSPPRG00000000777	POLR2E	100	99.048	Panthera_pardus
ENSTTRG00000001484	POLR2E	91	77.604	ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	94.079	Panthera_tigris_altaica
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	99.524	ENSPTRG00000010183	POLR2E	100	99.524	Pan_troglodytes
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	99.524	ENSPANG00000018011	POLR2E	100	99.524	Papio_anubis
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	94.286	ENSPKIG00000024123	POLR2E	100	94.286	Paramormyrops_kingsleyae
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	94.286	ENSPKIG00000009607	POLR2E	100	94.286	Paramormyrops_kingsleyae
ENSTTRG00000001484	POLR2E	98	95.122	ENSPSIG00000002870	POLR2E	99	95.122	Pelodiscus_sinensis
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	82.381	ENSPMGG00000014354	polr2eb	100	82.381	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	98.571	ENSPEMG00000023261	Polr2e	100	98.571	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSTTRG00000001484	POLR2E	90	98.942	ENSPCIG00000007312	POLR2E	75	98.942	Phascolarctos_cinereus
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	95.714	ENSPFOG00000005734	polr2eb	100	95.714	Poecilia_formosa
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	95.714	ENSPLAG00000014496	polr2eb	100	95.714	Poecilia_latipinna
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	95.714	ENSPMEG00000008053	polr2eb	100	95.714	Poecilia_mexicana
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	95.714	ENSPREG00000006489	polr2eb	100	95.714	Poecilia_reticulata
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	91.943	ENSPPYG00000009305	POLR2E	100	91.943	Pongo_abelii
ENSTTRG00000001484	POLR2E	53	100.000	ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	100.000	Procavia_capensis
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	99.524	ENSPCOG00000014491	POLR2E	100	99.524	Propithecus_coquereli
ENSTTRG00000001484	POLR2E	65	100.000	ENSPVAG00000007718	-	65	100.000	Pteropus_vampyrus
ENSTTRG00000001484	POLR2E	90	95.263	ENSPNYG00000019797	polr2eb	96	95.263	Pundamilia_nyererei
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	95.238	ENSPNAG00000026263	POLR2E	100	95.238	Pygocentrus_nattereri
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	98.571	ENSRNOG00000013545	Polr2e	100	98.571	Rattus_norvegicus
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	73.460	ENSRBIG00000027259	-	100	73.460	Rhinopithecus_bieti
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	99.524	ENSRBIG00000028726	-	100	99.524	Rhinopithecus_bieti
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	99.524	ENSRROG00000043763	POLR2E	100	99.524	Rhinopithecus_roxellana
ENSTTRG00000001484	POLR2E	99	43.119	YBR154C	RPB5	98	43.119	Saccharomyces_cerevisiae
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	99.524	ENSSBOG00000027241	POLR2E	100	99.524	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	99.048	ENSSHAG00000010690	POLR2E	100	99.048	Sarcophilus_harrisii
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	95.238	ENSSFOG00015006073	polr2e	100	95.238	Scleropages_formosus
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	95.238	ENSSMAG00000012782	polr2eb	100	95.238	Scophthalmus_maximus
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	95.238	ENSSDUG00000003352	polr2eb	100	95.238	Seriola_dumerili
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	95.238	ENSSLDG00000004965	polr2eb	100	95.238	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	97.619	ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	97.619	Sphenodon_punctatus
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	95.238	ENSSPAG00000017556	polr2eb	100	95.238	Stegastes_partitus
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	99.524	ENSSSCG00000021472	POLR2E	100	99.524	Sus_scrofa
ENSTTRG00000001484	POLR2E	66	89.286	ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	89.286	Taeniopygia_guttata
ENSTTRG00000001484	POLR2E	96	91.045	ENSTRUG00000018238	polr2eb	100	82.381	Takifugu_rubripes
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	95.238	ENSTNIG00000013187	polr2eb	100	95.238	Tetraodon_nigroviridis
ENSTTRG00000001484	POLR2E	92	96.392	ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	86.190	Ursus_americanus
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	99.524	ENSVVUG00000022818	POLR2E	54	99.524	Vulpes_vulpes
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	97.143	ENSXETG00000003291	polr2e	100	97.143	Xenopus_tropicalis
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	82.857	ENSXCOG00000009197	polr2eb	100	82.857	Xiphophorus_couchianus
ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	95.714	ENSXMAG00000026495	polr2eb	100	95.714	Xiphophorus_maculatus