EuRBPDB

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Description

Ensembl ID: ENSTTRG00000002033 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: SMARCA2
Alias: BAF190|BRM|SNF2|SNF2L2|SNF2LA|SWI2|Sth1p|hBRM|hSNF2a
Full Name: SWI/SNF related%2C matrix associated%2C actin dependent regulator of chromatin%2C subfamily a%2C member 2
Gene Type: protein_coding
Species: Tursiops_truncatus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 160503 bases
Position: chrGeneScaffold_341:83537-244039
Accession: 11098
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSTTRP00000001909	ResIII	PF04851.15	9.7e-09	1	1
ENSTTRP00000001909	BRK	PF07533.16	1.4e-17	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSTTRT00000002033	SMARCA2-201	4722	-	ENSTTRP00000001909	1573 (aa)	-	UPI00018B6F72

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	92	73.367	ENSTTRG00000009519	SMARCA4	93	73.338

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	100	93.648	ENSG00000080503	SMARCA2	99	99.441	Homo_sapiens
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	95	80.274	ENSAPOG00000002641	SMARCA2	97	79.663	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	90	88.381	ENSAMEG00000012325	SMARCA2	100	95.227	Ailuropoda_melanoleuca
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	95	80.528	ENSACIG00000015607	SMARCA2	93	80.582	Amphilophus_citrinellus
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	95	80.452	ENSAOCG00000009647	-	93	79.947	Amphiprion_ocellaris
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	95	80.144	ENSAPEG00000007646	SMARCA2	96	79.418	Amphiprion_percula
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	95	80.536	ENSATEG00000006916	SMARCA2	92	80.628	Anabas_testudineus
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	89	89.099	ENSAPLG00000013873	SMARCA2	94	88.571	Anas_platyrhynchos
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	95	90.654	ENSACAG00000002423	SMARCA2	95	90.120	Anolis_carolinensis
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	100	93.636	ENSANAG00000026498	SMARCA2	100	93.636	Aotus_nancymaae
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	95	81.304	ENSACLG00000004248	SMARCA2	92	80.486	Astatotilapia_calliptera
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	95	82.399	ENSAMXG00000012404	smarca2	93	82.782	Astyanax_mexicanus
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	100	94.219	ENSBTAG00000007494	SMARCA2	100	94.219	Bos_taurus
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	100	92.844	ENSCJAG00000010710	SMARCA2	99	96.222	Callithrix_jacchus
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	100	94.857	ENSCAFG00000002013	SMARCA2	100	94.857	Canis_familiaris
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	76	94.357	ENSCAFG00020026802	SMARCA2	96	94.357	Canis_lupus_dingo
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	100	95.362	ENSCHIG00000025863	SMARCA2	100	95.362	Capra_hircus
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	100	92.969	ENSTSYG00000003858	SMARCA2	100	92.969	Carlito_syrichta
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	95	91.229	ENSCAPG00000002890	SMARCA2	95	92.027	Cavia_aperea
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	95	95.282	ENSCPOG00000005475	SMARCA2	95	95.349	Cavia_porcellus
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	100	93.640	ENSCCAG00000030636	SMARCA2	100	93.640	Cebus_capucinus
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	100	93.561	ENSCATG00000031470	SMARCA2	99	94.978	Cercocebus_atys
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	95	95.364	ENSCLAG00000014484	SMARCA2	94	95.497	Chinchilla_lanigera
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	94	95.755	ENSCSAG00000008650	SMARCA2	99	95.755	Chlorocebus_sabaeus
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	87	91.840	ENSCHOG00000004316	SMARCA2	87	91.840	Choloepus_hoffmanni
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	95	91.573	ENSCPBG00000025463	SMARCA2	95	90.826	Chrysemys_picta_bellii
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	100	94.069	ENSCANG00000039597	SMARCA2	98	96.989	Colobus_angolensis_palliatus
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	95	88.255	ENSCGRG00001002323	Smarca2	95	88.652	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	95	77.255	ENSCSEG00000019311	SMARCA2	92	76.835	Cynoglossus_semilaevis
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	83	79.551	ENSCVAG00000016571	SMARCA2	95	79.247	Cyprinodon_variegatus
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	95	82.244	ENSDARG00000008904	smarca2	93	82.373	Danio_rerio
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	95	93.989	ENSDNOG00000006402	SMARCA2	95	94.320	Dasypus_novemcinctus
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	95	95.554	ENSDORG00000014832	Smarca2	95	95.687	Dipodomys_ordii
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	94	70.498	ENSEBUG00000011442	-	94	69.959	Eptatretus_burgeri
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	86	62.491	ENSEBUG00000002449	-	95	63.827	Eptatretus_burgeri
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	100	93.651	ENSEASG00005010312	SMARCA2	100	93.651	Equus_asinus_asinus
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	64	90.698	ENSEEUG00000015540	-	66	90.698	Erinaceus_europaeus
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	93	79.122	ENSELUG00000010318	smarca2	95	79.351	Esox_lucius
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	100	94.603	ENSFCAG00000001568	SMARCA2	100	94.603	Felis_catus
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	95	91.175	ENSFALG00000010416	SMARCA2	95	90.975	Ficedula_albicollis
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	95	94.863	ENSFDAG00000010502	SMARCA2	94	94.663	Fukomys_damarensis
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	95	81.340	ENSFHEG00000021250	SMARCA2	93	80.904	Fundulus_heteroclitus
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	94	77.948	ENSGMOG00000014229	SMARCA2	93	78.840	Gadus_morhua
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	95	91.175	ENSGALG00000010164	SMARCA2	95	91.175	Gallus_gallus
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	95	75.000	ENSGAFG00000001164	SMARCA2	89	96.667	Gambusia_affinis
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	95	79.202	ENSGACG00000014488	SMARCA2	94	78.576	Gasterosteus_aculeatus
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	95	91.705	ENSGAGG00000024412	SMARCA2	95	91.639	Gopherus_agassizii
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	95	92.467	ENSGGOG00000000513	SMARCA2	100	89.823	Gorilla_gorilla
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	95	81.076	ENSHBUG00000006691	SMARCA2	93	79.747	Haplochromis_burtoni
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	95	93.272	ENSHGLG00000005215	SMARCA2	95	94.555	Heterocephalus_glaber_female
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	95	95.643	ENSHGLG00100010496	SMARCA2	95	95.643	Heterocephalus_glaber_male
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	88	75.971	ENSHCOG00000015348	-	88	86.647	Hippocampus_comes
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	95	82.021	ENSIPUG00000011060	smarca2	94	81.416	Ictalurus_punctatus
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	100	93.405	ENSSTOG00000006812	SMARCA2	100	93.405	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	95	95.554	ENSJJAG00000010867	Smarca2	94	95.421	Jaculus_jaculus
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	95	79.315	ENSKMAG00000015844	-	93	79.521	Kryptolebias_marmoratus
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	92	84.973	ENSLOCG00000011499	smarca2	93	85.068	Lepisosteus_oculatus
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	95	92.171	ENSLAFG00000014061	SMARCA2	95	93.610	Loxodonta_africana
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	95	95.542	ENSMFAG00000003814	SMARCA2	99	94.535	Macaca_fascicularis
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	100	94.136	ENSMMUG00000015279	SMARCA2	100	94.136	Macaca_mulatta
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	100	93.577	ENSMNEG00000041069	SMARCA2	99	95.438	Macaca_nemestrina
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	95	94.341	ENSMLEG00000027418	SMARCA2	99	93.831	Mandrillus_leucophaeus
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	95	80.414	ENSMAMG00000003056	SMARCA2	97	80.896	Mastacembelus_armatus
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	95	81.304	ENSMZEG00005020709	SMARCA2	93	79.973	Maylandia_zebra
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	75	77.556	ENSMGAG00000005160	-	100	76.494	Meleagris_gallopavo
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	100	94.374	ENSMICG00000005162	SMARCA2	99	95.777	Microcebus_murinus
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	95	94.894	ENSMOCG00000001611	Smarca2	95	94.894	Microtus_ochrogaster
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	95	78.506	ENSMMOG00000014196	SMARCA2	93	79.945	Mola_mola
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	95	92.634	ENSMODG00000003578	SMARCA2	95	91.607	Monodelphis_domestica
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	95	80.813	ENSMALG00000009611	SMARCA2	92	80.136	Monopterus_albus
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	95	94.539	MGP_CAROLIEiJ_G0022841	Smarca2	95	94.342	Mus_caroli
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	95	94.536	ENSMUSG00000024921	Smarca2	99	99.441	Mus_musculus
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	95	94.653	MGP_PahariEiJ_G0014334	Smarca2	95	94.521	Mus_pahari
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	95	87.632	MGP_SPRETEiJ_G0023759	Smarca2	95	94.079	Mus_spretus
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	81	95.082	ENSMPUG00000005171	SMARCA2	94	95.082	Mustela_putorius_furo
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	96	89.635	ENSMLUG00000002342	SMARCA2	96	89.635	Myotis_lucifugus
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	95	95.127	ENSNGAG00000000108	Smarca2	95	94.793	Nannospalax_galili
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	87	70.774	ENSNBRG00000017998	SMARCA2	94	83.085	Neolamprologus_brichardi
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	95	93.671	ENSNLEG00000008575	SMARCA2	98	92.060	Nomascus_leucogenys
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	93	88.231	ENSMEUG00000009812	SMARCA2	93	88.299	Notamacropus_eugenii
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	95	88.177	ENSOPRG00000013474	SMARCA2	95	88.150	Ochotona_princeps
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	95	94.789	ENSODEG00000005452	SMARCA2	94	94.858	Octodon_degus
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	95	79.780	ENSONIG00000014163	SMARCA2	93	79.947	Oreochromis_niloticus
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	95	93.795	ENSOCUG00000006320	SMARCA2	95	93.421	Oryctolagus_cuniculus
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	95	79.974	ENSORLG00000020820	SMARCA2	99	77.605	Oryzias_latipes
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	95	80.157	ENSORLG00015006289	SMARCA2	99	77.145	Oryzias_latipes_hsok
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	95	81.025	ENSOMEG00000009736	-	95	80.331	Oryzias_melastigma
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	95	92.549	ENSOGAG00000017053	SMARCA2	95	92.549	Otolemur_garnettii
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	100	92.644	ENSOARG00000013265	SMARCA2	100	92.644	Ovis_aries
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	100	89.297	ENSPPAG00000038717	SMARCA2	99	92.711	Pan_paniscus
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	100	94.667	ENSPPRG00000001879	SMARCA2	100	94.667	Panthera_pardus
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	100	92.835	ENSPTRG00000051168	SMARCA2	98	96.636	Pan_troglodytes
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	95	89.536	ENSPANG00000025121	SMARCA2	95	89.655	Papio_anubis
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	95	83.845	ENSPKIG00000018469	-	95	83.757	Paramormyrops_kingsleyae
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	95	90.993	ENSPSIG00000006284	SMARCA2	95	89.928	Pelodiscus_sinensis
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	93	76.558	ENSPMGG00000013696	-	93	76.987	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	95	94.371	ENSPEMG00000019821	Smarca2	95	94.305	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	94	71.949	ENSPMAG00000005337	-	94	71.587	Petromyzon_marinus
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	95	93.293	ENSPCIG00000015658	SMARCA2	95	93.360	Phascolarctos_cinereus
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	95	80.052	ENSPFOG00000001856	SMARCA2	93	79.577	Poecilia_formosa
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	95	79.471	ENSPLAG00000017829	SMARCA2	92	78.663	Poecilia_latipinna
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	95	79.522	ENSPMEG00000001815	-	93	79.577	Poecilia_mexicana
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	95	79.600	ENSPREG00000013800	SMARCA2	93	79.590	Poecilia_reticulata
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	95	94.681	ENSPPYG00000019258	SMARCA2	95	95.146	Pongo_abelii
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	71	100.000	ENSPCAG00000016969	SMARCA2	71	100.000	Procavia_capensis
ENSTTRG00000002033	SMARCA2	95	94.333	ENSPCOG00000025709	SMARCA2	99	93.553	Propithecus_coquereli
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ENSTTRG00000002033	SMARCA2	95	77.712	ENSPNYG00000004533	SMARCA2	92	77.110	Pundamilia_nyererei
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