EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSTTRG00000003550 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: SYF2
Alias: CBPIN|DKFZp564O2082|NTC31|fSAP29|p29
Full Name: SYF2 pre-mRNA splicing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Tursiops_truncatus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 5586 bases
Position: chrscaffold_99354:158386-163971
Accession: 19824
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSTTRP00000003329	SYF2	PF08231.12	2.2e-54	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSTTRT00000003551	SYF2-201	735	-	ENSTTRP00000003329	244 (aa)	-	UPI00018B6302

Gene Model

Click here to download ENSTTRG00000003550's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSTTRG00000003550's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSTTRG00000003550	SYF2	100	92.623	ENSG00000117614	SYF2	100	92.213	Homo_sapiens
ENSTTRG00000003550	SYF2	91	83.784	ENSAPOG00000001174	syf2	91	84.722	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTTRG00000003550	SYF2	80	97.436	ENSAMEG00000010134	-	100	97.436	Ailuropoda_melanoleuca
ENSTTRG00000003550	SYF2	99	92.975	ENSAMEG00000010115	-	99	92.975	Ailuropoda_melanoleuca
ENSTTRG00000003550	SYF2	99	75.502	ENSACIG00000023688	syf2	86	81.860	Amphilophus_citrinellus
ENSTTRG00000003550	SYF2	100	79.098	ENSAOCG00000022046	syf2	92	85.185	Amphiprion_ocellaris
ENSTTRG00000003550	SYF2	92	78.125	ENSAOCG00000010912	syf2	69	77.232	Amphiprion_ocellaris
ENSTTRG00000003550	SYF2	99	79.668	ENSAPEG00000018858	syf2	92	78.838	Amphiprion_percula
ENSTTRG00000003550	SYF2	89	82.488	ENSATEG00000007745	syf2	91	82.870	Anabas_testudineus
ENSTTRG00000003550	SYF2	82	88.945	ENSAPLG00000016435	SYF2	99	88.500	Anas_platyrhynchos
ENSTTRG00000003550	SYF2	84	85.294	ENSACAG00000013653	-	100	85.294	Anolis_carolinensis
ENSTTRG00000003550	SYF2	68	76.048	ENSACAG00000026777	-	94	76.433	Anolis_carolinensis
ENSTTRG00000003550	SYF2	100	93.443	ENSANAG00000032473	SYF2	100	92.623	Aotus_nancymaae
ENSTTRG00000003550	SYF2	91	80.180	ENSACLG00000019916	syf2	97	74.897	Astatotilapia_calliptera
ENSTTRG00000003550	SYF2	100	76.639	ENSAMXG00000004051	syf2	100	76.230	Astyanax_mexicanus
ENSTTRG00000003550	SYF2	100	96.327	ENSBTAG00000001651	SYF2	100	97.458	Bos_taurus
ENSTTRG00000003550	SYF2	85	50.952	WBGene00019402	syf-2	90	50.711	Caenorhabditis_elegans
ENSTTRG00000003550	SYF2	100	93.033	ENSCJAG00000046570	SYF2	100	92.623	Callithrix_jacchus
ENSTTRG00000003550	SYF2	100	94.309	ENSCAFG00000012895	-	100	94.309	Canis_familiaris
ENSTTRG00000003550	SYF2	93	88.106	ENSCAFG00000030331	-	100	82.377	Canis_familiaris
ENSTTRG00000003550	SYF2	100	94.309	ENSCAFG00020021091	-	100	94.309	Canis_lupus_dingo
ENSTTRG00000003550	SYF2	74	89.011	ENSCAFG00020021094	-	83	97.436	Canis_lupus_dingo
ENSTTRG00000003550	SYF2	100	95.902	ENSCHIG00000020874	SYF2	99	97.059	Capra_hircus
ENSTTRG00000003550	SYF2	100	93.033	ENSTSYG00000005114	SYF2	100	93.033	Carlito_syrichta
ENSTTRG00000003550	SYF2	81	96.970	ENSCAPG00000010006	SYF2	100	96.970	Cavia_aperea
ENSTTRG00000003550	SYF2	100	91.393	ENSCPOG00000005326	SYF2	100	91.393	Cavia_porcellus
ENSTTRG00000003550	SYF2	100	93.852	ENSCCAG00000022459	SYF2	100	93.033	Cebus_capucinus
ENSTTRG00000003550	SYF2	100	92.213	ENSCATG00000026917	SYF2	100	91.393	Cercocebus_atys
ENSTTRG00000003550	SYF2	100	93.469	ENSCLAG00000008474	SYF2	100	92.245	Chinchilla_lanigera
ENSTTRG00000003550	SYF2	100	92.213	ENSCSAG00000000948	SYF2	100	91.393	Chlorocebus_sabaeus
ENSTTRG00000003550	SYF2	74	77.348	ENSCHOG00000005273	-	100	77.348	Choloepus_hoffmanni
ENSTTRG00000003550	SYF2	92	89.333	ENSCPBG00000025073	SYF2	87	89.352	Chrysemys_picta_bellii
ENSTTRG00000003550	SYF2	86	53.991	ENSCING00000003017	-	89	53.521	Ciona_intestinalis
ENSTTRG00000003550	SYF2	86	51.643	ENSCSAVG00000006627	-	97	51.643	Ciona_savignyi
ENSTTRG00000003550	SYF2	100	80.328	ENSCANG00000037322	SYF2	100	79.508	Colobus_angolensis_palliatus
ENSTTRG00000003550	SYF2	100	91.803	ENSCGRG00001020733	Syf2	100	91.803	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSTTRG00000003550	SYF2	80	94.898	ENSCGRG00000005095	Syf2	96	94.472	Cricetulus_griseus_crigri
ENSTTRG00000003550	SYF2	89	77.982	ENSCSEG00000000117	syf2	90	78.605	Cynoglossus_semilaevis
ENSTTRG00000003550	SYF2	91	81.448	ENSCVAG00000019543	syf2	90	81.944	Cyprinodon_variegatus
ENSTTRG00000003550	SYF2	95	78.814	ENSDARG00000004706	syf2	91	82.870	Danio_rerio
ENSTTRG00000003550	SYF2	100	93.878	ENSDNOG00000047605	SYF2	100	93.878	Dasypus_novemcinctus
ENSTTRG00000003550	SYF2	100	90.984	ENSDORG00000001274	Syf2	100	90.984	Dipodomys_ordii
ENSTTRG00000003550	SYF2	89	56.818	FBgn0033556	CG12343	96	56.422	Drosophila_melanogaster
ENSTTRG00000003550	SYF2	94	77.391	ENSETEG00000015729	SYF2	100	77.391	Echinops_telfairi
ENSTTRG00000003550	SYF2	81	60.406	ENSEBUG00000015402	syf2	95	60.406	Eptatretus_burgeri
ENSTTRG00000003550	SYF2	100	83.197	ENSEASG00005004232	-	100	83.197	Equus_asinus_asinus
ENSTTRG00000003550	SYF2	100	94.694	ENSEASG00005004224	-	100	94.694	Equus_asinus_asinus
ENSTTRG00000003550	SYF2	98	94.979	ENSECAG00000010440	-	100	94.979	Equus_caballus
ENSTTRG00000003550	SYF2	100	95.102	ENSECAG00000012023	-	100	95.102	Equus_caballus
ENSTTRG00000003550	SYF2	75	83.060	ENSEEUG00000015084	SYF2	100	83.060	Erinaceus_europaeus
ENSTTRG00000003550	SYF2	100	78.776	ENSELUG00000003465	syf2	99	78.776	Esox_lucius
ENSTTRG00000003550	SYF2	100	94.286	ENSFCAG00000010324	-	85	93.878	Felis_catus
ENSTTRG00000003550	SYF2	100	93.496	ENSFCAG00000043095	-	100	93.496	Felis_catus
ENSTTRG00000003550	SYF2	84	85.294	ENSFALG00000000460	SYF2	88	84.722	Ficedula_albicollis
ENSTTRG00000003550	SYF2	100	93.443	ENSFDAG00000008310	SYF2	100	92.623	Fukomys_damarensis
ENSTTRG00000003550	SYF2	91	66.518	ENSFHEG00000007238	syf2	96	67.281	Fundulus_heteroclitus
ENSTTRG00000003550	SYF2	89	82.569	ENSGMOG00000019138	syf2	96	83.721	Gadus_morhua
ENSTTRG00000003550	SYF2	92	88.444	ENSGALG00000013639	SYF2	100	81.746	Gallus_gallus
ENSTTRG00000003550	SYF2	100	74.180	ENSGAFG00000019435	syf2	91	80.556	Gambusia_affinis
ENSTTRG00000003550	SYF2	88	82.791	ENSGACG00000007305	syf2	99	76.860	Gasterosteus_aculeatus
ENSTTRG00000003550	SYF2	92	89.778	ENSGAGG00000010670	SYF2	99	84.211	Gopherus_agassizii
ENSTTRG00000003550	SYF2	100	93.033	ENSGGOG00000012796	SYF2	100	92.623	Gorilla_gorilla
ENSTTRG00000003550	SYF2	93	78.541	ENSHBUG00000020477	syf2	93	81.944	Haplochromis_burtoni
ENSTTRG00000003550	SYF2	99	92.593	ENSHGLG00000014393	SYF2	99	91.358	Heterocephalus_glaber_female
ENSTTRG00000003550	SYF2	92	83.036	ENSHGLG00000004304	-	90	81.944	Heterocephalus_glaber_female
ENSTTRG00000003550	SYF2	99	92.593	ENSHGLG00100014722	SYF2	99	91.358	Heterocephalus_glaber_male
ENSTTRG00000003550	SYF2	98	77.178	ENSHCOG00000012904	syf2	70	83.256	Hippocampus_comes
ENSTTRG00000003550	SYF2	99	78.008	ENSIPUG00000019859	syf2	91	84.259	Ictalurus_punctatus
ENSTTRG00000003550	SYF2	60	95.890	ENSSTOG00000023984	SYF2	100	95.890	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSTTRG00000003550	SYF2	82	96.482	ENSJJAG00000013301	Syf2	94	96.482	Jaculus_jaculus
ENSTTRG00000003550	SYF2	93	79.310	ENSKMAG00000013856	syf2	97	76.446	Kryptolebias_marmoratus
ENSTTRG00000003550	SYF2	90	82.648	ENSLBEG00000014425	syf2	99	77.178	Labrus_bergylta
ENSTTRG00000003550	SYF2	89	85.780	ENSLACG00000012064	SYF2	91	86.111	Latimeria_chalumnae
ENSTTRG00000003550	SYF2	99	78.838	ENSLOCG00000002728	syf2	86	84.259	Lepisosteus_oculatus
ENSTTRG00000003550	SYF2	100	93.469	ENSLAFG00000023150	-	100	93.469	Loxodonta_africana
ENSTTRG00000003550	SYF2	75	65.217	ENSLAFG00000030814	-	100	65.217	Loxodonta_africana
ENSTTRG00000003550	SYF2	100	92.623	ENSMFAG00000041831	SYF2	100	91.803	Macaca_fascicularis
ENSTTRG00000003550	SYF2	100	92.213	ENSMMUG00000002968	SYF2	100	91.803	Macaca_mulatta
ENSTTRG00000003550	SYF2	100	92.623	ENSMNEG00000030180	SYF2	100	91.803	Macaca_nemestrina
ENSTTRG00000003550	SYF2	100	92.213	ENSMLEG00000030248	SYF2	100	91.393	Mandrillus_leucophaeus
ENSTTRG00000003550	SYF2	100	73.770	ENSMAMG00000010403	syf2	100	73.770	Mastacembelus_armatus
ENSTTRG00000003550	SYF2	99	75.934	ENSMZEG00005006429	syf2	97	74.897	Maylandia_zebra
ENSTTRG00000003550	SYF2	82	88.945	ENSMGAG00000002019	SYF2	100	88.945	Meleagris_gallopavo
ENSTTRG00000003550	SYF2	100	91.393	ENSMAUG00000018974	Syf2	100	91.393	Mesocricetus_auratus
ENSTTRG00000003550	SYF2	82	96.482	ENSMICG00000016191	SYF2	100	96.482	Microcebus_murinus
ENSTTRG00000003550	SYF2	100	92.623	ENSMOCG00000022938	Syf2	100	92.623	Microtus_ochrogaster
ENSTTRG00000003550	SYF2	91	78.829	ENSMMOG00000002396	syf2	90	79.630	Mola_mola
ENSTTRG00000003550	SYF2	93	87.773	ENSMODG00000013951	-	95	88.991	Monodelphis_domestica
ENSTTRG00000003550	SYF2	100	75.510	ENSMALG00000010706	syf2	90	82.488	Monopterus_albus
ENSTTRG00000003550	SYF2	100	91.803	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	100	91.803	Mus_caroli
ENSTTRG00000003550	SYF2	100	91.803	ENSMUSG00000028821	Syf2	100	91.803	Mus_musculus
ENSTTRG00000003550	SYF2	100	91.803	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	100	91.803	Mus_pahari
ENSTTRG00000003550	SYF2	100	91.803	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	100	91.803	Mus_spretus
ENSTTRG00000003550	SYF2	100	94.715	ENSMPUG00000015802	-	100	94.715	Mustela_putorius_furo
ENSTTRG00000003550	SYF2	98	93.750	ENSMPUG00000015801	-	100	93.089	Mustela_putorius_furo
ENSTTRG00000003550	SYF2	98	91.667	ENSMLUG00000001885	SYF2	98	91.667	Myotis_lucifugus
ENSTTRG00000003550	SYF2	100	92.683	ENSNGAG00000007912	Syf2	100	92.683	Nannospalax_galili
ENSTTRG00000003550	SYF2	99	69.421	ENSNBRG00000010720	syf2	91	73.239	Neolamprologus_brichardi
ENSTTRG00000003550	SYF2	100	93.033	ENSNLEG00000035185	SYF2	100	92.623	Nomascus_leucogenys
ENSTTRG00000003550	SYF2	100	92.213	ENSOPRG00000012870	SYF2	100	92.213	Ochotona_princeps
ENSTTRG00000003550	SYF2	100	83.265	ENSODEG00000014338	-	99	84.034	Octodon_degus
ENSTTRG00000003550	SYF2	99	91.358	ENSODEG00000017664	-	99	91.358	Octodon_degus
ENSTTRG00000003550	SYF2	91	80.180	ENSONIG00000008213	syf2	97	74.897	Oreochromis_niloticus
ENSTTRG00000003550	SYF2	83	90.594	ENSOANG00000009552	SYF2	100	90.594	Ornithorhynchus_anatinus
ENSTTRG00000003550	SYF2	99	94.239	ENSOCUG00000013050	SYF2	99	94.239	Oryctolagus_cuniculus
ENSTTRG00000003550	SYF2	97	78.059	ENSORLG00000028820	syf2	93	83.333	Oryzias_latipes
ENSTTRG00000003550	SYF2	91	81.532	ENSORLG00020018333	syf2	91	83.333	Oryzias_latipes_hni
ENSTTRG00000003550	SYF2	97	77.637	ENSORLG00015014665	syf2	91	83.333	Oryzias_latipes_hsok
ENSTTRG00000003550	SYF2	99	77.686	ENSOMEG00000013911	syf2	91	83.796	Oryzias_melastigma
ENSTTRG00000003550	SYF2	100	93.469	ENSOGAG00000009962	SYF2	100	92.245	Otolemur_garnettii
ENSTTRG00000003550	SYF2	80	66.667	ENSOARG00000006269	-	100	66.667	Ovis_aries
ENSTTRG00000003550	SYF2	100	95.547	ENSOARG00000006348	-	100	95.547	Ovis_aries
ENSTTRG00000003550	SYF2	100	93.033	ENSPPAG00000036579	SYF2	100	92.623	Pan_paniscus
ENSTTRG00000003550	SYF2	100	93.496	ENSPPRG00000001651	-	100	93.496	Panthera_pardus
ENSTTRG00000003550	SYF2	99	94.672	ENSPPRG00000001638	-	99	94.262	Panthera_pardus
ENSTTRG00000003550	SYF2	91	97.309	ENSPTIG00000005711	-	81	97.309	Panthera_tigris_altaica
ENSTTRG00000003550	SYF2	100	93.496	ENSPTIG00000007036	-	100	93.496	Panthera_tigris_altaica
ENSTTRG00000003550	SYF2	100	93.033	ENSPTRG00000000352	SYF2	100	92.623	Pan_troglodytes
ENSTTRG00000003550	SYF2	100	92.623	ENSPANG00000008139	SYF2	100	91.803	Papio_anubis
ENSTTRG00000003550	SYF2	100	77.959	ENSPKIG00000008130	syf2	92	84.259	Paramormyrops_kingsleyae
ENSTTRG00000003550	SYF2	95	86.580	ENSPSIG00000011816	SYF2	84	88.889	Pelodiscus_sinensis
ENSTTRG00000003550	SYF2	97	76.695	ENSPMGG00000008755	syf2	84	81.944	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSTTRG00000003550	SYF2	100	92.623	ENSPEMG00000008283	Syf2	100	92.623	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSTTRG00000003550	SYF2	92	93.750	ENSPCIG00000014235	SYF2	100	87.200	Phascolarctos_cinereus
ENSTTRG00000003550	SYF2	100	74.590	ENSPFOG00000004116	syf2	99	74.180	Poecilia_formosa
ENSTTRG00000003550	SYF2	97	76.793	ENSPLAG00000006691	syf2	100	76.371	Poecilia_latipinna
ENSTTRG00000003550	SYF2	99	73.029	ENSPMEG00000011684	syf2	99	72.614	Poecilia_mexicana
ENSTTRG00000003550	SYF2	89	81.019	ENSPREG00000003009	syf2	99	75.104	Poecilia_reticulata
ENSTTRG00000003550	SYF2	100	93.443	ENSPPYG00000001713	SYF2	100	92.623	Pongo_abelii
ENSTTRG00000003550	SYF2	100	64.344	ENSPCOG00000027011	SYF2	100	63.934	Propithecus_coquereli
ENSTTRG00000003550	SYF2	100	82.041	ENSPVAG00000005841	SYF2	100	82.041	Pteropus_vampyrus
ENSTTRG00000003550	SYF2	91	80.180	ENSPNYG00000004979	syf2	97	74.897	Pundamilia_nyererei
ENSTTRG00000003550	SYF2	100	78.689	ENSPNAG00000015570	syf2	100	77.869	Pygocentrus_nattereri
ENSTTRG00000003550	SYF2	100	91.803	ENSRNOG00000060597	Syf2	100	91.803	Rattus_norvegicus
ENSTTRG00000003550	SYF2	100	90.574	ENSRBIG00000042970	SYF2	100	89.754	Rhinopithecus_bieti
ENSTTRG00000003550	SYF2	100	92.623	ENSRROG00000001347	SYF2	100	91.803	Rhinopithecus_roxellana
ENSTTRG00000003550	SYF2	100	92.213	ENSSBOG00000020184	SYF2	100	91.803	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSTTRG00000003550	SYF2	84	93.204	ENSSHAG00000007152	-	100	93.204	Sarcophilus_harrisii
ENSTTRG00000003550	SYF2	93	92.070	ENSSHAG00000015630	-	87	93.519	Sarcophilus_harrisii
ENSTTRG00000003550	SYF2	100	77.049	ENSSFOG00015023647	syf2	91	84.259	Scleropages_formosus
ENSTTRG00000003550	SYF2	99	77.178	ENSSMAG00000009867	syf2	99	76.763	Scophthalmus_maximus
ENSTTRG00000003550	SYF2	89	83.028	ENSSDUG00000013072	syf2	91	83.333	Seriola_dumerili
ENSTTRG00000003550	SYF2	89	83.028	ENSSLDG00000012677	syf2	91	83.333	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSTTRG00000003550	SYF2	100	75.000	ENSSARG00000012889	SYF2	100	75.000	Sorex_araneus
ENSTTRG00000003550	SYF2	99	82.645	ENSSPUG00000005251	SYF2	96	82.645	Sphenodon_punctatus
ENSTTRG00000003550	SYF2	100	76.639	ENSSPAG00000009626	syf2	91	83.333	Stegastes_partitus
ENSTTRG00000003550	SYF2	100	95.918	ENSSSCG00000037481	SYF2	100	95.918	Sus_scrofa
ENSTTRG00000003550	SYF2	61	59.603	ENSTGUG00000001126	SYF2	80	60.870	Taeniopygia_guttata
ENSTTRG00000003550	SYF2	100	73.770	ENSTRUG00000001499	syf2	86	81.395	Takifugu_rubripes
ENSTTRG00000003550	SYF2	91	78.475	ENSTNIG00000016912	syf2	97	80.093	Tetraodon_nigroviridis
ENSTTRG00000003550	SYF2	100	71.721	ENSTBEG00000017370	SYF2	99	69.672	Tupaia_belangeri
ENSTTRG00000003550	SYF2	100	93.496	ENSUAMG00000002897	SYF2	100	93.496	Ursus_americanus
ENSTTRG00000003550	SYF2	100	93.902	ENSUMAG00000013108	SYF2	100	93.902	Ursus_maritimus
ENSTTRG00000003550	SYF2	100	95.492	ENSVPAG00000005705	SYF2	100	95.492	Vicugna_pacos
ENSTTRG00000003550	SYF2	100	90.726	ENSVVUG00000027181	-	100	90.726	Vulpes_vulpes
ENSTTRG00000003550	SYF2	100	94.309	ENSVVUG00000027175	-	100	94.309	Vulpes_vulpes
ENSTTRG00000003550	SYF2	93	84.649	ENSXETG00000022797	syf2	87	86.111	Xenopus_tropicalis
ENSTTRG00000003550	SYF2	88	80.930	ENSXMAG00000022698	syf2	91	80.556	Xiphophorus_maculatus