EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSTTRG00000005931 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: SKIV2L
Alias: 170A|DDX13|HLP|SKI2W|SKIV2|SKIV2L1
Full Name: Ski2 like RNA helicase
Gene Type: protein_coding
Species: Tursiops_truncatus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 9862 bases
Position: chrGeneScaffold_3469:37830-47691
Accession: 10898
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSTTRP00000005610	rRNA_proc-arch	PF13234.6	6.1e-41	1	1
ENSTTRP00000005610	DEAD	PF00270.29	7.2e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSTTRT00000005932	SKIV2L-201	3633	-	ENSTTRP00000005610	1210 (aa)	-	UPI00018B63A0

Gene Model

Click here to download ENSTTRG00000005931's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSTTRG00000005931's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	76	34.259	ENSTTRG00000008678	MTREX	89	34.259

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	100	89.727	ENSG00000204351	SKIV2L	98	95.506	Homo_sapiens
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	99	57.540	ENSAPOG00000008257	skiv2l	99	57.751	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	100	90.610	ENSAMEG00000002078	SKIV2L	100	90.610	Ailuropoda_melanoleuca
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	99	56.250	ENSACIG00000016719	skiv2l	99	56.210	Amphilophus_citrinellus
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	99	57.063	ENSAOCG00000017352	skiv2l	99	57.200	Amphiprion_ocellaris
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	99	56.905	ENSAPEG00000001055	skiv2l	99	57.120	Amphiprion_percula
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	99	56.746	ENSATEG00000007601	skiv2l	99	56.661	Anabas_testudineus
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	99	61.901	ENSACAG00000011746	SKIV2L	100	62.559	Anolis_carolinensis
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	100	90.369	ENSANAG00000037992	SKIV2L	100	90.369	Aotus_nancymaae
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	99	57.607	ENSACLG00000006886	skiv2l	99	57.522	Astatotilapia_calliptera
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	98	55.404	ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	55.396	Astyanax_mexicanus
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	100	91.011	ENSBTAG00000005587	SKIV2L	100	91.011	Bos_taurus
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	96	36.776	WBGene00008502	skih-2	99	36.620	Caenorhabditis_elegans
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	100	89.727	ENSCJAG00000002263	SKIV2L	100	89.727	Callithrix_jacchus
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	100	89.968	ENSCAFG00000000679	SKIV2L	100	89.968	Canis_familiaris
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	100	89.968	ENSCAFG00020000948	SKIV2L	100	89.968	Canis_lupus_dingo
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	100	91.091	ENSCHIG00000012897	SKIV2L	100	91.091	Capra_hircus
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	100	89.727	ENSTSYG00000012133	SKIV2L	100	89.727	Carlito_syrichta
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	100	88.122	ENSCPOG00000001307	SKIV2L	100	88.122	Cavia_porcellus
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	100	90.369	ENSCCAG00000026206	SKIV2L	100	90.369	Cebus_capucinus
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	100	89.807	ENSCATG00000036901	SKIV2L	100	89.807	Cercocebus_atys
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	100	88.764	ENSCLAG00000007678	SKIV2L	100	88.764	Chinchilla_lanigera
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	100	89.727	ENSCSAG00000008988	SKIV2L	100	89.727	Chlorocebus_sabaeus
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	86	64.912	ENSCPBG00000000343	SKIV2L	96	64.912	Chrysemys_picta_bellii
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	93	47.413	ENSCING00000005576	-	99	47.328	Ciona_intestinalis
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	99	89.960	ENSCANG00000039709	SKIV2L	100	89.960	Colobus_angolensis_palliatus
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	100	88.613	ENSCGRG00001008385	Skiv2l	100	88.613	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	99	57.052	ENSCSEG00000011326	skiv2l	98	56.820	Cynoglossus_semilaevis
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	99	57.302	ENSCVAG00000003072	skiv2l	99	57.063	Cyprinodon_variegatus
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	99	56.522	ENSDARG00000062206	skiv2l	99	56.410	Danio_rerio
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	100	83.347	ENSDNOG00000037590	SKIV2L	100	83.814	Dasypus_novemcinctus
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	93	41.162	FBgn0039117	tst	97	41.176	Drosophila_melanogaster
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	70	87.302	ENSETEG00000009522	SKIV2L	70	89.189	Echinops_telfairi
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	89	52.654	ENSEBUG00000013680	-	95	53.003	Eptatretus_burgeri
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	93	90.534	ENSEASG00005015534	SKIV2L	100	90.534	Equus_asinus_asinus
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	95	90.000	ENSECAG00000021823	SKIV2L	96	90.000	Equus_caballus
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	56	89.223	ENSEEUG00000005049	SKIV2L	57	89.223	Erinaceus_europaeus
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	99	56.443	ENSELUG00000000181	skiv2l	94	61.634	Esox_lucius
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	100	90.690	ENSFCAG00000004519	SKIV2L	100	90.690	Felis_catus
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	100	85.886	ENSFDAG00000009438	SKIV2L	100	85.806	Fukomys_damarensis
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	99	57.278	ENSFHEG00000008853	skiv2l	99	57.257	Fundulus_heteroclitus
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	99	55.635	ENSGMOG00000005926	skiv2l	98	55.601	Gadus_morhua
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	77	56.691	ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	57.158	Gallus_gallus
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	99	57.403	ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	57.223	Gambusia_affinis
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	99	56.508	ENSGACG00000002927	skiv2l	98	56.567	Gasterosteus_aculeatus
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	100	89.486	ENSGGOG00000002270	SKIV2L	100	89.486	Gorilla_gorilla
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	99	57.448	ENSHBUG00000000726	skiv2l	99	57.361	Haplochromis_burtoni
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	100	86.939	ENSHGLG00000016596	SKIV2L	100	87.099	Heterocephalus_glaber_female
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	100	84.455	ENSHGLG00100014161	SKIV2L	100	84.615	Heterocephalus_glaber_male
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	98	56.306	ENSHCOG00000007191	skiv2l	100	56.225	Hippocampus_comes
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	99	55.450	ENSIPUG00000016263	skiv2l	100	55.413	Ictalurus_punctatus
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	100	89.406	ENSSTOG00000014596	SKIV2L	100	89.406	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	66	59.952	ENSLACG00000002986	-	66	60.202	Latimeria_chalumnae
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	100	88.844	ENSLAFG00000014231	SKIV2L	100	88.844	Loxodonta_africana
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	100	90.128	ENSMFAG00000034235	SKIV2L	100	90.128	Macaca_fascicularis
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	100	90.048	ENSMMUG00000000736	SKIV2L	100	90.048	Macaca_mulatta
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	100	90.048	ENSMNEG00000044474	SKIV2L	100	90.048	Macaca_nemestrina
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	100	89.888	ENSMLEG00000030512	SKIV2L	100	89.888	Mandrillus_leucophaeus
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	99	57.256	ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	57.315	Mastacembelus_armatus
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	99	57.528	ENSMZEG00005026415	skiv2l	99	57.442	Maylandia_zebra
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	69	47.379	ENSMGAG00000001320	SKIV2L	97	46.356	Meleagris_gallopavo
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	100	87.650	ENSMAUG00000018613	Skiv2l	100	87.901	Mesocricetus_auratus
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	100	89.647	ENSMICG00000046331	SKIV2L	100	89.647	Microcebus_murinus
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	100	87.997	ENSMOCG00000014240	Skiv2l	100	88.159	Microtus_ochrogaster
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	99	55.378	ENSMMOG00000014547	skiv2l	98	56.702	Mola_mola
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	100	83.106	ENSMODG00000015052	SKIV2L	100	83.106	Monodelphis_domestica
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	99	56.280	ENSMALG00000010535	skiv2l	98	56.225	Monopterus_albus
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	100	87.650	MGP_CAROLIEiJ_G0021477	Skiv2l	100	87.650	Mus_caroli
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	100	87.650	ENSMUSG00000040356	Skiv2l	100	87.650	Mus_musculus
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	100	87.570	MGP_PahariEiJ_G0020472	Skiv2l	100	87.570	Mus_pahari
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	100	87.249	MGP_SPRETEiJ_G0022382	Skiv2l	100	87.249	Mus_spretus
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	100	90.289	ENSMPUG00000010567	SKIV2L	100	90.289	Mustela_putorius_furo
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	100	89.165	ENSMLUG00000000628	SKIV2L	100	89.165	Myotis_lucifugus
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	99	56.778	ENSNBRG00000018650	skiv2l	98	56.728	Neolamprologus_brichardi
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	98	86.471	ENSNLEG00000006451	SKIV2L	99	86.553	Nomascus_leucogenys
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	74	92.035	ENSMEUG00000006072	SKIV2L	72	92.035	Notamacropus_eugenii
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	100	88.844	ENSOPRG00000003972	SKIV2L	100	88.844	Ochotona_princeps
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	100	87.400	ENSODEG00000017516	SKIV2L	100	87.400	Octodon_degus
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	99	57.928	ENSONIG00000013500	skiv2l	99	58.219	Oreochromis_niloticus
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	100	89.888	ENSOCUG00000007019	SKIV2L	100	89.888	Oryctolagus_cuniculus
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	99	57.911	ENSORLG00000002021	skiv2l	99	57.590	Oryzias_latipes
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	99	57.911	ENSORLG00020009462	skiv2l	99	57.590	Oryzias_latipes_hni
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	99	57.561	ENSORLG00015016750	skiv2l	99	57.430	Oryzias_latipes_hsok
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	99	58.141	ENSOMEG00000008531	skiv2l	99	57.810	Oryzias_melastigma
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	100	89.647	ENSOGAG00000009578	SKIV2L	100	89.647	Otolemur_garnettii
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	100	85.591	ENSOARG00000002411	-	100	85.591	Ovis_aries
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	98	88.817	ENSPPAG00000040211	SKIV2L	99	88.979	Pan_paniscus
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	100	90.851	ENSPPRG00000005017	SKIV2L	100	90.851	Panthera_pardus
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	100	90.530	ENSPTIG00000021656	SKIV2L	100	90.530	Panthera_tigris_altaica
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	100	89.647	ENSPTRG00000017997	SKIV2L	100	89.647	Pan_troglodytes
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	98	88.646	ENSPANG00000011501	SKIV2L	99	88.646	Papio_anubis
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	99	56.457	ENSPKIG00000011876	skiv2l	99	56.574	Paramormyrops_kingsleyae
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	99	56.396	ENSPMGG00000019707	skiv2l	98	56.748	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	100	88.292	ENSPEMG00000019001	Skiv2l	100	88.292	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	100	83.120	ENSPCIG00000018792	SKIV2L	100	83.120	Phascolarctos_cinereus
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	99	57.358	ENSPFOG00000002424	skiv2l	99	57.177	Poecilia_formosa
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	99	57.482	ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	57.303	Poecilia_latipinna
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	99	57.437	ENSPMEG00000006997	skiv2l	99	57.257	Poecilia_mexicana
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	99	55.707	ENSPREG00000002277	skiv2l	96	61.324	Poecilia_reticulata
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	100	89.005	ENSPPYG00000016472	SKIV2L	100	89.005	Pongo_abelii
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	74	92.105	ENSPCAG00000004178	SKIV2L	75	92.105	Procavia_capensis
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	100	90.610	ENSPCOG00000010308	SKIV2L	100	90.610	Propithecus_coquereli
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	100	89.246	ENSPVAG00000005136	SKIV2L	100	89.246	Pteropus_vampyrus
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	99	55.984	ENSPNYG00000017853	skiv2l	97	61.674	Pundamilia_nyererei
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	98	56.539	ENSPNAG00000011823	skiv2l	99	56.776	Pygocentrus_nattereri
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	100	88.212	ENSRNOG00000000421	Skiv2l	100	88.212	Rattus_norvegicus
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	98	87.348	ENSRBIG00000035485	SKIV2L	99	87.348	Rhinopithecus_bieti
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	100	89.807	ENSRROG00000036429	SKIV2L	100	89.807	Rhinopithecus_roxellana
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	93	35.420	YLR398C	-	84	45.700	Saccharomyces_cerevisiae
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	100	90.048	ENSSBOG00000027920	SKIV2L	100	90.048	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	100	82.466	ENSSHAG00000008963	SKIV2L	100	81.425	Sarcophilus_harrisii
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	99	57.469	ENSSFOG00015016930	skiv2l	99	57.610	Scleropages_formosus
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	99	56.903	ENSSMAG00000020185	skiv2l	99	56.742	Scophthalmus_maximus
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	99	57.324	ENSSDUG00000019977	skiv2l	99	57.384	Seriola_dumerili
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	99	55.911	ENSSLDG00000024382	skiv2l	98	56.179	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	99	59.179	ENSSPUG00000012945	SKIV2L	98	59.055	Sphenodon_punctatus
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	94	56.940	ENSSPAG00000012904	skiv2l	98	56.743	Stegastes_partitus
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	100	91.172	ENSSSCG00000001424	SKIV2L	100	91.172	Sus_scrofa
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	85	50.503	ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	50.971	Takifugu_rubripes
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	99	55.538	ENSTNIG00000004382	skiv2l	98	55.403	Tetraodon_nigroviridis
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	94	91.365	ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	91.365	Tupaia_belangeri
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	100	90.931	ENSUAMG00000024336	SKIV2L	100	90.931	Ursus_americanus
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	93	90.534	ENSUMAG00000012666	SKIV2L	100	90.534	Ursus_maritimus
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	98	90.302	ENSVVUG00000022807	SKIV2L	98	90.302	Vulpes_vulpes
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	100	54.754	ENSXETG00000010932	skiv2l	100	54.869	Xenopus_tropicalis
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	99	57.177	ENSXCOG00000019517	skiv2l	96	57.131	Xiphophorus_couchianus
ENSTTRG00000005931	SKIV2L	99	57.007	ENSXMAG00000014079	skiv2l	99	56.822	Xiphophorus_maculatus