EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSTTRG00000006230 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: EFTUD2
Alias: SNRNP116|Snrp116|Snu114|U5-116KD
Full Name: elongation factor Tu GTP binding domain containing 2
Gene Type: protein_coding
Species: Tursiops_truncatus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 29872 bases
Position: chrGeneScaffold_1253:3408-33279
Accession: 30858
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSTTRP00000005889	GTP_EFTU	PF00009.27	1.8e-45	1	1
ENSTTRP00000005889	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	8.3e-13	1	1
ENSTTRP00000005889	EFG_IV	PF03764.18	5.7e-23	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSTTRT00000006225	EFTUD2-201	2919	-	ENSTTRP00000005889	972 (aa)	-	UPI00018B787E

Gene Model

Click here to download ENSTTRG00000006230's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSTTRG00000006230's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	87	34.937	ENSTTRG00000006776	EEF2	99	34.937
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	69	34.409	ENSTTRG00000011243	EFL1	65	34.409

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	90.947	ENSG00000108883	EFTUD2	100	100.000	Homo_sapiens
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	91	90.011	ENSAPOG00000002433	eftud2	91	90.011	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	90.947	ENSAMEG00000018390	EFTUD2	100	90.947	Ailuropoda_melanoleuca
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	91	86.039	ENSACIG00000009096	eftud2	91	86.039	Amphilophus_citrinellus
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	87	84.353	ENSAOCG00000023385	eftud2	100	84.353	Amphiprion_ocellaris
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	91	90.125	ENSAPEG00000003321	eftud2	91	90.125	Amphiprion_percula
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	91	90.352	ENSATEG00000000457	eftud2	91	90.352	Anabas_testudineus
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	99	85.685	ENSAPLG00000011036	EFTUD2	99	85.685	Anas_platyrhynchos
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	89.095	ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	89.095	Anolis_carolinensis
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	90.947	ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	90.947	Aotus_nancymaae
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	91	89.898	ENSACLG00000001296	eftud2	91	89.898	Astatotilapia_calliptera
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	91	90.465	ENSAMXG00000000568	eftud2	90	90.465	Astyanax_mexicanus
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	90.947	ENSBTAG00000013526	EFTUD2	100	90.947	Bos_taurus
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	90	67.735	WBGene00001166	eftu-2	90	67.735	Caenorhabditis_elegans
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	90.947	ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	90.947	Callithrix_jacchus
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	90.947	ENSCAFG00000014065	EFTUD2	100	90.947	Canis_familiaris
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	90.947	ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	90.947	Canis_lupus_dingo
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	90.947	ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	90.947	Capra_hircus
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	90.638	ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	90.638	Carlito_syrichta
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	90.535	ENSCAPG00000014639	EFTUD2	100	90.535	Cavia_aperea
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	90.535	ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	90.535	Cavia_porcellus
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	90.947	ENSCCAG00000035302	EFTUD2	100	90.947	Cebus_capucinus
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	90.947	ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	90.947	Cercocebus_atys
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	90.432	ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	90.432	Chinchilla_lanigera
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	90.947	ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	90.947	Chlorocebus_sabaeus
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	87	82.706	ENSCHOG00000010031	EFTUD2	95	82.706	Choloepus_hoffmanni
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	89.815	ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	89.815	Chrysemys_picta_bellii
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	70.872	ENSCING00000009372	-	91	76.131	Ciona_intestinalis
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	90	76.871	ENSCSAVG00000004985	-	99	76.179	Ciona_savignyi
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	90.947	ENSCANG00000026557	EFTUD2	100	90.947	Colobus_angolensis_palliatus
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	90.947	ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	90.947	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	90.947	ENSCGRG00000003825	Eftud2	100	90.947	Cricetulus_griseus_crigri
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	91	89.444	ENSCSEG00000016775	eftud2	91	89.444	Cynoglossus_semilaevis
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	91	90.238	ENSCVAG00000012537	eftud2	91	90.238	Cyprinodon_variegatus
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	91	89.557	ENSDARG00000012261	eftud2	91	89.557	Danio_rerio
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	90.329	ENSDNOG00000008033	EFTUD2	100	90.329	Dasypus_novemcinctus
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	90.741	ENSDORG00000011566	Eftud2	100	90.741	Dipodomys_ordii
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	93	80.000	FBgn0039566	CG4849	90	73.243	Drosophila_melanogaster
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	86	94.286	ENSETEG00000005678	EFTUD2	86	94.286	Echinops_telfairi
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	76	83.221	ENSEBUG00000004047	-	96	82.476	Eptatretus_burgeri
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	90.947	ENSEASG00005010321	EFTUD2	100	90.947	Equus_asinus_asinus
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	90.844	ENSECAG00000019363	EFTUD2	93	90.844	Equus_caballus
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	83	100.000	ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	91	89.217	ENSELUG00000017169	eftud2	91	89.217	Esox_lucius
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	90.947	ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	90.947	Felis_catus
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	89.403	ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	89.403	Ficedula_albicollis
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	90.741	ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	90.741	Fukomys_damarensis
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	91	90.238	ENSFHEG00000013479	eftud2	91	90.238	Fundulus_heteroclitus
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	91	89.444	ENSGMOG00000014277	eftud2	100	83.539	Gadus_morhua
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	89.403	ENSGALG00000000988	EFTUD2	95	95.119	Gallus_gallus
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	91	90.125	ENSGAFG00000002263	eftud2	91	90.125	Gambusia_affinis
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	91	89.444	ENSGACG00000009163	eftud2	91	89.444	Gasterosteus_aculeatus
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	90.947	ENSGGOG00000012999	EFTUD2	100	90.947	Gorilla_gorilla
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	91	89.898	ENSHBUG00000023546	eftud2	91	89.898	Haplochromis_burtoni
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	90.535	ENSHGLG00000014497	EFTUD2	100	90.535	Heterocephalus_glaber_female
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	90.535	ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	90.535	Heterocephalus_glaber_male
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	91	89.330	ENSHCOG00000017689	eftud2	91	89.330	Hippocampus_comes
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	91	90.011	ENSIPUG00000023182	Eftud2	91	90.011	Ictalurus_punctatus
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	94	100.000	ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	100.000	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	91	96.368	ENSJJAG00000018268	Eftud2	94	96.368	Jaculus_jaculus
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	91	89.330	ENSKMAG00000021027	eftud2	91	89.330	Kryptolebias_marmoratus
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	87	88.941	ENSLBEG00000005875	eftud2	100	88.941	Labrus_bergylta
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	91	92.168	ENSLACG00000012918	EFTUD2	91	92.168	Latimeria_chalumnae
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	91	90.579	ENSLOCG00000011460	eftud2	91	90.579	Lepisosteus_oculatus
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	90.741	ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	90.741	Loxodonta_africana
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	90.947	ENSMFAG00000042655	EFTUD2	100	90.947	Macaca_fascicularis
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	90.947	ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	Macaca_mulatta
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	90.947	ENSMNEG00000037895	EFTUD2	100	90.947	Macaca_nemestrina
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	90.947	ENSMLEG00000032960	EFTUD2	100	90.947	Mandrillus_leucophaeus
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	91	90.352	ENSMAMG00000022190	eftud2	91	90.352	Mastacembelus_armatus
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	91	89.898	ENSMZEG00005022885	eftud2	91	89.898	Maylandia_zebra
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	89.425	ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	89.425	Meleagris_gallopavo
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	90.844	ENSMAUG00000021178	Eftud2	100	90.844	Mesocricetus_auratus
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	90.947	ENSMICG00000016592	EFTUD2	100	90.947	Microcebus_murinus
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	90.947	ENSMOCG00000009039	-	100	90.947	Microtus_ochrogaster
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	92	72.697	ENSMOCG00000017653	-	90	72.697	Microtus_ochrogaster
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	87	90.118	ENSMMOG00000020811	eftud2	100	90.118	Mola_mola
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	90.638	ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	90.638	Monodelphis_domestica
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	87	88.353	ENSMALG00000014501	eftud2	100	88.353	Monopterus_albus
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	90.844	MGP_CAROLIEiJ_G0017263	Eftud2	100	90.844	Mus_caroli
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	90.844	ENSMUSG00000020929	Eftud2	94	100.000	Mus_musculus
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	90.844	MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	90.844	Mus_pahari
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	90.844	MGP_SPRETEiJ_G0018106	Eftud2	100	90.844	Mus_spretus
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	97	90.572	ENSMPUG00000009136	EFTUD2	90	90.572	Mustela_putorius_furo
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	90.947	ENSMLUG00000012164	EFTUD2	99	90.947	Myotis_lucifugus
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	90.947	ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	90.947	Nannospalax_galili
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	91	89.784	ENSNBRG00000020081	eftud2	91	89.784	Neolamprologus_brichardi
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	87	96.235	ENSNLEG00000005210	EFTUD2	91	100.000	Nomascus_leucogenys
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	86.934	ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	86.934	Notamacropus_eugenii
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	82.613	ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	82.613	Ochotona_princeps
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	90.432	ENSODEG00000018041	-	100	90.432	Octodon_degus
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	83	78.305	ENSODEG00000003385	-	100	78.305	Octodon_degus
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	91	89.898	ENSONIG00000000912	eftud2	91	89.898	Oreochromis_niloticus
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	90.947	ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	90.947	Oryctolagus_cuniculus
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	91	89.671	ENSORLG00000003109	eftud2	91	89.671	Oryzias_latipes
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	91	89.671	ENSORLG00020009865	eftud2	91	89.671	Oryzias_latipes_hni
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	91	89.671	ENSORLG00015002611	eftud2	96	89.671	Oryzias_latipes_hsok
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	90	95.057	ENSOGAG00000012918	EFTUD2	93	100.000	Otolemur_garnettii
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	90.947	ENSOARG00000009078	EFTUD2	97	90.947	Ovis_aries
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	90.947	ENSPPAG00000029450	EFTUD2	100	90.947	Pan_paniscus
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	90.947	ENSPPRG00000010981	EFTUD2	100	90.947	Panthera_pardus
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	90.947	ENSPTIG00000007703	EFTUD2	100	90.947	Panthera_tigris_altaica
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	90.947	ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	90.947	Pan_troglodytes
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	90.947	ENSPANG00000021284	EFTUD2	100	90.947	Papio_anubis
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	93	87.762	ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	87.762	Pelodiscus_sinensis
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	91	81.952	ENSPMGG00000007281	eftud2	90	81.952	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	90.947	ENSPEMG00000005129	Eftud2	100	90.947	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	90.638	ENSPCIG00000015027	EFTUD2	100	90.638	Phascolarctos_cinereus
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	91	90.125	ENSPFOG00000008515	eftud2	91	90.125	Poecilia_formosa
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	91	90.125	ENSPLAG00000010393	eftud2	91	90.125	Poecilia_latipinna
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	91	90.125	ENSPMEG00000005087	eftud2	91	90.125	Poecilia_mexicana
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	89.506	ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	89.506	Pongo_abelii
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	86.831	ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	86.831	Procavia_capensis
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	90.844	ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	90.844	Propithecus_coquereli
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	88.580	ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	88.580	Pteropus_vampyrus
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	91	89.784	ENSPNYG00000012448	eftud2	91	89.784	Pundamilia_nyererei
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	91	90.238	ENSPNAG00000012490	eftud2	100	84.362	Pygocentrus_nattereri
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	91	96.254	ENSRNOG00000002818	Eftud2	94	100.000	Rattus_norvegicus
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	90.947	ENSRBIG00000043255	EFTUD2	100	90.947	Rhinopithecus_bieti
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	90.947	ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	90.947	Rhinopithecus_roxellana
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	97	31.719	YKL173W	SNU114	88	33.297	Saccharomyces_cerevisiae
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	90.947	ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	90.947	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	91	96.141	ENSSHAG00000008134	EFTUD2	94	96.141	Sarcophilus_harrisii
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	91	90.125	ENSSFOG00015023272	eftud2	91	90.125	Scleropages_formosus
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	91	89.444	ENSSMAG00000010174	eftud2	100	86.588	Scophthalmus_maximus
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	91	90.011	ENSSDUG00000022675	eftud2	91	90.011	Seriola_dumerili
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	91	90.125	ENSSLDG00000001595	eftud2	91	90.125	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	82.510	ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	82.510	Sorex_araneus
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	88.889	ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	88.889	Sphenodon_punctatus
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	91	90.011	ENSSPAG00000016235	eftud2	90	90.011	Stegastes_partitus
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	90.947	ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	90.947	Sus_scrofa
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	75	97.954	ENSTGUG00000002065	EFTUD2	89	97.954	Taeniopygia_guttata
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	91	88.990	ENSTRUG00000016422	eftud2	91	88.990	Takifugu_rubripes
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	91	84.258	ENSTNIG00000005346	eftud2	90	84.258	Tetraodon_nigroviridis
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	93	100.000	ENSTBEG00000011337	EFTUD2	93	100.000	Tupaia_belangeri
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	89.836	ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	89.836	Ursus_americanus
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	90.947	ENSUMAG00000014323	EFTUD2	100	90.947	Ursus_maritimus
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	88	100.000	ENSVPAG00000002748	EFTUD2	88	100.000	Vicugna_pacos
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	90.947	ENSVVUG00000018113	EFTUD2	100	90.947	Vulpes_vulpes
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	91	92.168	ENSXETG00000003394	eftud2	94	92.168	Xenopus_tropicalis
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	81	89.413	ENSXCOG00000017309	eftud2	96	89.413	Xiphophorus_couchianus
ENSTTRG00000006230	EFTUD2	91	90.125	ENSXMAG00000008494	eftud2	91	90.125	Xiphophorus_maculatus