EuRBPDB

  • Home
  • Cancer
  • Family
  • Species
  • RBPredictor
  • Search
  • Download
  • Submit
  • Help
  • Contact

  • Description
  • RBDs
  • Transcripts
  • Gene Model
  • PPI
  • Orthologs
Description
Ensembl ID
ENSTTRG00000006973 (Gene tree)
Gene ID
-
Gene Symbol
FTSJ3
Alias
SPB1
Full Name
FtsJ RNA methyltransferase homolog 3
Gene Type
protein_coding
Species
Tursiops_truncatus
Status
putative
Strand
Minus strand
Length
6864 bases
Position
chrGeneScaffold_3375:47008-53871
Accession
17136
RBP type
canonical RBP
Summary
-
RNA binding domains(RBDs)
Protein IDDomain Pfam IDE-value Domain number Total number
ENSTTRP00000006599FtsJPF01728.191.5e-5511
Transcripts
Transcript IDNameLengthRefSeq ID Protein IDLengthRefSeq IDUniportKB ID
ENSTTRT00000006978FTSJ3-2012502-ENSTTRP00000006599833 (aa)-UPI00018B7BA7
Gene Model
Click here to download ENSTTRG00000006973's gene model file
Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSTTRG00000006973's network
Orthologs
Ensembl IDGene SymbolCoverageIdentiy OrthologGene SymbolCoverageIdentiy Species
ENSTTRG00000006973FTSJ39886.842ENSG00000108592FTSJ3100100.000Homo_sapiens
ENSTTRG00000006973FTSJ37368.750ENSAPOG00000005543ftsj38467.654Acanthochromis_polyacanthus
ENSTTRG00000006973FTSJ310089.035ENSAMEG00000003148FTSJ39889.333Ailuropoda_melanoleuca
ENSTTRG00000006973FTSJ38568.108ENSACIG00000012880ftsj39853.571Amphilophus_citrinellus
ENSTTRG00000006973FTSJ310059.229ENSAOCG00000023196ftsj39660.261Amphiprion_ocellaris
ENSTTRG00000006973FTSJ310059.930ENSAPEG00000004250ftsj39760.024Amphiprion_percula
ENSTTRG00000006973FTSJ39258.452ENSATEG00000010069ftsj39658.018Anabas_testudineus
ENSTTRG00000006973FTSJ39261.111ENSAPLG00000010362-9860.128Anas_platyrhynchos
ENSTTRG00000006973FTSJ38863.636ENSACAG00000017930FTSJ39864.706Anolis_carolinensis
ENSTTRG00000006973FTSJ39886.867ENSANAG00000033774FTSJ39887.349Aotus_nancymaae
ENSTTRG00000006973FTSJ38468.233ENSACLG00000019137ftsj39767.978Astatotilapia_calliptera
ENSTTRG00000006973FTSJ39961.111ENSAMXG00000021571ftsj39462.098Astyanax_mexicanus
ENSTTRG00000006973FTSJ39890.557ENSBTAG00000021060FTSJ39890.678Bos_taurus
ENSTTRG00000006973FTSJ39940.621WBGene00019168H06I04.36048.565Caenorhabditis_elegans
ENSTTRG00000006973FTSJ39886.473ENSCJAG00000019631FTSJ39886.111Callithrix_jacchus
ENSTTRG00000006973FTSJ310088.138ENSCAFG00000012770FTSJ39888.554Canis_familiaris
ENSTTRG00000006973FTSJ310088.929ENSCAFG00020026630FTSJ39889.359Canis_lupus_dingo
ENSTTRG00000006973FTSJ39891.990ENSCHIG00000025676FTSJ39891.626Capra_hircus
ENSTTRG00000006973FTSJ39582.013ENSTSYG00000001393FTSJ39781.841Carlito_syrichta
ENSTTRG00000006973FTSJ37081.855ENSCAPG00000016654FTSJ39780.242Cavia_aperea
ENSTTRG00000006973FTSJ39886.007ENSCPOG00000011384FTSJ39886.128Cavia_porcellus
ENSTTRG00000006973FTSJ39887.093ENSCCAG00000023533-9791.115Cebus_capucinus
ENSTTRG00000006973FTSJ39886.228ENSCATG00000018510FTSJ39887.066Cercocebus_atys
ENSTTRG00000006973FTSJ39887.666ENSCLAG00000003222FTSJ39887.787Chinchilla_lanigera
ENSTTRG00000006973FTSJ310087.101ENSCSAG00000003921FTSJ39887.620Chlorocebus_sabaeus
ENSTTRG00000006973FTSJ39968.377ENSCPBG00000010032FTSJ39875.236Chrysemys_picta_bellii
ENSTTRG00000006973FTSJ36058.204ENSCING00000025069-9842.806Ciona_intestinalis
ENSTTRG00000006973FTSJ35857.003ENSCSAVG00000003607-6856.740Ciona_savignyi
ENSTTRG00000006973FTSJ39887.500ENSCANG00000042921FTSJ39887.981Colobus_angolensis_palliatus
ENSTTRG00000006973FTSJ39886.007ENSCGRG00001018068FTSJ39887.226Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSTTRG00000006973FTSJ39886.007ENSCGRG00000010648FTSJ39887.226Cricetulus_griseus_crigri
ENSTTRG00000006973FTSJ39960.660ENSCSEG00000013468ftsj39660.024Cynoglossus_semilaevis
ENSTTRG00000006973FTSJ39962.024ENSCVAG00000007484ftsj39762.019Cyprinodon_variegatus
ENSTTRG00000006973FTSJ39961.374ENSDARG00000104938ftsj39760.306Danio_rerio
ENSTTRG00000006973FTSJ310085.917ENSDNOG00000002392FTSJ39885.697Dasypus_novemcinctus
ENSTTRG00000006973FTSJ39887.334ENSDORG00000004200Ftsj39887.937Dipodomys_ordii
ENSTTRG00000006973FTSJ39938.408FBgn0030720CG89399839.319Drosophila_melanogaster
ENSTTRG00000006973FTSJ310082.054ENSETEG00000019228FTSJ39882.994Echinops_telfairi
ENSTTRG00000006973FTSJ39952.998ENSEBUG00000007828ftsj39752.855Eptatretus_burgeri
ENSTTRG00000006973FTSJ310089.762ENSEASG00005013565FTSJ39889.722Equus_asinus_asinus
ENSTTRG00000006973FTSJ39890.194ENSECAG00000011995FTSJ39890.073Equus_caballus
ENSTTRG00000006973FTSJ39959.064ENSELUG00000013501ftsj39559.479Esox_lucius
ENSTTRG00000006973FTSJ310088.530ENSFCAG00000013983FTSJ39889.320Felis_catus
ENSTTRG00000006973FTSJ39868.176ENSFALG00000013635FTSJ39968.296Ficedula_albicollis
ENSTTRG00000006973FTSJ39886.165ENSFDAG00000010274FTSJ39886.286Fukomys_damarensis
ENSTTRG00000006973FTSJ39962.738ENSFHEG00000007639ftsj39761.473Fundulus_heteroclitus
ENSTTRG00000006973FTSJ35070.938ENSGMOG00000017184ftsj310070.938Gadus_morhua
ENSTTRG00000006973FTSJ39869.784ENSGALG00000032993FTSJ39967.849Gallus_gallus
ENSTTRG00000006973FTSJ35071.194ENSGACG00000009841ftsj310070.492Gasterosteus_aculeatus
ENSTTRG00000006973FTSJ39970.546ENSGAGG00000006236FTSJ39970.964Gopherus_agassizii
ENSTTRG00000006973FTSJ39887.620ENSGGOG00000006794FTSJ39887.620Gorilla_gorilla
ENSTTRG00000006973FTSJ39961.593ENSHBUG00000022331ftsj39661.705Haplochromis_burtoni
ENSTTRG00000006973FTSJ39887.394ENSHGLG00000012282FTSJ39887.515Heterocephalus_glaber_female
ENSTTRG00000006973FTSJ39987.424ENSHGLG00100003578FTSJ39887.515Heterocephalus_glaber_male
ENSTTRG00000006973FTSJ39961.584ENSHCOG00000018770ftsj39661.124Hippocampus_comes
ENSTTRG00000006973FTSJ39960.563ENSIPUG00000024942ftsj39462.172Ictalurus_punctatus
ENSTTRG00000006973FTSJ39887.981ENSSTOG00000021265FTSJ39888.221Ictidomys_tridecemlineatus
ENSTTRG00000006973FTSJ39885.922ENSJJAG00000012822Ftsj39885.680Jaculus_jaculus
ENSTTRG00000006973FTSJ39962.500ENSKMAG00000021997ftsj39660.048Kryptolebias_marmoratus
ENSTTRG00000006973FTSJ39960.048ENSLBEG00000027142ftsj39658.754Labrus_bergylta
ENSTTRG00000006973FTSJ38149.432ENSLACG00000005523FTSJ39849.290Latimeria_chalumnae
ENSTTRG00000006973FTSJ39961.065ENSLOCG00000008979ftsj39862.545Lepisosteus_oculatus
ENSTTRG00000006973FTSJ310087.470ENSLAFG00000003252FTSJ39887.229Loxodonta_africana
ENSTTRG00000006973FTSJ39886.795ENSMFAG00000003764FTSJ39887.635Macaca_fascicularis
ENSTTRG00000006973FTSJ39882.070ENSMMUG00000016768FTSJ39881.829Macaca_mulatta
ENSTTRG00000006973FTSJ39886.811ENSMNEG00000029254FTSJ39887.650Macaca_nemestrina
ENSTTRG00000006973FTSJ39886.691ENSMLEG00000029091FTSJ39887.530Mandrillus_leucophaeus
ENSTTRG00000006973FTSJ39960.828ENSMZEG00005001992ftsj39662.275Maylandia_zebra
ENSTTRG00000006973FTSJ39272.310ENSMGAG00000000953FTSJ39964.719Meleagris_gallopavo
ENSTTRG00000006973FTSJ39887.348ENSMAUG00000015688Ftsj39886.496Mesocricetus_auratus
ENSTTRG00000006973FTSJ39889.277ENSMICG00000045996FTSJ39888.916Microcebus_murinus
ENSTTRG00000006973FTSJ310087.515ENSMOCG00000017809Ftsj39887.439Microtus_ochrogaster
ENSTTRG00000006973FTSJ39960.047ENSMMOG00000019522ftsj38960.427Mola_mola
ENSTTRG00000006973FTSJ39979.191ENSMODG00000009901FTSJ39878.408Monodelphis_domestica
ENSTTRG00000006973FTSJ39888.150MGP_CAROLIEiJ_G0017315Ftsj39888.271Mus_caroli
ENSTTRG00000006973FTSJ39887.077ENSMUSG00000020706Ftsj39887.319Mus_musculus
ENSTTRG00000006973FTSJ39888.058MGP_PahariEiJ_G0018445Ftsj39888.058Mus_pahari
ENSTTRG00000006973FTSJ39887.545MGP_SPRETEiJ_G0018159Ftsj39887.666Mus_spretus
ENSTTRG00000006973FTSJ310087.753ENSMPUG00000014911FTSJ39886.957Mustela_putorius_furo
ENSTTRG00000006973FTSJ310089.417ENSMLUG00000011667FTSJ39889.976Myotis_lucifugus
ENSTTRG00000006973FTSJ39988.620ENSNGAG00000005899Ftsj39888.092Nannospalax_galili
ENSTTRG00000006973FTSJ38568.449ENSNBRG00000017453ftsj39768.539Neolamprologus_brichardi
ENSTTRG00000006973FTSJ39987.260ENSNLEG00000004188FTSJ39887.831Nomascus_leucogenys
ENSTTRG00000006973FTSJ310073.263ENSMEUG00000013252FTSJ39872.262Notamacropus_eugenii
ENSTTRG00000006973FTSJ39884.229ENSOPRG00000014985FTSJ39885.301Ochotona_princeps
ENSTTRG00000006973FTSJ310085.969ENSODEG00000008167FTSJ39886.232Octodon_degus
ENSTTRG00000006973FTSJ39961.383ENSONIG00000001654ftsj39661.768Oreochromis_niloticus
ENSTTRG00000006973FTSJ310085.612ENSOCUG00000004319FTSJ39884.255Oryctolagus_cuniculus
ENSTTRG00000006973FTSJ39961.237ENSORLG00000005910ftsj39661.124Oryzias_latipes
ENSTTRG00000006973FTSJ39960.520ENSORLG00020021255ftsj38969.886Oryzias_latipes_hni
ENSTTRG00000006973FTSJ39961.548ENSORLG00015018416ftsj39661.078Oryzias_latipes_hsok
ENSTTRG00000006973FTSJ39961.575ENSOMEG00000014432ftsj39662.156Oryzias_melastigma
ENSTTRG00000006973FTSJ310087.530ENSOGAG00000032479FTSJ39888.299Otolemur_garnettii
ENSTTRG00000006973FTSJ39891.505ENSOARG00000013637FTSJ39891.869Ovis_aries
ENSTTRG00000006973FTSJ39887.305ENSPPAG00000027297FTSJ39888.024Pan_paniscus
ENSTTRG00000006973FTSJ310087.933ENSPPRG00000003042FTSJ39889.320Panthera_pardus
ENSTTRG00000006973FTSJ310087.173ENSPTIG00000012576FTSJ39888.661Panthera_tigris_altaica
ENSTTRG00000006973FTSJ39887.081ENSPTRG00000009524FTSJ39887.560Pan_troglodytes
ENSTTRG00000006973FTSJ39886.675ENSPANG00000020978FTSJ39887.515Papio_anubis
ENSTTRG00000006973FTSJ39862.816ENSPKIG00000012838ftsj39662.485Paramormyrops_kingsleyae
ENSTTRG00000006973FTSJ35981.111ENSPSIG00000004632FTSJ36485.870Pelodiscus_sinensis
ENSTTRG00000006973FTSJ38863.507ENSPMGG00000012959ftsj39853.735Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSTTRG00000006973FTSJ39887.927ENSPEMG00000000248Ftsj39887.927Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSTTRG00000006973FTSJ310078.546ENSPCIG00000009088FTSJ39878.960Phascolarctos_cinereus
ENSTTRG00000006973FTSJ39960.731ENSPFOG00000023101ftsj39759.929Poecilia_formosa
ENSTTRG00000006973FTSJ310060.563ENSPLAG00000003846ftsj39759.810Poecilia_latipinna
ENSTTRG00000006973FTSJ39960.849ENSPMEG00000012692ftsj39760.048Poecilia_mexicana
ENSTTRG00000006973FTSJ39960.070ENSPREG00000014874ftsj39759.527Poecilia_reticulata
ENSTTRG00000006973FTSJ39887.152ENSPPYG00000008532FTSJ39886.909Pongo_abelii
ENSTTRG00000006973FTSJ39983.909ENSPCAG00000002560FTSJ39882.950Procavia_capensis
ENSTTRG00000006973FTSJ39888.540ENSPCOG00000023921FTSJ39889.144Propithecus_coquereli
ENSTTRG00000006973FTSJ310089.810ENSPVAG00000000162FTSJ39890.253Pteropus_vampyrus
ENSTTRG00000006973FTSJ38568.063ENSPNYG00000005108ftsj39866.667Pundamilia_nyererei
ENSTTRG00000006973FTSJ39759.805ENSPNAG00000022474ftsj39460.319Pygocentrus_nattereri
ENSTTRG00000006973FTSJ310086.786ENSRNOG00000009857Ftsj39986.972Rattus_norvegicus
ENSTTRG00000006973FTSJ39886.418ENSRBIG00000039259FTSJ39887.139Rhinopithecus_bieti
ENSTTRG00000006973FTSJ39886.522ENSRROG00000045002FTSJ39887.244Rhinopithecus_roxellana
ENSTTRG00000006973FTSJ37742.612YCL054W-7343.529Saccharomyces_cerevisiae
ENSTTRG00000006973FTSJ39986.538ENSSBOG00000031794FTSJ39287.817Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSTTRG00000006973FTSJ310076.860ENSSHAG00000013062FTSJ39877.201Sarcophilus_harrisii
ENSTTRG00000006973FTSJ39962.989ENSSFOG00015018053ftsj39761.294Scleropages_formosus
ENSTTRG00000006973FTSJ36664.695ENSSMAG00000002863ftsj39660.240Scophthalmus_maximus
ENSTTRG00000006973FTSJ39961.249ENSSDUG00000003385ftsj39560.285Seriola_dumerili
ENSTTRG00000006973FTSJ39961.137ENSSLDG00000017970ftsj39560.167Seriola_lalandi_dorsalis
ENSTTRG00000006973FTSJ39269.131ENSSPUG00000012959FTSJ39968.353Sphenodon_punctatus
ENSTTRG00000006973FTSJ39959.364ENSSPAG00000002390ftsj39659.026Stegastes_partitus
ENSTTRG00000006973FTSJ39890.315ENSSSCG00000017288FTSJ39890.678Sus_scrofa
ENSTTRG00000006973FTSJ39962.188ENSTRUG00000017550ftsj39661.078Takifugu_rubripes
ENSTTRG00000006973FTSJ39961.831ENSTNIG00000015549ftsj39860.457Tetraodon_nigroviridis
ENSTTRG00000006973FTSJ39881.917ENSTBEG00000010295FTSJ39881.983Tupaia_belangeri
ENSTTRG00000006973FTSJ38297.761ENSUAMG00000007332FTSJ39597.059Ursus_americanus
ENSTTRG00000006973FTSJ310088.200ENSUMAG00000017450FTSJ39888.121Ursus_maritimus
ENSTTRG00000006973FTSJ310088.810ENSVVUG00000006106FTSJ39889.238Vulpes_vulpes
ENSTTRG00000006973FTSJ39759.215ENSXETG00000006939ftsj39958.612Xenopus_tropicalis
ENSTTRG00000006973FTSJ39959.026ENSXCOG00000002999ftsj38867.614Xiphophorus_couchianus
ENSTTRG00000006973FTSJ39960.402ENSXMAG00000018139ftsj39658.977Xiphophorus_maculatus

Copyright © , Bioinformatics Center, Sun Yat-sen Memorial Hospital, Sun Yat-sen University, China. All Rights Reserved.

Any comment and suggestion, please contact us