EuRBPDB

Description

RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSTTRG00000013369 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: XPO1
Alias: CRM1|emb
Full Name: exportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Tursiops_truncatus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 37689 bases
Position: chrGeneScaffold_2267:639195-676883
Accession: 12825
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSTTRP00000012684	CRM1_C	PF08767.11	1.6e-90	1	2
ENSTTRP00000012684	CRM1_C	PF08767.11	1.6e-90	2	2
ENSTTRP00000012684	Xpo1	PF08389.12	5.4e-43	1	1
ENSTTRP00000012684	IBN_N	PF03810.19	1.6e-12	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSTTRT00000013369	XPO1-201	3069	-	ENSTTRP00000012684	1023 (aa)	-	UPI00018B87E8

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSTTRG00000013369	XPO1	100	88.661	ENSG00000082898	XPO1	100	100.000	Homo_sapiens
ENSTTRG00000013369	XPO1	100	86.119	ENSAPOG00000004984	-	96	86.119	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTTRG00000013369	XPO1	87	79.372	ENSAPOG00000002354	xpo1a	95	79.372	Acanthochromis_polyacanthus
ENSTTRG00000013369	XPO1	100	89.160	ENSAMEG00000003460	XPO1	96	89.160	Ailuropoda_melanoleuca
ENSTTRG00000013369	XPO1	87	81.839	ENSACIG00000010259	xpo1a	95	81.839	Amphilophus_citrinellus
ENSTTRG00000013369	XPO1	87	84.978	ENSACIG00000010818	-	95	84.978	Amphilophus_citrinellus
ENSTTRG00000013369	XPO1	100	82.405	ENSAOCG00000018914	xpo1a	95	82.405	Amphiprion_ocellaris
ENSTTRG00000013369	XPO1	100	86.119	ENSAOCG00000010121	-	96	86.119	Amphiprion_ocellaris
ENSTTRG00000013369	XPO1	90	81.907	ENSAPEG00000006583	xpo1a	95	81.907	Amphiprion_percula
ENSTTRG00000013369	XPO1	100	86.119	ENSAPEG00000007038	-	96	86.119	Amphiprion_percula
ENSTTRG00000013369	XPO1	100	82.111	ENSATEG00000020750	xpo1a	95	82.111	Anabas_testudineus
ENSTTRG00000013369	XPO1	100	86.119	ENSATEG00000008816	-	96	86.119	Anabas_testudineus
ENSTTRG00000013369	XPO1	100	88.954	ENSAPLG00000004008	XPO1	96	88.954	Anas_platyrhynchos
ENSTTRG00000013369	XPO1	100	88.759	ENSACAG00000002501	XPO1	96	88.759	Anolis_carolinensis
ENSTTRG00000013369	XPO1	100	88.661	ENSANAG00000020802	XPO1	96	88.661	Aotus_nancymaae
ENSTTRG00000013369	XPO1	87	81.951	ENSACLG00000015669	xpo1a	95	81.951	Astatotilapia_calliptera
ENSTTRG00000013369	XPO1	100	85.924	ENSACLG00000015192	-	96	85.924	Astatotilapia_calliptera
ENSTTRG00000013369	XPO1	87	82.478	ENSAMXG00000003069	xpo1a	95	82.478	Astyanax_mexicanus
ENSTTRG00000013369	XPO1	100	86.413	ENSAMXG00000012704	xpo1b	96	86.413	Astyanax_mexicanus
ENSTTRG00000013369	XPO1	100	89.247	ENSBTAG00000013254	XPO1	96	89.247	Bos_taurus
ENSTTRG00000013369	XPO1	95	52.507	WBGene00002078	xpo-1	90	52.507	Caenorhabditis_elegans
ENSTTRG00000013369	XPO1	100	88.661	ENSCJAG00000008877	XPO1	96	88.661	Callithrix_jacchus
ENSTTRG00000013369	XPO1	100	89.247	ENSCAFG00000003050	XPO1	96	89.247	Canis_familiaris
ENSTTRG00000013369	XPO1	93	88.291	ENSCAFG00020026910	XPO1	94	88.291	Canis_lupus_dingo
ENSTTRG00000013369	XPO1	100	89.247	ENSCHIG00000018132	XPO1	96	89.247	Capra_hircus
ENSTTRG00000013369	XPO1	100	89.247	ENSTSYG00000004330	XPO1	96	89.247	Carlito_syrichta
ENSTTRG00000013369	XPO1	50	86.628	ENSCAPG00000006454	-	91	86.628	Cavia_aperea
ENSTTRG00000013369	XPO1	100	87.781	ENSCPOG00000034053	XPO1	95	87.781	Cavia_porcellus
ENSTTRG00000013369	XPO1	92	79.365	ENSCCAG00000037445	XPO1	91	79.365	Cebus_capucinus
ENSTTRG00000013369	XPO1	100	86.745	ENSCATG00000032674	XPO1	96	86.745	Cercocebus_atys
ENSTTRG00000013369	XPO1	100	89.052	ENSCLAG00000012953	XPO1	96	89.052	Chinchilla_lanigera
ENSTTRG00000013369	XPO1	100	88.661	ENSCSAG00000014606	XPO1	96	88.661	Chlorocebus_sabaeus
ENSTTRG00000013369	XPO1	87	97.414	ENSCHOG00000012088	XPO1	83	97.414	Choloepus_hoffmanni
ENSTTRG00000013369	XPO1	100	88.856	ENSCPBG00000026239	XPO1	96	88.856	Chrysemys_picta_bellii
ENSTTRG00000013369	XPO1	99	74.012	ENSCING00000024562	-	94	74.012	Ciona_intestinalis
ENSTTRG00000013369	XPO1	94	78.893	ENSCSAVG00000005965	-	89	78.893	Ciona_savignyi
ENSTTRG00000013369	XPO1	100	88.661	ENSCANG00000028883	XPO1	95	88.661	Colobus_angolensis_palliatus
ENSTTRG00000013369	XPO1	100	88.172	ENSCGRG00001000263	Xpo1	96	88.172	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSTTRG00000013369	XPO1	100	88.172	ENSCGRG00000001520	Xpo1	96	88.172	Cricetulus_griseus_crigri
ENSTTRG00000013369	XPO1	87	82.399	ENSCSEG00000001693	XPO1	95	82.399	Cynoglossus_semilaevis
ENSTTRG00000013369	XPO1	100	86.022	ENSCVAG00000016788	-	96	86.022	Cyprinodon_variegatus
ENSTTRG00000013369	XPO1	100	81.818	ENSCVAG00000016558	xpo1a	95	81.818	Cyprinodon_variegatus
ENSTTRG00000013369	XPO1	100	83.675	ENSDARG00000078041	xpo1a	100	87.307	Danio_rerio
ENSTTRG00000013369	XPO1	100	86.706	ENSDARG00000063229	xpo1b	96	86.706	Danio_rerio
ENSTTRG00000013369	XPO1	100	89.150	ENSDNOG00000005805	XPO1	96	89.150	Dasypus_novemcinctus
ENSTTRG00000013369	XPO1	82	90.191	ENSDORG00000013050	Xpo1	89	90.191	Dipodomys_ordii
ENSTTRG00000013369	XPO1	99	65.456	FBgn0020497	emb	95	65.456	Drosophila_melanogaster
ENSTTRG00000013369	XPO1	94	88.930	ENSETEG00000018045	XPO1	89	88.930	Echinops_telfairi
ENSTTRG00000013369	XPO1	84	81.333	ENSEBUG00000012580	-	93	81.333	Eptatretus_burgeri
ENSTTRG00000013369	XPO1	100	89.247	ENSEASG00005007223	XPO1	96	89.247	Equus_asinus_asinus
ENSTTRG00000013369	XPO1	91	99.219	ENSECAG00000024920	XPO1	95	99.219	Equus_caballus
ENSTTRG00000013369	XPO1	92	79.829	ENSEEUG00000009479	XPO1	87	79.829	Erinaceus_europaeus
ENSTTRG00000013369	XPO1	87	81.151	ENSELUG00000014306	-	93	81.151	Esox_lucius
ENSTTRG00000013369	XPO1	87	83.744	ENSELUG00000012707	xpo1a	95	83.744	Esox_lucius
ENSTTRG00000013369	XPO1	100	89.247	ENSFCAG00000002702	XPO1	96	89.247	Felis_catus
ENSTTRG00000013369	XPO1	100	88.759	ENSFALG00000010989	XPO1	96	88.759	Ficedula_albicollis
ENSTTRG00000013369	XPO1	100	87.390	ENSFDAG00000014716	XPO1	95	87.390	Fukomys_damarensis
ENSTTRG00000013369	XPO1	100	82.111	ENSFHEG00000002412	xpo1a	95	82.111	Fundulus_heteroclitus
ENSTTRG00000013369	XPO1	100	80.254	ENSGMOG00000019063	-	96	80.254	Gadus_morhua
ENSTTRG00000013369	XPO1	100	83.089	ENSGMOG00000004441	xpo1a	95	83.089	Gadus_morhua
ENSTTRG00000013369	XPO1	100	88.954	ENSGALG00000029476	XPO1	96	88.954	Gallus_gallus
ENSTTRG00000013369	XPO1	87	81.839	ENSGAFG00000004408	xpo1a	95	81.839	Gambusia_affinis
ENSTTRG00000013369	XPO1	90	85.049	ENSGAFG00000003355	-	94	85.049	Gambusia_affinis
ENSTTRG00000013369	XPO1	100	81.818	ENSGACG00000019736	xpo1a	95	81.818	Gasterosteus_aculeatus
ENSTTRG00000013369	XPO1	100	85.924	ENSGACG00000002743	-	96	85.924	Gasterosteus_aculeatus
ENSTTRG00000013369	XPO1	100	88.759	ENSGAGG00000017558	XPO1	96	88.759	Gopherus_agassizii
ENSTTRG00000013369	XPO1	100	88.661	ENSGGOG00000034878	XPO1	96	88.661	Gorilla_gorilla
ENSTTRG00000013369	XPO1	100	82.502	ENSHBUG00000007128	xpo1a	95	82.502	Haplochromis_burtoni
ENSTTRG00000013369	XPO1	100	86.022	ENSHBUG00000020037	-	96	86.022	Haplochromis_burtoni
ENSTTRG00000013369	XPO1	100	88.954	ENSHGLG00000003115	XPO1	96	88.954	Heterocephalus_glaber_female
ENSTTRG00000013369	XPO1	100	88.954	ENSHGLG00100012227	XPO1	96	88.954	Heterocephalus_glaber_male
ENSTTRG00000013369	XPO1	87	84.753	ENSHCOG00000006949	XPO1	95	84.753	Hippocampus_comes
ENSTTRG00000013369	XPO1	100	83.871	ENSIPUG00000024394	XPO1	96	83.871	Ictalurus_punctatus
ENSTTRG00000013369	XPO1	100	86.413	ENSIPUG00000012891	Xpo1	96	86.413	Ictalurus_punctatus
ENSTTRG00000013369	XPO1	100	89.150	ENSSTOG00000016122	XPO1	96	89.150	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSTTRG00000013369	XPO1	100	89.052	ENSJJAG00000020468	Xpo1	96	89.052	Jaculus_jaculus
ENSTTRG00000013369	XPO1	100	82.014	ENSKMAG00000004830	xpo1a	95	82.014	Kryptolebias_marmoratus
ENSTTRG00000013369	XPO1	100	85.630	ENSKMAG00000016218	-	96	85.630	Kryptolebias_marmoratus
ENSTTRG00000013369	XPO1	100	86.217	ENSLBEG00000005740	-	96	86.217	Labrus_bergylta
ENSTTRG00000013369	XPO1	87	79.241	ENSLBEG00000002104	xpo1a	95	79.241	Labrus_bergylta
ENSTTRG00000013369	XPO1	94	93.846	ENSLACG00000018213	XPO1	90	93.846	Latimeria_chalumnae
ENSTTRG00000013369	XPO1	100	86.804	ENSLOCG00000016095	xpo1b	95	86.804	Lepisosteus_oculatus
ENSTTRG00000013369	XPO1	100	88.856	ENSLAFG00000014553	XPO1	96	88.856	Loxodonta_africana
ENSTTRG00000013369	XPO1	100	88.661	ENSMFAG00000038679	XPO1	96	88.661	Macaca_fascicularis
ENSTTRG00000013369	XPO1	100	88.661	ENSMMUG00000006941	XPO1	96	88.661	Macaca_mulatta
ENSTTRG00000013369	XPO1	100	88.661	ENSMNEG00000030909	XPO1	96	88.661	Macaca_nemestrina
ENSTTRG00000013369	XPO1	100	86.758	ENSMLEG00000032004	XPO1	96	86.758	Mandrillus_leucophaeus
ENSTTRG00000013369	XPO1	100	82.405	ENSMAMG00000023037	xpo1a	95	82.405	Mastacembelus_armatus
ENSTTRG00000013369	XPO1	100	86.119	ENSMAMG00000010568	-	96	86.119	Mastacembelus_armatus
ENSTTRG00000013369	XPO1	100	85.924	ENSMZEG00005018158	-	94	85.049	Maylandia_zebra
ENSTTRG00000013369	XPO1	100	82.502	ENSMZEG00005005105	xpo1a	95	82.502	Maylandia_zebra
ENSTTRG00000013369	XPO1	66	91.246	ENSMGAG00000001496	-	93	91.246	Meleagris_gallopavo
ENSTTRG00000013369	XPO1	100	88.172	ENSMAUG00000006769	Xpo1	96	88.172	Mesocricetus_auratus
ENSTTRG00000013369	XPO1	100	89.247	ENSMICG00000027770	XPO1	96	89.247	Microcebus_murinus
ENSTTRG00000013369	XPO1	100	88.465	ENSMOCG00000012169	Xpo1	96	88.465	Microtus_ochrogaster
ENSTTRG00000013369	XPO1	87	84.814	ENSMMOG00000008001	-	95	84.814	Mola_mola
ENSTTRG00000013369	XPO1	87	81.839	ENSMMOG00000018767	xpo1a	95	81.839	Mola_mola
ENSTTRG00000013369	XPO1	100	87.879	ENSMODG00000002831	XPO1	96	87.879	Monodelphis_domestica
ENSTTRG00000013369	XPO1	87	81.523	ENSMALG00000008617	xpo1a	95	81.523	Monopterus_albus
ENSTTRG00000013369	XPO1	100	85.630	ENSMALG00000007085	-	96	85.630	Monopterus_albus
ENSTTRG00000013369	XPO1	100	88.465	MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	96	88.465	Mus_caroli
ENSTTRG00000013369	XPO1	100	88.563	ENSMUSG00000020290	Xpo1	96	88.563	Mus_musculus
ENSTTRG00000013369	XPO1	100	88.465	MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	96	88.465	Mus_pahari
ENSTTRG00000013369	XPO1	100	88.563	MGP_SPRETEiJ_G0016979	Xpo1	96	88.563	Mus_spretus
ENSTTRG00000013369	XPO1	100	89.247	ENSMPUG00000005560	XPO1	96	89.247	Mustela_putorius_furo
ENSTTRG00000013369	XPO1	100	89.150	ENSMLUG00000010670	XPO1	96	89.150	Myotis_lucifugus
ENSTTRG00000013369	XPO1	100	89.052	ENSNGAG00000022158	Xpo1	96	89.052	Nannospalax_galili
ENSTTRG00000013369	XPO1	100	86.022	ENSNBRG00000012229	-	99	86.022	Neolamprologus_brichardi
ENSTTRG00000013369	XPO1	100	82.502	ENSNBRG00000003776	xpo1a	95	82.502	Neolamprologus_brichardi
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